> NC_003198_P8|6|G6|16762942|NP_458559.1|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18|+|14515..21285|STY4459|-|large
repetitive protein
Length=2256
Score = 3300 bits (12548), Expect = 0.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 2256/2256 (100%), Positives = 2256/2256 (100%), Gaps = 0/2256 (0%)
Query 1 MEDLAGNVKESAPLEVRidttttinnivllndtGVQNDQLTNVAKPSFRIDVPGDVVQVR 60
MEDLAGNVKESAPLEVRIDTTTTINNIVLLNDTGVQNDQLTNVAKPSFRIDVPGDVVQVR
Sbjct 1 MEDLAGNVKESAPLEVRIDTTTTINNIVLLNDTGVQNDQLTNVAKPSFRIDVPGDVVQVR 60
Query 61 VTLDGGANWNVIRKNADGQWIFDSPNTLVDGTYTLRVEATDEAGNIANKDLVFNIDTNIQ 120
VTLDGGANWNVIRKNADGQWIFDSPNTLVDGTYTLRVEATDEAGNIANKDLVFNIDTNIQ
Sbjct 61 VTLDGGANWNVIRKNADGQWIFDSPNTLVDGTYTLRVEATDEAGNIANKDLVFNIDTNIQ 120
Query 121 VPTIALDAGQDTGANTADNITNISRPTFTIGNVDPDVIKVVVTIDGHDYNATKVGAGWQF 180
VPTIALDAGQDTGANTADNITNISRPTFTIGNVDPDVIKVVVTIDGHDYNATKVGAGWQF
Sbjct 121 VPTIALDAGQDTGANTADNITNISRPTFTIGNVDPDVIKVVVTIDGHDYNATKVGAGWQF 180
Query 181 TPGNAIPDGSYNITVTVEDKAGNTATSKPLPVVIDTTAEIESVTLVTDSGDSDVDNITKV 240
TPGNAIPDGSYNITVTVEDKAGNTATSKPLPVVIDTTAEIESVTLVTDSGDSDVDNITKV
Sbjct 181 TPGNAIPDGSYNITVTVEDKAGNTATSKPLPVVIDTTAEIESVTLVTDSGDSDVDNITKV 240
Query 241 DKPQFSIVTADDITHVRVKIDNAANWIELTKGGDGRWIFNVGSALPDGQHTLLVDVTDIA 300
DKPQFSIVTADDITHVRVKIDNAANWIELTKGGDGRWIFNVGSALPDGQHTLLVDVTDIA
Sbjct 241 DKPQFSIVTADDITHVRVKIDNAANWIELTKGGDGRWIFNVGSALPDGQHTLLVDVTDIA 300
Query 301 GNVAQETLQFTIDTTLREPTIVLDPTHDTGDDTNDNLTRINKPVFIIGNVDNDVSHIVVH 360
GNVAQETLQFTIDTTLREPTIVLDPTHDTGDDTNDNLTRINKPVFIIGNVDNDVSHIVVH
Sbjct 301 GNVAQETLQFTIDTTLREPTIVLDPTHDTGDDTNDNLTRINKPVFIIGNVDNDVSHIVVH 360
Query 361 LDGRDYTIENKGGNLTFTPDQPLSDGQHTISVTVTDIAGNTKTSAELQIEIDTQVQIDSV 420
LDGRDYTIENKGGNLTFTPDQPLSDGQHTISVTVTDIAGNTKTSAELQIEIDTQVQIDSV
Sbjct 361 LDGRDYTIENKGGNLTFTPDQPLSDGQHTISVTVTDIAGNTKTSAELQIEIDTQVQIDSV 420
Query 421 TLTTDSGVNDHDNVTNATRPSFEIATPDDVTSVLVSFDGVNWTPISKNAAGQWQFTAGSA 480
TLTTDSGVNDHDNVTNATRPSFEIATPDDVTSVLVSFDGVNWTPISKNAAGQWQFTAGSA
Sbjct 421 TLTTDSGVNDHDNVTNATRPSFEIATPDDVTSVLVSFDGVNWTPISKNAAGQWQFTAGSA 480
Query 481 LSDGHYTLHVQATDRAGNTANSTLGFTVDTQIDGLSVVMLDDAGKDSTDGITNITSPRFE 540
