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Homologs of join gene of NC_009257_P1

239

DNA-level

Hit (GenBank Accn)

Product

Source Genome

Eval.

Ident.(%)

1) FTF1141
( - )

NC_008245
(Francisella tularensis FSC 198)

0.0

99.3

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( - )

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( - )

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( - )

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( - )

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(Francisella tularensis FSC200)

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( - )

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(Francisella tularensis FSC200)

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( - )

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(Francisella tularensis FSC200)

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( - )

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(Francisella tularensis FSC200)

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( - )

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(Francisella tularensis FSC200)

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( - )

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( - )

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( - )

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( - )

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(Francisella tularensis FSC200)

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( - )

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( - )

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( - )

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( - )

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( - )

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(Francisella tularensis FSC200)

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( - )

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(Francisella tularensis FSC200)

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( - )

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( - )

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(Francisella tularensis FSC200)

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( - )

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(Francisella tularensis FSC200)

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( - )

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( - )

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( - )

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( - )

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(Francisella tularensis FSC200)

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( - )

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(Francisella tularensis TI0902)

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( - )

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(Francisella tularensis TI0902)

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( - )

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(Francisella tularensis TI0902)

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( - )

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(Francisella tularensis TI0902)

0.0

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( - )

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(Francisella tularensis TI0902)

0.0

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( - )

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(Francisella tularensis TI0902)

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( - )

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(Francisella tularensis TI0902)

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( - )

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(Francisella tularensis TI0902)

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( - )

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(Francisella tularensis TI0902)

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( - )

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(Francisella tularensis TI0902)

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( - )

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(Francisella tularensis TI0902)

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(Francisella tularensis TIGB03)

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( - )

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(Francisella tularensis TIGB03)

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130) unnamed
( - )

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(Francisella tularensis TIGB03)

0.0

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131) unnamed
( - )

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(Francisella tularensis TIGB03)

0.0

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132) unnamed
( - )

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(Francisella tularensis TIGB03)

0.0

99.2

133) unnamed
( - )

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(Francisella tularensis TIGB03)

0.0

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( - )

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(Francisella tularensis TIGB03)

0.0

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135) unnamed
( - )

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(Francisella tularensis TIGB03)

0.0

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136) unnamed
( - )

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(Francisella tularensis TIGB03)

0.0

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( - )

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(Francisella tularensis TIGB03)

0.0

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138) unnamed
( - )

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(Francisella tularensis TIGB03)

0.0

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( - )

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(Francisella tularensis TIGB03)

0.0

99.2

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( - )

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(Francisella tularensis TIGB03)

0.0

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( - )

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(Francisella tularensis TIGB03)

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(Francisella tularensis TIGB03)

0.0

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( - )

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(Francisella tularensis TIGB03)

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( - )

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(Francisella tularensis TIGB03)

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( - )

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(Francisella tularensis TIGB03)

0.0

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148) unnamed
( - )

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(Francisella tularensis TIGB03)

0.0

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149) unnamed
( - )

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(Francisella tularensis TIGB03)

0.0

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( - )

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(Francisella tularensis TIGB03)

0.0

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( - )

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(Francisella tularensis TIGB03)

0.0

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( - )

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(Francisella tularensis TIGB03)

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(Francisella tularensis TIGB03)

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(Francisella tularensis TIGB03)

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( - )

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(Francisella tularensis TIGB03)

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( - )

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(Francisella tularensis TIGB03)

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(Francisella tularensis TIGB03)

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(Francisella tularensis TIGB03)

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(Francisella tularensis TIGB03)

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( - )

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(Francisella tularensis TIGB03)

0.0

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( - )

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(Francisella tularensis TIGB03)

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( - )

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Query: 704 cttggaatatcaggggctaatgcttcttttatatctaatgcacttgcatctggatgatct 763
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2) FTT_1141 in NC_006570


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3) FTV_1091 in NC_016937


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5) unnamed in NC_019551


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6) unnamed in NC_019551


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31) unnamed in NC_019551


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32) isftu1 in NC_007880


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43) FTH_1218 in NC_008369


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56) unnamed in NC_019551


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57) isftu1 in NC_008369


>NC_009257_P1|1|G1|134301192|YP_001121160.1|Francisella_tularensis_subsp._tularensis_WY96-3418|+|1..881|join|FTW_0033|transposase 
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58) unnamed in NC_019551


