Homolog Viewer

PAthogenisity Island DataBase (PAI DB)

Home PAIs REIs Genomes Search Links

Homologs of SA0406 gene of NC_002745_P1

DNA-level

Hit (GenBank Accn)

Product

Source Genome

Eval.

Ident.(%)

1) SAAV_0389
( - )

NC_013450
(Staphylococcus aureus ED98)

0.0

100

2) SAOV_0459
( - )

NC_017337
(Staphylococcus aureus ED133)

0.0

94.2

3) SAR0446
( - )

NC_002952
(Staphylococcus aureus MRSA252)

0.0

98.6

• Sequence Alignments

1) SAAV_0389 in NC_013450


>NC_002745_P1|32|G32|15926124|NP_373657.1|Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315|+|29333..30658|-|SA0406|hypothetical 
          Length = 1326

 Score = 2538 bits (6548), Expect = 0.0
 Identities = 1325/1326 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1    atgaaagataaatacaaaatagatccagggattattaaaaataatacagaggaaactaca 60
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1    atgaaagataaatacaaaatagatccagggattattaaaaataatacagaggaaactaca 60

Query: 61   gctatttctaaaatcagctacgaagttgaaaatgcgaatttatatggagctgatagtgaa 120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61   gctatttctaaaatcagctacgaagttgaaaatgcgaatttatatggagctgatagtgaa 120

Query: 121  gatataacaagacaaatagaatatttgaaagccaaaaaaaa-ttcccttctaatcttgaa 179
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 121  gatataacaagacaaatagaatatttgaaagccaaaaaaaaattcccttctaatcttgaa 180

Query: 180  tatgttgatagttacactgattctcttaatggagtaacaacttctgcttttttaaataaa 239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181  tatgttgatagttacactgattctcttaatggagtaacaacttctgcttttttaaataaa 240

Query: 240  gatacaggcaaagtaactcttgggatgactgggactaatatacaaggcgaagcctttaaa 299
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241  gatacaggcaaagtaactcttgggatgactgggactaatatacaaggcgaagcctttaaa 300

Query: 300  aagttaaaagaaggtgaattttcaagacaaaatgttaccaatgctttggaaacagttaaa 359
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301  aagttaaaagaaggtgaattttcaagacaaaatgttaccaatgctttggaaacagttaaa 360

Query: 360  gatggatatgcagatcttaaaatattatattctcctgcatctgatcaaaactatagatat 419
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361  gatggatatgcagatcttaaaatattatattctcctgcatctgatcaaaactatagatat 420

Query: 420  gcgaatacacaagaatttataaataaaataaaaagtaagtatgacattgattttattact 479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421  gcgaatacacaagaatttataaataaaataaaaagtaagtatgacattgattttattact 480

Query: 480  ggtcattcactaggtggaagagatgcggtagttcttggaatgagtaatggtattccgaac 539
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481  ggtcattcactaggtggaagagatgcggtagttcttggaatgagtaatggtattccgaac 540

Query: 540  attgtggtttataatccagctcctatttctataaatagtttgaatcctaattccccagat 599
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541  attgtggtttataatccagctcctatttctataaatagtttgaatcctaattccccagat 600

Query: 600  ggaaaacgattgttagagttatataaaaattataaaggtaatattactaggtttgttgca 659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601  ggaaaacgattgttagagttatataaaaattataaaggtaatattactaggtttgttgca 660

Query: 660  gaaaatgatgcattgacagaaaatctgaagaaatataagcattatgtttttttcggtaat 719
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661  gaaaatgatgcattgacagaaaatctgaagaaatataagcattatgtttttttcggtaat 720

Query: 720  gataaagtctttaaaaatggtaaaggtcatgaaatggaaggctttctgaccgaagaagaa 779
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721  gataaagtctttaaaaatggtaaaggtcatgaaatggaaggctttctgaccgaagaagaa 780

Query: 780  caaaaagctataaaaaaagaacttaaaaaactacaaggttatgcagaagaaaataataag 839
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781  caaaaagctataaaaaaagaacttaaaaaactacaaggttatgcagaagaaaataataag 840

