Homolog Viewer

PAthogenisity Island DataBase (PAI DB)

Home PAIs REIs Genomes Search Links

Homologs of tnpC gene of AF141323

DNA-level

Hit (GenBank Accn)

Product

Source Genome

Eval.

Ident.(%)

1) SF0319
( - )

NC_004337
(Shigella flexneri 301)

0.0

100

2) SF0476
( - )

NC_004337
(Shigella flexneri 301)

0.0

100

3) SF3705
( - )

NC_004337
(Shigella flexneri 301)

0.0

99.8

4) SF2212
( - )

NC_004337
(Shigella flexneri 301)

0.0

99.8

5) SF0228
( - )

NC_004337
(Shigella flexneri 301)

0.0

99.8

6) SF1049
( - )

NC_004337
(Shigella flexneri 301)

0.0

99.7

7) SF1057
( - )

NC_004337
(Shigella flexneri 301)

0.0

99.5

8) SFxv_4032
( - )

NC_017328
(Shigella flexneri 2002017)

0.0

99.8

9) SF0491
( - )

NC_004337
(Shigella flexneri 301)

0.0

99.4

10) SF0300
( - )

NC_004337
(Shigella flexneri 301)

0.0

99.4

11) unnamed
( - )

NC_007607
(Shigella dysenteriae Sd197)

0.0

98.9

12) SbBS512_A0081
( - )

NC_010660
(Shigella boydii CDC 3083-94)

0.0

98.7

13) SbBS512_A0059
( - )

NC_010660
(Shigella boydii CDC 3083-94)

0.0

98.7

14) unnamed
( - )

NC_013364
(Escherichia coli 11128)

0.0

15) ECO111_4885
( - )

NC_013364
(Escherichia coli 11128)

0.0

16) unnamed
( - )

NC_007607
(Shigella dysenteriae Sd197)

0.0

17) unnamed
( - )

NC_013353
(Escherichia coli 12009)

0.0

94.5

18) unnamed
( - )

NC_013353
(Escherichia coli 12009)

0.0

94.5

19) unnamed
( - )

NC_013353
(Escherichia coli 12009)

e-278

94.7

20) ECO103_3568
( - )

NC_013353
(Escherichia coli 12009)

e-278

94.7

21) ECUMN_3342
( - )

NC_011751
(Escherichia coli UMN026)

e-264

92.9

22) EcE24377A_D0056
( - )

NC_009788
(Escherichia coli E24377A)

e-253

99.3

23) EC55989_4640
( - )

NC_011748
(Escherichia coli 55989)

e-252

99.1

24) EC55989_4651
( - )

NC_011748
(Escherichia coli 55989)

e-252

99.1

25) EC55989_4675
( - )

NC_011748
(Escherichia coli 55989)

e-252

99.1

26) EcE24377A_4840
( - )

NC_009801
(Escherichia coli E24377A)

e-252

99.1

27) unnamed
( - )

NC_017646
(Escherichia coli CE10)

e-236

92.4

28) EcE24377A_E0017
( - )

NC_009790
(Escherichia coli E24377A)

e-234

94.6

29) EcE24377A_E0024
( - )

NC_009790
(Escherichia coli E24377A)

e-234

94.6

30) SF2974
( - )

NC_004337
(Shigella flexneri 301)

e-216

91.1

• Sequence Alignments

1) SF0319 in NC_004337


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 1221 bits (3150), Expect = 0.0
 Identities = 621/621 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 264 atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 323
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 60

Query: 324 cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 383
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 120

Query: 384 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcg 443
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcg 180

Query: 444 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaa 503
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaa 240

Query: 504 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 563
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 300

Query: 564 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 623
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 360

Query: 624 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 683
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 420

Query: 684 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 743
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 480

Query: 744 gcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 803
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 540

Query: 804 gaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 863
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 600

Query: 864 aacgatgatctggcagcctga 884
           |||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aacgatgatctggcagcctga 621

