Homolog Viewer

PAthogenisity Island DataBase (PAI DB)

Home PAIs REIs Genomes Search Links

Homologs of epaO gene of DQ077151

DNA-level

Hit (GenBank Accn)

Product

Source Genome

Eval.

Ident.(%)

1) EKO11_0868
( - )

NC_016902
(Escherichia coli KO11FL)

0.0

97.9

2) epaO
( - )

NC_017635
(Escherichia coli W)

0.0

97.9

3) epaO
( - )

NC_011353
(Escherichia coli EC4115)

0.0

96.5

• Sequence Alignments

1) EKO11_0868 in NC_016902


>DQ077151|12|G11|71388160|AAZ31294.1|Escherichia_coli_789|-|6721..7668|epaO|-|EpaO 
          Length = 948

 Score = 1763 bits (4550), Expect = 0.0
 Identities = 928/948 (98%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgttcggtctgaggaaagtaaatcgaaacactcatacgtttgaaaccacttttcaaaat 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgttcggtctgaggaaagtaaatcgaaacactcatatgtttgaaaccacttttcaaaat 60

Query: 61  tggaaagaaaatggcgaagatgttgcattattaatgcccgaatttagtgctaaatggtta 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 61  tggaaagaaaatggcgaagatgttgcattattaatgcccgaatttagtgctaaatggcta 120

Query: 121 ccgatagcagaagagagtggcagctggtctggatgggtattgcttggagaaatatttccc 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ccgatagcagaagagagtggcagctggtctggatgggtattgcttggagaaatatttccc 180

Query: 181 ttaatttcatctgagctcgctgggatggctttaatgccagaaacggaaaggttaataggg 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttaatttcatctgagctcgctgggatggctttaatgccagaaacggaaaggttaataggg 240

Query: 241 gaatggctcagtttatccagttccccgttaaatctaaagcatcctgaactaaaatataat 300
           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gaatggctcagtttatcaagttccccgttaaatctaaagcatcctgaactaaaatataat 300

Query: 301 cgtttgcacgtaggtaaagtatttgatggagtattgagccctgctcaaccactaataaga 360
           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 cgtttgcgcgtaggtaaagtatttgatggagtattgagccctgctcaaccactaataaga 360

Query: 361 atatgaacaggggaattgaatctttggttagataaagtcacagtctgccaatacggaaac 420
           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 361 atatggacaggggaattgaatctttggttagataaagtcacagtctgtcaatacggaaac 420

Query: 421 gctccagtgttagacaaaaaatcattaaattggtccattcattttgtaattggatttagt 480
           ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gctccagcgttagacaaaaaatcattatattggtccattcattttgtaattggatttagt 480

Query: 481 aaaacatgttacagaagtcttgttgatattgaagttggtgatgttttattaatctcaaat 540
           ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aaaacatgttacagaagtcttattgatattgaagttggtgatgttttattaatctcaaat 540

Query: 541 aatttggcttatgcggttatttataatacaaaaatttgtgatttaatttatccagaggag 600
           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 aatttagcttatgcggttatttataatacaaaaatttgtgatttaatttatccagaggag 600

Query: 601 ttaaaaatggctgatcattttgagtacgaggaagattttgaaacagatgattttgatatc 660
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 ttaaaaatggctgatcattttgagtacgaggaagattttgaaacagatgattttgatatc 660

Query: 661 aaaaaaaacgagagtgagatttatgatgaaaatgacgaacagatgattaatagttttgaa 720
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 aaaaaaaacgagagtgagatttatgatgaaaatgacgatcagatgattaatagttttgaa 720

Query: 721 gagttgcctgtaaaaattgagtttgttcttggtaagaaaataattaatctttatgaaata 780
           || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
Sbjct: 721 gacttgcctgtaaaaattgagtttgttcttggtaagaaaataatgaatctatatgaaaca 780

Query: 781 gacgatctctgtgcaaaaagaataatatctctgcttcctgaatctgagaaaaatatagag 840
           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct: 781 gacgaactctgtgcaaaaagaataatatctctgcttcctgaatctgagaaaaatatagaa 840

