Homolog Viewer

PAthogenisity Island DataBase (PAI DB)

Home PAIs REIs Genomes Search Links

Homologs of SC1402 gene of NC_006905_P3

DNA-level

Hit (GenBank Accn)

Product

Source Genome

Eval.

Ident.(%)

1) orf245
( - )

NC_011274
(Salmonella enterica 287/91)

0.0

99.5

2) SPUCDC_1198
( - )

NC_022221
(Salmonella enterica CDC1983-67)

0.0

99.3

3) SPUL_1198
( - )

NC_016831
(Salmonella enterica RKS5078)

0.0

99.3

4) I137_05515
( - )

NC_021984
(Salmonella enterica S06004)

0.0

99.3

• Sequence Alignments

1) orf245 in NC_011274


>NC_006905_P3|4|G4|62179972|YP_216389.1|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Choleraesuis_str._SC-B67|-|4132..4869|-|SC1402|hypothetical 
          Length = 738

 Score = 1423 bits (3671), Expect = 0.0
 Identities = 734/738 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaaaattttatttattggcgaatcctggcacattcatatgattcactctaaaggtttt 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaaaattttatttattggcgaatcctggcacattcatatgattcactctaaaggtttt 60

Query: 61  gatagctttacatcgagcaaatatgaagaaggcgcagactatttattatcctgcttacgc 120
           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  gatagctttacatcgagcaaatacgaagaaggcgcagactatttattatcctgcttacgc 120

Query: 121 tagggtaatatcgatgtggactacatgcctgcccatattgtgcaaactcgttttccacat 180
            |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct: 121 cagggtaatatcgatgtagactacatgcctgcccatattgtgcaaactcgttttccacaa 180

Query: 181 accgccgaagcattagcctgctatgatgcgatcgtcatcagtgatatcggtagcaatacg 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 accgccgaagcattagcctgctatgatgcgatcgtcatcagtgatatcggtagcaatacg 240

Query: 241 ttcctgctacaaaacagaacgttttataatatggacattattcctgatgcattacaactt 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ttcctgctacaaaacagaacgttttataatatggacattattcctgatgcattacaactt 300

Query: 301 atcgccgattatgttgctgagggcggcggtctgttgatgatcggcgggtatttatccttt 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 atcgccgattatgttgctgagggcggcggtctgttgatgatcggcgggtatttatccttt 360

Query: 361 acgggaatagaagcaaaagccaattataaaaatacggttctggcggaggtattgccggtt 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 acgggaatagaagcaaaagccaattataaaaatacggttctggcggaggtattgccggtt 420

Query: 421 gatatgctggatgtagatgaccgcgtagaactaccgcaaggatgtaaagcagtaaatact 480
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gatatgctggatgtagatgaccgcgtagaactaccgcaaggatgtaaagcagtaaatact 480

Query: 481 gcggtagagcatgttattacccagccatttagcgaatggccgccgctgttgggctataac 540
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gcggtagagcatgttattacccagccatttagcgaatggccgccgctgttgggctataac 540

Query: 541 aagcttatcgccaaagaaaatagtcaagtccttgctgaaattaatggcgatccactgtta 600
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 aagcttatcgccaaagaaaatagtcaagtccttgctgaaattaatggcgatccactgtta 600

Query: 601 gttatgggtacttaccataaagggaaagtatgttgctttgccagtgattgttcgccgcac 660
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gttatgggtacttaccataaagggaaagtatgttgctttgccagtgattgttcgccgcac 660

Query: 661 tggggaagcccgcagtttctgcaatgggaacattacgccaccttctggtgtaatgtttta 720
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 tggggaagcccgcagtttctgcaatgggaacattacgccaccttctggtgtaatgtttta 720

Query: 721 cacacaataaaaaaataa 738
           ||||||||||||||||||
Sbjct: 721 cacacaataaaaaaataa 738

2) SPUCDC_1198 in NC_022221


>NC_006905_P3|4|G4|62179972|YP_216389.1|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Choleraesuis_str._SC-B67|-|4132..4869|-|SC1402|hypothetical 
          Length = 738

 Score = 1420 bits (3664), Expect = 0.0
 Identities = 733/738 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaaaattttatttattggcgaatcctggcacattcatatgattcactctaaaggtttt 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaaaattttatttattggcgaatcctggcacattcatatgattcactctaaaggtttt 60