2) SF0476 in NC_004337


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 1221 bits (3150), Expect = 0.0
 Identities = 621/621 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 49  atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 108
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 60

Query: 109 cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 168
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 120

Query: 169 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcg 228
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcg 180

Query: 229 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaa 288
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaa 240

Query: 289 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 348
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 300

Query: 349 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 408
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 360

Query: 409 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 468
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 420

Query: 469 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 528
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 480

Query: 529 gcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 588
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 540

Query: 589 gaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 648
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 600

Query: 649 aacgatgatctggcagcctga 669
           |||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aacgatgatctggcagcctga 621

3) SF2212 in NC_004337


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 1218 bits (3144), Expect = 0.0
 Identities = 620/621 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 264 atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcggc 323
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 1   atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 60

Query: 324 cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 383
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 120

Query: 384 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcg 443
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcg 180

Query: 444 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaa 503
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaa 240

Query: 504 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 563
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 300

Query: 564 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 623
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 360

Query: 624 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 683
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 420

Query: 684 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 743
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 480

Query: 744 gcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 803
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 540

Query: 804 gaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 863
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 600

Query: 864 aacgatgatctggcagcctga 884
           |||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aacgatgatctggcagcctga 621

4) SF3705 in NC_004337


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 1218 bits (3143), Expect = 0.0
 Identities = 620/621 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 264 atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 323
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 60

Query: 324 cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 383
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 120

Query: 384 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcg 443
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcg 180

Query: 444 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaa 503
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaa 240

Query: 504 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 563
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 300

Query: 564 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggtctacacacagcggcttaag 623
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 360

Query: 624 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 683
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 420

Query: 684 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 743
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 480

Query: 744 gcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 803
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 540

Query: 804 gaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 863
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 600

Query: 864 aacgatgatctggcagcctga 884
           |||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aacgatgatctggcagcctga 621

5) SF0228 in NC_004337


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 1216 bits (3139), Expect = 0.0
 Identities = 620/621 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 264 atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 323
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 60

Query: 324 cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 383
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 120

Query: 384 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcg 443
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcg 180

Query: 444 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaa 503
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaa 240

Query: 504 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 563
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 300

Query: 564 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 623
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 360

Query: 624 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 683
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 420

Query: 684 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 743
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 480

Query: 744 gcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgcag 803
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 481 gcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 540

Query: 804 gaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 863
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 600

Query: 864 aacgatgatctggcagcctga 884
           |||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aacgatgatctggcagcctga 621

6) SF1049 in NC_004337


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 1214 bits (3133), Expect = 0.0
 Identities = 619/621 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 264 atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaagtccgtacgaccatcagc 323
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 60

Query: 324 cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 383
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 120

Query: 384 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcg 443
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcg 180

Query: 444 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaa 503
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaa 240

Query: 504 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 563
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 300

Query: 564 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 623
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 360

Query: 624 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 683
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 420

Query: 684 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 743
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 480

Query: 744 gcagaagtggaactggccacactcacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 803
           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 540

Query: 804 gaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 863
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 600

Query: 864 aacgatgatctggcagcctga 884
           |||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aacgatgatctggcagcctga 621

7) SF1057 in NC_004337


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 1210 bits (3122), Expect = 0.0
 Identities = 618/621 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 264 atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcggc 323
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 1   atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 60

Query: 324 cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 383
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 120

Query: 384 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcg 443
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcg 180

Query: 444 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaa 503
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaa 240

Query: 504 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 563
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 300

Query: 564 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 623
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 360

Query: 624 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 683
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 420

Query: 684 gagagcatcaatggtctttacaaatcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 743
           |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 480

Query: 744 gcagaagtggaactggccacactcacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 803
           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 540

Query: 804 gaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 863
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 600

Query: 864 aacgatgatctggcagcctga 884
           |||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aacgatgatctggcagcctga 621

8) SFxv_4032 in NC_017328


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 1209 bits (3121), Expect = 0.0
 Identities = 620/622 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 28  atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 87
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 60

