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Homologs of tnp gene of AB063173

DNA-level

Hit (GenBank Accn)

Product

Source Genome

Eval.

Ident.(%)

1) SERP2219
( - )

NC_002976
(Staphylococcus epidermidis RP62A)

0.0

2) SAUSA300_0069
( - )

NC_007793
(Staphylococcus aureus FPR3757)

0.0

98.8

3) USA300HOU_0074
( - )

NC_010079
(Staphylococcus aureus TCH1516)

0.0

98.8

4) SEA0032
( - )

NC_006663
(Staphylococcus epidermidis RP62A)

0.0

97.5

5) unnamed
( - )

NC_002952
(Staphylococcus aureus MRSA252)

e-296

86.7

6) unnamed
( - )

NC_002952
(Staphylococcus aureus MRSA252)

e-296

86.7

• Sequence Alignments

1) SERP2219 in NC_002976


>AB063173|19|G15|17026008|BAB72136.1|Staphylococcus_aureus_JCSC1978(8/6-3P)|+|18265..18939|tnp|-|transposase 
          Length = 675

 Score = 1271 bits (3281), Expect = 0.0
 Identities = 667/675 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaagatgttatcactgtagccgttggctac 60
           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctac 60

Query: 61  tatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120
           |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  tatctaagatatacattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120

Query: 121 aacgttcatcattcaacggtctaccgttgggttcaagaatatgtctcaattttatatcaa 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||
Sbjct: 121 aacgttcatcattcaacggtctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttgtatcaa 180

Query: 181 atttggaagaaaa-gcatcaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtacatc 239
           ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 atttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtacatc 240

Query: 240 aaaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatgcagagggacatacatta 299
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aaaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatgcagagggacatacatta 300

Query: 300 gatatttggttgcgtaagcaacgagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctc 359
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gatatttggttgcgtaagcaacgagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctc 360

Query: 360 attaaacaatttggtaaacctcaaaaggtaattacagatcaggcaccttcaacgaaggta 419
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 attaaacaatttggtaaacctcaaaaggtaattacagatcaggcaccttcaacgaaggta 420

Query: 420 gcaatggctaaagtaattaaagcttttaaacttaaacctgactgtcattgtacatcgaaa 479
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gcaatggctaaagtaattaaagcttttaaacttaaacctgactgtcattgtacatcgaaa 480

Query: 480 tatctgaataacctcattgagcaagatcaccgtcatattaaagtaagaaagacaaggtat 539
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 tatctgaataacctcattgagcaagatcaccgtcatattaaagtaagaaagacaaggtat 540

Query: 540 caaagtatcaatacagcaaagaatactttaaaaggtattgaatgtatttacgctctatat 599
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 caaagtatcaatacagcaaagaatactttaaaaggtattgaatgtatttacgctctatat 600

Query: 600 aaaaagaaccgcaggtctcttcagatctacggattttcgccatgccacgaaattagcatc 659
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aaaaagaaccgcaggtctcttcagatctacggattttcgccatgccacgaaattagcatc 660

Query: 660 atgctagcgagttaa 674
           |||||||| ||||||
Sbjct: 661 atgctagcaagttaa 675

2) SAUSA300_0069 in NC_007793


>AB063173|19|G15|17026008|BAB72136.1|Staphylococcus_aureus_JCSC1978(8/6-3P)|+|18265..18939|tnp|-|transposase 
          Length = 675

 Score = 1268 bits (3273), Expect = 0.0
 Identities = 666/675 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctac 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctac 60

Query: 61  tatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120
           |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  tatctaagatatacattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120

Query: 121 aacgttcatcattcaacggtctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaa 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 121 aacgttcatcattcaacggtctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttgtatcaa 180

Query: 181 atttggaagaaaaagcataaaaa-gctaattacaaatggcgtattgatgagacgtacatc 239
           ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 atttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtacatc 240

Query: 240 aaaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatgcagagggatatacatta 299
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 241 aaaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatgcagagggacatacatta 300

Query: 300 gatatttggttgcgtaagcaacgagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctc 359
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gatatttggttgcgtaagcaacgagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctc 360

