Homolog Viewer

PAthogenisity Island DataBase (PAI DB)

Home PAIs REIs Genomes Search Links

Homologs of SAMSHR1132_00340 gene of NC_016941_R1

DNA-level

Hit (GenBank Accn)

Product

Source Genome

Eval.

Ident.(%)

1) SAA6159_00033
( - )

NC_017338
(Staphylococcus aureus JKD6159)

e-133

100

2) SAEMRSA15_00321
( - )

NC_017763
(Staphylococcus aureus HO 5096 0412)

e-131

100

• Sequence Alignments

1) SAA6159_00033 in NC_017338


>NC_016941_R1|11|G9|379794560|YP_005324558.1|Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MSHR1132|+|8652..8894|-|SAMSHR1132_00340|hypothetical 
          Length = 243

 Score = 470 bits (1214), Expect = e-133
 Identities = 243/243 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 19  gcttcacatgaaacagctaaagaagctttgggcgataaagagttaagagccattgcacat 78
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   gcttcacatgaaacagctaaagaagctttgggcgataaagagttaagagccattgcacat 60

Query: 79  gagttaactaaaacagttaaggataacatgagtgttgattggtctaaacgagacagtgct 138
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  gagttaactaaaacagttaaggataacatgagtgttgattggtctaaacgagacagtgct 120

Query: 139 aaagctaaaatgagagttcaagttagacgcctattaaagaaatatggctatccaccagat 198
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 aaagctaaaatgagagttcaagttagacgcctattaaagaaatatggctatccaccagat 180

Query: 199 cttcaaaaaatggctgtggaacaagttgtagagcaagcagaattaatggcaagtcagcaa 258
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 cttcaaaaaatggctgtggaacaagttgtagagcaagcagaattaatggcaagtcagcaa 240

Query: 259 taa 261
           |||
Sbjct: 241 taa 243

2) SAEMRSA15_00321 in NC_017763


>NC_016941_R1|11|G9|379794560|YP_005324558.1|Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MSHR1132|+|8652..8894|-|SAMSHR1132_00340|hypothetical 
          Length = 243

 Score = 464 bits (1198), Expect = e-131
 Identities = 240/240 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   tcacatgaaacagctaaagaagctttgggcgataaagagttaagagccattgcacatgag 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4   tcacatgaaacagctaaagaagctttgggcgataaagagttaagagccattgcacatgag 63

Query: 61  ttaactaaaacagttaaggataacatgagtgttgattggtctaaacgagacagtgctaaa 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 64  ttaactaaaacagttaaggataacatgagtgttgattggtctaaacgagacagtgctaaa 123

Query: 121 gctaaaatgagagttcaagttagacgcctattaaagaaatatggctatccaccagatctt 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 124 gctaaaatgagagttcaagttagacgcctattaaagaaatatggctatccaccagatctt 183

Query: 181 caaaaaatggctgtggaacaagttgtagagcaagcagaattaatggcaagtcagcaataa 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 184 caaaaaatggctgtggaacaagttgtagagcaagcagaattaatggcaagtcagcaataa 243