Query: 88  cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 147
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 120

Query: 148 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcg 207
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcg 180

Query: 208 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtgggggtggcgggtctcatcgtccatgga 267
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtgggg-tggcgggtctcatcgtccatgga 239

Query: 268 aacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcac 327
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 240 aacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcac 299

Query: 328 ggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggtctacacacagcggcttaa 387
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 300 ggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaa 359

Query: 388 ggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggc 447
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 360 ggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggc 419

Query: 448 ggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccg 507
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 420 ggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccg 479

Query: 508 tgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgct 567
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 tgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgct 539

Query: 568 ggaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgg 627
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 540 ggaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgg 599

Query: 628 aaacgatgatctggcagcctga 649
           ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 aaacgatgatctggcagcctga 621

9) SF0300 in NC_004337


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 1209 bits (3119), Expect = 0.0
 Identities = 617/621 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 264 atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcggc 323
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 1   atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 60

Query: 324 cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 383
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 120

Query: 384 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcg 443
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcg 180

Query: 444 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaa 503
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaa 240

Query: 504 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 563
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 300

Query: 564 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 623
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 360

Query: 624 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 683
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 420

Query: 684 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaactgt 743
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 421 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 480

Query: 744 gcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgccg 803
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 481 gcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 540

Query: 804 gaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 863
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 600

Query: 864 aacgatgatctgtcagcctga 884
           |||||||||||| ||||||||
Sbjct: 601 aacgatgatctggcagcctga 621

10) SF0491 in NC_004337


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 1209 bits (3119), Expect = 0.0
 Identities = 617/621 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 264 atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtatgaccatcagc 323
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 1   atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 60

Query: 324 cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 383
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 120

Query: 384 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcagggcttcgtctatgtggcg 443
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcg 180

Query: 444 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaa 503
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaa 240

Query: 504 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 563
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 300

Query: 564 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 623
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 360

Query: 624 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 683
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 420

Query: 684 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 743
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 480

Query: 744 gcagaagtggaactggccacactcacgtgggtggactggtataataatcgacgattgctg 803
           ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 481 gcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 540

Query: 804 gaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 863
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 600

Query: 864 aacgatgatctggcagcctga 884
           |||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aacgatgatctggcagcctga 621

11) unnamed in NC_007607


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 1201 bits (3099), Expect = 0.0
 Identities = 614/621 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 55  atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 114
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 60

Query: 115 cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 174
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 120

Query: 175 cagctgcgggtggctgattttacttacgccagcacatggcagggcttcgtctatgtggcg 234
           |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcg 180

Query: 235 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaa 294
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaa 240

Query: 295 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 354
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 300

Query: 355 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 414
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 360

Query: 415 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 474
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 420

Query: 475 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 534
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 480

Query: 535 gcagaagtggaactggccacactcacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 594
           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 540

Query: 595 gaaaggctgggccatactcctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 654
           |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 600

Query: 655 aacgatgatctggcagcctga 675
           |||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aacgatgatctggcagcctga 621

12) SbBS512_A0059 in NC_010660


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 1198 bits (3092), Expect = 0.0
 Identities = 613/621 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 49  atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 108
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 60

Query: 109 cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 168
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 120

Query: 169 cagctgtgggtagctgattttacttacgtcagcacatggcagggcttcgtctatgtggcg 228
           ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcg 180

Query: 229 ttcatcattgatgtgtttgccggatacattgtggggtggcgggtctcatcgtccatggag 288
           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct: 181 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaa 240

Query: 289 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 348
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 300

Query: 349 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 408
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 360

Query: 409 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 468
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 420

Query: 469 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 528
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 480

Query: 529 gcagaagtggaactggccacactcacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 588
           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 540

Query: 589 gaaaggctgggccatactcctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 648
           |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 600

Query: 649 aacgatgatctggcagcctga 669
           |||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aacgatgatctggcagcctga 621