Query: 360 attaaacaatttggtaaacctcaaaaggtaattacagatcaggcaccttcaacgaaggta 419
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 attaaacaatttggtaaacctcaaaaggtaattacagatcaggcaccttcaacgaaggta 420

Query: 420 gcaatggctaaagtaattaaagcttttaaacttaaacctgactgttattgtacatcgaaa 479
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 421 gcaatggctaaagtaattaaagcttttaaacttaaacctgactgtcattgtacatcgaaa 480

Query: 480 tatctgaataacctcattgagcaagatcactgtcatattaaaataagaaagacaaggtat 539
           |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 481 tatctgaataacctcattgagcaagatcaccgtcatattaaagtaagaaagacaaggtat 540

Query: 540 caaaatatcaatacagcaaagaatactttaaaaggtattgaatgtatttacgctctatat 599
           |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 caaagtatcaatacagcaaagaatactttaaaaggtattgaatgtatttacgctctatat 600

Query: 600 aaaaagaaccgcaggtctcttcagatctacggattttcgccatgccacgaaattagcatc 659
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aaaaagaaccgcaggtctcttcagatctacggattttcgccatgccacgaaattagcatc 660

Query: 660 atgctagcaagttaa 674
           |||||||||||||||
Sbjct: 661 atgctagcaagttaa 675

3) USA300HOU_0074 in NC_010079


>AB063173|19|G15|17026008|BAB72136.1|Staphylococcus_aureus_JCSC1978(8/6-3P)|+|18265..18939|tnp|-|transposase 
          Length = 675

 Score = 1268 bits (3273), Expect = 0.0
 Identities = 666/675 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctac 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctac 60

Query: 61  tatctaagatatgcattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120
           |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  tatctaagatatacattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120

Query: 121 aacgttcatcattcaacggtctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttatatcaa 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 121 aacgttcatcattcaacggtctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttgtatcaa 180

Query: 181 atttggaagaaaaagcataaaaa-gctaattacaaatggcgtattgatgagacgtacatc 239
           ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 atttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtacatc 240

Query: 240 aaaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatgcagagggatatacatta 299
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 241 aaaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatgcagagggacatacatta 300

Query: 300 gatatttggttgcgtaagcaacgagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctc 359
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gatatttggttgcgtaagcaacgagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctc 360

Query: 360 attaaacaatttggtaaacctcaaaaggtaattacagatcaggcaccttcaacgaaggta 419
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 attaaacaatttggtaaacctcaaaaggtaattacagatcaggcaccttcaacgaaggta 420

Query: 420 gcaatggctaaagtaattaaagcttttaaacttaaacctgactgttattgtacatcgaaa 479
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 421 gcaatggctaaagtaattaaagcttttaaacttaaacctgactgtcattgtacatcgaaa 480

Query: 480 tatctgaataacctcattgagcaagatcactgtcatattaaaataagaaagacaaggtat 539
           |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 481 tatctgaataacctcattgagcaagatcaccgtcatattaaagtaagaaagacaaggtat 540

Query: 540 caaaatatcaatacagcaaagaatactttaaaaggtattgaatgtatttacgctctatat 599
           |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 caaagtatcaatacagcaaagaatactttaaaaggtattgaatgtatttacgctctatat 600

Query: 600 aaaaagaaccgcaggtctcttcagatctacggattttcgccatgccacgaaattagcatc 659
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aaaaagaaccgcaggtctcttcagatctacggattttcgccatgccacgaaattagcatc 660

Query: 660 atgctagcaagttaa 674
           |||||||||||||||
Sbjct: 661 atgctagcaagttaa 675

4) SEA0032 in NC_006663


>AB063173|19|G15|17026008|BAB72136.1|Staphylococcus_aureus_JCSC1978(8/6-3P)|+|18265..18939|tnp|-|transposase 
          Length = 675

 Score = 1256 bits (3241), Expect = 0.0
 Identities = 658/675 (97%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctac 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctac 60

