Homolog Viewer

PAthogenisity Island DataBase (PAI DB)

Home PAIs REIs Genomes Search Links

Homologs of S4063 gene of NC_004741_P2

DNA-level

Hit (GenBank Accn)

Product

Source Genome

Eval.

Ident.(%)

1) SF3705
( - )

NC_004337
(Shigella flexneri 301)

0.0

100

2) SF0319
( - )

NC_004337
(Shigella flexneri 301)

0.0

99.8

3) SF0476
( - )

NC_004337
(Shigella flexneri 301)

0.0

99.8

4) SF2212
( - )

NC_004337
(Shigella flexneri 301)

0.0

99.7

5) SF0228
( - )

NC_004337
(Shigella flexneri 301)

0.0

99.7

6) SFxv_4032
( - )

NC_017328
(Shigella flexneri 2002017)

0.0

100

7) SF1049
( - )

NC_004337
(Shigella flexneri 301)

0.0

99.5

8) SF1057
( - )

NC_004337
(Shigella flexneri 301)

0.0

99.4

9) SF0300
( - )

NC_004337
(Shigella flexneri 301)

0.0

99.2

10) SF0491
( - )

NC_004337
(Shigella flexneri 301)

0.0

99.2

11) unnamed
( - )

NC_007607
(Shigella dysenteriae Sd197)

0.0

98.8

12) SbBS512_A0059
( - )

NC_010660
(Shigella boydii CDC 3083-94)

0.0

98.6

13) SbBS512_A0081
( - )

NC_010660
(Shigella boydii CDC 3083-94)

0.0

98.6

14) unnamed
( - )

NC_013364
(Escherichia coli 11128)

0.0

95.7

15) ECO111_4885
( - )

NC_013364
(Escherichia coli 11128)

0.0

95.7

16) unnamed
( - )

NC_013353
(Escherichia coli 12009)

0.0

94.4

17) unnamed
( - )

NC_013353
(Escherichia coli 12009)

0.0

94.4

18) ECO103_4898
( - )

NC_013353
(Escherichia coli 12009)

0.0

94.4

19) ECO103_3580
( - )

NC_013353
(Escherichia coli 12009)

0.0

94.4

20) join
( - )

NC_017626
(Escherichia coli 042)

0.0

92.7

21) unnamed
( - )

NC_007607
(Shigella dysenteriae Sd197)

0.0

98.8

22) unnamed
( - )

NC_013353
(Escherichia coli 12009)

e-277

94.5

23) ECO103_3568
( - )

NC_013353
(Escherichia coli 12009)

e-277

94.5

24) ECUMN_3342
( - )

NC_011751
(Escherichia coli UMN026)

e-263

92.7

25) unnamed
( - )

NC_017646
(Escherichia coli CE10)

e-235

92.2

26) SF1844
( - )

NC_004337
(Shigella flexneri 301)

e-220

99.8

27) SF0694
( - )

NC_004337
(Shigella flexneri 301)

e-220

99.8

28) SF1919
( - )

NC_004337
(Shigella flexneri 301)

e-216

99.2

• Sequence Alignments

1) SF3705 in NC_004337


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 1274 bits (3288), Expect = 0.0
 Identities = 648/648 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 237 gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 60

Query: 297 ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 356
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 120

Query: 357 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 416
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 180

Query: 417 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 476
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 240

Query: 477 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 536
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 300

Query: 537 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 596
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 360

Query: 597 tcgctggtctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 656
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tcgctggtctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 420

Query: 657 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 716
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 480

Query: 717 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 776
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 540

Query: 777 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 836
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 600

Query: 837 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 884
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648

2) SF0319 in NC_004337


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 1272 bits (3281), Expect = 0.0
 Identities = 647/648 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 237 gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 60

Query: 297 ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 356
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 120

Query: 357 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 416
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 180

Query: 417 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 476
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 240

Query: 477 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 536
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 300

Query: 537 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 596
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 360