13) SbBS512_A0081 in NC_010660


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 1198 bits (3092), Expect = 0.0
 Identities = 613/621 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 49  atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 108
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 60

Query: 109 cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 168
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 120

Query: 169 cagctgtgggtagctgattttacttacgtcagcacatggcagggcttcgtctatgtggcg 228
           ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcg 180

Query: 229 ttcatcattgatgtgtttgccggatacattgtggggtggcgggtctcatcgtccatggag 288
           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct: 181 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaa 240

Query: 289 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 348
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 300

Query: 349 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 408
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 360

Query: 409 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 468
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 420

Query: 469 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 528
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 480

Query: 529 gcagaagtggaactggccacactcacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 588
           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 540

Query: 589 gaaaggctgggccatactcctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 648
           |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 600

Query: 649 aacgatgatctggcagcctga 669
           |||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aacgatgatctggcagcctga 621

14) unnamed in NC_013364


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 1146 bits (2958), Expect = 0.0
 Identities = 596/621 (96%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 110 atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 169
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 60

Query: 170 cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 229
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 120

Query: 230 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcagggcttcgtctatgtggcg 289
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcg 180

Query: 290 tttatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtctatggaa 349
           || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 181 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaa 240

Query: 350 acgacattcgtgctggatgcgctggagcaggcgttgtgggcccgtcgtccgtctggcacc 409
           |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| 
Sbjct: 241 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 300

Query: 410 atccatcacagcgataaaggctctcagtatgtgtcactggcctatacggagcgactaaaa 469
            |||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||  |||| || || 
Sbjct: 301 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 360

Query: 470 gaagccggattactggcatcaacagggagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggct 529
           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct: 361 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 420

Query: 530 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 589
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 480

Query: 590 gcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 649
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 540

Query: 650 ggaaggctgggccatactcctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 709
           | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 600

Query: 710 aacgatgatctggcagcctga 730
           |||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aacgatgatctggcagcctga 621

15) ECO111_4885 in NC_013364


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 1146 bits (2958), Expect = 0.0
 Identities = 596/621 (96%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 112 atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 171
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 60

Query: 172 cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 231
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 120

Query: 232 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcagggcttcgtctatgtggcg 291
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcg 180

Query: 292 tttatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtctatggaa 351
           || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 181 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaa 240

Query: 352 acgacattcgtgctggatgcgctggagcaggcgttgtgggcccgtcgtccgtctggcacc 411
           |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| 
Sbjct: 241 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 300

Query: 412 atccatcacagcgataaaggctctcagtatgtgtcactggcctatacggagcgactaaaa 471
            |||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||  |||| || || 
Sbjct: 301 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 360

Query: 472 gaagccggattactggcatcaacagggagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggct 531
           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct: 361 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 420

Query: 532 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 591
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 480

Query: 592 gcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 651
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 540

Query: 652 ggaaggctgggccatactcctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 711
           | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 600

Query: 712 aacgatgatctggcagcctga 732
           |||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aacgatgatctggcagcctga 621

16) unnamed in NC_007607


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 1123 bits (2897), Expect = 0.0
 Identities = 574/580 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   ggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagtt 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 42  ggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagtt 101

Query: 61  cgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggca 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct: 102 cgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcg 161

Query: 121 gggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcg 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 162 gggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcg 221

Query: 181 ggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggc 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 222 ggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggc 281

Query: 241 ccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggc 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 282 ccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggc 341

Query: 301 ctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactc 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 342 ctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactc 401

Query: 361 gtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccg 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 402 gtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccg 461

Query: 421 taagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactcacgtgggtggactggta 480
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 462 taagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggta 521

Query: 481 taacaatcgacgattgctggaaaggctgggctatactcctccggcagaagcagaaaaagc 540
           ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 522 taacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagc 581

Query: 541 ttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 580
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 582 ttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 621