LSDGHYTLHVQATDRAGNTANSTLGFTVDTQIDGLSVVMLDDAGKDSTDGITNITSPRFE
Sbjct 481 LSDGHYTLHVQATDRAGNTANSTLGFTVDTQIDGLSVVMLDDAGKDSTDGITNITSPRFE 540
Query 541 ISAREQLQSVTVILNGKSSTLTQGAGNKWLFTPDTPLVDGTYKIEIVAEDIAGNKISKEV 600
ISAREQLQSVTVILNGKSSTLTQGAGNKWLFTPDTPLVDGTYKIEIVAEDIAGNKISKEV
Sbjct 541 ISAREQLQSVTVILNGKSSTLTQGAGNKWLFTPDTPLVDGTYKIEIVAEDIAGNKISKEV 600
Query 601 SFTIDTIVSDPSIDLLDADDTGESAVDNITSVTTPRFVIGNVPADIDTVVIRINGVSYPV 660
SFTIDTIVSDPSIDLLDADDTGESAVDNITSVTTPRFVIGNVPADIDTVVIRINGVSYPV
Sbjct 601 SFTIDTIVSDPSIDLLDADDTGESAVDNITSVTTPRFVIGNVPADIDTVVIRINGVSYPV 660
Query 661 TANGNNLWEFQVPVALNDGVYEAVVVFRDIAGNTSETKLPFTIDTTTSVSVRMEPASDTG 720
TANGNNLWEFQVPVALNDGVYEAVVVFRDIAGNTSETKLPFTIDTTTSVSVRMEPASDTG
Sbjct 661 TANGNNLWEFQVPVALNDGVYEAVVVFRDIAGNTSETKLPFTIDTTTSVSVRMEPASDTG 720
Query 721 SSNSDNLTNKQNPKFEGTAEPNAKLVITIVDDKSGREVLKHTITVGADGNWSVTPNILPD 780
SSNSDNLTNKQNPKFEGTAEPNAKLVITIVDDKSGREVLKHTITVGADGNWSVTPNILPD
Sbjct 721 SSNSDNLTNKQNPKFEGTAEPNAKLVITIVDDKSGREVLKHTITVGADGNWSVTPNILPD 780
Query 781 GMYTINVVATDVAGNTAQTQERFTIDTVTIDPTIRLSDPSIDDQYEATSLRPEFKGLAEA 840
GMYTINVVATDVAGNTAQTQERFTIDTVTIDPTIRLSDPSIDDQYEATSLRPEFKGLAEA
Sbjct 781 GMYTINVVATDVAGNTAQTQERFTIDTVTIDPTIRLSDPSIDDQYEATSLRPEFKGLAEA 840
Query 841 FSTIMIQWDGKVVGSANANANGEWSWTPPSVLAPGSYVVSIVAKDKAGNESSQvdfpvvi 900
FSTIMIQWDGKVVGSANANANGEWSWTPPSVLAPGSYVVSIVAKDKAGNESSQVDFPVVI
Sbjct 841 FSTIMIQWDGKVVGSANANANGEWSWTPPSVLAPGSYVVSIVAKDKAGNESSQVDFPVVI 900
Query 901 pvidvtpptiKLSEESDSGALGDFTTNNKTPTLIGSTLPNTIVSIYVDGVKVGEATADTA 960
PVIDVTPPTIKLSEESDSGALGDFTTNNKTPTLIGSTLPNTIVSIYVDGVKVGEATADTA
Sbjct 901 PVIDVTPPTIKLSEESDSGALGDFTTNNKTPTLIGSTLPNTIVSIYVDGVKVGEATADTA 960
Query 961 GRYTFQLSEMKDGHYVVQVGIVNPRDNSELRSTAVDVTIDTEVAELVWNISGMHEGGYIN 1020
GRYTFQLSEMKDGHYVVQVGIVNPRDNSELRSTAVDVTIDTEVAELVWNISGMHEGGYIN
Sbjct 961 GRYTFQLSEMKDGHYVVQVGIVNPRDNSELRSTAVDVTIDTEVAELVWNISGMHEGGYIN 1020
Query 1021 TVTPEIGGTSEPNSKITIFVNGVEKAIAYTTGAGHWGVVLPALGNDGNYELTFKVEDVAG 1080
TVTPEIGGTSEPNSKITIFVNGVEKAIAYTTGAGHWGVVLPALGNDGNYELTFKVEDVAG
Sbjct 1021 TVTPEIGGTSEPNSKITIFVNGVEKAIAYTTGAGHWGVVLPALGNDGNYELTFKVEDVAG 1080
Query 1081 NIREFGPQNVILDTVISPLTVVLREADDSGKVGDWITNKSHVTIDGTAEAGSTLTIRNPQ 1140