>NC_009257_P1|1|G1|134301192|YP_001121160.1|Francisella_tularensis_subsp._tularensis_WY96-3418|+|1..881|join|FTW_0033|transposase 
          Length = 881

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 Strand = Plus / Plus

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59) isftu1 in NC_008369


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          Length = 881

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Sbjct: 840 gatgctatctcttatgtgtttaacaaaatactctcggattaa 881

60) isftu1 in NC_008369


>NC_009257_P1|1|G1|134301192|YP_001121160.1|Francisella_tularensis_subsp._tularensis_WY96-3418|+|1..881|join|FTW_0033|transposase 
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Sbjct: 181 gctagctttaccgataaaacattgattgaacagtatttgatagatcatccagatgcaagt 240

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Query: 301 cttaatatacttggttttagttttaaaaaaagactccaaaatataagcaaagaaaagaac 360
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Sbjct: 301 cttaatagacttggttttagttttaaaaaaagactccaaaatataagcaaagaaaagaac 360

Query: 361 atgaaaggttggagtatatagaaaaactaaaagaaatagctcaaaacttgttattttata 420
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61) isftu1 in NC_008369


>NC_009257_P1|1|G1|134301192|YP_001121160.1|Francisella_tularensis_subsp._tularensis_WY96-3418|+|1..881|join|FTW_0033|transposase 
          Length = 881

 Score = 1657 bits (4275), Expect = 0.0
 Identities = 871/881 (99%)
 Strand = Plus / Plus

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Query: 540 ataattatgcagataaaaagattatagctccattagagtacagcggatataccaatactg 599
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62) isftu1 in NC_008369


>NC_009257_P1|1|G1|134301192|YP_001121160.1|Francisella_tularensis_subsp._tularensis_WY96-3418|+|1..881|join|FTW_0033|transposase 
          Length = 881

 Score = 1657 bits (4276), Expect = 0.0
 Identities = 871/881 (99%)
 Strand = Plus / Plus

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Sbjct: 121 gagttttataaaagaaccggagattatagttcaaagcaaggagttggttgtggcagagtc 180

Query: 181 gctagctttaccgataaaacattgattgaacagtatttgatagatcatccagatgcaagt 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 241 acattagatataaaagaagcattagcccctgatattccaagaagtacattttatgattgt 300
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Sbjct: 301 cttaatagacttggttttagttttaaaaaaagactccaaaatataagcaaagaaaagaac 360

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           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 atgaaaggttggagtatatagaaaaactaaaagaaatagctcaaaacttgttattttata 420

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           || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 721 ttgatgtacaaatattatatctacctccgtactctccagatttaaatcctattgaaaagg 780
           ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
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           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 atgctatctcttatgtgtttaacaaaatactctcggattaa 881

63) FTA_1044 in NC_009749


>NC_009257_P1|1|G1|134301192|YP_001121160.1|Francisella_tularensis_subsp._tularensis_WY96-3418|+|1..881|join|FTW_0033|transposase 
          Length = 881

 Score = 1656 bits (4273), Expect = 0.0
 Identities = 866/875 (99%)
 Strand = Plus / Minus

Query: 282  ttaatccgagagtattttgttaaacacataagagatagcatcacaaaatttttcaaaact 341
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 342  attattcacttttctaaatatttttttaaagttagcccaaaccttttcaataggatttaa 401
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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            ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 462  cagcttagaggatttatggaaactagcattatccattactatagtagttttaggttttaa 521
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 701  cagcttagaggatttatggaaactagcattatccattactatagtagttttaggttttaa 642

Query: 522  tgatgggcataagtgttcctcaaaccattgattaaaaatttcagtattggtatatccgct 581
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 641  tgatgggcataagtgttcctcaaaccattgattaaaaatttcagtattggtatatccact 582

Query: 582  gtactctaatggagctataatctttttatctgcataattatatccagcaacaatacttct 641
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 581  gtactctaatggagctataatctttttatctgcataattatatccagcaacaatacttct 522