17) unnamed in NC_013353


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 1111 bits (2867), Expect = 0.0
 Identities = 587/621 (95%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 222 atggcggttatggggcttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgcactaccgtcagc 281
           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||
Sbjct: 1   atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 60

Query: 282 cggaaagccattaccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcggggcagaacgtcctgac 341
           ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct: 61  cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 120

Query: 342 cagttgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcagggcttcgtttatgtggcg 401
           ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct: 121 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcg 180

Query: 402 ttcatcattgatgtgttcgccggatacatcgtgggatggcgggtctcatcgtccatggaa 461
           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaa 240

Query: 462 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcagtatgggaccgtcgtccgtctggcact 521
           ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||| 
Sbjct: 241 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 300

Query: 522 atccatcactgtgataaaggttctctgtatgtatcgctggcctacacgcagcggcttaag 581
            |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 301 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 360

Query: 582 gaagcaggattactggcatcaacagggagcacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 641
           ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 420

Query: 642 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaatagctggaaaaaccgg 701
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| 
Sbjct: 421 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 480

Query: 702 acagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 761
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 540

Query: 762 ggaaggctggatcatatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcaga 821
           | ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 541 gaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 600

Query: 822 aacgatgatctggcagcctga 842
           |||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aacgatgatctggcagcctga 621

18) unnamed in NC_013353


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 1111 bits (2867), Expect = 0.0
 Identities = 587/621 (95%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 222 atggcggttatggggcttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgcactaccgtcagc 281
           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||
Sbjct: 1   atggcggttatgggacttgccggtgttctccggggtaaaaaggtccgtacgaccatcagc 60

Query: 282 cggaaagccattaccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcggggcagaacgtcctgac 341
           ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct: 61  cggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagttcgtggcagaacgacctgac 120

Query: 342 cagttgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcagggcttcgtttatgtggcg 401
           ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct: 121 cagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcg 180

Query: 402 ttcatcattgatgtgttcgccggatacatcgtgggatggcgggtctcatcgtccatggaa 461
           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaa 240

Query: 462 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcagtatgggaccgtcgtccgtctggcact 521
           ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||| 
Sbjct: 241 acgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacg 300

Query: 522 atccatcactgtgataaaggttctctgtatgtatcgctggcctacacgcagcggcttaag 581
            |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 301 gtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcggcttaag 360

Query: 582 gaagcaggattactggcatcaacagggagcacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 641
           ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcg 420

Query: 642 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaatagctggaaaaaccgg 701
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| 
Sbjct: 421 gagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgt 480

Query: 702 acagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 761
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacgattgctg 540

Query: 762 ggaaggctggatcatatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcaga 821
           | ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 541 gaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttccatcgga 600

Query: 822 aacgatgatctggcagcctga 842
           |||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aacgatgatctggcagcctga 621

19) unnamed in NC_013353


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 953 bits (2458), Expect = e-278
 Identities = 499/527 (95%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   gtcagttcgtggcagaacgtcctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagca 60
           ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 95  gtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagca 154

Query: 61  catggcagggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatgtatcgtgg 120
           |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||
Sbjct: 155 catggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtgg 214

Query: 121 ggtggcgagtctcatcgtctatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgt 180
           ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 215 ggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgt 274

Query: 181 tgtgggcccgtcggccgtccggcacagtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtat 240
           | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 275 tatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtat 334

Query: 241 cactggcctatacggagcgactaaaagaagcaaaactgctggcatcaacagggagtacag 300
           | |||||||| ||  |||| || || |||||   | | |||||||||||||| |||||||
Sbjct: 335 cgctggcctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacag 394

Query: 301 gtgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaa 360
           | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 395 gcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaa 454

Query: 361 tacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactcacgtgggtgg 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 455 tacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtgg 514

Query: 421 actggtataacaatcgacgattgctgggaaggctgggtcatatccctccggcagaagcag 480
           ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct: 515 actggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagcag 574