Query: 597 tcgctggcctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 656
           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tcgctggtctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 420

Query: 657 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 716
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 480

Query: 717 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 776
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 540

Query: 777 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 836
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 600

Query: 837 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 884
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648

3) SF0476 in NC_004337


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 1272 bits (3281), Expect = 0.0
 Identities = 647/648 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 22  gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 81
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 60

Query: 82  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 141
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 120

Query: 142 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 201
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 180

Query: 202 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 261
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 240

Query: 262 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 321
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 300

Query: 322 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 381
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 360

Query: 382 tcgctggcctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 441
           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tcgctggtctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 420

Query: 442 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 501
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 480

Query: 502 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 561
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 540

Query: 562 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 621
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 600

Query: 622 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 669
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648

4) SF2212 in NC_004337


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 1269 bits (3275), Expect = 0.0
 Identities = 646/648 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 237 gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 60

Query: 297 ggtaaaaaggtccgtacgaccatcggccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 356
           |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 120

Query: 357 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 416
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 180

Query: 417 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 476
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 240

Query: 477 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 536
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 300

Query: 537 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 596
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 360

Query: 597 tcgctggcctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 656
           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tcgctggtctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 420

Query: 657 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 716
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 480

Query: 717 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 776
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 540

Query: 777 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 836
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 600

Query: 837 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 884
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648

5) SF0228 in NC_004337


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 1267 bits (3270), Expect = 0.0
 Identities = 646/648 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 237 gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 60

Query: 297 ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 356
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 120

Query: 357 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 416
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 180

Query: 417 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 476
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 240

Query: 477 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 536
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 300

Query: 537 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 596
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 360

Query: 597 tcgctggcctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 656
           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tcgctggtctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 420

Query: 657 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 716
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 480

Query: 717 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 776
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 540

Query: 777 gactggtataacaatcgacgattgcaggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 836
           ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 600

Query: 837 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 884
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648

6) SFxv_4032 in NC_017328


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 1265 bits (3265), Expect = 0.0
 Identities = 648/649 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 60

Query: 61  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 120

Query: 121 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 180

Query: 181 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 240

Query: 241 ggggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggc 300
           ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ggg-tggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggc 299

Query: 301 gttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgt 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 300 gttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgt 359

Query: 361 atcgctggtctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtac 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 360 atcgctggtctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtac 419

Query: 421 aggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggt 480
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 420 aggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggt 479

Query: 481 aatacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggt 540
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 aatacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggt 539

Query: 541 ggactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagc 600
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 540 ggactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagc 599

Query: 601 agaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 649
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 agaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648

7) SF1049 in NC_004337


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 1265 bits (3264), Expect = 0.0
 Identities = 645/648 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 237 gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 60

Query: 297 ggtaaaaaagtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 356
           |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 120

Query: 357 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 416
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 180

Query: 417 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 476
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 240

Query: 477 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 536
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 300

Query: 537 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 596
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 360

Query: 597 tcgctggcctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 656
           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tcgctggtctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 420

Query: 657 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 716
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 480

Query: 717 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactcacgtgggtg 776
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 481 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 540

Query: 777 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 836
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 600

Query: 837 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 884
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648

8) SF1057 in NC_004337


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 1261 bits (3253), Expect = 0.0
 Identities = 644/648 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 237 gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 60

Query: 297 ggtaaaaaggtccgtacgaccatcggccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 356
           |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 120

Query: 357 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 416
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 180

Query: 417 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 476
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 240

Query: 477 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 536
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 300

Query: 537 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 596
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 360

Query: 597 tcgctggcctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 656
           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tcgctggtctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 420

Query: 657 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaatcggaggta 716
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 421 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 480

Query: 717 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactcacgtgggtg 776
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 481 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 540

Query: 777 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 836
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 600

Query: 837 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 884
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648

9) SF0300 in NC_004337


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 1260 bits (3250), Expect = 0.0
 Identities = 643/648 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 237 gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 60