Query: 840  tcatttgtaaagaattcaaataatgctatctctaaattagctagtatagaattacttaga 899
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841  tcatttgtaaagaattcaaataatgctatctctaaattagctagtatagaattacttaga 900

Query: 900  gcaaatatgatgactacaaatggaggaggattatcttcttcgcagcaaaaagttttagaa 959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901  gcaaatatgatgactacaaatggaggaggattatcttcttcgcagcaaaaagttttagaa 960

Query: 960  agtttaacagctttaacaattgcgcagtcattcagtcaactgatagacgatgaaattaat 1019
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961  agtttaacagctttaacaattgcgcagtcattcagtcaactgatagacgatgaaattaat 1020

Query: 1020 caaatcaaaaaaatgtataatgaaaagaaaaaggaatttggaaaaaattgggaagacgct 1079
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 caaatcaaaaaaatgtataatgaaaagaaaaaggaatttggaaaaaattgggaagacgct 1080

Query: 1080 caaaaagctggaaaagctgtaggtgaagatttgagtgtaaatggagttctcaatgcttta 1139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 caaaaagctggaaaagctgtaggtgaagatttgagtgtaaatggagttctcaatgcttta 1140

Query: 1140 gatgaaggtcaagtgaatgaaagtagtatggtaagagaacctgaacaaatgatatctgca 1199
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 gatgaaggtcaagtgaatgaaagtagtatggtaagagaacctgaacaaatgatatctgca 1200

Query: 1200 aaagaaagacaactttcaacgatagggtcttctgtatcaaattatattatgagagttaga 1259
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 aaagaaagacaactttcaacgatagggtcttctgtatcaaattatattatgagagttaga 1260

Query: 1260 ctcagtattaatgaaatcgttgataaagatcaagtgcttgcatcacaaataggtggatta 1319
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 ctcagtattaatgaaatcgttgataaagatcaagtgcttgcatcacaaataggtggatta 1320

Query: 1320 ctatga 1325
            ||||||
Sbjct: 1321 ctatga 1326

2) SAOV_0459 in NC_017337


>NC_002745_P1|32|G32|15926124|NP_373657.1|Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315|+|29333..30658|-|SA0406|hypothetical 
          Length = 1326

 Score = 2286 bits (5898), Expect = 0.0
 Identities = 1249/1326 (94%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1    atgaaagataaatataaaataaaaacagggaatataaatgttgtaactgaagaaactaca 60
            |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||| ||   |   || || |||||||||
Sbjct: 1    atgaaagataaatacaaaatagatccagggattattaaaaataatacagaggaaactaca 60

Query: 61   gctgtttcaaaaattagttatgaacttgagaatgcacatctacataatcttgataatgat 120
            ||| |||| ||||| || || ||| |||| |||||  || || ||     ||||| ||| 
Sbjct: 61   gctatttctaaaatcagctacgaagttgaaaatgcgaatttatatggagctgatagtgaa 120

Query: 121  agcattggaaggcaaataaaaggtttaaagtcagatggtaaattcccttctaatcttgaa 180
               ||   ||| |||||| ||  ||| ||  |  |    |||||||||||||||||||||
Sbjct: 121  gatataacaagacaaatagaatatttgaaagccaaaaaaaaattcccttctaatcttgaa 180

Query: 181  tgtgttgatagttacactgattctcttaatggagtaacaacttctgcttttttaaataaa 240
            | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181  tatgttgatagttacactgattctcttaatggagtaacaacttctgcttttttaaataaa 240

Query: 241  gatacaggcaaagtaactcttgggatgactgggactaatatacaaggctaagcctttaaa 300
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 241  gatacaggcaaagtaactcttgggatgactgggactaatatacaaggcgaagcctttaaa 300

Query: 301  aagttaaaagaaggtgaattttcaagacaaaatgttaccaatgctttggaaacagttaaa 360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301  aagttaaaagaaggtgaattttcaagacaaaatgttaccaatgctttggaaacagttaaa 360

Query: 361  gatggatatgcagatattaaaatattatattctcctgcatctgatcaaaactatagatat 420
            ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361  gatggatatgcagatcttaaaatattatattctcctgcatctgatcaaaactatagatat 420

Query: 421  gcgaatacacaagaatttataaataaaataaaaagtaagtatgacattgattttattact 480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421  gcgaatacacaagaatttataaataaaataaaaagtaagtatgacattgattttattact 480

