>AY330643|5|G5|37811882|AAR03947.1|Helicobacter_pylori_Du23:2|-|3899..6145|cag5|HP0524|Cag5
Length = 2247
Score = 3027 bits (7811), Expect = 0.0
Identities = 1604/1673 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 578 agaaa--atgatcaaagctaaactcatcacacccaataataaaaaacgcgcctttgacaa 635
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 576 agaaaagatgatcaaagctaaactcatcacacccaataataaaaaacgcgcctttgacaa 635
Query: 636 acgagaagttattgtaggcaggcgtggtttaggggattttatcgcttacgcagggcaggc 695
|||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct: 636 acgagaggtgattgtaggcaggcgtggtttaggggattttattgcttacgcaggacaggc 695
Query: 696 gttcattggcttgattgctcctaccagaagcggtaagggggtgggttttatcatgcccaa 755
|||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||
Sbjct: 696 gttcattggcttgattgcccctactagaagcggtaaaggtgtgggtttcatcatgcccaa 755
Query: 756 tatgatcaattattctcaaaatatcgttgtgtttgaccctaaggctgacactatggaaac 815
||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 756 tatgatcaattatcctcaaaatatcgttgtgtttgatcctaaggctgacactatggaaac 815
Query: 816 ttgcggaaaaatcagggaacagcgtttcaaacagaaagtgttcatctatgaacctttctc 875
|||||| |||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 816 ttgcgggaaaatcagagaaaaacgcttcaaccaaaaagtgttcatctatgaacctttctc 875
Query: 876 cttaaaaacacaccgatttaatcctttcgcttatgtggattttggtaatgatgtggtttt 935
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 876 cttaaaaacacaccgatttaatcctttcgcttatgtggattttggtaatgatgtggtttt 935
Query: 936 tgactgaagacatactctctcaaattgacacacgcctaaaaggtcatgggatggtggcta 995
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 936 -gactgaagacatactctctcaaattgacacacgcctaaaagggcatgggatggtggcta 994
Query: 996 gtggtggggatttttccactcaaatctttggattggcaaagctcgtgttccctgaaagac 1055
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 995 gtgggggggatttttccactcaaatctttggattggcaaagctcgtgttccctgaaagac 1054
Query: 1056 ctaatgaaaaagatcctttttttagcaatcaagcgcgaaatctttttgtcatcaattgca 1115
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1055 ctaatgaaaaagatcctttttttagcaatcaagcacgaaatctttttgtcatcaattgca 1114
Query: 1116 atatttatagggatctcatgtggactaaaaaggggcttgagtttgtcaaaagaaaaaaaa 1175
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1115 atatttatagggatcttatgtggactaaaaaggggcttgagtttgtcaaaagaaaaaaaa 1174
Query: 1176 tcatcatgcctgaaacccctacgatgtttttcataggttctatggcaagcggtatcaact 1235
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 1175 tcatcatgcctgaaaccccaacgatgtttttcataggttctatggcaagcggtatcaatt 1234
Query: 1236 tgattgatgaagaaacaaacatggaaaaagtcgtgtctctgatggaattttttggaggtg 1295
||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1235 tgattgatgaaaacacaaacatggaaaaagttgtgtctctgatggaattttttggaggtg 1294
Query: 1296 aagaagataagagtggcgataatataagagtgcttagtcctgccactagaaacatgtgga 1355
||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct: 1295 aagaagataagagtggcgacaatctaagagcgcttagtcctactactagaaacatgtgga 1354
Query: 1356 ataatttcaagacaatgggcggcgctaaagaaacttacagctctgttcaaggggtctata 1415
|||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1355 ataacttcaagacaatgggtggcgctaaagaaacttatagctctgttcaaggggtctata 1414
Query: 1416 cttcagcgtttgccccctacaacaacgccatgatcagaaatttcacgagcgctaatgatt 1475
||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1415 cttcagcgtttgcgccttacaataacgccatgatcaggaatttcacgagcgctaatgatt 1474
Query: 1476 ttgatttcaggcgtttaaggattgatgaagtgagtattggcgtgatcgctaatcctaaag 1535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1475 ttgatttcaggcgtttaaggattgatgaagtgagtattggcgtgatcgctaatcctaaag 1534
Query: 1536 aaagcactattgttgggccgatattagagctgtttttcaatgtgatgatttatagcaacc 1595
|||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1535 aaagcactattgttggaccgatactagagctgtttttcaatgtgatgatttatagcaacc 1594
Query: 1596 ttattctgccaatccatgatccacaatgcaaaagaagttgtttaatgctcatggacgaat 1655
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||
Sbjct: 1595 tcattctgccaatccatgatccacaatgcaaaagaagttgcttaatgcttatggatgaat 1654
Query: 1656 ttacgctttgtggctatttagagacctttgtgaaagcggtagggattatggcagaataca 1715
| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1655 tcacgctctgtggctatttagagacctttgttaaagcggtagggattatggcagaataca 1714
Query: 1716 acatgcgccctgcgtttgtgtttcaaagtaaggcgcaactagagaatgaccccccacttg 1775
||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1715 acatgcgtcccgcttttgtgtttcaaagtaaggcgcaactagagaatgaccccccacttg 1774
Query: 1776 gttatggtaggaatggcgctaagactattttagacaacctttctttgaatatgtattatg 1835
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1775 gttatggtaggaatggcgctaagactattttagacaacctttctttgaatatgtattatg 1834
Query: 1836 ggattaacaacgataactactatgaacattttgaaaaactttctaaggtgttaggaaaat 1895
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 1835 ggattaacaacgataactactatgaacattttgaaaaactttctaaggtgttagggaaat 1894
Query: 1896 acacaaggcaagatgtgagccgaagcattgatgataataccggtaagaccaatacttcta 1955
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 1895 acacaaggcaagatgtgagccgaagcattgatgacaataccggtaagaccaacacttcta 1954
Query: 1956 tcagcaacaaggagcggtttttgatgacccctgatgaattgatgactatgggcgatgagc 2015
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1955 tcagcaacaaagagcggtttttgatgacccctgatgaattgatgactatgggcgatgagc 2014
Query: 2016 ttatcattctagaaaacacgctcaaacccataaaatgccacaaggcgctttactacgatg 2075
||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 2015 ttatcattctagagaatacgctcaaacccatcaaatgccacaaggcgctttactatgatg 2074
Query: 2076 atccattcttcactgatgaactcattaaagtaagtccaagcttgagcaagaaatacaaat 2135
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2075 atccattcttcaccgatgaactcattaaggtaagtccaagcttgagcaagaaatacaaat 2134
Query: 2136 tgggaaaagtgcctaatcaagcgacattctatgatgatttgcaagccgctaaaactagag 2195
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2135 tgggaaaagtgcctgatcaagcaacattctatgatgatttgcaagccgctaaaactagag 2194
Query: 2196 gtgaattgagctatgataaatctttagtgcctgtgggttcaagcgaactgtga 2248
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 2195 gtgaattgagctatgacaagtctttagtgcctgtgggttcaagtgaactgtga 2247
Score = 1051 bits (2711), Expect = e-307
Identities = 554/569 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggaagactttttatataacaccttatatttcatagagaattataagttagttgttatt 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||
Sbjct: 1 atggaagactttttatataacaccttatatttcatagaggattataagttggttgttatt 60
Query: 61 tttagtttcatagggttaatagcgttattttttctctacaaattcataaaagctcaaaaa 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tttagtttcatagggttaatagcgttattttttctttacaaattcataaaagctcaaaaa 120
Query: 121 aaggcttttaaagataaagctaaccaacctcaaaagaaaaaaaactttaaagaaatcatt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 aaggcttttaaagataaagctaaccaacctcaaaagaaaaaaaactttaaagaaatcatt 180
Query: 181 atagaggggctgaaagaaagagttaaaacctttggcttttggttacaagctacactatta 240
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||
Sbjct: 181 atagaggggctgaaagaaagaattaaaacctttggcttttggttgcaagctatactatta 240
Query: 241 ctatcctattcttttatcacatcagggttatttttcttgatcctcttaggtaatttttat 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ctatcctattcttttatcacatcagggttatttttcttgattctcttaggtaatttttat 300
Query: 301 gatgataataaattgcctgagagtgatgatgatctttttgatatatggatctatgcgata 360
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gatgataatcgattgcctgagagtgatgatgatctttttgatatatggatctatgcgata 360
Query: 361 caagattttcctgcatactattttaaggcactttgttttagttcactcaagatttatggg 420
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 361 caagattttcctgcatactattttaaagcgctttgttttagttcactcaaaatttatggg 420
Query: 421 ttcaatatatccttagtcgtatatagttctattttatgctcttatatattcattaccttt 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 421 ttcaatatatccttagtcgtatatagttctattttatgctcttatatcttcattaccttt 480
Query: 481 tttgtgtggttcttaaaatacttaactcggactagagatataggagcgaacaaaaaagtt 540
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct: 481 tttgtgtggttcttaaaatacttaactcggactagagacataggagcgaataaaaaagtt 540
Query: 541 gatgatctctttggtagcgcgagttggga 569
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gatgatctctttggtagcgcgagttggga 569 |