Query: 481 aaaaagcttattatgcttccatcagaaacgatgatctggcagcctga 527
           ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 575 aaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 621

20) ECO103_3568 in NC_013353


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 953 bits (2458), Expect = e-278
 Identities = 499/527 (95%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 137 gtcagttcgtggcagaacgtcctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagca 196
           ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 95  gtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagca 154

Query: 197 catggcagggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatgtatcgtgg 256
           |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||
Sbjct: 155 catggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtgg 214

Query: 257 ggtggcgagtctcatcgtctatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgt 316
           ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 215 ggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgt 274

Query: 317 tgtgggcccgtcggccgtccggcacagtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtat 376
           | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 275 tatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtat 334

Query: 377 cactggcctatacggagcgactaaaagaagcaaaactgctggcatcaacagggagtacag 436
           | |||||||| ||  |||| || || |||||   | | |||||||||||||| |||||||
Sbjct: 335 cgctggcctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacag 394

Query: 437 gtgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaa 496
           | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 395 gcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaa 454

Query: 497 tacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactcacgtgggtgg 556
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 455 tacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtgg 514

Query: 557 actggtataacaatcgacgattgctgggaaggctgggtcatatccctccggcagaagcag 616
           ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct: 515 actggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagcag 574

Query: 617 aaaaagcttattatgcttccatcagaaacgatgatctggcagcctga 663
           ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 575 aaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 621

21) ECUMN_3342 in NC_011751


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 907 bits (2339), Expect = e-264
 Identities = 482/519 (93%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   gtggcagaacgtcctgaccagctgtgggtggctgattttaattacgtcagcacatggcag 60
           ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct: 103 gtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcgg 162

Query: 61  ggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggtgg 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 163 ggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgg 222

Query: 121 gtctcatcgtctatggaaacgacattcatgctggatgcgctggagcaggcgttgtgggcc 180
           ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct: 223 gtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcc 282

Query: 181 cgccgtccgtccggcaccatccatcacagcgataaaggctctcagtatgtgtcactggcc 240
           || || |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||
Sbjct: 283 cgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcc 342

Query: 241 tatatggagcgattaaaagaagcaaaactgctggcatcaacagggagtacaggcgactcg 300
           || |   ||||  | || |||||   | | |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 343 tacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcg 402

Query: 301 tatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgt 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 403 tatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgt 462

Query: 361 aagatctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactcacgtgggtggactggtat 420
           |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 463 aagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtat 522

Query: 421 aacaatcgacgattgctgggaaggctgggccatactcctccggcagaagcagaaaaagct 480
           ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 523 aacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagct 582

Query: 481 tattatgcttccatcggaaacaatgatctggcagcctga 519
           ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 583 tattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 621

22) EcE24377A_D0056 in NC_009788


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 870 bits (2244), Expect = e-253
 Identities = 444/447 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   gtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtcc 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 175 gtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtcc 234

Query: 61  atggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtcc 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 235 atggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtcc 294

Query: 121 ggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcgg 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 295 ggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcgg 354

Query: 181 cttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcg 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 355 cttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcg 414

Query: 241 atggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaa 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 415 atggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaa 474

Query: 301 aaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacga 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 475 aaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacga 534

Query: 361 ttgctggaaaggctgggccatactcctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttcc 420
           |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 535 ttgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttcc 594

Query: 421 atcggaaacgatgatctggcagcctga 447
           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 595 atcggaaacgatgatctggcagcctga 621

23) EC55989_4640 in NC_011748


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 866 bits (2233), Expect = e-252
 Identities = 443/447 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   gtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtcc 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 175 gtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtcc 234

Query: 61  atggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtcc 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 235 atggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtcc 294

Query: 121 ggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcgg 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 295 ggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcgg 354

Query: 181 cttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcg 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 355 cttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcg 414

Query: 241 atggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaa 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 415 atggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaa 474