Query: 481  ggacattcactaggtggaagagatgcggtagttctaggaatgagtaatggtattccgaac 540
            || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481  ggtcattcactaggtggaagagatgcggtagttcttggaatgagtaatggtattccgaac 540

Query: 541  attgtggtttataatccagctcctatttctataactagtttgaatcctaattccccagat 600
            |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541  attgtggtttataatccagctcctatttctataaatagtttgaatcctaattccccagat 600

Query: 601  ggaaaacgtttattagaattatataagaattataaaggtaatattactagatttgttgca 660
            |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 601  ggaaaacgattgttagagttatataaaaattataaaggtaatattactaggtttgttgca 660

Query: 661  gaaaatgatgaattgacagaaaatctgaagaaatataagcattatgtttttttcggtaat 720
            |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661  gaaaatgatgcattgacagaaaatctgaagaaatataagcattatgtttttttcggtaat 720

Query: 721  gatatcgtctttaaaaatggtaaaggtcatgaaatggaagggtttttaaccaaagaagaa 780
            ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||
Sbjct: 721  gataaagtctttaaaaatggtaaaggtcatgaaatggaaggctttctgaccgaagaagaa 780

Query: 781  caaaaagctataaaaaaagaacttaaaaaactaaaaggttatgcagaagaaaataataag 840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781  caaaaagctataaaaaaagaacttaaaaaactacaaggttatgcagaagaaaataataag 840

Query: 841  tcatttgtaaagcattcaaataatgctatctctaaattagctagtatagaattacttaga 900
            |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841  tcatttgtaaagaattcaaataatgctatctctaaattagctagtatagaattacttaga 900

Query: 901  gccaatatgatgactgcaaatggaggaggattatcttcttcgcagcagaaagttttagaa 960
            || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 901  gcaaatatgatgactacaaatggaggaggattatcttcttcgcagcaaaaagttttagaa 960

Query: 961  agtttaacagctttaacaattgcgcagtcattcagtcaactgatagacgatgaaattaat 1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961  agtttaacagctttaacaattgcgcagtcattcagtcaactgatagacgatgaaattaat 1020

Query: 1021 caaatcaaaaaaatgtataatgaaaagaaaaagaaatttgaaaaaaattgggaagacgct 1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 caaatcaaaaaaatgtataatgaaaagaaaaaggaatttggaaaaaattgggaagacgct 1080

Query: 1081 caaaaagctggaaaagctgtaggtgaagatttgagtgtaaatgaagttctcaatgcttta 1140
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 1081 caaaaagctggaaaagctgtaggtgaagatttgagtgtaaatggagttctcaatgcttta 1140

Query: 1141 gatgaaggtcaagtgaatgaaagtagtatggtaagagaacctgaacaaatgatatctgca 1200
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 gatgaaggtcaagtgaatgaaagtagtatggtaagagaacctgaacaaatgatatctgca 1200

Query: 1201 aaagaaagacaactttcaacgatagggtcttctgtatcaaattatattatgagagttaga 1260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 aaagaaagacaactttcaacgatagggtcttctgtatcaaattatattatgagagttaga 1260

Query: 1261 ctcagtattaatgaaatcgttgataaagatcaagtgcttgcatcacaaataggtggatta 1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 ctcagtattaatgaaatcgttgataaagatcaagtgcttgcatcacaaataggtggatta 1320

Query: 1321 ctatga 1326
            ||||||
Sbjct: 1321 ctatga 1326

3) SAR0446 in NC_002952


>NC_002745_P1|32|G32|15926124|NP_373657.1|Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315|+|29333..30658|-|SA0406|hypothetical 
          Length = 1326

 Score = 2179 bits (5623), Expect = 0.0
 Identities = 1148/1164 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 165  ttcccttctaatcttgaatatgttgatagttacactgattctcttactggagtaacaact 224
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 163  ttcccttctaatcttgaatatgttgatagttacactgattctcttaatggagtaacaact 222

Query: 225  tctgcttttttaaataaagatacaggcaaagtaactcttgggatgactgggactaatata 284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 223  tctgcttttttaaataaagatacaggcaaagtaactcttgggatgactgggactaatata 282

