>AF282852|5|G5|8843974|AAF80195.1|Helicobacter_pylori_CCUG_17874=NCTC_11638|-|3357..5603|cag-beta|-|Cag-beta
Length = 2247
Score = 3988 bits (10291), Expect = 0.0
Identities = 2128/2247 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggaagacttgttgtataacaccttatatttcatagaggattataagttggttgttatt 60
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atggaagactttttgtataacaccttatatttcatagaggattataagttggttgttatt 60
Query: 61 tttagttccataggggtaatagcgttattttttctctacaaattcataaaagctcaaaaa 120
||||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tttagtttcatagggttaatagcgttattcttcctatacaaattcataaaagctcaaaaa 120
Query: 121 aaagcttttaaagataaagctaaccaacctcaaaagaaaaaaa-ctttaaagaaatcatt 179
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 121 aaggcttttaaagataaagctaaccagcctcaaaagaaaaaaagctttaaagaaatcatt 180
Query: 180 atagaggggctgaaagaaagagttaaaacctttggcttttggttacaagctacactatta 239
||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||
Sbjct: 181 atagatgggctgaaagaaagggttaaaacctttggcttttggttgcaagctatactatta 240
Query: 240 ctatcctattcttttatcacatcagggttatttttcttgatcctattaggtaatttttat 299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct: 241 ctatcctattcttttatcacatcagggttatttttcttgattctcttaggtaatttttat 300
Query: 300 gatgataataaattgcctgagagtgatgatgatctttttgacatatggatctatgcgata 359
||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct: 301 gatgataatcgatcgcctgaaagtgatgatgatctttttgatatatgggtctatgcgata 360
Query: 360 caagattttcctgcatactattttaaggcactttgttttagttcactcaagatttatggg 419
|||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 caagattttcctaattactattttaaagcgcttggttttagttcactcaagatttatggg 420
Query: 420 ttcaatatatccttagtcgtatatagttctattttatgctcttatatattcattaccttt 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ttcaatatatccttagtcgtatatagttctattttatgctcttatatattcattaccttt 480
Query: 480 tttgtgtggttcttaaaatacttaactcggactagagacataggagcgaataaaaaagtt 539
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 tttgtgtggttcttaaaatacttaactcggactagagatataggagcgaataaaaaagtt 540
Query: 540 gatgatctctttggtagcgcgagttgggagagcgaagaaaaaatgatcaaagctaaactt 599
||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| || ||
Sbjct: 541 gatgatctctttggtagcgcgagttgggaaactgaagagaaaatgatcaaagccaagctc 600
Query: 600 atcacacccaataataaaaaacgcgcctttgacaaacgagaggttattgtaggcaggcgt 659
||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 601 atcacgcctaacaataaaaaacgcgcctttgacaaacgagaggtgattgtaggcaggcgt 660
Query: 660 ggtttgggggattttatcgcttatgcagggcaagcgttcattggcttgattgctcctacc 719
|| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 661 ggcttgggggatttcatcgcttacgcagggcaggcgttcattggcttgattgctcccact 720
Query: 720 agaagcggtaagggggtgggtttcatcatgcccaatatgatcaattatcctcaaaatatc 779
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 agaagcggtaaaggtgtgggtttcatcatgcccaatatgatcaattatcctcaaaatatc 780
Query: 780 gttgtgtttgaccctaaggctgacactatggaaacttgcggaaaaatcagagaaaaacgc 839
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 gttgtgtttgatcctaaggctgacactatggagacttgcggaaaaatcagagaaaaacgc 840
Query: 840 ttcaaccaaaaagtgttcatctatgaacctttctccttaaaaacacaccgatttaatcct 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 ttcaaccaaaaagtgttcatctatgaacctttctccttaaaaacacaccgatttaatcct 900
Query: 900 ttcgcttatgtggattttggtaatgatgtggttttgactgaagacatactctctcaaatt 959
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 ttcgcttatgtggattttggtaatgatgtggttttgaccgaagacatactctctcaaatt 960
Query: 960 gacacacgcctaaaagggcatggcatggtggctagtgggggggatttttccactcaaatc 1019
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 gacacacgcctaaaagggcatggcatggtggctagtggaggggatttttccactcaaatc 1020
Query: 1020 tttggattggcaaagctcgtgttccctgaaagacctaatgaaaaagatcctttttttagc 1079
||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 1021 tttggattggctaagttggtgttccctgaaagacctaatgaaaaagatcctttctttagc 1080
Query: 1080 aatcaagcgcgaaacctttttgtcatcaattgcaatatttatagggatctcatgtggact 1139