Query: 301 aaccgtgcagaagtggaactggccacactcacgtgggtggactggtataacaatcgacga 360
           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 475 aaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacga 534

Query: 361 ttgctggaaaggctgggccatactcctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttcc 420
           |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 535 ttgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttcc 594

Query: 421 atcggaaacgatgatctggcagcctga 447
           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 595 atcggaaacgatgatctggcagcctga 621

24) EC55989_4651 in NC_011748


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 866 bits (2233), Expect = e-252
 Identities = 443/447 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   gtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtcc 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 175 gtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtcc 234

Query: 61  atggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtcc 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 235 atggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtcc 294

Query: 121 ggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcgg 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 295 ggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcgg 354

Query: 181 cttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcg 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 355 cttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcg 414

Query: 241 atggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaa 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 415 atggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaa 474

Query: 301 aaccgtgcagaagtggaactggccacactcacgtgggtggactggtataacaatcgacga 360
           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 475 aaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacga 534

Query: 361 ttgctggaaaggctgggccatactcctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttcc 420
           |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 535 ttgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttcc 594

Query: 421 atcggaaacgatgatctggcagcctga 447
           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 595 atcggaaacgatgatctggcagcctga 621

25) EC55989_4675 in NC_011748


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 866 bits (2233), Expect = e-252
 Identities = 443/447 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   gtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtcc 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 175 gtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtcc 234

Query: 61  atggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtcc 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 235 atggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtcc 294

Query: 121 ggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcgg 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 295 ggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcgg 354

Query: 181 cttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcg 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 355 cttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcg 414

Query: 241 atggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaa 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 415 atggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaa 474

Query: 301 aaccgtgcagaagtggaactggccacactcacgtgggtggactggtataacaatcgacga 360
           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 475 aaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacga 534

Query: 361 ttgctggaaaggctgggccatactcctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttcc 420
           |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 535 ttgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttcc 594

Query: 421 atcggaaacgatgatctggcagcctga 447
           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 595 atcggaaacgatgatctggcagcctga 621

26) EcE24377A_4840 in NC_009801


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 866 bits (2233), Expect = e-252
 Identities = 443/447 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   gtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtcc 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 175 gtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtcc 234

Query: 61  atggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtcc 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 235 atggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtcc 294

Query: 121 ggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcgg 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 295 ggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcgg 354

Query: 181 cttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcg 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 355 cttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcg 414

Query: 241 atggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaa 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 415 atggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaa 474

Query: 301 aaccgtgcagaagtggaactggccacactcacgtgggtggactggtataacaatcgacga 360
           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 475 aaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacga 534

Query: 361 ttgctggaaaggctgggccatactcctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttcc 420
           |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 535 ttgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttcc 594

Query: 421 atcggaaacgatgatctggcagcctga 447
           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 595 atcggaaacgatgatctggcagcctga 621

27) unnamed in NC_017646


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 814 bits (2100), Expect = e-236
 Identities = 437/473 (92%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   tcagcacatggcagggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggataca 60
           |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 149 tcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggataca 208

Query: 61  tcgtgggggggcgggtatcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcgctggagc 120
           |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 209 tcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagc 268

Query: 121 aggcgttgtgggcccatcgtccgtccggcaccatccatcacagcgataaaggctctcagt 180
           ||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct: 269 aggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagt 328

Query: 181 atgtgtcactggcctatacggagcgattaaaagaagcaaaactgctggcatcaacaggaa 240
           |||| || |||||||| ||  ||||  | || |||||   | | ||||||||||||||||
Sbjct: 329 atgtatcgctggcctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaa 388

Query: 241 gtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcgg 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 389 gtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcgg 448

Query: 301 aggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactgtccacactcacgt 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct: 449 aggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgt 508

Query: 361 gggtggactggtataacaatcgacgattgctgggaaggctgaggcatactcctccggcag 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |  ||||||||||
Sbjct: 509 gggtggactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcag 568