Query: 297 ggtaaaaaggtccgtacgaccatcggccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 356
           |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 120

Query: 357 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 416
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 180

Query: 417 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 476
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 240

Query: 477 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 536
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 300

Query: 537 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 596
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 360

Query: 597 tcgctggcctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 656
           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tcgctggtctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 420

Query: 657 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 716
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 480

Query: 717 atacaccgtaagagctggaaaaactgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 776
           |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 540

Query: 777 gactggtataacaatcgacgattgccggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 836
           ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 600

Query: 837 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctgtcagcctga 884
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 601 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648

10) SF0491 in NC_004337


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 1259 bits (3250), Expect = 0.0
 Identities = 643/648 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 237 gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 60

Query: 297 ggtaaaaaggtccgtatgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 356
           |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 120

Query: 357 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 416
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 180

Query: 417 acatggcagggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 476
           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 240

Query: 477 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 536
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 300

Query: 537 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 596
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 360

Query: 597 tcgctggcctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 656
           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tcgctggtctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 420

Query: 657 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 716
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 480

Query: 717 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactcacgtgggtg 776
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 481 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 540

Query: 777 gactggtataataatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 836
           ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 600

Query: 837 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 884
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648

11) unnamed in NC_007607


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 1252 bits (3230), Expect = 0.0
 Identities = 640/648 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 28  gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 87
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 60

Query: 88  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 147
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 120

Query: 148 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgcgggtggctgattttacttacgccagc 207
           ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 121 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 180

Query: 208 acatggcagggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 267
           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 240

Query: 268 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 327
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 300

Query: 328 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 387
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 360

Query: 388 tcgctggcctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 447
           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tcgctggtctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 420

Query: 448 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 507
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 480

Query: 508 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactcacgtgggtg 567
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 481 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 540

Query: 568 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccatactcctccggcagaagca 627
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||
Sbjct: 541 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 600

Query: 628 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 675
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648

12) SbBS512_A0059 in NC_010660


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 1249 bits (3223), Expect = 0.0
 Identities = 639/648 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 22  gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 81
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 60

Query: 82  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 141
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 120

Query: 142 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtagctgattttacttacgtcagc 201
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 180

Query: 202 acatggcagggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacattgtg 261
           ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 181 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 240

Query: 262 gggtggcgggtctcatcgtccatggagacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 321
           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 300

Query: 322 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 381
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 360

Query: 382 tcgctggcctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 441
           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tcgctggtctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 420

Query: 442 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 501
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 480

Query: 502 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactcacgtgggtg 561
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 481 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 540

Query: 562 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccatactcctccggcagaagca 621
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||
Sbjct: 541 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 600

Query: 622 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 669
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648

13) SbBS512_A0081 in NC_010660


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 1249 bits (3223), Expect = 0.0
 Identities = 639/648 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 22  gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 81
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 60

Query: 82  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 141
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 120

Query: 142 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtagctgattttacttacgtcagc 201
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 180

Query: 202 acatggcagggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacattgtg 261
           ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 181 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 240

Query: 262 gggtggcgggtctcatcgtccatggagacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 321
           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 300

Query: 322 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 381
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 360

Query: 382 tcgctggcctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 441
           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tcgctggtctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 420

Query: 442 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 501
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 480

Query: 502 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactcacgtgggtg 561
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 481 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 540

Query: 562 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccatactcctccggcagaagca 621
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||
Sbjct: 541 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 600

Query: 622 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 669
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648

14) unnamed in NC_013364


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 1190 bits (3071), Expect = 0.0
 Identities = 620/648 (96%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 83  gtggccagatgtacagtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 142
           ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 60

Query: 143 ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 202
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 120

Query: 203 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 262
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 180

Query: 263 acatggcagggcttcgtctatgtggcgtttatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 322
           ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 240

