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Homologs of SERP2219 gene of NC_002976_P3

DNA-level

Hit (GenBank Accn)

Product

Source Genome

Eval.

Ident.(%)

1) SERP2219
( - )

NC_002976
(Staphylococcus epidermidis RP62A)

0.0

100

2) SAUSA300_0069
( - )

NC_007793
(Staphylococcus aureus FPR3757)

0.0

98.5

3) USA300HOU_0074
( - )

NC_010079
(Staphylococcus aureus TCH1516)

0.0

98.5

4) SEA0032
( - )

NC_006663
(Staphylococcus epidermidis RP62A)

0.0

5) unnamed
( - )

NC_002952
(Staphylococcus aureus MRSA252)

e-205

86.8

6) unnamed
( - )

NC_002952
(Staphylococcus aureus MRSA252)

e-205

86.8

• Sequence Alignments

1) SERP2219 in NC_002976


>NC_002976_P3|7|S1|GeneID:3242955|-|Staphylococcus_epidermidis_RP62A|+|4696..5369|-|SERP2219|- 
          Length = 674

 Score = 1300 bits (3355), Expect = 0.0
 Identities = 674/674 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaagatgttatcactgtagccgttggctac 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaagatgttatcactgtagccgttggctac 60

Query: 61  tatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  tatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120

Query: 121 aacgttcatcattcaacggtctaccgttgggttcaagaatatgtctcaattttatatcaa 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 aacgttcatcattcaacggtctaccgttgggttcaagaatatgtctcaattttatatcaa 180

Query: 181 atttggaagaaaagcatcaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtacatca 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 atttggaagaaaagcatcaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtacatca 240

Query: 241 aaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatgcagagggacatacattag 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatgcagagggacatacattag 300

Query: 301 atatttggttgcgtaagcaacgagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctca 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 atatttggttgcgtaagcaacgagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctca 360

Query: 361 ttaaacaatttggtaaacctcaaaaggtaattacagatcaggcaccttcaacgaaggtag 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ttaaacaatttggtaaacctcaaaaggtaattacagatcaggcaccttcaacgaaggtag 420

Query: 421 caatggctaaagtaattaaagcttttaaacttaaacctgactgtcattgtacatcgaaat 480
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 caatggctaaagtaattaaagcttttaaacttaaacctgactgtcattgtacatcgaaat 480

Query: 481 atctgaataacctcattgagcaagatcaccgtcatattaaagtaagaaagacaaggtatc 540
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 atctgaataacctcattgagcaagatcaccgtcatattaaagtaagaaagacaaggtatc 540

Query: 541 aaagtatcaatacagcaaagaatactttaaaaggtattgaatgtatttacgctctatata 600
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 aaagtatcaatacagcaaagaatactttaaaaggtattgaatgtatttacgctctatata 600

Query: 601 aaaagaaccgcaggtctcttcagatctacggattttcgccatgccacgaaattagcatca 660
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aaaagaaccgcaggtctcttcagatctacggattttcgccatgccacgaaattagcatca 660

Query: 661 tgctagcgagttaa 674
           ||||||||||||||
Sbjct: 661 tgctagcgagttaa 674

2) SAUSA300_0069 in NC_007793


>NC_002976_P3|7|S1|GeneID:3242955|-|Staphylococcus_epidermidis_RP62A|+|4696..5369|-|SERP2219|- 
          Length = 674

 Score = 1252 bits (3232), Expect = 0.0
 Identities = 663/675 (98%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctac 60
           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaagatgttatcactgtagccgttggctac 60

Query: 61  tatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  tatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120

Query: 121 aacgttcatcattcaacggtctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaa 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||
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Query: 181 atttggaagaaaaagcat-aaaaagctaattacaaatggcgtattgatgagacgtacatc 239
           ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 atttggaagaaaa-gcatcaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtacatc 239

Query: 240 aaaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatgcagagggatatacatta 299
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 240 aaaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatgcagagggacatacatta 299

Query: 300 gatatttggttgcgtaagcaacgagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctc 359
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 300 gatatttggttgcgtaagcaacgagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctc 359