Query: 841 atacgtgtaaatggtgcgctaactggctatggcgaacttgttgaagtggatgataaattg 900
           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 atacgtgtaaatggcgcgctaactggctatggcgaacttgttgaagtggatgataaattg 900

Query: 901 ggcgtagaaattcattcttggttatcagggaataataatgtcaaatag 948
           |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 901 ggcgtagagattcattcttggttatcagggcataataatgtcaaatag 948

2) epaO in NC_017635


>DQ077151|12|G11|71388160|AAZ31294.1|Escherichia_coli_789|-|6721..7668|epaO|-|EpaO 
          Length = 948

 Score = 1763 bits (4550), Expect = 0.0
 Identities = 928/948 (98%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgttcggtctgaggaaagtaaatcgaaacactcatacgtttgaaaccacttttcaaaat 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgttcggtctgaggaaagtaaatcgaaacactcatatgtttgaaaccacttttcaaaat 60

Query: 61  tggaaagaaaatggcgaagatgttgcattattaatgcccgaatttagtgctaaatggtta 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 61  tggaaagaaaatggcgaagatgttgcattattaatgcccgaatttagtgctaaatggcta 120

Query: 121 ccgatagcagaagagagtggcagctggtctggatgggtattgcttggagaaatatttccc 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ccgatagcagaagagagtggcagctggtctggatgggtattgcttggagaaatatttccc 180

Query: 181 ttaatttcatctgagctcgctgggatggctttaatgccagaaacggaaaggttaataggg 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttaatttcatctgagctcgctgggatggctttaatgccagaaacggaaaggttaataggg 240

Query: 241 gaatggctcagtttatccagttccccgttaaatctaaagcatcctgaactaaaatataat 300
           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gaatggctcagtttatcaagttccccgttaaatctaaagcatcctgaactaaaatataat 300

Query: 301 cgtttgcacgtaggtaaagtatttgatggagtattgagccctgctcaaccactaataaga 360
           ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 cgtttgcgcgtaggtaaagtatttgatggagtattgagccctgctcaaccactaataaga 360

Query: 361 atatgaacaggggaattgaatctttggttagataaagtcacagtctgccaatacggaaac 420
           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 361 atatggacaggggaattgaatctttggttagataaagtcacagtctgtcaatacggaaac 420

Query: 421 gctccagtgttagacaaaaaatcattaaattggtccattcattttgtaattggatttagt 480
           ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gctccagcgttagacaaaaaatcattatattggtccattcattttgtaattggatttagt 480

Query: 481 aaaacatgttacagaagtcttgttgatattgaagttggtgatgttttattaatctcaaat 540
           ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aaaacatgttacagaagtcttattgatattgaagttggtgatgttttattaatctcaaat 540

Query: 541 aatttggcttatgcggttatttataatacaaaaatttgtgatttaatttatccagaggag 600
           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 aatttagcttatgcggttatttataatacaaaaatttgtgatttaatttatccagaggag 600

Query: 601 ttaaaaatggctgatcattttgagtacgaggaagattttgaaacagatgattttgatatc 660
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 ttaaaaatggctgatcattttgagtacgaggaagattttgaaacagatgattttgatatc 660

Query: 661 aaaaaaaacgagagtgagatttatgatgaaaatgacgaacagatgattaatagttttgaa 720
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 aaaaaaaacgagagtgagatttatgatgaaaatgacgatcagatgattaatagttttgaa 720

Query: 721 gagttgcctgtaaaaattgagtttgttcttggtaagaaaataattaatctttatgaaata 780
           || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
Sbjct: 721 gacttgcctgtaaaaattgagtttgttcttggtaagaaaataatgaatctatatgaaaca 780

Query: 781 gacgatctctgtgcaaaaagaataatatctctgcttcctgaatctgagaaaaatatagag 840
           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct: 781 gacgaactctgtgcaaaaagaataatatctctgcttcctgaatctgagaaaaatatagaa 840

Query: 841 atacgtgtaaatggtgcgctaactggctatggcgaacttgttgaagtggatgataaattg 900
           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 atacgtgtaaatggcgcgctaactggctatggcgaacttgttgaagtggatgataaattg 900