Query: 323 gggtggcgggtctcatcgtctatggaaacgacattcgtgctggatgcgctggagcaggcg 382
           |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 241 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 300

Query: 383 ttgtgggcccgtcgtccgtctggcaccatccatcacagcgataaaggctctcagtatgtg 442
           || ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| 
Sbjct: 301 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 360

Query: 443 tcactggcctatacggagcgactaaaagaagccggattactggcatcaacagggagtaca 502
           || |||| ||| ||  |||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 361 tcgctggtctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 420

Query: 503 ggcgactcgtatgacaacgcgatggctgagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 562
           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 480

Query: 563 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 622
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 540

Query: 623 gactggtataacaatcgacgattgctgggaaggctgggccatactcctccggcagaagca 682
           |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||
Sbjct: 541 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 600

Query: 683 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 730
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648

15) ECO111_4885 in NC_013364


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 1190 bits (3071), Expect = 0.0
 Identities = 620/648 (96%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 85  gtggccagatgtacagtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 144
           ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 60

Query: 145 ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 204
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 120

Query: 205 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 264
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 180

Query: 265 acatggcagggcttcgtctatgtggcgtttatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 324
           ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 240

Query: 325 gggtggcgggtctcatcgtctatggaaacgacattcgtgctggatgcgctggagcaggcg 384
           |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 241 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 300

Query: 385 ttgtgggcccgtcgtccgtctggcaccatccatcacagcgataaaggctctcagtatgtg 444
           || ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| 
Sbjct: 301 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 360

Query: 445 tcactggcctatacggagcgactaaaagaagccggattactggcatcaacagggagtaca 504
           || |||| ||| ||  |||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 361 tcgctggtctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 420

Query: 505 ggcgactcgtatgacaacgcgatggctgagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 564
           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 480

Query: 565 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 624
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 540

Query: 625 gactggtataacaatcgacgattgctgggaaggctgggccatactcctccggcagaagca 684
           |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||
Sbjct: 541 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 600

Query: 685 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 732
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648

16) ECO103_3580 in NC_013353


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 1159 bits (2992), Expect = 0.0
 Identities = 612/648 (94%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 241 gtggccaggtgcactgtggcacgtctcatggcggttatggggcttgccggtgttctccgg 300
           |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 1   gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 60

Query: 301 ggtaaaaaggtccgcactaccgtcagccggaaagccattaccgcaggcgaccgcgtaaac 360
           |||||||||||||| || ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 120

Query: 361 cgtcagttcggggcagaacgtcctgaccagttgtgggtggctgattttacttacgtcagc 420
           |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 180

Query: 421 acatggcagggcttcgtttatgtggcgttcatcattgatgtgttcgccggatacatcgtg 480
           ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 240

Query: 481 ggatggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggca 540
           || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct: 241 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 300

Query: 541 gtatgggaccgtcgtccgtctggcactatccatcactgtgataaaggttctctgtatgta 600
            |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 301 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 360

Query: 601 tcgctggcctacacgcagcggcttaaggaagcaggattactggcatcaacagggagcaca 660
           ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||
Sbjct: 361 tcgctggtctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 420

Query: 661 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 720
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 480

Query: 721 atacaccgtaatagctggaaaaaccggacagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 780
           ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 540

Query: 781 gactggtataacaatcgacgattgctgggaaggctggatcatatccctccggcagaagca 840
           |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 600

Query: 841 gaaaaagcttattatgcttccatcagaaacgatgatctggcagcctga 888
           |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648

17) unnamed in NC_013353


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 1159 bits (2992), Expect = 0.0
 Identities = 612/648 (94%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 195 gtggccaggtgcactgtggcacgtctcatggcggttatggggcttgccggtgttctccgg 254
           |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 1   gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 60

Query: 255 ggtaaaaaggtccgcactaccgtcagccggaaagccattaccgcaggcgaccgcgtaaac 314
           |||||||||||||| || ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 120

