Homolog Viewer

PAthogenisity Island DataBase (PAI DB)

Home PAIs REIs Genomes Search Links

Homologs of ECs3717 gene of NC_002695_P1

DNA-level

Hit (GenBank Accn)

Product

Source Genome

Eval.

Ident.(%)

1) EKO11_0878
( - )

NC_016902
(Escherichia coli KO11FL)

e-177

98.2

2) EcE24377A_3178
( - )

NC_009801
(Escherichia coli E24377A)

e-151

97.9

3) eprJ
( - )

NC_013364
(Escherichia coli 11128)

e-150

97.9

• Sequence Alignments

1) EKO11_0878 in NC_016902


>NC_002695_P1|15|G15|15832971|NP_311744.1|Escherichia_coli_O157:H7_str._Sakai|-|10059..10391|-|ECs3717|EprJ 
          Length = 333

 Score = 617 bits (1592), Expect = e-177
 Identities = 326/333 (98%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgtcagtaagcaatatgccacctattgatagagctgagcaatcaactgctcatgaaata 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgtcagtaagcaatatgccacctattgatagagctgagcaatcaactgctcatgaaata 60

Query: 61  cagcaagcgaaagtgattgatttaaatgaccgggttctcaatcttgacaacccggatgat 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cagcaagcgaaagtgattgatttaaatgaccgggttctcaatcttgacaacccggatgat 120

Query: 121 aaaatgatctccgcttttgccaactatgctgtacaaactgaaaattggcagcaaaatgcg 180
           |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 aaaatgatctccgcttttgctaactatgctgtacaaactgaaaattggcagcaaaatgcg 180

Query: 181 ttacaagcattaaggtctgataaagaggggttaactcctgaaaaattattagtcttgcag 240
           ||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttacaagcattaacgtctgataaaaaaggattaactcctgaaaaattattagtcttgcag 240

Query: 241 gatcatgtgcttaattataatgtcgaggtttcattggtgg-aacattagcaagaaagatt 299
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||
Sbjct: 241 gatcatgtgcttaattataatgtcgaggtttcattggtgggaacattagcaagaaaaatt 300

Query: 300 gtcgctgcagttgagacgttgacccgctcatga 332
           |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtcgctgcagttgagacgttgacccgctcatga 333

2) EcE24377A_3178 in NC_009801


>NC_002695_P1|15|G15|15832971|NP_311744.1|Escherichia_coli_O157:H7_str._Sakai|-|10059..10391|-|ECs3717|EprJ 
          Length = 333

 Score = 531 bits (1370), Expect = e-151
 Identities = 282/289 (98%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgtcagtaagcaatatgccacctattgatagagctgagtaatcaactgctcatgaaata 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgtcagtaagcaatatgccacctattgatagagctgagcaatcaactgctcatgaaata 60

Query: 61  cagcaagcgaaagtgattgatttaaatgaccgggttctcaatcttgacaacccggatgat 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cagcaagcgaaagtgattgatttaaatgaccgggttctcaatcttgacaacccggatgat 120

Query: 121 aaaatgatctccgcttttgccaactatgctgtacaaactgaaaattggcagcaaaatgcg 180
           |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 aaaatgatctccgcttttgctaactatgctgtacaaactgaaaattggcagcaaaatgcg 180

Query: 181 ttacaagcattaaggtctgataaagaggggttaactcctgaaaaattattagtcttgcag 240
           ||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttacaagcattaacgtctgataaaaaaggattaactcctgaaaaattattagtcttgcag 240

Query: 241 gatcatgtgcttaattataatgtcgaggtttcattggtgg-aacattag 288
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 241 gatcatgtgcttaattataatgtcgaggtttcattggtgggaacattag 289

3) eprJ in NC_013364


>NC_002695_P1|15|G15|15832971|NP_311744.1|Escherichia_coli_O157:H7_str._Sakai|-|10059..10391|-|ECs3717|EprJ 
          Length = 333

 Score = 529 bits (1366), Expect = e-150
 Identities = 282/289 (98%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgtcagtaagcaatatgccacctattgatagagctgagcaatcaactgctcatgaaata 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgtcagtaagcaatatgccacctattgatagagctgagcaatcaactgctcatgaaata 60

Query: 61  cagcaagcgaaagtgattgatttaaatgaccgggttctcaatcttgacaacccggatgat 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  cagcaagcgaaagtgattgatttaaatgaccgggttctcaatcttgacaacccggatgat 120

Query: 121 aaaatgatctccgcttttgccaactatgctgtacaaactgaaaattggcagcaaaatgcg 180
           |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 aaaatgatctccgcttttgctaactatgctgtacaaactgaaaattggcagcaaaatgcg 180

Query: 181 ttacaagcattaaggtctgataaagagggggtaactcctgaaaaattattagtcttgcag 240
           ||||||||||||| |||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttacaagcattaacgtctgataaaaaaggattaactcctgaaaaattattagtcttgcag 240

Query: 241 gatcatgtgcttaattataatgtcgaggtttcattggtgg-aacattag 288
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 241 gatcatgtgcttaattataatgtcgaggtttcattggtgggaacattag 289