Query: 61  gatagctttacatcaagcaaatatgaagaaggcgcagactatttattatcctgcttacgc 120
           |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  gatagctttacatcgagcaaatacgaagaaggcgcagactatttattatcctgcttacgc 120

Query: 121 tagggtaatatcgatgtggactacatgcctgcccatattgtgcaaactcgttttccacat 180
            |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct: 121 cagggtaatatcgatgtagactacatgcctgcccatattgtgcaaactcgttttccacaa 180

Query: 181 accgccgaagcattagcctgctatgatgcgatcgtcatcagtgatatcggtagcaatacg 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 accgccgaagcattagcctgctatgatgcgatcgtcatcagtgatatcggtagcaatacg 240

Query: 241 ttcctgctacaaaacagaacgttttataatatggacattattcctgatgcattacaactt 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ttcctgctacaaaacagaacgttttataatatggacattattcctgatgcattacaactt 300

Query: 301 atcgccgattatgttgctgagggcggcggtctgttgatgatcggcgggtatttatccttt 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 atcgccgattatgttgctgagggcggcggtctgttgatgatcggcgggtatttatccttt 360

Query: 361 acgggaatagaagcaaaagccaattataaaaatacggttctggcggaggtattgccggtt 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 acgggaatagaagcaaaagccaattataaaaatacggttctggcggaggtattgccggtt 420

Query: 421 gatatgctggatgtagatgaccgcgtagaactaccgcaaggatgtaaagcagtaaatact 480
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gatatgctggatgtagatgaccgcgtagaactaccgcaaggatgtaaagcagtaaatact 480

Query: 481 gcggtagagcatgttattacccagccatttagcgaatggccgccgctgttgggctataac 540
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gcggtagagcatgttattacccagccatttagcgaatggccgccgctgttgggctataac 540

Query: 541 aagcttatcgccaaagaaaatagtcaagtccttgctgaaattaatggcgatccactgtta 600
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 aagcttatcgccaaagaaaatagtcaagtccttgctgaaattaatggcgatccactgtta 600

Query: 601 gttatgggtacttaccataaagggaaagtatgttgctttgccagtgattgttcgccgcac 660
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gttatgggtacttaccataaagggaaagtatgttgctttgccagtgattgttcgccgcac 660

Query: 661 tggggaagcccgcagtttctgcaatgggaacattacgccaccttctggtgtaatgtttta 720
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 tggggaagcccgcagtttctgcaatgggaacattacgccaccttctggtgtaatgtttta 720

Query: 721 cacacaataaaaaaataa 738
           ||||||||||||||||||
Sbjct: 721 cacacaataaaaaaataa 738

3) SPUL_1198 in NC_016831


>NC_006905_P3|4|G4|62179972|YP_216389.1|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Choleraesuis_str._SC-B67|-|4132..4869|-|SC1402|hypothetical 
          Length = 738

 Score = 1420 bits (3664), Expect = 0.0
 Identities = 733/738 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaaaattttatttattggcgaatcctggcacattcatatgattcactctaaaggtttt 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaaaattttatttattggcgaatcctggcacattcatatgattcactctaaaggtttt 60

Query: 61  gatagctttacatcaagcaaatatgaagaaggcgcagactatttattatcctgcttacgc 120
           |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  gatagctttacatcgagcaaatacgaagaaggcgcagactatttattatcctgcttacgc 120

Query: 121 tagggtaatatcgatgtggactacatgcctgcccatattgtgcaaactcgttttccacat 180
            |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct: 121 cagggtaatatcgatgtagactacatgcctgcccatattgtgcaaactcgttttccacaa 180

Query: 181 accgccgaagcattagcctgctatgatgcgatcgtcatcagtgatatcggtagcaatacg 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 accgccgaagcattagcctgctatgatgcgatcgtcatcagtgatatcggtagcaatacg 240

Query: 241 ttcctgctacaaaacagaacgttttataatatggacattattcctgatgcattacaactt 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ttcctgctacaaaacagaacgttttataatatggacattattcctgatgcattacaactt 300

Query: 301 atcgccgattatgttgctgagggcggcggtctgttgatgatcggcgggtatttatccttt 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 atcgccgattatgttgctgagggcggcggtctgttgatgatcggcgggtatttatccttt 360

Query: 361 acgggaatagaagcaaaagccaattataaaaatacggttctggcggaggtattgccggtt 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 acgggaatagaagcaaaagccaattataaaaatacggttctggcggaggtattgccggtt 420