Query: 315 cgtcagttcggggcagaacgtcctgaccagttgtgggtggctgattttacttacgtcagc 374
           |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 180

Query: 375 acatggcagggcttcgtttatgtggcgttcatcattgatgtgttcgccggatacatcgtg 434
           ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 240

Query: 435 ggatggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggca 494
           || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct: 241 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 300

Query: 495 gtatgggaccgtcgtccgtctggcactatccatcactgtgataaaggttctctgtatgta 554
            |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 301 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 360

Query: 555 tcgctggcctacacgcagcggcttaaggaagcaggattactggcatcaacagggagcaca 614
           ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||
Sbjct: 361 tcgctggtctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 420

Query: 615 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 674
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 480

Query: 675 atacaccgtaatagctggaaaaaccggacagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 734
           ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 540

Query: 735 gactggtataacaatcgacgattgctgggaaggctggatcatatccctccggcagaagca 794
           |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 600

Query: 795 gaaaaagcttattatgcttccatcagaaacgatgatctggcagcctga 842
           |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648

18) unnamed in NC_013353


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 1159 bits (2992), Expect = 0.0
 Identities = 612/648 (94%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 195 gtggccaggtgcactgtggcacgtctcatggcggttatggggcttgccggtgttctccgg 254
           |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 1   gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 60

Query: 255 ggtaaaaaggtccgcactaccgtcagccggaaagccattaccgcaggcgaccgcgtaaac 314
           |||||||||||||| || ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 120

Query: 315 cgtcagttcggggcagaacgtcctgaccagttgtgggtggctgattttacttacgtcagc 374
           |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 180

Query: 375 acatggcagggcttcgtttatgtggcgttcatcattgatgtgttcgccggatacatcgtg 434
           ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 240

Query: 435 ggatggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggca 494
           || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct: 241 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 300

Query: 495 gtatgggaccgtcgtccgtctggcactatccatcactgtgataaaggttctctgtatgta 554
            |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 301 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 360

Query: 555 tcgctggcctacacgcagcggcttaaggaagcaggattactggcatcaacagggagcaca 614
           ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||
Sbjct: 361 tcgctggtctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 420

Query: 615 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 674
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 480

Query: 675 atacaccgtaatagctggaaaaaccggacagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 734
           ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 540

Query: 735 gactggtataacaatcgacgattgctgggaaggctggatcatatccctccggcagaagca 794
           |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 600

Query: 795 gaaaaagcttattatgcttccatcagaaacgatgatctggcagcctga 842
           |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648

19) ECO103_4898 in NC_013353


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 1159 bits (2992), Expect = 0.0
 Identities = 612/648 (94%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 241 gtggccaggtgcactgtggcacgtctcatggcggttatggggcttgccggtgttctccgg 300
           |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 1   gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 60

Query: 301 ggtaaaaaggtccgcactaccgtcagccggaaagccattaccgcaggcgaccgcgtaaac 360
           |||||||||||||| || ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 120

Query: 361 cgtcagttcggggcagaacgtcctgaccagttgtgggtggctgattttacttacgtcagc 420
           |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 180

Query: 421 acatggcagggcttcgtttatgtggcgttcatcattgatgtgttcgccggatacatcgtg 480
           ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 240

Query: 481 ggatggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggca 540
           || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct: 241 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 300

Query: 541 gtatgggaccgtcgtccgtctggcactatccatcactgtgataaaggttctctgtatgta 600
            |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 301 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 360

Query: 601 tcgctggcctacacgcagcggcttaaggaagcaggattactggcatcaacagggagcaca 660
           ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||
Sbjct: 361 tcgctggtctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 420

Query: 661 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 720
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 480

Query: 721 atacaccgtaatagctggaaaaaccggacagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 780
           ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 540

Query: 781 gactggtataacaatcgacgattgctgggaaggctggatcatatccctccggcagaagca 840
           |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 600

Query: 841 gaaaaagcttattatgcttccatcagaaacgatgatctggcagcctga 888
           |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648