Query: 642  tctttgtgtttgatatgctaaaacctcgccataactaggctcaccaattagtgaccatcc 701
            ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 521  tctttgtgtttgatatgctaaaacctcaccataactaggctcaccaattagtgaccatcc 462

Query: 702  tcttaggatagaaagcttattgtcacaccccatctcatctatataaaataacaagttttg 761
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 461  tcttaggatagaaagcttattgtcacaccccatctcatctatataaaataacaagttttg 402

Query: 762  agctatttcttttagtttttctatatactccaacctttcatgttcttttctttgcttata 821
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 401  agctatttcttttagtttttctatatactccaacctttcatgttcttttctttgcttata 342

Query: 822  ttttggagtctttttttaaaactaaaaccaagtatattaagacaatcataaaatgtactt 881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 341  ttttggagtctttttttaaaactaaaaccaagtctattaagacaatcataaaatgtactt 282

Query: 882  cttggaatatcaggggctaatgcttcttttatatctaatgtacttgcatctggatgatct 941
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 281  cttggaatatcaggggctaatgcttcttttatatctaatgcacttgcatctggatgatct 222

Query: 942  atcaaatactgttcaatcaatgttttatcggtaaagctagcgactctgccacaaccaact 1001
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 221  atcaaatactgttcaatcaatgttttatcggtaaagctagcgactctgccacaaccaact 162

Query: 1002 ccttgccttgaactataatctccggttcttttataaagctctatccatgaaacaactgta 1061
            |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 161  ccttgctttgaactataatctccggttcttttataaaactctatccatgaaacaactgta 102

Query: 1062 cgcttatctatgttaaaaaacttactcagctcgaactccgtcataccttcttcatattta 1121
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 101  cgcttatctatgttaaaaaacttactcagctcgaactccgtcataccttcttcatattta 42

Query: 1122 ttaattacaatgtctctaaaatcttggctatatga 1156
            |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 41   ttaattacgatgtctctaaaatattggctatatga 7

64) isftu1 in NC_008369


>NC_009257_P1|1|G1|134301192|YP_001121160.1|Francisella_tularensis_subsp._tularensis_WY96-3418|+|1..881|join|FTW_0033|transposase 
          Length = 881

 Score = 1654 bits (4269), Expect = 0.0
 Identities = 870/881 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgccatcatatagtcaagattttagagacatcgtaattaataaatatgaagaaggtatg 60
           |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgccatcatatagccaatattttagagacatcgtaattaataaatatgaagaaggtatg 60

Query: 61  acggagttcgagctgagtaagttttttaacatagataagcgtacagttgtttcatggata 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  acggagttcgagctgagtaagttttttaacatagataagcgtacagttgtttcatggata 120

Query: 121 gagctttataaaagaaccggagattatagttcaaggcaaggagttggttgtggcagagtc 180
           ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gagttttataaaagaaccggagattatagttcaaagcaaggagttggttgtggcagagtc 180

Query: 181 gctagctttaccgataaaacattgattgaacagtatttgatagatcatccagatgcaagt 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gctagctttaccgataaaacattgattgaacagtatttgatagatcatccagatgcaagt 240

Query: 241 acattagatataaaagaagcattagcccctgatattccaagaagtacattttatgattgt 300
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gcattagatataaaagaagcattagcccctgatattccaagaagtacattttatgattgt 300

Query: 301 cttaatatacttggttttagttttaaaaaaagactccaaaatataagcaaagaaaagaac 360
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Sbjct: 301 cttaatagacttggttttagttttaaaaaaagactccaaaatataagcaaagaaaagaac 360

Query: 361 atgaaaggttggagtatatagaaaaactaaaagaaatagctcaaaacttgttattttata 420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 atgaaaggttggagtatatagaaaaactaaaagaaatagctcaaaacttgttattttata 420

Query: 421 tagatgagatggggtgtgacaataagctttctatcctaagaggatggtcactaattggtg 480
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Sbjct: 421 tagatgagatggggtgtgacaataagctttctatcctaagaggatggtcactaattggtg 480

