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Homologs of pipD gene of AF060858

DNA-level

Hit (GenBank Accn)

Product

Source Genome

Eval.

Ident.(%)

1) STMMW_11041
( - )

NC_016854
(Salmonella enterica D23580)

0.0

99.1

2) pipD
( - )

NC_011147
(Salmonella enterica AKU12601)

0.0

97.9

3) pipD
( - )

NC_006511
(Salmonella enterica ATCC 9150)

0.0

97.9

• Sequence Alignments

1) STMMW_11041 in NC_016854


>AF060858|4|G4|3511131|AAC33721.1|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Dublin_2229|+|2865..4166|pipD|-|dipeptidase 
          Length = 1302

 Score = 2465 bits (6361), Expect = 0.0
 Identities = 1274/1287 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1    atgaaaaagtatcttgcattcgccgttacgctgctgggtatgggtaaagtcatcgcctgt 60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1    atgaaaaagtatcttgcattcgccgttacgctgctgggtatgggtaaagtcatcgcctgt 60

Query: 61   actacccttttggtaggcaatcaggcttcggctgacggctccttcattatcgcgcgcaac 120
            ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61   actacccttttcgtaggcaatcaggcttcggctgacggctccttcattatcgcgcgcaac 120

Query: 121  gaagatggctcggcaaataacgccaagcataaggttattcatcccatcgcgtttcatcaa 180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 121  gaagatggctcggcaaataacgccaagcataaggttattcatcccgtcgcgtttcatcaa 180

Query: 181  caaggcgagtataaagcacatcggaacaattttagctggccgcttccggagacagcgatg 240
            ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181  caaggcgagtataaagcacatcgcaacaattttagctggccgcttccggagacagcgatg 240

Query: 241  cgctatacggcgattcatgactttgatactaacgataacgccatgggtgaagccggtttc 300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241  cgctatacggcgattcatgactttgatactaacgataacgccatgggtgaagccggtttc 300

Query: 301  aattcggcgggcgtcggaatgagcgcaacggaaaccatttataacggcagagcggcgctg 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301  aattcggcgggcgtcggaatgagcgcaacggaaaccatttataacggcagagcggcgctg 360

Query: 361  gctgccgatccttacgtgacaaaaacgggaatcacggaagacgccattgagtccgtgatc 420
            |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361  gctgccgatccttacgtgacaaaaacaggaatcacggaagacgccattgagtccgtgatc 420

Query: 421  ctgccagtggcgcaatcggcgcgtcagggcgccaaattactgggagatattattgaacaa 480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 421  ctgccagtggcgcaatcggcgcgtcagggcgccaaattactgggagacattattgaacaa 480

Query: 481  aaaggcgcgggcgaaggtttcggcgtcgcgtttattgatagcaaagagatatggtatctg 540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481  aaaggcgcgggcgaaggtttcggcgtcgcgtttattgatagcaaagagatatggtatctg 540

Query: 541  gagacgggaagcggtcatcaatggctggcagtacgacttccggcagatagctatttcgtt 600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541  gagacgggaagcggtcatcaatggctggcagtacgacttccggcagatagctatttcgtt 600

Query: 601  tccgccaatcagggacgtttacgccattacgatccgaatgataacgcgaattatatggcg 660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601  tccgccaatcagggacgtttacgccattacgatccgaatgataacgcgaattatatggcg 660

Query: 661  tcaccaacgttagtaagctttgcgaaaaagcagggattatatgatccggcccgcggcgaa 720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661  tcaccaacgttagtaagctttgcgaaaaagcagggattatatgatccggcccgcggcgaa 720

Query: 721  ttcgactttcatcaagcctattcgcaggataacaaaaacgataccacctataattatccg 780
            ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721  ttcgactttcatcaagcctattcacaggataacaaaaacgataccacctataattatccg 780

Query: 781  cgcgtctggacgctacaacaccagtttaatccgcatctggatacggtcgttagcgaaggg 840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||
Sbjct: 781  cgcgtctggacgctacaacaccagtttaatccgcatctggatacggtcgttagcccaggg 840

Query: 841  gaaacatttcctgtttttttaacgccaataacgaagatcagcgtggcggcagtaaaaaac 900
            ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 841  gaaacatttcccgtttttttaacgccaataacgaagatcagcgtggccgcagtaaaaaac 900