Query: 421 aagcagaaaaagcgtattatgcttccatcggaaatgatgagctggcagcctga 473
           ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct: 569 aagcagaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 621

28) EcE24377A_E0017 in NC_009790


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 806 bits (2079), Expect = e-234
 Identities = 423/447 (95%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   gtggcgtttatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtct 60
           |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct: 175 gtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtcc 234

Query: 61  atggaaacgacattcgtgctggatgcgctggagcaggcgttgtgggcccgtcgtccgtct 120
           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| 
Sbjct: 235 atggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtcc 294

Query: 121 ggcaccatccatcacagcgataaaggctctcagtatgtgtcactggcctatacggagcga 180
           |||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||  |||| 
Sbjct: 295 ggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcgg 354

Query: 181 ctaaaagaagccggattactggcatcaacagggagtacaggcgactcgtatgacaacgcg 240
           || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 355 cttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcg 414

Query: 241 atggctgagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaa 300
           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 415 atggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaa 474

Query: 301 aaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacga 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 475 aaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacga 534

Query: 361 ttgctgggaaggctgggccatactcctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttcc 420
           ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 535 ttgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttcc 594

Query: 421 atcggaaacgatgatctggcagcctga 447
           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 595 atcggaaacgatgatctggcagcctga 621

29) EcE24377A_E0024 in NC_009790


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 806 bits (2079), Expect = e-234
 Identities = 423/447 (95%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   gtggcgtttatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtct 60
           |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct: 175 gtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtcc 234

Query: 61  atggaaacgacattcgtgctggatgcgctggagcaggcgttgtgggcccgtcgtccgtct 120
           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| 
Sbjct: 235 atggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtcc 294

Query: 121 ggcaccatccatcacagcgataaaggctctcagtatgtgtcactggcctatacggagcga 180
           |||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||  |||| 
Sbjct: 295 ggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcgg 354

Query: 181 ctaaaagaagccggattactggcatcaacagggagtacaggcgactcgtatgacaacgcg 240
           || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 355 cttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcg 414

Query: 241 atggctgagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaa 300
           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 415 atggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaa 474

Query: 301 aaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacga 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 475 aaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacga 534

Query: 361 ttgctgggaaggctgggccatactcctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttcc 420
           ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 535 ttgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttcc 594

Query: 421 atcggaaacgatgatctggcagcctga 447
           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 595 atcggaaacgatgatctggcagcctga 621

30) SF2974 in NC_004337


>AF141323|7|G7|5532452|AAD44736.1|Shigella_flexneri_5a_str._M90T|-|5838..6458|tnpC|-|TnpC 
          Length = 621

 Score = 748 bits (1931), Expect = e-216
 Identities = 407/447 (91%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   gtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtgtggtgacgagtctcatcgtct 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| 
Sbjct: 175 gtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgggtctcatcgtcc 234

Query: 61  atggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttgtgggcccgtcgtccgtct 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| 
Sbjct: 235 atggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgtcc 294

Query: 121 ggcaccatccatcacagcgataaaggctctcagtatgtgtcactggcctataaggcgcga 180
           |||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |    ||| 
Sbjct: 295 ggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagcgg 354

Query: 181 ctaaaagaagcaaaactgctggcatcaacagggagtactggtgactcgtatgacaacgcg 240
           || || |||||   | | |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct: 355 cttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacgcg 414

Query: 241 atggcagagatcatcaagggcctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaa 300
           ||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 415 atggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctggaaa 474

Query: 301 aaccggacagaagtggagctggccacactcacgtgggtggactggtataacaatcgacga 360
           |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 475 aaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgacga 534

Query: 361 ttgctggaaaggctgggccatatcccaccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttcc 420
           |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 535 ttgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgcttcc 594

Query: 421 atcggaaatgatgatctggcagcctga 447
           |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 595 atcggaaacgatgatctggcagcctga 621