> AJ870974|23|G19|68637855|CAI36060.1|Pseudomonas_syringae_pv._phaseolicola_1302A|+|21605..22963|pilO|-|type
IV pilus protein
Length=452
Score = 617 bits (2330), Expect = 4e-178, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 451/452 (99%), Positives = 452/452 (100%), Gaps = 0/452 (0%)
Query 1 MANLFSLIRKRATRPPTPSDGKVQILTYHGRSFVTGLLWHPLGSLTGYMKEARQFGRTQQ 60
MANLFSLIRKRATRPPTPSDGKVQILTYHGRSFVTGLLWHPLGSLTGYMKEARQFGRTQQ
Sbjct 1 MANLFSLIRKRATRPPTPSDGKVQILTYHGRSFVTGLLWHPLGSLTGYMKEARQFGRTQQ 60
Query 61 MDIVAIRHTESVIQAGFVSQNDGAVKGMYslaaalagqlgaswlaawKIEDAEDRYALVA 120
MDIVAIRHTESVIQAGFVSQNDGAVKGMYSLAAALAGQLGASWLAAWKIEDAEDRYALVA
Sbjct 61 MDIVAIRHTESVIQAGFVSQNDGAVKGMYSLAAALAGQLGASWLAAWKIEDAEDRYALVA 120
Query 121 VYRGAVIPGADLVGSSEEIKKKVAQQLSRSMSFDKIFLPPEFGRGGEQFDPEALLQPSNL 180
VYRGAVIPGADLVGSSEEIKKKVAQQLSRSMSFDKIFLPPEFGRGGEQFDPEALLQPSNL
Sbjct 121 VYRGAVIPGADLVGSSEEIKKKVAQQLSRSMSFDKIFLPPEFGRGGEQFDPEALLQPSNL 180
Query 181 KREYKLTPLAFGLSRQELLKAGVIGALVVAGLIGWHQWNEHKlqlarqaqqaaeaarqae 240
KREYKLTPLAFGLSRQELLKAGVIGALVVAGLIGWHQWNEHKLQLARQAQQAAEAARQAE
Sbjct 181 KREYKLTPLAFGLSRQELLKAGVIGALVVAGLIGWHQWNEHKLQLARQAQQAAEAARQAE 240
Query 241 ldalNQRTNSPVVIEALVHPWVKQPSVPVFLRGCNGAIDQLPPAIQGWLFVSAKCDGTLM 300
LDALNQRTNSPVVIEALVHPWVKQPSVPVFLRGCNGAIDQLPPAI+GWLFVSAKCDGTLM
Sbjct 241 LDALNQRTNSPVVIEALVHPWVKQPSVPVFLRGCNGAIDQLPPAIKGWLFVSAKCDGTLM 300
Query 301 SANYNRTGNSTTLAFSAATAGYFADTPAFYDEGNMAAVKLTFELPLAGDDVLNPATQALD 360
SANYNRTGNSTTLAFSAATAGYFADTPAFYDEGNMAAVKLTFELPLAGDDVLNPATQALD
Sbjct 301 SANYNRTGNSTTLAFSAATAGYFADTPAFYDEGNMAAVKLTFELPLAGDDVLNPATQALD 360
Query 361 SITSWLQAQNVQPKITEVPVTVVqppalpgqpapppppppDYRHFEIRYTSLLPPATVLQ 420
SITSWLQAQNVQPKITEVPVTVVQPPALPGQPAPPPPPPPDYRHFEIRYTSLLPPATVLQ
Sbjct 361 SITSWLQAQNVQPKITEVPVTVVQPPALPGQPAPPPPPPPDYRHFEIRYTSLLPPATVLQ 420
Query 421 GVESTGMRLREIKTDFQDGKLTWNVIGDLYVH 452
GVESTGMRLREIKTDFQDGKLTWNVIGDLYVH
Sbjct 421 GVESTGMRLREIKTDFQDGKLTWNVIGDLYVH 452 |