Query: 901  gcgctacgcaatcactatcagggaacgtcgcacgacccttatgccagtcataatccacaa 960
            ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901  gcgttacgcaatcactatcagggaacgtcgcacgacccttatgccagtcataatccacaa 960

Query: 961  gaaccatggcgacctatatccgtttttcgtacccaggagtcacatattttacaggtcaga 1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961  gaaccatggcgacctatatccgtttttcgtacccaggagtcacatattttacaggtcaga 1020

Query: 1021 ccgaaattaccgcaggctatcggcaacgtagaatacatcgcctatggaatgccatctctt 1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 ccgaaattaccgcaggctatcggcaacgtagaatacatcgcctatggaatgccatctctt 1080

Query: 1081 agcgtctatctcccctattatcaggggatgcgtcattatcaacccggagatgataaagga 1140
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 agcgtctatctcccctattatcaggggatgcgtcattatcaacccggagatgataaagga 1140

Query: 1141 accgatcgggcgagcaacgactctacctactggacattccgcacgctgcaaacgctggtt 1200
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 -ccgatcgggcgagcaacgactctacctactggacattccgcacgctgcaaacgctggtt 1199

Query: 1201 atgcaggactacaatgcgtttgcgccagatgtgcaacacgcctggaaaacatttgaacag 1260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 1200 atgcaggactacaatgcgtttgcgccagatgtgcaacacgcctgcaaaacatttgaacag 1259

Query: 1261 caaacagctaagcagcagtataagatg 1287
            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1260 caaacagctaagcagcagtataagatg 1286

2) pipD in NC_011147


>AF060858|4|G4|3511131|AAC33721.1|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Dublin_2229|+|2865..4166|pipD|-|dipeptidase 
          Length = 1302

 Score = 2450 bits (6322), Expect = 0.0
 Identities = 1275/1303 (98%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1    atgaaaaagtatcttgctttcgtcgttacgctgctgggtatgggtaaagtcatcgcctgt 60
            ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1    atgaaaaagtatcttgcattcgccgttacgctgctgggtatgggtaaagtcatcgcctgt 60

Query: 61   actacccttttggtaggcaatcaggcttcggctgacggctcctttattatcgcgcgcaac 120
            ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 61   actacccttttcgtaggcaatcaggcttcggctgacggctccttcattatcgcgcgcaac 120

Query: 121  gaggatggctcggcaaataacgccaagcataaggttattcatcccgtcgcgtttcatcaa 180
            || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121  gaagatggctcggcaaataacgccaagcataaggttattcatcccgtcgcgtttcatcaa 180

Query: 181  caaggcgagtataaagcacatcgcaacaattttagctgaccgcttccggagacagcgatg 240
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 181  caaggcgagtataaagcacatcgcaacaattttagctggccgcttccggagacagcgatg 240

Query: 241  cgctatacggcgattcatgactttgatactaacgataacgccatgggtgaagccggtttc 300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241  cgctatacggcgattcatgactttgatactaacgataacgccatgggtgaagccggtttc 300

Query: 301  aattcggcgggcgtcggaatgagcgcaacggaaaccatttacaacggcagagcggcgctg 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 301  aattcggcgggcgtcggaatgagcgcaacggaaaccatttataacggcagagcggcgctg 360

Query: 361  gctgccgatccttacgtgacaaaaacgggaatcacggaagacgccattgagtccgtgatc 420
            |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361  gctgccgatccttacgtgacaaaaacaggaatcacggaagacgccattgagtccgtgatc 420

Query: 421  ctgccagtggtgcaatcggcgcgtcagggcgccaaattactgggcgacattattgaacaa 480
            |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 421  ctgccagtggcgcaatcggcgcgtcagggcgccaaattactgggagacattattgaacaa 480

Query: 481  aaaggcgctggcgaaggtttcggcgtcgcgtttattgatagcaaagagatatggtatctg 540
            |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481  aaaggcgcgggcgaaggtttcggcgtcgcgtttattgatagcaaagagatatggtatctg 540