Query: 285  caaggcgaagcctttaaaaagttaaaagaaggtgaattttcaagacaaaatgttaccaat 344
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 283  caaggcgaagcctttaaaaagttaaaagaaggtgaattttcaagacaaaatgttaccaat 342

Query: 345  gctttggaaacagttaaagatggatatgcagatattaaaatattatattctcctgcatct 404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 343  gctttggaaacagttaaagatggatatgcagatcttaaaatattatattctcctgcatct 402

Query: 405  gatcaaaactatagatatgcgaatacacaagaatttataaataaaataaaaagtaagtat 464
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 403  gatcaaaactatagatatgcgaatacacaagaatttataaataaaataaaaagtaagtat 462

Query: 465  gacattgattttattactggacattcactaggtggaagagatgcggtagttctaggaatg 524
            |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 463  gacattgattttattactggtcattcactaggtggaagagatgcggtagttcttggaatg 522

Query: 525  agtaatggtattccgaacattgtggtttataatccagctcctatttctataactagtttg 584
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 523  agtaatggtattccgaacattgtggtttataatccagctcctatttctataaatagtttg 582

Query: 585  aatcctaattccccagatggaaaacgattgttagaattatataaaaattataaaggtaat 644
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 583  aatcctaattccccagatggaaaacgattgttagagttatataaaaattataaaggtaat 642

Query: 645  attactaggtttgttgcagaaaatgatgcattgacagaaaatctgaagaaatataagcat 704
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 643  attactaggtttgttgcagaaaatgatgcattgacagaaaatctgaagaaatataagcat 702

Query: 705  tatgtttttttcggtaatgataaagtctttaaaaatggtaaaggtcatgaaatggaaggc 764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 703  tatgtttttttcggtaatgataaagtctttaaaaatggtaaaggtcatgaaatggaaggc 762

Query: 765  tttctgaccgaagaagaacaaaaagctataaaaaaagaacttaaaaaactaaaaggttat 824
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 763  tttctgaccgaagaagaacaaaaagctataaaaaaagaacttaaaaaactacaaggttat 822

Query: 825  gcagaagaaaataataagtcatttgtaaagcattcaaataatgctatctctaaattagct 884
            |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 823  gcagaagaaaataataagtcatttgtaaagaattcaaataatgctatctctaaattagct 882

Query: 885  agtatagaattacttagagccaatatgatgactgcaaatggaggaggattatcttcttcg 944
            |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 883  agtatagaattacttagagcaaatatgatgactacaaatggaggaggattatcttcttcg 942

Query: 945  cagcagaaagttttagacagtttaacagctttaacaattgcgcagtcattcagtcaactg 1004
            ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 943  cagcaaaaagttttagaaagtttaacagctttaacaattgcgcagtcattcagtcaactg 1002

Query: 1005 atagacgatgaaattaatcaaatcaaaaaaatgtataatgaaaagaaaaagaaatttgga 1064
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 1003 atagacgatgaaattaatcaaatcaaaaaaatgtataatgaaaagaaaaaggaatttgga 1062

Query: 1065 aaaaattgggaagacgctcaaaaagctggaaaagctgtaggtgaagatttgagtgtaaat 1124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1063 aaaaattgggaagacgctcaaaaagctggaaaagctgtaggtgaagatttgagtgtaaat 1122

Query: 1125 gaagttcttaatgctttagatgaaggtcaagtgaatgaaagtagtatggtaagagaacct 1184
            | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1123 ggagttctcaatgctttagatgaaggtcaagtgaatgaaagtagtatggtaagagaacct 1182

Query: 1185 gaacaaatgatatctgcaaaagaaagacaactttcaacgatagggtcttctgtatcaaat 1244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1183 gaacaaatgatatctgcaaaagaaagacaactttcaacgatagggtcttctgtatcaaat 1242

Query: 1245 tatattatgagagttagactcagtattaatgaaatcgtagataaagatcaagtgcttgca 1304
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 1243 tatattatgagagttagactcagtattaatgaaatcgttgataaagatcaagtgcttgca 1302

Query: 1305 tcacaaataggtggattactatga 1328
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1303 tcacaaataggtggattactatga 1326