Query: 61  tatctaagatatgcattgagctatcgtgatatatctgaaatattaagagaacgtggtgta 120
           |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 61  tatctaagatatacattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120

Query: 121 aacgttcatcattcaacgatctaccgttgagttcaagaatatgccccaattttatatcaa 180
           |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 121 aacgttcatcattcaacggtctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttgtatcaa 180

Query: 181 atttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtatatc 240
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 181 atttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtacatc 240

Query: 241 aaaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatacagagggacatacatta 300
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 241 aaaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatgcagagggacatacatta 300

Query: 301 gatatttggttgcgtaagcaacgagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctc 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gatatttggttgcgtaagcaacgagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctc 360

Query: 361 attaaacaatttggtaagcctcaaaaggtagttacagatcaggcaccttcaacgaaggca 420
           ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 361 attaaacaatttggtaaacctcaaaaggtaattacagatcaggcaccttcaacgaaggta 420

Query: 421 gcaatggctaaagtaattaaagcttttaaacttaaacctgactgtcattgtacatcgaaa 480
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gcaatggctaaagtaattaaagcttttaaacttaaacctgactgtcattgtacatcgaaa 480

Query: 481 tatctgaataacctcattgagcaagatcaccgtcatattaaagtaagaaagacaagatat 540
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 481 tatctgaataacctcattgagcaagatcaccgtcatattaaagtaagaaagacaaggtat 540

Query: 541 caaagtatcaatacggcaaaaagtactttaaaaggtattgaatgtatttacgctctatat 600
           |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 caaagtatcaatacagcaaagaatactttaaaaggtattgaatgtatttacgctctatat 600

Query: 601 aaaaagaaccgtaggtctcttcagatctacggattttctccatgccacgaaattagcatc 660
           ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aaaaagaaccgcaggtctcttcagatctacggattttcgccatgccacgaaattagcatc 660

Query: 661 atgctagcaagttaa 675
           |||||||||||||||
Sbjct: 661 atgctagcaagttaa 675

5) unnamed in NC_002952


>AB063173|19|G15|17026008|BAB72136.1|Staphylococcus_aureus_JCSC1978(8/6-3P)|+|18265..18939|tnp|-|transposase 
          Length = 675

 Score = 1013 bits (2615), Expect = e-296
 Identities = 585/675 (87%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 59  atgaattatttcagatataagcaatttgacaaagatgtcattactgtagccgttggctac 118
           ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctac 60

Query: 119 tatctaagatatgcattaagttatcgtgatatatctgaaatattgagagaacgaggcatc 178
           |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  | 
Sbjct: 61  tatctaagatatacattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120

Query: 179 tatgttcatcattcaacaatttatcgatgggtacaggaatatgctcctattttgtatcaa 238
            | ||||||||||||||  | || || ||||| || |||||||| || ||||||||||||
Sbjct: 121 aacgttcatcattcaacggtctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttgtatcaa 180

Query: 239 atttggaagaaaaagaataagcaagcttattataaatggcatatagatgagacgtatatc 298
           ||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||
Sbjct: 181 atttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtacatc 240

Query: 299 aaaattaaagggcaatggaattatttatatcgcgctattgatgcagatggccatacacta 358
           ||||| |||||  ||||||  ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| ||
Sbjct: 241 aaaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatgcagagggacatacatta 300

Query: 359 gatatttcgttacgtaagaaacgagataatcactcagcatatacgtttattaaacgtctt 418
           ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| 
Sbjct: 301 gatatttggttgcgtaagcaacgagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctc 360

Query: 419 attaaacaatttggcaaacctcaaatgataattacagaccaagccccttcaacgaaggtg 478
           |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||| 
Sbjct: 361 attaaacaatttggtaaacctcaaaaggtaattacagatcaggcaccttcaacgaaggta 420

Query: 479 gcaatgtccaaagtgattaaagattttaaacttacccccaactgtcattgtacctctaaa 538
           |||||| | ||||| ||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||||| || |||
Sbjct: 421 gcaatggctaaagtaattaaagcttttaaacttaaacctgactgtcattgtacatcgaaa 480