Query: 541  gagacgggaagcggacatcaatggctggcagtacgacttccggcagatagctatttcgtt 600
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541  gagacgggaagcggtcatcaatggctggcagtacgacttccggcagatagctatttcgtt 600

Query: 601  tccgccaatcagggacgtttacggcattacgatccgaatgataacgcgaattatatggcg 660
            ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601  tccgccaatcagggacgtttacgccattacgatccgaatgataacgcgaattatatggcg 660

Query: 661  tcatcaacgttagtaagctttgcgaaaaagcagggattatatgatccggcccgcggcgaa 720
            ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661  tcaccaacgttagtaagctttgcgaaaaagcagggattatatgatccggcccgcggcgaa 720

Query: 721  ttcgactttcatcaagcctattcgcaggataacaaaaacgataccacctataattatccg 780
            ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721  ttcgactttcatcaagcctattcacaggataacaaaaacgataccacctataattatccg 780

Query: 781  cgcgtctggacgctacaacaccagtttaatccgcatctggatacggccgttagcgaaggg 840
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||
Sbjct: 781  cgcgtctggacgctacaacaccagtttaatccgcatctggatacggtcgttagcccaggg 840

Query: 841  gaaacatttcctgtttttttaacgccaataacgaagatcagcgtggcggcagtaaaaaac 900
            ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 841  gaaacatttcccgtttttttaacgccaataacgaagatcagcgtggccgcagtaaaaaac 900

Query: 901  gcgttacgcaatcactatcagggaacgtcgcacgacccttatgccagtcataatccacaa 960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901  gcgttacgcaatcactatcagggaacgtcgcacgacccttatgccagtcataatccacaa 960

Query: 961  gaaccatggcgacctatatccgtttttcgtacccaggagtcacatattttacaggtcaga 1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961  gaaccatggcgacctatatccgtttttcgtacccaggagtcacatattttacaggtcaga 1020

Query: 1021 ccgaaattaccgcaggctatcggcaacgtagaatacatcgcctatggaatgccatctctt 1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 ccgaaattaccgcaggctatcggcaacgtagaatacatcgcctatggaatgccatctctt 1080

Query: 1081 agcgtctatctcccctattaccaggggatgcgtcattatcaacccggagatgataaagga 1140
            |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 agcgtctatctcccctattatcaggggatgcgtcattatcaacccggagatgataaagga 1140

Query: 1141 accgatcgggcgagcaacgactctacctactggacattccgcacgctgcaaacactggtt 1200
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 1141 -ccgatcgggcgagcaacgactctacctactggacattccgcacgctgcaaacgctggtt 1199

Query: 1201 atgcaagactacaatacgtttgcgccagatgtgcaacatgcctggaaaacatttgaacag 1260
            ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct: 1200 atgcaggactacaatgcgtttgcgccagatgtgcaacacgcctgcaaaacatttgaacag 1259

Query: 1261 caaacagctaagcaacagtataagatggagcagagctatctga 1303
            |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1260 caaacagctaagcagcagtataagatggagcagagctatctga 1302

3) pipD in NC_006511


>AF060858|4|G4|3511131|AAC33721.1|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Dublin_2229|+|2865..4166|pipD|-|dipeptidase 
          Length = 1302

 Score = 2450 bits (6322), Expect = 0.0
 Identities = 1275/1303 (98%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1    atgaaaaagtatcttgctttcgtcgttacgctgctgggtatgggtaaagtcatcgcctgt 60
            ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1    atgaaaaagtatcttgcattcgccgttacgctgctgggtatgggtaaagtcatcgcctgt 60

Query: 61   actacccttttggtaggcaatcaggcttcggctgacggctcctttattatcgcgcgcaac 120
            ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 61   actacccttttcgtaggcaatcaggcttcggctgacggctccttcattatcgcgcgcaac 120

Query: 121  gaggatggctcggcaaataacgccaagcataaggttattcatcccgtcgcgtttcatcaa 180
            || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121  gaagatggctcggcaaataacgccaagcataaggttattcatcccgtcgcgtttcatcaa 180

Query: 181  caaggcgagtataaagcacatcgcaacaattttagctgaccgcttccggagacagcgatg 240
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 181  caaggcgagtataaagcacatcgcaacaattttagctggccgcttccggagacagcgatg 240