Query: 421 gatatgctggatgtagatgaccgcgtagaactaccgcaaggatgtaaagcagtaaatact 480
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gatatgctggatgtagatgaccgcgtagaactaccgcaaggatgtaaagcagtaaatact 480

Query: 481 gcggtagagcatgttattacccagccatttagcgaatggccgccgctgttgggctataac 540
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gcggtagagcatgttattacccagccatttagcgaatggccgccgctgttgggctataac 540

Query: 541 aagcttatcgccaaagaaaatagtcaagtccttgctgaaattaatggcgatccactgtta 600
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 aagcttatcgccaaagaaaatagtcaagtccttgctgaaattaatggcgatccactgtta 600

Query: 601 gttatgggtacttaccataaagggaaagtatgttgctttgccagtgattgttcgccgcac 660
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gttatgggtacttaccataaagggaaagtatgttgctttgccagtgattgttcgccgcac 660

Query: 661 tggggaagcccgcagtttctgcaatgggaacattacgccaccttctggtgtaatgtttta 720
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 tggggaagcccgcagtttctgcaatgggaacattacgccaccttctggtgtaatgtttta 720

Query: 721 cacacaataaaaaaataa 738
           ||||||||||||||||||
Sbjct: 721 cacacaataaaaaaataa 738

4) I137_05515 in NC_021984


>NC_006905_P3|4|G4|62179972|YP_216389.1|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Choleraesuis_str._SC-B67|-|4132..4869|-|SC1402|hypothetical 
          Length = 738

 Score = 1420 bits (3664), Expect = 0.0
 Identities = 733/738 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaaaattttatttattggcgaatcctggcacattcatatgattcactctaaaggtttt 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaaaattttatttattggcgaatcctggcacattcatatgattcactctaaaggtttt 60

Query: 61  gatagctttacatcaagcaaatatgaagaaggcgcagactatttattatcctgcttacgc 120
           |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  gatagctttacatcgagcaaatacgaagaaggcgcagactatttattatcctgcttacgc 120

Query: 121 tagggtaatatcgatgtggactacatgcctgcccatattgtgcaaactcgttttccacat 180
            |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct: 121 cagggtaatatcgatgtagactacatgcctgcccatattgtgcaaactcgttttccacaa 180

Query: 181 accgccgaagcattagcctgctatgatgcgatcgtcatcagtgatatcggtagcaatacg 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 accgccgaagcattagcctgctatgatgcgatcgtcatcagtgatatcggtagcaatacg 240

Query: 241 ttcctgctacaaaacagaacgttttataatatggacattattcctgatgcattacaactt 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ttcctgctacaaaacagaacgttttataatatggacattattcctgatgcattacaactt 300

Query: 301 atcgccgattatgttgctgagggcggcggtctgttgatgatcggcgggtatttatccttt 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 atcgccgattatgttgctgagggcggcggtctgttgatgatcggcgggtatttatccttt 360

Query: 361 acgggaatagaagcaaaagccaattataaaaatacggttctggcggaggtattgccggtt 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 acgggaatagaagcaaaagccaattataaaaatacggttctggcggaggtattgccggtt 420

Query: 421 gatatgctggatgtagatgaccgcgtagaactaccgcaaggatgtaaagcagtaaatact 480
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gatatgctggatgtagatgaccgcgtagaactaccgcaaggatgtaaagcagtaaatact 480

Query: 481 gcggtagagcatgttattacccagccatttagcgaatggccgccgctgttgggctataac 540
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gcggtagagcatgttattacccagccatttagcgaatggccgccgctgttgggctataac 540

Query: 541 aagcttatcgccaaagaaaatagtcaagtccttgctgaaattaatggcgatccactgtta 600
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 aagcttatcgccaaagaaaatagtcaagtccttgctgaaattaatggcgatccactgtta 600

Query: 601 gttatgggtacttaccataaagggaaagtatgttgctttgccagtgattgttcgccgcac 660
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gttatgggtacttaccataaagggaaagtatgttgctttgccagtgattgttcgccgcac 660

Query: 661 tggggaagcccgcagtttctgcaatgggaacattacgccaccttctggtgtaatgtttta 720
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 tggggaagcccgcagtttctgcaatgggaacattacgccaccttctggtgtaatgtttta 720

Query: 721 cacacaataaaaaaataa 738
           ||||||||||||||||||
Sbjct: 721 cacacaataaaaaaataa 738