NIREFGPQNVILDTVISPLTVVLREADDSGKVGDWITNKSHVTIDGTAEAGSTLTIRNPQ
Sbjct 1081 NIREFGPQNVILDTVISPLTVVLREADDSGKVGDWITNKSHVTIDGTAEAGSTLTIRNPQ 1140
Query 1141 GVVIATLVVGNDGRWSAELDLREGSNAFVVVSEDKAGNGQQKDILIEHDTQIEISDISLS 1200
GVVIATLVVGNDGRWSAELDLREGSNAFVVVSEDKAGNGQQKDILIEHDTQIEISDISLS
Sbjct 1141 GVVIATLVVGNDGRWSAELDLREGSNAFVVVSEDKAGNGQQKDILIEHDTQIEISDISLS 1200
Query 1201 RDTNSGDKYDLITNNKSPVLVAMTDPGATVQVYINGVLQGTVEASSSGNISYTMPANSAD 1260
RDTNSGDKYDLITNNKSPVLVAMTDPGATVQVYINGVLQGTVEASSSGNISYTMPANSAD
Sbjct 1201 RDTNSGDKYDLITNNKSPVLVAMTDPGATVQVYINGVLQGTVEASSSGNISYTMPANSAD 1260
Query 1261 GEYQVQFVATDTAGNRVESAITTVTIDSQIAVFDIDEDSLPALSNNRALSVSGVGEAGSQ 1320
GEYQVQFVATDTAGNRVESAITTVTIDSQIAVFDIDEDSLPALSNNRALSVSGVGEAGSQ
Sbjct 1261 GEYQVQFVATDTAGNRVESAITTVTIDSQIAVFDIDEDSLPALSNNRALSVSGVGEAGSQ 1320
Query 1321 VSIFVDGKLVNVVMVEADGSWRAPILLQDDGTFNIHFSITDVAGNTQVSKNYSVDVDSST 1380
VSIFVDGKLVNVVMVEADGSWRAPILLQDDGTFNIHFSITDVAGNTQVSKNYSVDVDSST
Sbjct 1321 VSIFVDGKLVNVVMVEADGSWRAPILLQDDGTFNIHFSITDVAGNTQVSKNYSVDVDSST 1380
Query 1381 DFPTLNLEDASNSGSLDDLITNHNKPVLVGTAEAGATIHIYVDEKIVANVLVLEDGTWSY 1440
DFPTLNLEDASNSGSLDDLITNHNKPVLVGTAEAGATIHIYVDEKIVANVLVLEDGTWSY
Sbjct 1381 DFPTLNLEDASNSGSLDDLITNHNKPVLVGTAEAGATIHIYVDEKIVANVLVLEDGTWSY 1440
Query 1441 QFDNALKDGEYSIRVVAEDPAGNTAESPRLLVTIDTSTFIDNPAMVAGSDNGIFSNDSIT 1500
QFDNALKDGEYSIRVVAEDPAGNTAESPRLLVTIDTSTFIDNPAMVAGSDNGIFSNDSIT
Sbjct 1441 QFDNALKDGEYSIRVVAEDPAGNTAESPRLLVTIDTSTFIDNPAMVAGSDNGIFSNDSIT 1500
Query 1501 SQTRPTFSIFGEMNQSVQIFIDGVLVDTITVTDRNQVYRPESPLGDGSHSIYYVITDKAG 1560
SQTRPTFSIFGEMNQSVQIFIDGVLVDTITVTDRNQVYRPESPLGDGSHSIYYVITDKAG
Sbjct 1501 SQTRPTFSIFGEMNQSVQIFIDGVLVDTITVTDRNQVYRPESPLGDGSHSIYYVITDKAG 1560
Query 1561 NTATSKTLNFTIDTFNTTPVAIDSIGGQTLAEMTGSDGKIYITDTTRNLLFSGSAEPNSK 1620
NTATSKTLNFTIDTFNTTPVAIDSIGGQTLAEMTGSDGKIYITDTTRNLLFSGSAEPNSK
Sbjct 1561 NTATSKTLNFTIDTFNTTPVAIDSIGGQTLAEMTGSDGKIYITDTTRNLLFSGSAEPNSK 1620
Query 1621 IEIIINGLNVGEVWVNEKGHWQMPVNPLYFTEGQLDITVKSTDRAGNVNQEKYSIWVDTH 1680
IEIIINGLNVGEVWVNEKGHWQMPVNPLYFTEGQLDITVKSTDRAGNVNQEKYSIWVDTH
Sbjct 1621 IEIIINGLNVGEVWVNEKGHWQMPVNPLYFTEGQLDITVKSTDRAGNVNQEKYSIWVDTH 1680