Query: 360 attaaacaatttggtaaacctcaaaaggtaattacagatcaggcaccttcaacgaaggta 419
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 360 attaaacaatttggtaaacctcaaaaggtaattacagatcaggcaccttcaacgaaggta 419

Query: 420 gcaatggctaaagtaattaaagcttttaaacttaaacctgactgttattgtacatcgaaa 479
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 420 gcaatggctaaagtaattaaagcttttaaacttaaacctgactgtcattgtacatcgaaa 479

Query: 480 tatctgaataacctcattgagcaagatcactgtcatattaaaataagaaagacaaggtat 539
           |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 480 tatctgaataacctcattgagcaagatcaccgtcatattaaagtaagaaagacaaggtat 539

Query: 540 caaaatatcaatacagcaaagaatactttaaaaggtattgaatgtatttacgctctatat 599
           |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 540 caaagtatcaatacagcaaagaatactttaaaaggtattgaatgtatttacgctctatat 599

Query: 600 aaaaagaaccgcaggtctcttcagatctacggattttcgccatgccacgaaattagcatc 659
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 aaaaagaaccgcaggtctcttcagatctacggattttcgccatgccacgaaattagcatc 659

Query: 660 atgctagcaagttaa 674
           |||||||| ||||||
Sbjct: 660 atgctagcgagttaa 674

3) USA300HOU_0074 in NC_010079


>NC_002976_P3|7|S1|GeneID:3242955|-|Staphylococcus_epidermidis_RP62A|+|4696..5369|-|SERP2219|- 
          Length = 674

 Score = 1252 bits (3232), Expect = 0.0
 Identities = 663/675 (98%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctac 60
           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaagatgttatcactgtagccgttggctac 60

Query: 61  tatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  tatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120

Query: 121 aacgttcatcattcaacggtctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaa 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct: 121 aacgttcatcattcaacggtctaccgttgggttcaagaatatgtctcaattttatatcaa 180

Query: 181 atttggaagaaaaagcat-aaaaagctaattacaaatggcgtattgatgagacgtacatc 239
           ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 atttggaagaaaa-gcatcaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtacatc 239

Query: 240 aaaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatgcagagggatatacatta 299
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 240 aaaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatgcagagggacatacatta 299

Query: 300 gatatttggttgcgtaagcaacgagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctc 359
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 300 gatatttggttgcgtaagcaacgagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctc 359

Query: 360 attaaacaatttggtaaacctcaaaaggtaattacagatcaggcaccttcaacgaaggta 419
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 360 attaaacaatttggtaaacctcaaaaggtaattacagatcaggcaccttcaacgaaggta 419

Query: 420 gcaatggctaaagtaattaaagcttttaaacttaaacctgactgttattgtacatcgaaa 479
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 420 gcaatggctaaagtaattaaagcttttaaacttaaacctgactgtcattgtacatcgaaa 479

Query: 480 tatctgaataacctcattgagcaagatcactgtcatattaaaataagaaagacaaggtat 539
           |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 480 tatctgaataacctcattgagcaagatcaccgtcatattaaagtaagaaagacaaggtat 539

Query: 540 caaaatatcaatacagcaaagaatactttaaaaggtattgaatgtatttacgctctatat 599
           |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 540 caaagtatcaatacagcaaagaatactttaaaaggtattgaatgtatttacgctctatat 599

Query: 600 aaaaagaaccgcaggtctcttcagatctacggattttcgccatgccacgaaattagcatc 659
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 aaaaagaaccgcaggtctcttcagatctacggattttcgccatgccacgaaattagcatc 659

Query: 660 atgctagcaagttaa 674
           |||||||| ||||||
Sbjct: 660 atgctagcgagttaa 674

4) SEA0032 in NC_006663


>NC_002976_P3|7|S1|GeneID:3242955|-|Staphylococcus_epidermidis_RP62A|+|4696..5369|-|SERP2219|- 
          Length = 674

 Score = 1236 bits (3189), Expect = 0.0
 Identities = 654/675 (97%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctac 60
           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaagatgttatcactgtagccgttggctac 60

Query: 61  tatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgta 120
           |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 61  tatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120

Query: 121 aacgttcatcattcaacgatctaccgttgagttcaagaatatgccccaattttatatcaa 180
           |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct: 121 aacgttcatcattcaacggtctaccgttgggttcaagaatatgtctcaattttatatcaa 180

Query: 181 atttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtatatc 240
           ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 181 atttggaagaaaa-gcatcaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtacatc 239

Query: 241 aaaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatacagagggacatacatta 300
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 240 aaaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatgcagagggacatacatta 299

Query: 301 gatatttggttgcgtaagcaacgagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctc 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 300 gatatttggttgcgtaagcaacgagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctc 359

Query: 361 attaaacaatttggtaagcctcaaaaggtagttacagatcaggcaccttcaacgaaggca 420
           ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 360 attaaacaatttggtaaacctcaaaaggtaattacagatcaggcaccttcaacgaaggta 419

Query: 421 gcaatggctaaagtaattaaagcttttaaacttaaacctgactgtcattgtacatcgaaa 480
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 420 gcaatggctaaagtaattaaagcttttaaacttaaacctgactgtcattgtacatcgaaa 479

Query: 481 tatctgaataacctcattgagcaagatcaccgtcatattaaagtaagaaagacaagatat 540
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 480 tatctgaataacctcattgagcaagatcaccgtcatattaaagtaagaaagacaaggtat 539

Query: 541 caaagtatcaatacggcaaaaagtactttaaaaggtattgaatgtatttacgctctatat 600
           |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 540 caaagtatcaatacagcaaagaatactttaaaaggtattgaatgtatttacgctctatat 599

Query: 601 aaaaagaaccgtaggtctcttcagatctacggattttctccatgccacgaaattagcatc 660
           ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 aaaaagaaccgcaggtctcttcagatctacggattttcgccatgccacgaaattagcatc 659

Query: 661 atgctagcaagttaa 675
           |||||||| ||||||
Sbjct: 660 atgctagcgagttaa 674

5) unnamed in NC_002952


>NC_002976_P3|7|S1|GeneID:3242955|-|Staphylococcus_epidermidis_RP62A|+|4696..5369|-|SERP2219|- 
          Length = 674

 Score = 711 bits (1836), Expect = e-205
 Identities = 411/473 (87%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 261 aagcttattataaatggcatatagatgagacgtatatcaaaattaaagggcaatggaatt 320
           |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||  |
Sbjct: 202 aagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtacatcaaaataaaaggaaaatggagct 261

Query: 321 atttatatcgcgctattgatgcagatggccatacactagatatttcgttacgtaagaaac 380
           |||||||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| |||||| |||
Sbjct: 262 atttatatcgtgccattgatgcagagggacatacattagatatttggttgcgtaagcaac 321

Query: 381 gagataatcactcagcatatacgtttattaaacgtcttattaaacaatttggcaaacctc 440
           |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct: 322 gagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctcattaaacaatttggtaaacctc 381

Query: 441 aaatgataattacagaccaagccccttcaacgaaggtggcaatgtccaaagtgattaaag 500
           ||| | |||||||||| || || |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||
Sbjct: 382 aaaaggtaattacagatcaggcaccttcaacgaaggtagcaatggctaaagtaattaaag 441

Query: 501 attttaaacttacccccaactgtcattgtacctctaaatatttaaataatctcattgaac 560
            |||||||||||  ||  ||||||||||||| || |||||| | ||||| |||||||| |
Sbjct: 442 cttttaaacttaaacctgactgtcattgtacatcgaaatatctgaataacctcattgagc 501

Query: 561 aagatcatcgtcatatcaaagtaaggaaaataagttatcaaagtatcaatacggcaaaga 620
           ||||||| |||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 502 aagatcaccgtcatattaaagtaagaaagacaaggtatcaaagtatcaatacagcaaaga 561

Query: 621 atacgatcaaaggcattgaatgtatttatggactatataaaaagaaccgcagatctcttc 680
           ||||  | ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 562 atactttaaaaggtattgaatgtatttacgctctatataaaaagaaccgcaggtctcttc 621

