Homolog Viewer

PAthogenisity Island DataBase (PAI DB)

Home PAIs REIs Genomes Search Links

Homologs of hsdR gene of NC_003923_R1

DNA-level

Hit (GenBank Accn)

Product

Source Genome

Eval.

Ident.(%)

1) SAA6159_00033
( - )

NC_017338
(Staphylococcus aureus JKD6159)

e-143

100

2) SAEMRSA15_00321
( - )

NC_017763
(Staphylococcus aureus HO 5096 0412)

e-131

100

• Sequence Alignments

1) SAA6159_00033 in NC_017338


>NC_003923_R1|9|G9|21281762|NP_644848.1|Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2|+|8108..8437|hsdR|MW0033|hypothetical 
          Length = 330

 Score = 505 bits (1303), Expect = e-143
 Identities = 261/261 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   ttgtatgtagtatatcgagcttcacatgaaacagctaaagaagctttgggcgataaagag 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 70  ttgtatgtagtatatcgagcttcacatgaaacagctaaagaagctttgggcgataaagag 129

Query: 61  ttaagagccattgcacatgagttaactaaaacagttaaggataacatgagtgttgattgg 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 130 ttaagagccattgcacatgagttaactaaaacagttaaggataacatgagtgttgattgg 189

Query: 121 tctaaacgagacagtgctaaagctaaaatgagagttcaagttagacgcctattaaagaaa 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 190 tctaaacgagacagtgctaaagctaaaatgagagttcaagttagacgcctattaaagaaa 249

Query: 181 tatggctatccaccagatcttcaaaaaatggctgtggaacaagttgtagagcaagcagaa 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 250 tatggctatccaccagatcttcaaaaaatggctgtggaacaagttgtagagcaagcagaa 309

Query: 241 ttaatggcaagtcagcaataa 261
           |||||||||||||||||||||
Sbjct: 310 ttaatggcaagtcagcaataa 330

2) SAEMRSA15_00321 in NC_017763


>NC_003923_R1|9|G9|21281762|NP_644848.1|Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2|+|8108..8437|hsdR|MW0033|hypothetical 
          Length = 330

 Score = 464 bits (1198), Expect = e-131
 Identities = 240/240 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   tcacatgaaacagctaaagaagctttgggcgataaagagttaagagccattgcacatgag 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 91  tcacatgaaacagctaaagaagctttgggcgataaagagttaagagccattgcacatgag 150

Query: 61  ttaactaaaacagttaaggataacatgagtgttgattggtctaaacgagacagtgctaaa 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 151 ttaactaaaacagttaaggataacatgagtgttgattggtctaaacgagacagtgctaaa 210

Query: 121 gctaaaatgagagttcaagttagacgcctattaaagaaatatggctatccaccagatctt 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 211 gctaaaatgagagttcaagttagacgcctattaaagaaatatggctatccaccagatctt 270

Query: 181 caaaaaatggctgtggaacaagttgtagagcaagcagaattaatggcaagtcagcaataa 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 271 caaaaaatggctgtggaacaagttgtagagcaagcagaattaatggcaagtcagcaataa 330