Homolog Viewer

PAthogenisity Island DataBase (PAI DB)

Home PAIs REIs Genomes Search Links

Homologs of SAV0029 gene of NC_002758_R1

DNA-level

Hit (GenBank Accn)

Product

Source Genome

Eval.

Ident.(%)

1) repB
( - )

NC_002952
(Staphylococcus aureus MRSA252)

0.0

100

2) SAA6008_00031
( - )

NC_017341
(Staphylococcus aureus JKD6008)

0.0

99.9

3) SGPB_1678
( - )

NC_015600
(Streptococcus pasteurianus ATCC 43144)

0.0

100

• Sequence Alignments

1) repB in NC_002952


>NC_002758_R1|6|G6|15923019|NP_370553.1|Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_Mu50|-|3719..4513|-|SAV0029|hypothetical 
          Length = 795

 Score = 1530 bits (3949), Expect = 0.0
 Identities = 795/795 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgggggtttcttttaatattatgtgtcctaatagtagcatttattcagatgaaaaatca 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgggggtttcttttaatattatgtgtcctaatagtagcatttattcagatgaaaaatca 60

Query: 61  agggttttagtggacaagacaaaaagtggaaaagtgagaccatggagagaaaagaaaatc 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  agggttttagtggacaagacaaaaagtggaaaagtgagaccatggagagaaaagaaaatc 120

Query: 121 gctaatgttgattactttgaacttctgcatattcttgaatttaaaaaggctgaaagagta 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gctaatgttgattactttgaacttctgcatattcttgaatttaaaaaggctgaaagagta 180

Query: 181 aaagattgtgctgaaatattagagtataaacaaaatcgtgaaacaggcgaaagaaagttg 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aaagattgtgctgaaatattagagtataaacaaaatcgtgaaacaggcgaaagaaagttg 240

Query: 241 tatcgagtgtggttttgtaaatccaggctttgtccaatgtgcaactggaggagagcaatg 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tatcgagtgtggttttgtaaatccaggctttgtccaatgtgcaactggaggagagcaatg 300

Query: 301 aaacatggcattcagtcacaaaaggttgttgctgaagttattaaacaaaagccaacagtt 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 aaacatggcattcagtcacaaaaggttgttgctgaagttattaaacaaaagccaacagtt 360

Query: 361 cgttggttgtttctcacattaacagttaaaaatgtttatgatggcgaagaattaaataag 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 cgttggttgtttctcacattaacagttaaaaatgtttatgatggcgaagaattaaataag 420

Query: 421 agtttgtcagatatggctcaaggatttcgccgaatgatgcaatataaaaaaattaataaa 480
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 agtttgtcagatatggctcaaggatttcgccgaatgatgcaatataaaaaaattaataaa 480

Query: 481 aatcttgttggttttatgcgtgcaacggaagtgacaataaataataaagataattcttat 540
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aatcttgttggttttatgcgtgcaacggaagtgacaataaataataaagataattcttat 540

Query: 541 aatcagcacatgcatgtattggtatgtgtggaaccaacttattttaagaatacagaaaac 600
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 aatcagcacatgcatgtattggtatgtgtggaaccaacttattttaagaatacagaaaac 600

Query: 601 tacgtgaatcaaaaacaatggattcaattttggaaaaaggcaatgaaattagactatgat 660
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 tacgtgaatcaaaaacaatggattcaattttggaaaaaggcaatgaaattagactatgat 660

Query: 661 ccaaatgtaaaagttcaaatgattcgaccgaaaaataaatataaatcggatatacaatcg 720
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 ccaaatgtaaaagttcaaatgattcgaccgaaaaataaatataaatcggatatacaatcg 720

Query: 721 gcaattgacgaaactgcaaaatatcctgtaaaggatacggattttatgaccgatgatgaa 780
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 gcaattgacgaaactgcaaaatatcctgtaaaggatacggattttatgaccgatgatgaa 780

Query: 781 gaaaagaatttgtaa 795
           |||||||||||||||
Sbjct: 781 gaaaagaatttgtaa 795

2) SAA6008_00031 in NC_017341


>NC_002758_R1|6|G6|15923019|NP_370553.1|Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_Mu50|-|3719..4513|-|SAV0029|hypothetical 
          Length = 795

 Score = 1486 bits (3834), Expect = 0.0
 Identities = 773/774 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgtgtcctaatagtagcatttattcagatgaaaaatcaagggttttagtggacaagaca 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 22  atgtgtcctaatagtagcatttattcagatgaaaaatcaagggttttagtggacaagaca 81

Query: 61  aaaagtggaaaagtgagaccatggagagaaaagaaaatcgctaatgttgattactttgaa 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 82  aaaagtggaaaagtgagaccatggagagaaaagaaaatcgctaatgttgattactttgaa 141

Query: 121 cttctgcatattcttgaatttaaaaaggctgaaagagtaaaagattgtgctgaaatatta 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 142 cttctgcatattcttgaatttaaaaaggctgaaagagtaaaagattgtgctgaaatatta 201