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 aatcaagcgcgaaatctttttgtcatcaattgcaatatttatagggatctcatgtggact 1140
Query: 1140 aaaaaggggcttgagtttgtcaaaagaaaaaaaatcatcatgcctgaaactcccacgatg 1199
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct: 1141 aaaaaggggcttgagtttgtcaaaagaaaaaaaatcatcatgcctgaaacccctacgatg 1200
Query: 1200 tttttcataggttctatggcaagcggtatcaacttgattgatgaagacacaaacatggaa 1259
|||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 tttttcataggttctatggcaagcgggatcaacctgattgatgaagacacaaacatggaa 1260
Query: 1260 aaagtcgtgtctctgatggaattttttggaggtgaagaagataagagtggcgataatata 1319
|||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct: 1261 aaagtcgtgtctttaatggaattttttggaggtgaagaagataagagtggcgacaatcta 1320
Query: 1320 agagtgcttagtcctgccactagaaacatgtggaataatttcaagacaatgggcggtgct 1379
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||
Sbjct: 1321 agagcacttagtcctgctactagaaacatgtggaataacttcaagacaatgggtggcgct 1380
Query: 1380 aaagaaacttacagctctgttcaaggggtctatacttcagcgtttgccccctacaacaac 1439
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||
Sbjct: 1381 aaagaaacttacagctctgttcaaggggtctatacatcagcgtttgcaccttacaataac 1440
Query: 1440 gccatgatcagaaatttcacgagcgctaatgattttgatttcaggcgtttaaggattgat 1499
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1441 gctatgatcaggaatttcacgagcgctaatgattttgatttcaggcgtttaaggattgat 1500
Query: 1500 gaagtgagtattggcgtgatcgctaatcctaaagaaagcactattgttgggccgatatta 1559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 1501 gaagtgagtattggcgtgatcgctaatcctaaagaaagcactattgttgggccgatacta 1560
Query: 1560 gagctgtttttcaatgtgatgatttatagcaaccttattctgccaatccatgatccacaa 1619
|||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1561 gagctgtttttcaatgtgatgatttatagcaatttgattctgccaatccatgatccacaa 1620
Query: 1620 tgcaaaagaagttgtttaatgctcatggacgaatttacgctttgtggctatttagagacc 1679
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| || |||
Sbjct: 1621 tgcaaaagaagttgcttaatgctcatggatgaattcactttatgtggctatttggaaacc 1680
Query: 1680 tttgttaaagcggtagggatcatggcagaatacaacatgcgccctgcgtttgtgtttcaa 1739
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct: 1681 tttgttaaagcggtagggattatggcagaatacaacatgcgccccgcttttgtgtttcaa 1740
Query: 1740 agtaaggcgcaactagagaatgaccccccacttggttatggtaggaatggcgctaagact 1799
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 1741 agtaaggcgcaattagagaatgaccccccacttggttatggcaggaatggcgctaagact 1800
Query: 1800 attttagacaacctttctttgaatatgtattatgggattaacaacgataactactatgaa 1859
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||
Sbjct: 1801 attttagacaacctttccttgaatatgtattatgggatcaacaacgataattattatgaa 1860
Query: 1860 cattttgaaaaactttctaaggtgttagggaaatacactagacaagacgtgagccgaagc 1919
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||
Sbjct: 1861 cattttgaaaaactttctaaggtgttagggaaatacacaaggcaagatgtgagccgaagc 1920
Query: 1920 attgatgataataccggtaagaccaatacttctatcagcaacaaagagcggtttttgatg 1979
|||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1921 attgatgacaatacaggtaagaccaacacttctatcagcaacaaagagcggtttttgatg 1980
Query: 1980 acccctgatgaattgatgactatgggcgatgagcttatcattctagaaaacacgctcaaa 2039
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 1981 acccccgatgaattgatgactatgggcgatgagcttatcattctagagaacacgctcaaa 2040
Query: 2040 cccatcaagtgccacaaggcgctttactatgatgatccattcttcactgatgagcttatt 2099
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||
Sbjct: 2041 ccaatcaaatgccacaaggcgctttactatgatgatccattcttcaccgatgaactcatt 2100
Query: 2100 aaggtaagtccaagcttgagcaagaaatacaaattagggaaagtgcctaatcaagcaaca 2159
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||
Sbjct: 2101 aaggtaagtccaagcttgagcaagaaatacaaattggggaaagtgcctgatcagacgact 2160
Query: 2160 ttttatgacgatttgcaagccgctaaaactagaggcgaattgagctatgataagtcttta 2219
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 2161 ttttatgatgatttgcaagccgctaaaaccagaggcgaattgagctatgacaagtcttta 2220
Query: 2220 gtgcctgtgggttcaagcgaactgtga 2246
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2221 gtgcctgtgggttcaagcgaactgtga 2247 |