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Homologs of SE0090 gene of NC_004461_R1

DNA-level

Hit (GenBank Accn)

Product

Source Genome

Eval.

Ident.(%)

1) SERP2219
( - )

NC_002976
(Staphylococcus epidermidis RP62A)

0.0

99.1

2) SAUSA300_0069
( - )

NC_007793
(Staphylococcus aureus FPR3757)

0.0

3) USA300HOU_0074
( - )

NC_010079
(Staphylococcus aureus TCH1516)

0.0

4) SEA0032
( - )

NC_006663
(Staphylococcus epidermidis RP62A)

0.0

97.6

5) unnamed
( - )

NC_002952
(Staphylococcus aureus MRSA252)

e-295

86.5

6) unnamed
( - )

NC_002952
(Staphylococcus aureus MRSA252)

e-295

86.5

• Sequence Alignments

1) SERP2219 in NC_002976


>NC_004461_R1|68|G68|27467008|NP_763645.1|Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228|-|57140..57814|-|SE0090|transposase 
          Length = 675

 Score = 1274 bits (3288), Expect = 0.0
 Identities = 668/675 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaagatgttatcactgtagccgttggctac 60
           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctac 60

Query: 61  tatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  tatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120

Query: 121 aacgttcatcattcaacggtctaccgttgggttcaagaatatgtctcaattttatatcaa 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
Sbjct: 121 aacgttcatcattcaacggtctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcga 180

Query: 181 atttggaagaaaa-gcatcaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtacatc 239
           ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 atttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtacatc 240

Query: 240 aaaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatgcagagggacatacatta 299
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aaaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatgcagagggacatacatta 300

Query: 300 gatatttggttgcgtaagcaacgagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctc 359
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 360 attaaacaatttggtaaacctcaaaaggtaattacagatcaggcaccttcaacgaaggta 419
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 420 gcaatggctaaagtaattaaagcttttaaacttaaacctgactgtcattgtacatcgaaa 479
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 480 tatctgaataacctcattgagcaagatcaccgtcatattaaagtaagaaagacaaggtat 539
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 540 caaagtatcaatacagcaaagaatactttaaaaggtattgaatgtatttacgctctatat 599
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 600 aaaaagaaccgcaggtctcttcagatctacggattttcgccatgccacgaaattagcatc 659
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 660 atgctagcgagttaa 674
           |||||||| ||||||
Sbjct: 661 atgctagcaagttaa 675

2) SAUSA300_0069 in NC_007793


>NC_004461_R1|68|G68|27467008|NP_763645.1|Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228|-|57140..57814|-|SE0090|transposase 
          Length = 675

 Score = 1271 bits (3280), Expect = 0.0
 Identities = 667/675 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctac 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctac 60

Query: 61  tatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  tatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120

Query: 121 aacgttcatcattcaacggtctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaa 180
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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Query: 181 atttggaagaaaaagcataaaaa-gctaattacaaatggcgtattgatgagacgtacatc 239
           ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 atttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtacatc 240

Query: 240 aaaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatgcagagggatatacatta 299
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 241 aaaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatgcagagggacatacatta 300

Query: 300 gatatttggttgcgtaagcaacgagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctc 359
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gatatttggttgcgtaagcaacgagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctc 360

Query: 360 attaaacaatttggtaaacctcaaaaggtaattacagatcaggcaccttcaacgaaggta 419
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 attaaacaatttggtaaacctcaaaaggtaattacagatcaggcaccttcaacgaaggta 420

Query: 420 gcaatggctaaagtaattaaagcttttaaacttaaacctgactgttattgtacatcgaaa 479
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 421 gcaatggctaaagtaattaaagcttttaaacttaaacctgactgtcattgtacatcgaaa 480

Query: 480 tatctgaataacctcattgagcaagatcactgtcatattaaaataagaaagacaaggtat 539
           |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 481 tatctgaataacctcattgagcaagatcaccgtcatattaaagtaagaaagacaaggtat 540

Query: 540 caaaatatcaatacagcaaagaatactttaaaaggtattgaatgtatttacgctctatat 599
           |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 600 aaaaagaaccgcaggtctcttcagatctacggattttcgccatgccacgaaattagcatc 659
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 660 atgctagcaagttaa 674
           |||||||||||||||
Sbjct: 661 atgctagcaagttaa 675

3) USA300HOU_0074 in NC_010079


>NC_004461_R1|68|G68|27467008|NP_763645.1|Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228|-|57140..57814|-|SE0090|transposase 
          Length = 675

 Score = 1271 bits (3280), Expect = 0.0
 Identities = 667/675 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctac 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctac 60

