>AY330636|6|G6|37811783|AAR03858.1|Helicobacter_pylori_Ca52|-|4877..7123|cag5|HP0524|Cag5
Length = 2247
Score = 3007 bits (7758), Expect = 0.0
Identities = 1598/1673 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 578 agaaa--atgatcaaagctaaactcatcacacccaataataaaaaacgcgcctttgacaa 635
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 576 agaaaagatgatcaaagctaaacttatcacacccaataataaaaaacgcgcctttgacaa 635
Query: 636 acgagaagttattgtaggcaggcgtggtttaggggattttatcgcttacgcagggcaggc 695
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 636 acgagaggttattgtaggcaggcgtggtttaggggattttatcgcttacgcaggacaggc 695
Query: 696 gttcattggcttgattgctcctaccagaagcggtaagggggtgggttttatcatgcccaa 755
||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||
Sbjct: 696 gttcattggcttgatcgctcctactagaagcggtaaaggtgtgggtttcatcatgcccaa 755
Query: 756 tatgatcaattattctcaaaatatcgttgtgtttgaccctaaggctgacactatggaaac 815
||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct: 756 tatgatcaattatcctcaaaacatcgttgtgtttgaccctaaggcggatactatggaaac 815
Query: 816 ttgcggaaaaatcagggaacagcgtttcaaacagaaagtgttcatctatgaacctttctc 875
||||||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 816 ttgcggaaaaatcagagaaaaacgcttcaaccaaaaagtgttcatctatgaacctttctc 875
Query: 876 cttaaaaacacaccgatttaatcctttcgcttatgtggattttggtaatgatgtggtttt 935
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 876 cttaaaaacacaccgatttaatcctttcgcttatgtggattttggtaatgatgtggtttt 935
Query: 936 tgactgaagacatactctctcaaattgacacacgcctaaaaggtcatgggatggtggcta 995
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 936 -gactgaagacatactctctcaaattgacacacgcctaaaagggcatgggatggtggcta 994
Query: 996 gtggtggggatttttccactcaaatctttggattggcaaagctcgtgttccctgaaagac 1055
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||
Sbjct: 995 gtgggggggatttttccactcaaatctttggattggctaaattggtgttccctgaaagac 1054
Query: 1056 ctaatgaaaaagatcctttttttagcaatcaagcgcgaaatctttttgtcatcaattgca 1115
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1055 ccaatgaaaaagatcctttttttagcaatcaagcgcgaaatctttttgtcatcaattgca 1114
Query: 1116 atatttatagggatctcatgtggactaaaaaggggcttgagtttgtcaaaagaaaaaaaa 1175
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1115 atatttatagggatctcatgtggactaaaaaggggcttgagtttgtcaaaagaaaaaaaa 1174
Query: 1176 tcatcatgcctgaaacccctacgatgtttttcataggttctatggcaagcggtatcaact 1235
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1175 tcatcatgcctgaaacccccacgatgtttttcataggttctatggcaagcggtatcaact 1234
Query: 1236 tgattgatgaagaaacaaacatggaaaaagtcgtgtctctgatggaattttttggaggtg 1295
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1235 tgattgatgaagacacaaacatggaaaaagtcgtgtctctgatggaattttttggaggtg 1294
Query: 1296 aagaagataagagtggcgataatataagagtgcttagtcctgccactagaaacatgtgga 1355
||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct: 1295 aagaagataagagtggcgacaatctaagagcgcttagtcctactactagaaacatgtgga 1354
Query: 1356 ataatttcaagacaatgggcggcgctaaagaaacttacagctctgttcaaggggtctata 1415
|||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1355 ataacttcaagacaatgggtggtgctaaagaaacttatagctctgttcaaggggtctata 1414
Query: 1416 cttcagcgtttgccccctacaacaacgccatgatcagaaatttcacgagcgctaatgatt 1475
| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1415 catcagcgtttgcgccttacaataacgccatgatcaggaatttcacgagcgctaatgatt 1474
Query: 1476 ttgatttcaggcgtttaaggattgatgaagtgagtattggcgtgatcgctaatcctaaag 1535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1475 ttgatttcaggcgtttaaggattgatgaagtgagtattggcgtgatcgctaatcctaaag 1534
Query: 1536 aaagcactattgttgggccgatattagagctgtttttcaatgtgatgatttatagcaacc 1595
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1535 aaagcactattgttgggccgatactagagctgtttttcaatgtgatgatttatagcaacc 1594
Query: 1596 ttattctgccaatccatgatccacaatgcaaaagaagttgtttaatgctcatggacgaat 1655
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||
Sbjct: 1595 ttattttgccaatccatgatccacaatgcaaaagaagttgcttaatgcttatggatgaat 1654
Query: 1656 ttacgctttgtggctatttagagacctttgtgaaagcggtagggattatggcagaataca 1715
| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1655 tcacgctctgtggctatttagagacctttgttaaagcggtagggattatggcagaataca 1714
Query: 1716 acatgcgccctgcgtttgtgtttcaaagtaaggcgcaactagagaatgaccccccacttg 1775
||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1715 acatgcgtcccgcttttgtgtttcaaagtaaggcgcaactagagaatgaccccccacttg 1774
Query: 1776 gttatggtaggaatggcgctaagactattttagacaacctttctttgaatatgtattatg 1835
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1775 gttatggtaggaatggcgctaagactattttagacaacctttctttgaatatgtattatg 1834
Query: 1836 ggattaacaacgataactactatgaacattttgaaaaactttctaaggtgttaggaaaat 1895
|||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 1835 ggatcaacaacgataattattatgaacattttgaaaaactttctaaggtgttagggaaat 1894
Query: 1896 acacaaggcaagatgtgagccgaagcattgatgataataccggtaagaccaatacttcta 1955
||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct: 1895 acacaaggcaagacgtgagccgaagcattgatgacaatacaggtaagaccaacacttcta 1954
Query: 1956 tcagcaacaaggagcggtttttgatgacccctgatgaattgatgactatgggcgatgagc 2015
|||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1955 tcagcaacaaagagcggtttttgatgacccccgatgaattgatgactatgggcgatgagc 2014
Query: 2016 ttatcattctagaaaacacgctcaaacccataaaatgccacaaggcgctttactacgatg 2075
||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 2015 ttatcattctagagaacacgctcaaacccatcaaatgccacaaggcgctttactatgatg 2074
Query: 2076 atccattcttcactgatgaactcattaaagtaagtccaagcttgagcaagaaatacaaat 2135
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2075 atccattcttcaccgatgaactcattaaggtaagtccaagcttgagcaagaaatacaaat 2134
Query: 2136 tgggaaaagtgcctaatcaagcgacattctatgatgatttgcaagccgctaaaactagag 2195
|||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2135 tggggaaagtgcctaatcaggcaacattctatgatgatttgcaagccgctaaaactagag 2194
Query: 2196 gtgaattgagctatgataaatctttagtgcctgtgggttcaagcgaactgtga 2248
|||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2195 gtgaattgagctatgacaagtctttagtgcctgtgggttcaagcgaactgtga 2247
Score = 1046 bits (2698), Expect = e-306
Identities = 552/569 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggaagactttttatataacaccttatatttcatagagaattataagttagttgttatt 60
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||
Sbjct: 1 atggaagactttttgtataacaccttatatttcatagaggattataagttggttgttatt 60
Query: 61 tttagtttcatagggttaatagcgttattttttctctacaaattcataaaagctcaaaaa 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tttagtttcatagggttaatagcgttattttttctttacaaattcataaaagctcaaaaa 120
Query: 121 aaggcttttaaagataaagctaaccaacctcaaaagaaaaaaaactttaaagaaatcatt 180
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 aaagcttttaaagataaagctaaccaacctcaaaagaaaaaaaactttaaagaaatcatc 180
Query: 181 atagaggggctgaaagaaagagttaaaacctttggcttttggttacaagctacactatta 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||
Sbjct: 181 atagaggggctgaaagaaagagttaaaacctttggcttttggttgcaagctatactatta 240
Query: 241 ctatcctattcttttatcacatcagggttatttttcttgatcctcttaggtaatttttat 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ctatcctattcttttatcacatcagggttatttttcttgattctcttaggtaatttttat 300
Query: 301 gatgataataaattgcctgagagtgatgatgatctttttgatatatggatctatgcgata 360
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gatgataatagattgcctgagagtgatgatgatctttttgatatatggatctatgcgata 360
Query: 361 caagattttcctgcatactattttaaggcactttgttttagttcactcaagatttatggg 420
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 361 caagattttcctgcatactattttaaagcgctttgttttagttcactcaaaatttatggg 420
Query: 421 ttcaatatatccttagtcgtatatagttctattttatgctcttatatattcattaccttt 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 421 ttcaatatatccttagtcgtatatagttctattttatgctcttatatcttcattaccttt 480
Query: 481 tttgtgtggttcttaaaatacttaactcggactagagatataggagcgaacaaaaaagtt 540
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct: 481 tttgtgtggttcttaaaatacttaactcggactagagacataggagcgaataaaaaagtt 540
Query: 541 gatgatctctttggtagcgcgagttggga 569
|||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 541 gatgatctctttgggagcgcgagttggga 569 |