Query: 681 agatctacgggttttcgccatgccgtgtaattagcatcatgctagctagttaa 733
           |||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 622 agatctacggattttcgccatgccacgaaattagcatcatgctagcgagttaa 674


 Score = 293 bits (757), Expect = 2e-79
 Identities = 167/193 (87%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 59  atgaattatttcagatataagcaatttgacaaagatgtcattactgtagccgttggctac 118
           ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaagatgttatcactgtagccgttggctac 60

Query: 119 tatctaagatatgcattaagttatcgtgatatatctgaaatattgagagaacgaggcatc 178
           ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  | 
Sbjct: 61  tatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120

Query: 179 tatgttcatcattcaacaatttatcgatgggtacaggaatatgctcctattttgtatcaa 238
            | ||||||||||||||  | || || ||||| || |||||||   | ||||| ||||||
Sbjct: 121 aacgttcatcattcaacggtctaccgttgggttcaagaatatgtctcaattttatatcaa 180

Query: 239 atttggaagaaaa 251
           |||||||||||||
Sbjct: 181 atttggaagaaaa 193

6) unnamed in NC_002952


>NC_002976_P3|7|S1|GeneID:3242955|-|Staphylococcus_epidermidis_RP62A|+|4696..5369|-|SERP2219|- 
          Length = 674

 Score = 711 bits (1836), Expect = e-205
 Identities = 411/473 (87%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 261 aagcttattataaatggcatatagatgagacgtatatcaaaattaaagggcaatggaatt 320
           |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||  |
Sbjct: 202 aagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtacatcaaaataaaaggaaaatggagct 261

Query: 321 atttatatcgcgctattgatgcagatggccatacactagatatttcgttacgtaagaaac 380
           |||||||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| |||||| |||
Sbjct: 262 atttatatcgtgccattgatgcagagggacatacattagatatttggttgcgtaagcaac 321

Query: 381 gagataatcactcagcatatacgtttattaaacgtcttattaaacaatttggcaaacctc 440
           |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct: 322 gagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctcattaaacaatttggtaaacctc 381

Query: 441 aaatgataattacagaccaagccccttcaacgaaggtggcaatgtccaaagtgattaaag 500
           ||| | |||||||||| || || |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||
Sbjct: 382 aaaaggtaattacagatcaggcaccttcaacgaaggtagcaatggctaaagtaattaaag 441

Query: 501 attttaaacttacccccaactgtcattgtacctctaaatatttaaataatctcattgaac 560
            |||||||||||  ||  ||||||||||||| || |||||| | ||||| |||||||| |
Sbjct: 442 cttttaaacttaaacctgactgtcattgtacatcgaaatatctgaataacctcattgagc 501

Query: 561 aagatcatcgtcatatcaaagtaaggaaaataagttatcaaagtatcaatacggcaaaga 620
           ||||||| |||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 502 aagatcaccgtcatattaaagtaagaaagacaaggtatcaaagtatcaatacagcaaaga 561

Query: 621 atacgatcaaaggcattgaatgtatttatggactatataaaaagaaccgcagatctcttc 680
           ||||  | ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 562 atactttaaaaggtattgaatgtatttacgctctatataaaaagaaccgcaggtctcttc 621

Query: 681 agatctacgggttttcgccatgccgtgtaattagcatcatgctagctagttaa 733
           |||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 622 agatctacggattttcgccatgccacgaaattagcatcatgctagcgagttaa 674


 Score = 293 bits (757), Expect = 2e-79
 Identities = 167/193 (87%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 59  atgaattatttcagatataagcaatttgacaaagatgtcattactgtagccgttggctac 118
           ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaagatgttatcactgtagccgttggctac 60

Query: 119 tatctaagatatgcattaagttatcgtgatatatctgaaatattgagagaacgaggcatc 178
           ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  | 
Sbjct: 61  tatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120

Query: 179 tatgttcatcattcaacaatttatcgatgggtacaggaatatgctcctattttgtatcaa 238
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