20) join in NC_017626


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 1123 bits (2899), Expect = 0.0
 Identities = 601/648 (93%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 240 gtggccagatgtacagtggcgcgcctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 299
           ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 60

Query: 300 ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagcctttgccgcaggcgaccgcgtaaac 359
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 120

Query: 360 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 419
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 180

Query: 420 acatggcagggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 479
           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 240

Query: 480 tggtgacgagtctcatcgtctatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 539
            |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcg 300

Query: 540 ttgtgggcccgtcgtccgtctggcaccatccatcacagcgataaaggctctcagtatgtg 599
           || ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| 
Sbjct: 301 ttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgta 360

Query: 600 tcactggcctataaggcgcgactaaaagaagcaaaactgctggcatcaacagggagtact 659
           || |||| ||| |    ||| || || |||||   | | |||||||||||||| ||||| 
Sbjct: 361 tcgctggtctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtaca 420

Query: 660 ggtgactcgtatgacaacgcgatggcagagatcatcaagggcctttacaaagcggaggta 719
           || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggta 480

Query: 720 atacaccgtaagagctggaaaaaccggacagaagtggagctggccacactcacgtgggtg 779
           ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct: 481 atacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtg 540

Query: 780 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccatatcccaccggcagaagca 839
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct: 541 gactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagca 600

Query: 840 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaatgatgatctggcagcctga 887
           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648

21) unnamed in NC_007607


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 1120 bits (2891), Expect = 0.0
 Identities = 573/580 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   ggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagtt 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69  ggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaaccgtcagtt 128

Query: 61  cgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggca 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct: 129 cgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcg 188

Query: 121 gggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcg 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 189 gggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcg 248

Query: 181 ggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggc 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 249 ggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggc 308

Query: 241 ccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggc 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct: 309 ccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggt 368

Query: 301 ctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactc 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 369 ctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactc 428

Query: 361 gtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccg 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429 gtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccg 488

Query: 421 taagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactcacgtgggtggactggta 480
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 489 taagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggta 548

Query: 481 taacaatcgacgattgctggaaaggctgggctatactcctccggcagaagcagaaaaagc 540
           ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 549 taacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagc 608

Query: 541 ttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 580
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 609 ttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648

22) unnamed in NC_013353


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 950 bits (2451), Expect = e-277
 Identities = 498/527 (94%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   gtcagttcgtggcagaacgtcctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagca 60
           ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 gtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagca 181

Query: 61  catggcagggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatgtatcgtgg 120
           |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||
Sbjct: 182 catggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtgg 241

Query: 121 ggtggcgagtctcatcgtctatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgt 180
           ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 ggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgt 301

Query: 181 tgtgggcccgtcggccgtccggcacagtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtat 240
           | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 tatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtat 361

Query: 241 cactggcctatacggagcgactaaaagaagcaaaactgctggcatcaacagggagtacag 300
           | |||| ||| ||  |||| || || |||||   | | |||||||||||||| |||||||
Sbjct: 362 cgctggtctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacag 421

Query: 301 gtgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaa 360
           | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 gcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaa 481

Query: 361 tacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactcacgtgggtgg 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 482 tacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtgg 541

Query: 421 actggtataacaatcgacgattgctgggaaggctgggtcatatccctccggcagaagcag 480
           ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct: 542 actggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagcag 601

Query: 481 aaaaagcttattatgcttccatcagaaacgatgatctggcagcctga 527
           ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602 aaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648

23) ECO103_3568 in NC_013353


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 950 bits (2451), Expect = e-277
 Identities = 498/527 (94%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 137 gtcagttcgtggcagaacgtcctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagca 196
           ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 gtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagca 181

Query: 197 catggcagggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatgtatcgtgg 256
           |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||
Sbjct: 182 catggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtgg 241

Query: 257 ggtggcgagtctcatcgtctatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgt 316
           ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 ggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgt 301

