Homolog Viewer

PAthogenisity Island DataBase (PAI DB)

Home PAIs REIs Genomes Search Links

Homologs of SACOL0035 gene of NC_002951_R1

DNA-level

Hit (GenBank Accn)

Product

Source Genome

Eval.

Ident.(%)

1) SAA6159_00033
( - )

NC_017338
(Staphylococcus aureus JKD6159)

e-143

100

2) SAEMRSA15_00321
( - )

NC_017763
(Staphylococcus aureus HO 5096 0412)

e-131

100

• Sequence Alignments

1) SAA6159_00033 in NC_017338


>NC_002951_R1|10|G10|57651142|YP_184946.1|Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_COL|+|8336..8596|-|SACOL0035|hypothetical 
          Length = 261

 Score = 505 bits (1303), Expect = e-143
 Identities = 261/261 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   ttgtatgtagtatatcgagcttcacatgaaacagctaaagaagctttgggcgataaagag 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   ttgtatgtagtatatcgagcttcacatgaaacagctaaagaagctttgggcgataaagag 60

Query: 61  ttaagagccattgcacatgagttaactaaaacagttaaggataacatgagtgttgattgg 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  ttaagagccattgcacatgagttaactaaaacagttaaggataacatgagtgttgattgg 120

Query: 121 tctaaacgagacagtgctaaagctaaaatgagagttcaagttagacgcctattaaagaaa 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 tctaaacgagacagtgctaaagctaaaatgagagttcaagttagacgcctattaaagaaa 180

Query: 181 tatggctatccaccagatcttcaaaaaatggctgtggaacaagttgtagagcaagcagaa 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tatggctatccaccagatcttcaaaaaatggctgtggaacaagttgtagagcaagcagaa 240

Query: 241 ttaatggcaagtcagcaataa 261
           |||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ttaatggcaagtcagcaataa 261

2) SAEMRSA15_00321 in NC_017763


>NC_002951_R1|10|G10|57651142|YP_184946.1|Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_COL|+|8336..8596|-|SACOL0035|hypothetical 
          Length = 261

 Score = 464 bits (1198), Expect = e-131
 Identities = 240/240 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   tcacatgaaacagctaaagaagctttgggcgataaagagttaagagccattgcacatgag 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 22  tcacatgaaacagctaaagaagctttgggcgataaagagttaagagccattgcacatgag 81

Query: 61  ttaactaaaacagttaaggataacatgagtgttgattggtctaaacgagacagtgctaaa 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 82  ttaactaaaacagttaaggataacatgagtgttgattggtctaaacgagacagtgctaaa 141

Query: 121 gctaaaatgagagttcaagttagacgcctattaaagaaatatggctatccaccagatctt 180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 142 gctaaaatgagagttcaagttagacgcctattaaagaaatatggctatccaccagatctt 201

Query: 181 caaaaaatggctgtggaacaagttgtagagcaagcagaattaatggcaagtcagcaataa 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 202 caaaaaatggctgtggaacaagttgtagagcaagcagaattaatggcaagtcagcaataa 261