Query: 539 tatttaaataatctcattgaacaagatcatcgtcatatcaaagtaaggaaaataagttat 598
           ||| | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || | ||| |||
Sbjct: 481 tatctgaataacctcattgagcaagatcaccgtcatattaaagtaagaaagacaaggtat 540

Query: 599 caaagtatcaatacggcaaagaatacgatcaaaggcattgaatgtatttatggactatat 658
           |||||||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||||| |  ||||||
Sbjct: 541 caaagtatcaatacagcaaagaatactttaaaaggtattgaatgtatttacgctctatat 600

Query: 659 aaaaagaaccgcagatctcttcagatctacgggttttcgccatgccgtgtaattagcatc 718
           |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||
Sbjct: 601 aaaaagaaccgcaggtctcttcagatctacggattttcgccatgccacgaaattagcatc 660

Query: 719 atgctagctagttaa 733
           |||||||| ||||||
Sbjct: 661 atgctagcaagttaa 675

6) unnamed in NC_002952


>AB063173|19|G15|17026008|BAB72136.1|Staphylococcus_aureus_JCSC1978(8/6-3P)|+|18265..18939|tnp|-|transposase 
          Length = 675

 Score = 1013 bits (2615), Expect = e-296
 Identities = 585/675 (87%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 59  atgaattatttcagatataagcaatttgacaaagatgtcattactgtagccgttggctac 118
           ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaactatttcagatataaacaatttaacaaggatgttatcactgtagccgttggctac 60

Query: 119 tatctaagatatgcattaagttatcgtgatatatctgaaatattgagagaacgaggcatc 178
           |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  | 
Sbjct: 61  tatctaagatatacattgagttatcgtgatatatctgaaatattaagggaacgtggtgta 120

Query: 179 tatgttcatcattcaacaatttatcgatgggtacaggaatatgctcctattttgtatcaa 238
            | ||||||||||||||  | || || ||||| || |||||||| || ||||||||||||
Sbjct: 121 aacgttcatcattcaacggtctaccgttgggttcaagaatatgccccaattttgtatcaa 180

Query: 239 atttggaagaaaaagaataagcaagcttattataaatggcatatagatgagacgtatatc 298
           ||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||
Sbjct: 181 atttggaagaaaaagcataaaaaagcttattacaaatggcgtattgatgagacgtacatc 240

Query: 299 aaaattaaagggcaatggaattatttatatcgcgctattgatgcagatggccatacacta 358
           ||||| |||||  ||||||  ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| ||
Sbjct: 241 aaaataaaaggaaaatggagctatttatatcgtgccattgatgcagagggacatacatta 300

Query: 359 gatatttcgttacgtaagaaacgagataatcactcagcatatacgtttattaaacgtctt 418
           ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| 
Sbjct: 301 gatatttggttgcgtaagcaacgagataatcattcagcatatgcgtttatcaaacgtctc 360

Query: 419 attaaacaatttggcaaacctcaaatgataattacagaccaagccccttcaacgaaggtg 478
           |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||| 
Sbjct: 361 attaaacaatttggtaaacctcaaaaggtaattacagatcaggcaccttcaacgaaggta 420

Query: 479 gcaatgtccaaagtgattaaagattttaaacttacccccaactgtcattgtacctctaaa 538
           |||||| | ||||| ||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||||| || |||
Sbjct: 421 gcaatggctaaagtaattaaagcttttaaacttaaacctgactgtcattgtacatcgaaa 480

Query: 539 tatttaaataatctcattgaacaagatcatcgtcatatcaaagtaaggaaaataagttat 598
           ||| | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || | ||| |||
Sbjct: 481 tatctgaataacctcattgagcaagatcaccgtcatattaaagtaagaaagacaaggtat 540

Query: 599 caaagtatcaatacggcaaagaatacgatcaaaggcattgaatgtatttatggactatat 658
           |||||||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||||| |  ||||||
Sbjct: 541 caaagtatcaatacagcaaagaatactttaaaaggtattgaatgtatttacgctctatat 600

Query: 659 aaaaagaaccgcagatctcttcagatctacgggttttcgccatgccgtgtaattagcatc 718
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