Homolog Viewer

PAthogenisity Island DataBase (PAI DB)

Home PAIs REIs Genomes Search Links

Homologs of eprJ gene of DQ077151

DNA-level

Hit (GenBank Accn)

Product

Source Genome

Eval.

Ident.(%)

1) EcE24377A_3178
( - )

NC_009801
(Escherichia coli E24377A)

e-159

100

2) EKO11_0878
( - )

NC_016902
(Escherichia coli KO11FL)

e-158

99.7

3) eprJ
( - )

NC_013364
(Escherichia coli 11128)

e-157

99.3

4) EC55989_3138
( - )

NC_011748
(Escherichia coli 55989)

e-117

100

5) ECIAI1_2972
( - )

NC_011741
(Escherichia coli IAI1)

e-116

99.5

• Sequence Alignments

1) EcE24377A_3178 in NC_009801


>DQ077151|2|S1|-|-|Escherichia_coli_789|-|1032..1319|eprJ|-|- 
          Length = 288

 Score = 558 bits (1439), Expect = e-159
 Identities = 288/288 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgtcagtaagcaatatgccacctattgatagagctgagtaatcaactgctcatgaaata 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgtcagtaagcaatatgccacctattgatagagctgagtaatcaactgctcatgaaata 60

Query: 61  cagcaagcgaaagtgattgatttaaatgaccgggttctcaatcttgacaacccggatgat 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cagcaagcgaaagtgattgatttaaatgaccgggttctcaatcttgacaacccggatgat 120

Query: 121 aaaatgatctccgcttttgccaactatgctgtacaaactgaaaattggcagcaaaatgcg 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 aaaatgatctccgcttttgccaactatgctgtacaaactgaaaattggcagcaaaatgcg 180

Query: 181 ttacaagcattaaggtctgataaagaggggttaactcctgaaaaattattagtcttgcag 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttacaagcattaaggtctgataaagaggggttaactcctgaaaaattattagtcttgcag 240

Query: 241 gatcatgtgcttaattataatgtcgaggtttcattggtggaacattag 288
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gatcatgtgcttaattataatgtcgaggtttcattggtggaacattag 288

2) EKO11_0878 in NC_016902


>DQ077151|2|S1|-|-|Escherichia_coli_789|-|1032..1319|eprJ|-|- 
          Length = 288

 Score = 555 bits (1432), Expect = e-158
 Identities = 287/288 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgtcagtaagcaatatgccacctattgatagagctgagcaatcaactgctcatgaaata 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgtcagtaagcaatatgccacctattgatagagctgagtaatcaactgctcatgaaata 60

Query: 61  cagcaagcgaaagtgattgatttaaatgaccgggttctcaatcttgacaacccggatgat 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cagcaagcgaaagtgattgatttaaatgaccgggttctcaatcttgacaacccggatgat 120

Query: 121 aaaatgatctccgcttttgccaactatgctgtacaaactgaaaattggcagcaaaatgcg 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 aaaatgatctccgcttttgccaactatgctgtacaaactgaaaattggcagcaaaatgcg 180

Query: 181 ttacaagcattaaggtctgataaagaggggttaactcctgaaaaattattagtcttgcag 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttacaagcattaaggtctgataaagaggggttaactcctgaaaaattattagtcttgcag 240

Query: 241 gatcatgtgcttaattataatgtcgaggtttcattggtggaacattag 288
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gatcatgtgcttaattataatgtcgaggtttcattggtggaacattag 288

3) eprJ in NC_013364


>DQ077151|2|S1|-|-|Escherichia_coli_789|-|1032..1319|eprJ|-|- 
          Length = 288

 Score = 551 bits (1421), Expect = e-157
 Identities = 286/288 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgtcagtaagcaatatgccacctattgatagagctgagcaatcaactgctcatgaaata 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgtcagtaagcaatatgccacctattgatagagctgagtaatcaactgctcatgaaata 60

Query: 61  cagcaagcgaaagtgattgatttaaatgaccgggttctcaatcttgacaacccggatgat 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cagcaagcgaaagtgattgatttaaatgaccgggttctcaatcttgacaacccggatgat 120

Query: 121 aaaatgatctccgcttttgccaactatgctgtacaaactgaaaattggcagcaaaatgcg 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 aaaatgatctccgcttttgccaactatgctgtacaaactgaaaattggcagcaaaatgcg 180

Query: 181 ttacaagcattaaggtctgataaagagggggtaactcctgaaaaattattagtcttgcag 240
           |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttacaagcattaaggtctgataaagaggggttaactcctgaaaaattattagtcttgcag 240

Query: 241 gatcatgtgcttaattataatgtcgaggtttcattggtggaacattag 288
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gatcatgtgcttaattataatgtcgaggtttcattggtggaacattag 288

4) EC55989_3138 in NC_011748


>DQ077151|2|S1|-|-|Escherichia_coli_789|-|1032..1319|eprJ|-|- 
          Length = 288

 Score = 418 bits (1079), Expect = e-117
 Identities = 216/216 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   gtgattgatttaaatgaccgggttctcaatcttgacaacccggatgataaaatgatctcc 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 73  gtgattgatttaaatgaccgggttctcaatcttgacaacccggatgataaaatgatctcc 132

Query: 61  gcttttgccaactatgctgtacaaactgaaaattggcagcaaaatgcgttacaagcatta 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 133 gcttttgccaactatgctgtacaaactgaaaattggcagcaaaatgcgttacaagcatta 192

Query: 121 aggtctgataaagaggggttaactcctgaaaaattattagtcttgcaggatcatgtgctt 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 193 aggtctgataaagaggggttaactcctgaaaaattattagtcttgcaggatcatgtgctt 252

Query: 181 aattataatgtcgaggtttcattggtggaacattag 216
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 253 aattataatgtcgaggtttcattggtggaacattag 288

5) ECIAI1_2972 in NC_011741


>DQ077151|2|S1|-|-|Escherichia_coli_789|-|1032..1319|eprJ|-|- 
          Length = 288

 Score = 415 bits (1072), Expect = e-116
 Identities = 215/216 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   gtgattgatttaaatgatcgggttctcaatcttgacaacccggatgataaaatgatctcc 60
           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 73  gtgattgatttaaatgaccgggttctcaatcttgacaacccggatgataaaatgatctcc 132

Query: 61  gcttttgccaactatgctgtacaaactgaaaattggcagcaaaatgcgttacaagcatta 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 133 gcttttgccaactatgctgtacaaactgaaaattggcagcaaaatgcgttacaagcatta 192

Query: 121 aggtctgataaagaggggttaactcctgaaaaattattagtcttgcaggatcatgtgctt 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 193 aggtctgataaagaggggttaactcctgaaaaattattagtcttgcaggatcatgtgctt 252

Query: 181 aattataatgtcgaggtttcattggtggaacattag 216
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 253 aattataatgtcgaggtttcattggtggaacattag 288