Query: 317 tgtgggcccgtcggccgtccggcacagtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtat 376
           | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 tatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtat 361

Query: 377 cactggcctatacggagcgactaaaagaagcaaaactgctggcatcaacagggagtacag 436
           | |||| ||| ||  |||| || || |||||   | | |||||||||||||| |||||||
Sbjct: 362 cgctggtctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacag 421

Query: 437 gtgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaa 496
           | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 gcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaa 481

Query: 497 tacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactcacgtgggtgg 556
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 482 tacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtgg 541

Query: 557 actggtataacaatcgacgattgctgggaaggctgggtcatatccctccggcagaagcag 616
           ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct: 542 actggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagcag 601

Query: 617 aaaaagcttattatgcttccatcagaaacgatgatctggcagcctga 663
           ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602 aaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648

24) ECUMN_3342 in NC_011751


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 904 bits (2332), Expect = e-263
 Identities = 481/519 (93%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   gtggcagaacgtcctgaccagctgtgggtggctgattttaattacgtcagcacatggcag 60
           ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct: 130 gtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagcacatggcgg 189

Query: 61  ggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggtgg 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 190 ggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtggggtggcgg 249

Query: 121 gtctcatcgtctatggaaacgacattcatgctggatgcgctggagcaggcgttgtgggcc 180
           ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct: 250 gtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcc 309

Query: 181 cgccgtccgtccggcaccatccatcacagcgataaaggctctcagtatgtgtcactggcc 240
           || || |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |
Sbjct: 310 cgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggtc 369

Query: 241 tatatggagcgattaaaagaagcaaaactgctggcatcaacagggagtacaggcgactcg 300
           || |   ||||  | || |||||   | | |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 370 tacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcg 429

Query: 301 tatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgt 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 430 tatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgt 489

Query: 361 aagatctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactcacgtgggtggactggtat 420
           |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 490 aagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtat 549

Query: 421 aacaatcgacgattgctgggaaggctgggccatactcctccggcagaagcagaaaaagct 480
           ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 550 aacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagct 609

Query: 481 tattatgcttccatcggaaacaatgatctggcagcctga 519
           ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 610 tattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648

25) unnamed in NC_017646


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 811 bits (2093), Expect = e-235
 Identities = 436/473 (92%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   tcagcacatggcagggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggataca 60
           |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 176 tcagcacatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggataca 235

Query: 61  tcgtgggggggcgggtatcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcgctggagc 120
           |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 236 tcgtggggtggcgggtctcatcgtccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagc 295

Query: 121 aggcgttgtgggcccatcgtccgtccggcaccatccatcacagcgataaaggctctcagt 180
           ||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct: 296 aggcgttatgggcccgtcgaccgtccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagt 355

Query: 181 atgtgtcactggcctatacggagcgattaaaagaagcaaaactgctggcatcaacaggaa 240
           |||| || |||| ||| ||  ||||  | || |||||   | | ||||||||||||||||
Sbjct: 356 atgtatcgctggtctacacacagcggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaa 415

Query: 241 gtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcgg 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 416 gtacaggcgactcgtatgacaacgcgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcgg 475

Query: 301 aggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactgtccacactcacgt 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct: 476 aggtaatacaccgtaagagctggaaaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgt 535

Query: 361 gggtggactggtataacaatcgacgattgctgggaaggctgaggcatactcctccggcag 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |  ||||||||||
Sbjct: 536 gggtggactggtataacaatcgacgattgctggaaaggctgggccacatccctccggcag 595

Query: 421 aagcagaaaaagcgtattatgcttccatcggaaatgatgagctggcagcctga 473
           ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct: 596 aagcagaaaaagcttattatgcttccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648

26) SF0694 in NC_004337


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 761 bits (1963), Expect = e-220
 Identities = 388/389 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 482 ccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgt 541
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 260 ccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgt 319

