Homolog Viewer

PAthogenisity Island DataBase (PAI DB)

Home PAIs REIs Genomes Search Links

Homologs of SAUSA300_1749 gene of NC_007793_P5

DNA-level

Hit (GenBank Accn)

Product

Source Genome

Eval.

Ident.(%)

1) SAS1728
( - )

NC_002953
(Staphylococcus aureus MSSA476)

e-207

99.7

2) SAEMRSA15_17180
( - )

NC_017763
(Staphylococcus aureus HO 5096 0412)

e-173

91.5

• Sequence Alignments

1) SAS1728 in NC_002953


>NC_007793_P5|8|G7|87162061|YP_494440.1|Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_USA300_FPR3757|-|4852..5229|-|SAUSA300_1749|hypothetical 
          Length = 378

 Score = 717 bits (1851), Expect = e-207
 Identities = 377/378 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   ttgaataaaaaatatcttatgattgtaattataattttaatattgattctaggcggaatc 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   ttgaataaaaaatatcttatgattgtaattataattttaatattgattctaggcggaatc 60

Query: 61  tttttgaagatgaaatatgacgaaaagaaataatatgatgaacaaaaagaaagaataacg 120
           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  tttttgaagatgaaatatgacgaaaagaaatattatgatgaacaaaaagaaagaataacg 120

Query: 121 atttatatgaagtacaatgtgaaaggttataaaaatataagcttcgctaattttaaagaa 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 atttatatgaagtacaatgtgaaaggttataaaaatataagcttcgctaattttaaagaa 180

Query: 181 aacccaatggatggttattctattagtggttatataaataatgataaaaagttatcattt 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aacccaatggatggttattctattagtggttatataaataatgataaaaagttatcattt 240

Query: 241 acagctggtataagatctgttgatgattttcaatttgataccgatatttcttatacagat 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 acagctggtataagatctgttgatgattttcaatttgataccgatatttcttatacagat 300

Query: 301 gaattgggtagaaaatttaataaaaatcctaagtcagtttctgaaataaaaaaagagcaa 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gaattgggtagaaaatttaataaaaatcctaagtcagtttctgaaataaaaaaagagcaa 360

Query: 361 aatacgtccaataaataa 378
           ||||||||||||||||||
Sbjct: 361 aatacgtccaataaataa 378

2) SAEMRSA15_17180 in NC_017763


>NC_007793_P5|8|G7|87162061|YP_494440.1|Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_USA300_FPR3757|-|4852..5229|-|SAUSA300_1749|hypothetical 
          Length = 378

 Score = 606 bits (1563), Expect = e-173
 Identities = 346/378 (92%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   ttgaataaaaaacctcttgtgattgtatttataattataatattgattctaggcggaatc 60
           ||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   ttgaataaaaaatatcttatgattgtaattataattttaatattgattctaggcggaatc 60

Query: 61  tttttgaagatgaaatatgatgaaatgaaatattatgatgagcaaaaagaaagaatcata 120
           |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  
Sbjct: 61  tttttgaagatgaaatatgacgaaaagaaatattatgatgaacaaaaagaaagaataacg 120

Query: 121 ttatttatgaaatataatgttaaagggtttaaagaaatacaattcgaggaacaaaaagaa 180
            | | |||||| || ||||| ||||| | |||| | |||   ||||   |    ||||||
Sbjct: 121 atttatatgaagtacaatgtgaaaggttataaaaatataagcttcgctaattttaaagaa 180

Query: 181 aacccaatggatggttattctattagtggttatataaataatgataaaaagttatcattt 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aacccaatggatggttattctattagtggttatataaataatgataaaaagttatcattt 240

Query: 241 acagctggtataagatctgttgatgattttcaatttgataccgatatttcttatacagat 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 acagctggtataagatctgttgatgattttcaatttgataccgatatttcttatacagat 300

Query: 301 gaattgggtagaaaatttaataaaaatcctaagtcagtttctgaaataaagaaagagcaa 360
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 301 gaattgggtagaaaatttaataaaaatcctaagtcagtttctgaaataaaaaaagagcaa 360

Query: 361 aatacgtccaataaataa 378
           ||||||||||||||||||
Sbjct: 361 aatacgtccaataaataa 378