Query: 241  cgctatacggcgattcatgactttgatactaacgataacgccatgggtgaagccggtttc 300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241  cgctatacggcgattcatgactttgatactaacgataacgccatgggtgaagccggtttc 300

Query: 301  aattcggcgggcgtcggaatgagcgcaacggaaaccatttacaacggcagagcggcgctg 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 301  aattcggcgggcgtcggaatgagcgcaacggaaaccatttataacggcagagcggcgctg 360

Query: 361  gctgccgatccttacgtgacaaaaacgggaatcacggaagacgccattgagtccgtgatc 420
            |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361  gctgccgatccttacgtgacaaaaacaggaatcacggaagacgccattgagtccgtgatc 420

Query: 421  ctgccagtggtgcaatcggcgcgtcagggcgccaaattactgggcgacattattgaacaa 480
            |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 421  ctgccagtggcgcaatcggcgcgtcagggcgccaaattactgggagacattattgaacaa 480

Query: 481  aaaggcgctggcgaaggtttcggcgtcgcgtttattgatagcaaagagatatggtatctg 540
            |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481  aaaggcgcgggcgaaggtttcggcgtcgcgtttattgatagcaaagagatatggtatctg 540

Query: 541  gagacgggaagcggacatcaatggctggcagtacgacttccggcagatagctatttcgtt 600
            |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541  gagacgggaagcggtcatcaatggctggcagtacgacttccggcagatagctatttcgtt 600

Query: 601  tccgccaatcagggacgtttacggcattacgatccgaatgataacgcgaattatatggcg 660
            ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601  tccgccaatcagggacgtttacgccattacgatccgaatgataacgcgaattatatggcg 660

Query: 661  tcatcaacgttagtaagctttgcgaaaaagcagggattatatgatccggcccgcggcgaa 720
            ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661  tcaccaacgttagtaagctttgcgaaaaagcagggattatatgatccggcccgcggcgaa 720

Query: 721  ttcgactttcatcaagcctattcgcaggataacaaaaacgataccacctataattatccg 780
            ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721  ttcgactttcatcaagcctattcacaggataacaaaaacgataccacctataattatccg 780

Query: 781  cgcgtctggacgctacaacaccagtttaatccgcatctggatacggccgttagcgaaggg 840
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||
Sbjct: 781  cgcgtctggacgctacaacaccagtttaatccgcatctggatacggtcgttagcccaggg 840

Query: 841  gaaacatttcctgtttttttaacgccaataacgaagatcagcgtggcggcagtaaaaaac 900
            ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 841  gaaacatttcccgtttttttaacgccaataacgaagatcagcgtggccgcagtaaaaaac 900

Query: 901  gcgttacgcaatcactatcagggaacgtcgcacgacccttatgccagtcataatccacaa 960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901  gcgttacgcaatcactatcagggaacgtcgcacgacccttatgccagtcataatccacaa 960

Query: 961  gaaccatggcgacctatatccgtttttcgtacccaggagtcacatattttacaggtcaga 1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961  gaaccatggcgacctatatccgtttttcgtacccaggagtcacatattttacaggtcaga 1020

Query: 1021 ccgaaattaccgcaggctatcggcaacgtagaatacatcgcctatggaatgccatctctt 1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 ccgaaattaccgcaggctatcggcaacgtagaatacatcgcctatggaatgccatctctt 1080

Query: 1081 agcgtctatctcccctattaccaggggatgcgtcattatcaacccggagatgataaagga 1140
            |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 agcgtctatctcccctattatcaggggatgcgtcattatcaacccggagatgataaagga 1140

Query: 1141 accgatcgggcgagcaacgactctacctactggacattccgcacgctgcaaacactggtt 1200
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 1141 -ccgatcgggcgagcaacgactctacctactggacattccgcacgctgcaaacgctggtt 1199

Query: 1201 atgcaagactacaatacgtttgcgccagatgtgcaacatgcctggaaaacatttgaacag 1260
            ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct: 1200 atgcaggactacaatgcgtttgcgccagatgtgcaacacgcctgcaaaacatttgaacag 1259

Query: 1261 caaacagctaagcaacagtataagatggagcagagctatctga 1303
            |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1260 caaacagctaagcagcagtataagatggagcagagctatctga 1302