Query 1681 IQVFTSELDdnksssktdwwsnsstITMRGMGEIGATVSLIvagvtlatavvaaNGQWEL 1740
IQVFTSELDDNKSSSKTDWWSNSSTITMRGMGEIGATVSLIVAGVTLATAVVAANGQWEL
Sbjct 1681 IQVFTSELDDNKSSSKTDWWSNSSTITMRGMGEIGATVSLIVAGVTLATAVVAANGQWEL 1740
Query 1741 STDQLPEGKYDITLSIEDNAGNRKEEVHEIFIDRTPPNAPVVTYSDIVNDLIIMQGTAEA 1800
STDQLPEGKYDITLSIEDNAGNRKEEVHEIFIDRTPPNAPVVTYSDIVNDLIIMQGTAEA
Sbjct 1741 STDQLPEGKYDITLSIEDNAGNRKEEVHEIFIDRTPPNAPVVTYSDIVNDLIIMQGTAEA 1800
Query 1801 KSQLIITDSNGNTYTLTVPDNGKWSMAIPYPSEGKFTITSVDAIGNRSDDVPLDIMKEVP 1860
KSQLIITDSNGNTYTLTVPDNGKWSMAIPYPSEGKFTITSVDAIGNRSDDVPLDIMKEVP
Sbjct 1801 KSQLIITDSNGNTYTLTVPDNGKWSMAIPYPSEGKFTITSVDAIGNRSDDVPLDIMKEVP 1860
Query 1861 VISLSPDSDSGTVGDNITRDKQPTFIIGNLESDVVVVQVDINGTVYNAEKNADGVWFFTP 1920
VISLSPDSDSGTVGDNITRDKQPTFIIGNLESDVVVVQVDINGTVYNAEKNADGVWFFTP
Sbjct 1861 VISLSPDSDSGTVGDNITRDKQPTFIIGNLESDVVVVQVDINGTVYNAEKNADGVWFFTP 1920
Query 1921 GTPLADGSYTISVIASDAAGNQKNSLPITVTIDSTLTVPEIALAAGEDNGVSDSDNVTNH 1980
GTPLADGSYTISVIASDAAGNQKNSLPITVTIDSTLTVPEIALAAGEDNGVSDSDNVTNH
Sbjct 1921 GTPLADGSYTISVIASDAAGNQKNSLPITVTIDSTLTVPEIALAAGEDNGVSDSDNVTNH 1980
Query 1981 TQPKFTLQHIDAdvtgvtvnvthngvtdtYQATQGADGWTFTPPAAWNDGTYTLSVTVVD 2040
TQPKFTLQHIDADVTGVTVNVTHNGVTDTYQATQGADGWTFTPPAAWNDGTYTLSVTVVD
Sbjct 1981 TQPKFTLQHIDADVTGVTVNVTHNGVTDTYQATQGADGWTFTPPAAWNDGTYTLSVTVVD 2040
Query 2041 RAGNSQQsaslavtvdstvtvtadsqhddasddaTPTAVTPPESETVNAESDTHLRTVPS 2100
RAGNSQQSASLAVTVDSTVTVTADSQHDDASDDATPTAVTPPESETVNAESDTHLRTVPS
Sbjct 2041 RAGNSQQSASLAVTVDSTVTVTADSQHDDASDDATPTAVTPPESETVNAESDTHLRTVPS 2100
Query 2101 AAEESVVKETAYSITLLNANSGDEIDRSISQTPSFEISVPENIVNVSVMFEGEEFTLPIT 2160
AAEESVVKETAYSITLLNANSGDEIDRSISQTPSFEISVPENIVNVSVMFEGEEFTLPIT
Sbjct 2101 AAEESVVKETAYSITLLNANSGDEIDRSISQTPSFEISVPENIVNVSVMFEGEEFTLPIT 2160
Query 2161 NQKAIFEVPLSLEDGEYTMDVkfidkdddflikekTFSVDHSSADIVNAMNARGKTEDDI 2220
NQKAIFEVPLSLEDGEYTMDVKFIDKDDDFLIKEKTFSVDHSSADIVNAMNARGKTEDDI
Sbjct 2161 NQKAIFEVPLSLEDGEYTMDVKFIDKDDDFLIKEKTFSVDHSSADIVNAMNARGKTEDDI 2220
Query 2221 NDSPSTSSVGHNNNGAIDVFAVNEVTLPVDNQEEHA 2256
NDSPSTSSVGHNNNGAIDVFAVNEVTLPVDNQEEHA
Sbjct 2221 NDSPSTSSVGHNNNGAIDVFAVNEVTLPVDNQEEHA 2256 |