Query: 61  tatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  tatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120

Query: 121 aacgttcatcattcaacggtctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaa 180
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 121 aacgttcatcattcaacggtctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcga 180

Query: 181 atttggaagaaaaagcataaaaa-gctaattacaaatggcgtattgatgagacgtacatc 239
           ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 atttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtacatc 240

Query: 240 aaaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatgcagagggatatacatta 299
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 241 aaaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatgcagagggacatacatta 300

Query: 300 gatatttggttgcgtaagcaacgagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctc 359
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 360 attaaacaatttggtaaacctcaaaaggtaattacagatcaggcaccttcaacgaaggta 419
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 attaaacaatttggtaaacctcaaaaggtaattacagatcaggcaccttcaacgaaggta 420

Query: 420 gcaatggctaaagtaattaaagcttttaaacttaaacctgactgttattgtacatcgaaa 479
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
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Query: 480 tatctgaataacctcattgagcaagatcactgtcatattaaaataagaaagacaaggtat 539
           |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 481 tatctgaataacctcattgagcaagatcaccgtcatattaaagtaagaaagacaaggtat 540

Query: 540 caaaatatcaatacagcaaagaatactttaaaaggtattgaatgtatttacgctctatat 599
           |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 600 aaaaagaaccgcaggtctcttcagatctacggattttcgccatgccacgaaattagcatc 659
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aaaaagaaccgcaggtctcttcagatctacggattttcgccatgccacgaaattagcatc 660

Query: 660 atgctagcaagttaa 674
           |||||||||||||||
Sbjct: 661 atgctagcaagttaa 675

4) SEA0032 in NC_006663


>NC_004461_R1|68|G68|27467008|NP_763645.1|Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228|-|57140..57814|-|SE0090|transposase 
          Length = 675

 Score = 1259 bits (3248), Expect = 0.0
 Identities = 659/675 (98%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctac 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctac 60

Query: 61  tatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgta 120
           |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 61  tatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120

Query: 121 aacgttcatcattcaacgatctaccgttgagttcaagaatatgccccaattttatatcaa 180
           |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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Query: 181 atttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtatatc 240
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 181 atttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtacatc 240

Query: 241 aaaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatacagagggacatacatta 300
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 241 aaaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatgcagagggacatacatta 300

Query: 301 gatatttggttgcgtaagcaacgagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctc 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gatatttggttgcgtaagcaacgagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctc 360

Query: 361 attaaacaatttggtaagcctcaaaaggtagttacagatcaggcaccttcaacgaaggca 420
           ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 361 attaaacaatttggtaaacctcaaaaggtaattacagatcaggcaccttcaacgaaggta 420

Query: 421 gcaatggctaaagtaattaaagcttttaaacttaaacctgactgtcattgtacatcgaaa 480
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gcaatggctaaagtaattaaagcttttaaacttaaacctgactgtcattgtacatcgaaa 480

Query: 481 tatctgaataacctcattgagcaagatcaccgtcatattaaagtaagaaagacaagatat 540
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
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           |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 601 aaaaagaaccgtaggtctcttcagatctacggattttctccatgccacgaaattagcatc 660
           ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aaaaagaaccgcaggtctcttcagatctacggattttcgccatgccacgaaattagcatc 660

Query: 661 atgctagcaagttaa 675
           |||||||||||||||
Sbjct: 661 atgctagcaagttaa 675

5) unnamed in NC_002952


>NC_004461_R1|68|G68|27467008|NP_763645.1|Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228|-|57140..57814|-|SE0090|transposase 
          Length = 675

 Score = 1011 bits (2609), Expect = e-295
 Identities = 584/675 (87%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 59  atgaattatttcagatataagcaatttgacaaagatgtcattactgtagccgttggctac 118
           ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctac 60

Query: 119 tatctaagatatgcattaagttatcgtgatatatctgaaatattgagagaacgaggcatc 178
           ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  | 
Sbjct: 61  tatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120

Query: 179 tatgttcatcattcaacaatttatcgatgggtacaggaatatgctcctattttgtatcaa 238
            | ||||||||||||||  | || || ||||| || |||||||| || ||||| |||| |
Sbjct: 121 aacgttcatcattcaacggtctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcga 180

Query: 239 atttggaagaaaaagaataagcaagcttattataaatggcatatagatgagacgtatatc 298
           ||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||
Sbjct: 181 atttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtacatc 240

Query: 299 aaaattaaagggcaatggaattatttatatcgcgctattgatgcagatggccatacacta 358
           ||||| |||||  ||||||  ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| ||
Sbjct: 241 aaaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatgcagagggacatacatta 300

