> NC_004578_P1|12|G9|28868580|NP_791199.1|Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000|+|5452..6912|hopAA1-1|PSPTO_1372|type
III effector HopAA1-1
Length=486
Score = 677 bits (2558), Expect = 0.0, Method: Compositional matrix adjust.
Identities = 486/486 (100%), Positives = 486/486 (100%), Gaps = 0/486 (0%)
Query 1 MHINRRVQQPPVTATDSFRTAsdaslasssvrsvssdqqrEINAIADYLTDHVFAAHKLP 60
MHINRRVQQPPVTATDSFRTASDASLASSSVRSVSSDQQREINAIADYLTDHVFAAHKLP
Sbjct 1 MHINRRVQQPPVTATDSFRTASDASLASSSVRSVSSDQQREINAIADYLTDHVFAAHKLP 60
Query 61 PADSADGQAAVDVHNAQITALIETRASRLHFEGETPATIADTFAKAEKLDRLATTTSGAL 120
PADSADGQAAVDVHNAQITALIETRASRLHFEGETPATIADTFAKAEKLDRLATTTSGAL
Sbjct 61 PADSADGQAAVDVHNAQITALIETRASRLHFEGETPATIADTFAKAEKLDRLATTTSGAL 120
Query 121 RATPFAMASLLQYMQPAINKGDWLPAPLKPLTPLISGALSGAMDQVGTKMMDRATGDLHY 180
RATPFAMASLLQYMQPAINKGDWLPAPLKPLTPLISGALSGAMDQVGTKMMDRATGDLHY
Sbjct 121 RATPFAMASLLQYMQPAINKGDWLPAPLKPLTPLISGALSGAMDQVGTKMMDRATGDLHY 180
Query 181 LSASPDRLHDAMAASVKRHSPSLARQVLDTGVAVQTYSARNAVRTVLAPALASRPAVQGA 240
LSASPDRLHDAMAASVKRHSPSLARQVLDTGVAVQTYSARNAVRTVLAPALASRPAVQGA
Sbjct 181 LSASPDRLHDAMAASVKRHSPSLARQVLDTGVAVQTYSARNAVRTVLAPALASRPAVQGA 240
Query 241 VDLGVSMagglaanagfgnrllSVQSRDHQRGGALVLGLKDKEPKAQLSEENDWLEAYKA 300
VDLGVSMAGGLAANAGFGNRLLSVQSRDHQRGGALVLGLKDKEPKAQLSEENDWLEAYKA
Sbjct 241 VDLGVSMAGGLAANAGFGNRLLSVQSRDHQRGGALVLGLKDKEPKAQLSEENDWLEAYKA 300
Query 301 IKSASYSGAALNAGKRMAGLPLDMATDAMGAVRSLVSASSLTQNglalaggfagvgklQE 360
IKSASYSGAALNAGKRMAGLPLDMATDAMGAVRSLVSASSLTQNGLALAGGFAGVGKLQE
Sbjct 301 IKSASYSGAALNAGKRMAGLPLDMATDAMGAVRSLVSASSLTQNGLALAGGFAGVGKLQE 360
Query 361 MATKNITDPATKAAVSQLTNLAGSAAVFAGWTTAALTTDPAVKKAESFIQDTVKSTASST 420
MATKNITDPATKAAVSQLTNLAGSAAVFAGWTTAALTTDPAVKKAESFIQDTVKSTASST
Sbjct 361 MATKNITDPATKAAVSQLTNLAGSAAVFAGWTTAALTTDPAVKKAESFIQDTVKSTASST 420
Query 421 TGYVADQTVKLAKTVKDMGGEAITHTGASLRNTVNNLRQRPAREADIEEGGTAASPSEIP 480
TGYVADQTVKLAKTVKDMGGEAITHTGASLRNTVNNLRQRPAREADIEEGGTAASPSEIP
Sbjct 421 TGYVADQTVKLAKTVKDMGGEAITHTGASLRNTVNNLRQRPAREADIEEGGTAASPSEIP 480
Query 481 FRPMRS 486
FRPMRS
Sbjct 481 FRPMRS 486 |