Query: 542 ccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagc 601
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 320 ccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggtctacacacagc 379

Query: 602 ggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacg 661
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 380 ggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacg 439

Query: 662 cgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctgga 721
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 440 cgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctgga 499

Query: 722 aaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgac 781
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 500 aaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgac 559

Query: 782 gattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgctt 841
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 560 gattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgctt 619

Query: 842 ccatcggaaacgatgatctggcagcctga 870
           |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 620 ccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648


 Score = 483 bits (1247), Expect = e-136
 Identities = 245/245 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 237 gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 60

Query: 297 ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 356
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 120

Query: 357 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 416
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 180

Query: 417 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 476
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 240

Query: 477 gggtg 481
           |||||
Sbjct: 241 gggtg 245

27) SF1844 in NC_004337


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 761 bits (1963), Expect = e-220
 Identities = 388/389 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 482 ccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgt 541
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 260 ccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgt 319

Query: 542 ccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagc 601
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 320 ccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggtctacacacagc 379

Query: 602 ggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacg 661
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 380 ggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacg 439

Query: 662 cgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctgga 721
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 440 cgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctgga 499

Query: 722 aaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgac 781
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 500 aaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgac 559

Query: 782 gattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgctt 841
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 560 gattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgctt 619

Query: 842 ccatcggaaacgatgatctggcagcctga 870
           |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 620 ccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648


 Score = 483 bits (1247), Expect = e-136
 Identities = 245/245 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 237 gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 60

Query: 297 ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 356
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 120

Query: 357 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 416
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 180

Query: 417 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 476
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 240

Query: 477 gggtg 481
           |||||
Sbjct: 241 gggtg 245

28) SF1919 in NC_004337


>NC_004741_P2|18|G18|30065061|NP_839232.1|Shigella_flexneri_2a_str._2457T|+|22209..22856|-|S4063|IS629 
          Length = 648

 Score = 749 bits (1932), Expect = e-216
 Identities = 384/389 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 485 ccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgt 544
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 260 ccatggaaacgacattcgtgctggatgcactggagcaggcgttatgggcccgtcgaccgt 319

Query: 545 ccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggcctacacacagc 604
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 320 ccggcacggtccatcacagtgataaaggttctcagtatgtatcgctggtctacacacagc 379

Query: 605 ggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacg 664
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 380 ggcttaaggaagccggattactggcatcaacaggaagtacaggcgactcgtatgacaacg 439

Query: 665 cgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctgga 724
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 440 cgatggcggagagcatcaatggtctttacaaagcggaggtaatacaccgtaagagctgga 499

Query: 725 aaaaccgtgcagaagtggaactggccacactcacgtgggtggactggtataacaatcgac 784
           ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 500 aaaaccgtgcagaagtggaactggccacactaacgtgggtggactggtataacaatcgac 559

Query: 785 gattgctggaaaggctgggccatactcctccggcagaagcagaaaaagcttattatgctt 844
           |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 560 gattgctggaaaggctgggccacatccctccggcagaagcagaaaaagcttattatgctt 619

Query: 845 ccatcggaaacgatgatctggcagcctga 873
           |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 620 ccatcggaaacgatgatctggcagcctga 648


 Score = 483 bits (1247), Expect = e-136
 Identities = 245/245 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 240 gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 299
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   gtggccagatgcactgtggcacgtctcatggcggttatgggacttgccggtgttctccgg 60

Query: 300 ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 359
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  ggtaaaaaggtccgtacgaccatcagccggaaagccgttgccgcaggcgaccgcgtaaac 120

Query: 360 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 419
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cgtcagttcgtggcagaacgacctgaccagctgtgggtggctgattttacttacgtcagc 180

Query: 420 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 479
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acatggcggggcttcgtctatgtggcgttcatcattgatgtgtttgccggatacatcgtg 240

Query: 480 gggtg 484
           |||||
Sbjct: 241 gggtg 245