Query: 359 gatatttcgttacgtaagaaacgagataatcactcagcatatacgtttattaaacgtctt 418
           ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| 
Sbjct: 301 gatatttggttgcgtaagcaacgagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctc 360

Query: 419 attaaacaatttggcaaacctcaaatgataattacagaccaagccccttcaacgaaggtg 478
           |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||| 
Sbjct: 361 attaaacaatttggtaaacctcaaaaggtaattacagatcaggcaccttcaacgaaggta 420

Query: 479 gcaatgtccaaagtgattaaagattttaaacttacccccaactgtcattgtacctctaaa 538
           |||||| | ||||| ||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||||| || |||
Sbjct: 421 gcaatggctaaagtaattaaagcttttaaacttaaacctgactgtcattgtacatcgaaa 480

Query: 539 tatttaaataatctcattgaacaagatcatcgtcatatcaaagtaaggaaaataagttat 598
           ||| | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || | ||| |||
Sbjct: 481 tatctgaataacctcattgagcaagatcaccgtcatattaaagtaagaaagacaaggtat 540

Query: 599 caaagtatcaatacggcaaagaatacgatcaaaggcattgaatgtatttatggactatat 658
           |||||||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||||| |  ||||||
Sbjct: 541 caaagtatcaatacagcaaagaatactttaaaaggtattgaatgtatttacgctctatat 600

Query: 659 aaaaagaaccgcagatctcttcagatctacgggttttcgccatgccgtgtaattagcatc 718
           |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||
Sbjct: 601 aaaaagaaccgcaggtctcttcagatctacggattttcgccatgccacgaaattagcatc 660

Query: 719 atgctagctagttaa 733
           |||||||| ||||||
Sbjct: 661 atgctagcaagttaa 675

6) unnamed in NC_002952


>NC_004461_R1|68|G68|27467008|NP_763645.1|Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228|-|57140..57814|-|SE0090|transposase 
          Length = 675

 Score = 1011 bits (2609), Expect = e-295
 Identities = 584/675 (87%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 59  atgaattatttcagatataagcaatttgacaaagatgtcattactgtagccgttggctac 118
           ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctac 60

Query: 119 tatctaagatatgcattaagttatcgtgatatatctgaaatattgagagaacgaggcatc 178
           ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  | 
Sbjct: 61  tatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120

Query: 179 tatgttcatcattcaacaatttatcgatgggtacaggaatatgctcctattttgtatcaa 238
            | ||||||||||||||  | || || ||||| || |||||||| || ||||| |||| |
Sbjct: 121 aacgttcatcattcaacggtctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcga 180

Query: 239 atttggaagaaaaagaataagcaagcttattataaatggcatatagatgagacgtatatc 298
           ||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||
Sbjct: 181 atttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtacatc 240

Query: 299 aaaattaaagggcaatggaattatttatatcgcgctattgatgcagatggccatacacta 358
           ||||| |||||  ||||||  ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| ||
Sbjct: 241 aaaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatgcagagggacatacatta 300

Query: 359 gatatttcgttacgtaagaaacgagataatcactcagcatatacgtttattaaacgtctt 418
           ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| 
Sbjct: 301 gatatttggttgcgtaagcaacgagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctc 360

Query: 419 attaaacaatttggcaaacctcaaatgataattacagaccaagccccttcaacgaaggtg 478
           |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||| 
Sbjct: 361 attaaacaatttggtaaacctcaaaaggtaattacagatcaggcaccttcaacgaaggta 420

Query: 479 gcaatgtccaaagtgattaaagattttaaacttacccccaactgtcattgtacctctaaa 538
           |||||| | ||||| ||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||||| || |||
Sbjct: 421 gcaatggctaaagtaattaaagcttttaaacttaaacctgactgtcattgtacatcgaaa 480

Query: 539 tatttaaataatctcattgaacaagatcatcgtcatatcaaagtaaggaaaataagttat 598
           ||| | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || | ||| |||
Sbjct: 481 tatctgaataacctcattgagcaagatcaccgtcatattaaagtaagaaagacaaggtat 540

Query: 599 caaagtatcaatacggcaaagaatacgatcaaaggcattgaatgtatttatggactatat 658
           |||||||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||||| |  ||||||
Sbjct: 541 caaagtatcaatacagcaaagaatactttaaaaggtattgaatgtatttacgctctatat 600

Query: 659 aaaaagaaccgcagatctcttcagatctacgggttttcgccatgccgtgtaattagcatc 718
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