Query: 901 ggcgtagaaattcattcttggttatcagggaataataatgtcaaatag 948
           |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 901 ggcgtagagattcattcttggttatcagggcataataatgtcaaatag 948

3) epaO in NC_011353


>DQ077151|12|G11|71388160|AAZ31294.1|Escherichia_coli_789|-|6721..7668|epaO|-|EpaO 
          Length = 948

 Score = 1712 bits (4418), Expect = 0.0
 Identities = 914/948 (96%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 41  atgttcggtctgaggaaagtaaatcgaaacactc-tacgtttgaaaccacttttcaaaat 99
           |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgttcggtctgaggaaagtaaatcgaaacactcatatgtttgaaaccacttttcaaaat 60

Query: 100 tggaaagaaaatggcgaagatgttgcattattaatgcccgaatttagtgctaaatggcta 159
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  tggaaagaaaatggcgaagatgttgcattattaatgcccgaatttagtgctaaatggcta 120

Query: 160 ccgatagcagaagagagtggcagctggtctggatgggtgttgcttcgagaaatatttccc 219
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct: 121 ccgatagcagaagagagtggcagctggtctggatgggtattgcttggagaaatatttccc 180

Query: 220 ttaatttctgccgagctcgctgggatggctttaatgccagaaacggaaaggttaataggg 279
           ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ttaatttcatctgagctcgctgggatggctttaatgccagaaacggaaaggttaataggg 240

Query: 280 gaatggctcagtttatccagttccccgttaaatctaaagtatcctgaactaaaatataat 339
           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gaatggctcagtttatcaagttccccgttaaatctaaagcatcctgaactaaaatataat 300

Query: 340 cgtttgtgcgtaggtaaagtatttgatggagtattgagtccagctcaaccactgataaga 399
           |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||
Sbjct: 301 cgtttgcgcgtaggtaaagtatttgatggagtattgagccctgctcaaccactaataaga 360

Query: 400 atatggacaggggaattgaatctttggttagataaagtcacagtctgccaatacgaaaac 459
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct: 361 atatggacaggggaattgaatctttggttagataaagtcacagtctgtcaatacggaaac 420

Query: 460 gctccaactttagacaaaaaatcattatattggcccattcattttgtaattggatttagt 519
           |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gctccagcgttagacaaaaaatcattatattggtccattcattttgtaattggatttagt 480

Query: 520 aaaacatgttatagaactattgttgatattgaagtcggtgatgttttattaatctcaaat 579
           ||||||||||| |||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aaaacatgttacagaagtcttattgatattgaagttggtgatgttttattaatctcaaat 540

Query: 580 aatatggcttatgcggttatttataatacaaagatttgtgatttaatttatccagaggag 639
           ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 aatttagcttatgcggttatttataatacaaaaatttgtgatttaatttatccagaggag 600

Query: 640 ttaaaaatggctgatcattttcagtacgaggaagattttgaaacagatgactttgatatc 699
           ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 601 ttaaaaatggctgatcattttgagtacgaggaagattttgaaacagatgattttgatatc 660

Query: 700 aaaaaaagcgagagtgagatttatgatgaaaatgacgaacagatgattaatagttttgaa 759
           ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 aaaaaaaacgagagtgagatttatgatgaaaatgacgatcagatgattaatagttttgaa 720

Query: 760 gagttgcctgtaaaaattgagtttgttcttggtaagaaaataatgaatctatatgaaata 819
           || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 721 gacttgcctgtaaaaattgagtttgttcttggtaagaaaataatgaatctatatgaaaca 780

Query: 820 gacgagctctgtgcaaaaagaataatatctctgcttcctgaatctgagaaaaatatagag 879
           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct: 781 gacgaactctgtgcaaaaagaataatatctctgcttcctgaatctgagaaaaatatagaa 840

Query: 880 atacgtgtaaatggcgcgctaactggctatggcgaacttgttgaagtggatgataaattg 939
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 atacgtgtaaatggcgcgctaactggctatggcgaacttgttgaagtggatgataaattg 900

Query: 940 ggcgtagagattcattcttggttatcagggcataataatgtcaaatag 987
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 ggcgtagagattcattcttggttatcagggcataataatgtcaaatag 948