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Homologs of ORF 245 gene of AJ224978

DNA-level

Hit (GenBank Accn)

Product

Source Genome

Eval.

Ident.(%)

1) orf245
( - )

NC_011274
(Salmonella enterica 287/91)

0.0

98.9

2) SPUCDC_1198
( - )

NC_022221
(Salmonella enterica CDC1983-67)

0.0

98.8

3) SPUL_1198
( - )

NC_016831
(Salmonella enterica RKS5078)

0.0

98.8

4) I137_05515
( - )

NC_021984
(Salmonella enterica S06004)

0.0

98.8

• Sequence Alignments

1) orf245 in NC_011274


>AJ224978|10|G10|4456875|CAB37418.1|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhimurium_LT2|+|11238..11975|ORF 
          Length = 738

 Score = 1412 bits (3643), Expect = 0.0
 Identities = 730/738 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaaaattttatttattggcgaatcctggcacattcatatgattcactctaaaggtttt 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
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Query: 121 tagggtaatatcgatgtggactacatgcctgcccatattgtgcaaactcgttttccacat 180
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
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           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 241 ttcctgctacaaaacagaacgttttataatatggacattattcctgatgcattacaactt 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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           ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
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Query: 361 acgggaatagaagcaaaagccaattataaaaatacggttctggcggaggtattgccggtt 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
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           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 601 gttatgggtacttaccataaagggaaagtatgttgctttgccagtgattgttcgccgcac 660
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
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           |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 721 cacacaataaaaaaataa 738
           ||||||||||||||||||
Sbjct: 721 cacacaataaaaaaataa 738

2) SPUCDC_1198 in NC_022221


>AJ224978|10|G10|4456875|CAB37418.1|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhimurium_LT2|+|11238..11975|ORF 
          Length = 738

 Score = 1409 bits (3636), Expect = 0.0
 Identities = 729/738 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaaaattttatttattggcgaatcctggcacattcatatgattcactctaaaggtttt 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaaaattttatttattggcgaatcctggcacattcatatgattcactctaaaggtttt 60

Query: 61  gatagctttacatcaagcaaatatgaagaaggcgcagactatttattatcctgcttacgc 120
           |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
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            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
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Query: 181 accgccgaagcattagcctgctatgatgcgatcgtcatcagtgatatcggtagcaatacg 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 241 ttcctgctacaaaacagaacgttttataatatggacattattcctgatgcattacaactt 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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           ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
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Query: 361 acgggaatagaagcaaaagccaattataaaaatacggttctggcggaggtattgccggtt 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
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Query: 421 gatatgctggatgtagatgaccgcgtagaactaccgcaaggatgtaaagcagtaaatact 480
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 481 gcggtagagcatgttattacccagccatttagcgaatggccgccgctgttgggctataac 540
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 541 aagcttatcgccaaagaaaatagtcaagtccttgctgaaattaatggcgatccactgtta 600
           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 601 gttatgggtacttaccataaagggaaagtatgttgctttgccagtgattgttcgccgcac 660
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
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           |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 721 cacacaataaaaaaataa 738
           ||||||||||||||||||
Sbjct: 721 cacacaataaaaaaataa 738

3) SPUL_1198 in NC_016831


>AJ224978|10|G10|4456875|CAB37418.1|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhimurium_LT2|+|11238..11975|ORF 
          Length = 738

 Score = 1409 bits (3636), Expect = 0.0
 Identities = 729/738 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaaaattttatttattggcgaatcctggcacattcatatgattcactctaaaggtttt 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 61  gatagctttacatcaagcaaatatgaagaaggcgcagactatttattatcctgcttacgc 120
           |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
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Query: 121 tagggtaatatcgatgtggactacatgcctgcccatattgtgcaaactcgttttccacat 180
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
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Query: 181 accgccgaagcattagcctgctatgatgcgatcgtcatcagtgatatcggtagcaatacg 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 241 ttcctgctacaaaacagaacgttttataatatggacattattcctgatgcattacaactt 300
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Query: 301 atcgccgattatgttgctgagggcggcggtctgttgatgatcggcgggtatttatccttt 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 atcgccgattatgttgctgagggcggcggtctgttaatgatcggcgggtatttatccttt 360

Query: 361 acgggaatagaagcaaaagccaattataaaaatacggttctggcggaggtattgccggtt 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
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Query: 421 gatatgctggatgtagatgaccgcgtagaactaccgcaaggatgtaaagcagtaaatact 480
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 gatatgctggatgtagatgaccgcgtagaactaccgcaaggatgtaaagcagtaaatact 480

Query: 481 gcggtagagcatgttattacccagccatttagcgaatggccgccgctgttgggctataac 540
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 541 aagcttatcgccaaagaaaatagtcaagtccttgctgaaattaatggcgatccactgtta 600
           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 601 gttatgggtacttaccataaagggaaagtatgttgctttgccagtgattgttcgccgcac 660
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
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Query: 721 cacacaataaaaaaataa 738
           ||||||||||||||||||
Sbjct: 721 cacacaataaaaaaataa 738

4) I137_05515 in NC_021984


>AJ224978|10|G10|4456875|CAB37418.1|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhimurium_LT2|+|11238..11975|ORF 
          Length = 738

 Score = 1409 bits (3636), Expect = 0.0
 Identities = 729/738 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaaaattttatttattggcgaatcctggcacattcatatgattcactctaaaggtttt 60
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgaaaattttatttattggcgaatcctggcacattcatatgattcactctaaaggtttt 60

Query: 61  gatagctttacatcaagcaaatatgaagaaggcgcagactatttattatcctgcttacgc 120
           |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
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Query: 121 tagggtaatatcgatgtggactacatgcctgcccatattgtgcaaactcgttttccacat 180
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
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Sbjct: 181 accgccgaagcattagcctgctatgatgcgatcgtcatcagtgatatcggtagcaatacg 240

Query: 241 ttcctgctacaaaacagaacgttttataatatggacattattcctgatgcattacaactt 300
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ttcctgctacaaaacagaacgttttataatatggacattattcctgatgcattacaactt 300

Query: 301 atcgccgattatgttgctgagggcggcggtctgttgatgatcggcgggtatttatccttt 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 atcgccgattatgttgctgagggcggcggtctgttaatgatcggcgggtatttatccttt 360

Query: 361 acgggaatagaagcaaaagccaattataaaaatacggttctggcggaggtattgccggtt 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
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           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 481 gcggtagagcatgttattacccagccatttagcgaatggccgccgctgttgggctataac 540
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gcggtagagcatgttattacccagccatttagcgaatggccgccgctgttgggctataac 540

Query: 541 aagcttatcgccaaagaaaatagtcaagtccttgctgaaattaatggcgatccactgtta 600
           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 aagcttatcgccaaagaaaatagtcaggtccttgctgaaattaatggcgatccactgtta 600

Query: 601 gttatgggtacttaccataaagggaaagtatgttgctttgccagtgattgttcgccgcac 660
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gttatgggtacttaccataaagggaaagtatgttgttttgccagtgattgttcgccgcac 660

Query: 661 tggggaagcccgcagtttctgcaatgggaacattacgccaccttctggtgtaatgtttta 720
           |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 tggggaagtccgcagtttctgcaatgggaacattacgccaccttctggtgtaatgtttta 720

Query: 721 cacacaataaaaaaataa 738
           ||||||||||||||||||
Sbjct: 721 cacacaataaaaaaataa 738