Query: 181 gagtataaacaaaatcgtgaaacaggcgaaagaaagttgtatcgagtgtggttttgtaaa 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 202 gagtataaacaaaatcgtgaaacaggcgaaagaaagttgtatcgagtgtggttttgtaaa 261

Query: 241 tccaggctttgtccaatgtgcaactggaggagagcaatgaaacatggcattcagtcacaa 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 262 tccaggctttgtccaatgtgcaactggaggagagcaatgaaacatggcattcagtcacaa 321

Query: 301 aaggttgttgctgaagttattaaacaaaagccaacagttcgttggttgtttctcacaata 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 322 aaggttgttgctgaagttattaaacaaaagccaacagttcgttggttgtttctcacatta 381

Query: 361 acagttaaaaatgtttatgatggcgaagaattaaataagagtttgtcagatatggctcaa 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 382 acagttaaaaatgtttatgatggcgaagaattaaataagagtttgtcagatatggctcaa 441

Query: 421 ggatttcgccgaatgatgcaatataaaaaaattaataaaaatcttgttggttttatgcgt 480
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 442 ggatttcgccgaatgatgcaatataaaaaaattaataaaaatcttgttggttttatgcgt 501

Query: 481 gcaacggaagtgacaataaataataaagataattcttataatcagcacatgcatgtattg 540
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 502 gcaacggaagtgacaataaataataaagataattcttataatcagcacatgcatgtattg 561

Query: 541 gtatgtgtggaaccaacttattttaagaatacagaaaactacgtgaatcaaaaacaatgg 600
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 562 gtatgtgtggaaccaacttattttaagaatacagaaaactacgtgaatcaaaaacaatgg 621

Query: 601 attcaattttggaaaaaggcaatgaaattagactatgatccaaatgtaaaagttcaaatg 660
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 622 attcaattttggaaaaaggcaatgaaattagactatgatccaaatgtaaaagttcaaatg 681

Query: 661 attcgaccgaaaaataaatataaatcggatatacaatcggcaattgacgaaactgcaaaa 720
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 682 attcgaccgaaaaataaatataaatcggatatacaatcggcaattgacgaaactgcaaaa 741

Query: 721 tatcctgtaaaggatacggattttatgaccgatgatgaagaaaagaatttgtaa 774
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 742 tatcctgtaaaggatacggattttatgaccgatgatgaagaaaagaatttgtaa 795

3) SGPB_1678 in NC_015600


>NC_002758_R1|6|G6|15923019|NP_370553.1|Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_Mu50|-|3719..4513|-|SAV0029|hypothetical 
          Length = 795

 Score = 1116 bits (2879), Expect = 0.0
 Identities = 579/579 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgtgtcctaatagtagcatttattcagatgaaaaatcaagggttttagtggacaagaca 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 22  atgtgtcctaatagtagcatttattcagatgaaaaatcaagggttttagtggacaagaca 81

Query: 61  aaaagtggaaaagtgagaccatggagagaaaagaaaatcgctaatgttgattactttgaa 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 82  aaaagtggaaaagtgagaccatggagagaaaagaaaatcgctaatgttgattactttgaa 141

Query: 121 cttctgcatattcttgaatttaaaaaggctgaaagagtaaaagattgtgctgaaatatta 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 142 cttctgcatattcttgaatttaaaaaggctgaaagagtaaaagattgtgctgaaatatta 201

Query: 181 gagtataaacaaaatcgtgaaacaggcgaaagaaagttgtatcgagtgtggttttgtaaa 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 202 gagtataaacaaaatcgtgaaacaggcgaaagaaagttgtatcgagtgtggttttgtaaa 261

Query: 241 tccaggctttgtccaatgtgcaactggaggagagcaatgaaacatggcattcagtcacaa 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 262 tccaggctttgtccaatgtgcaactggaggagagcaatgaaacatggcattcagtcacaa 321

Query: 301 aaggttgttgctgaagttattaaacaaaagccaacagttcgttggttgtttctcacatta 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 322 aaggttgttgctgaagttattaaacaaaagccaacagttcgttggttgtttctcacatta 381

Query: 361 acagttaaaaatgtttatgatggcgaagaattaaataagagtttgtcagatatggctcaa 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 382 acagttaaaaatgtttatgatggcgaagaattaaataagagtttgtcagatatggctcaa 441

Query: 421 ggatttcgccgaatgatgcaatataaaaaaattaataaaaatcttgttggttttatgcgt 480
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 442 ggatttcgccgaatgatgcaatataaaaaaattaataaaaatcttgttggttttatgcgt 501

Query: 481 gcaacggaagtgacaataaataataaagataattcttataatcagcacatgcatgtattg 540
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 502 gcaacggaagtgacaataaataataaagataattcttataatcagcacatgcatgtattg 561

Query: 541 gtatgtgtggaaccaacttattttaagaatacagaaaac 579
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 562 gtatgtgtggaaccaacttattttaagaatacagaaaac 600