Query: 481 agtctagttatggcgaggttttagcatatcaaacacaaagaagaagtattgttgctggat 540
           || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 agcctagttatggtgaggttttagcatatcaaacacaaagaagaagtattgttgctggat 540

Query: 541 ataattatgcagataaaaagattatagctccattagagtacagcggatataccaatactg 600
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Sbjct: 541 ataattatgcagataaaaagattatagctccattagagtacagtggatataccaatactg 600

Query: 601 aaatttttaatcaatggtttgaggaacacttatgcccatcattaaaacctaaaactacta 660
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Sbjct: 601 aaatttttaatcaatggtttgaggaacacttatgcccatcattaaaacctaaaactacta 660

Query: 661 tagtaatggataatgctagtttccataaatcctctaagctgattgaaatagccaataaat 720
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Sbjct: 661 tagtaatggataatgctagtttccataaatcctctaagctgattgaaatagccaataaat 720

Query: 721 ttgatgtacaaatattatatctacctccgtactctccagatttaaatcctattgaaaagg 780
           ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 ttgatgtacaaatattatatctacctccgtattctccagatttaaatcctattgaaaagg 780

Query: 781 tttgggctaactttaaaaaaatatttagaaaagtgaataatagttttgaaaa-ttttgtg 839
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 781 tttgggctaactttaaaaaaatatttagaaaagtgaataatagttttgaaaaattttgtg 840

Query: 840 atgctatctcttatgtgtttaacaaaatactctcggattaa 880
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 atgctatctcttatgtgtttaacaaaatactctcggattaa 881

65) unnamed in NC_019551


>NC_009257_P1|1|G1|134301192|YP_001121160.1|Francisella_tularensis_subsp._tularensis_WY96-3418|+|1..881|join|FTW_0033|transposase 
          Length = 881

 Score = 1531 bits (3950), Expect = 0.0
 Identities = 800/808 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 67  atgccatcatatagccaagattttagagacatcgtaattaataaatatgaagaaggtatg 126
           |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgccatcatatagccaatattttagagacatcgtaattaataaatatgaagaaggtatg 60

Query: 127 acggagttcgagctgagtaagttttttaacatagataagcgtacagttgtttcatggata 186
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  acggagttcgagctgagtaagttttttaacatagataagcgtacagttgtttcatggata 120

Query: 187 gagctttataaaagaaccggagattatagttcaaggcaaggagttggttgtggcagagtc 246
           ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gagttttataaaagaaccggagattatagttcaaagcaaggagttggttgtggcagagtc 180

Query: 247 gctagctttaccgataaaacattgattgaacagtatttgatagatcatccagatgcaagt 306
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gctagctttaccgataaaacattgattgaacagtatttgatagatcatccagatgcaagt 240

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68) isftu1 in NC_008369


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69) isftu1 in NC_008369


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72) isftu1 in NC_008369


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73) isftu1 in NC_008369


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74) unnamed in NC_019551


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 Strand = Plus / Plus

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77) isftu1 in NC_008369


>NC_009257_P1|1|G1|134301192|YP_001121160.1|Francisella_tularensis_subsp._tularensis_WY96-3418|+|1..881|join|FTW_0033|transposase 
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 Strand = Plus / Plus

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Sbjct: 781 tttgggctaactttaaaaaaatatttag 808

78) unnamed in NC_019551


>NC_009257_P1|1|G1|134301192|YP_001121160.1|Francisella_tularensis_subsp._tularensis_WY96-3418|+|1..881|join|FTW_0033|transposase 
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79) unnamed in NC_019551


>NC_009257_P1|1|G1|134301192|YP_001121160.1|Francisella_tularensis_subsp._tularensis_WY96-3418|+|1..881|join|FTW_0033|transposase 
          Length = 881

 Score = 1524 bits (3932), Expect = 0.0
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80) isftu1 in NC_008369


>NC_009257_P1|1|G1|134301192|YP_001121160.1|Francisella_tularensis_subsp._tularensis_WY96-3418|+|1..881|join|FTW_0033|transposase 
          Length = 881

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81) isftu1 in NC_006570


>NC_009257_P1|1|G1|134301192|YP_001121160.1|Francisella_tularensis_subsp._tularensis_WY96-3418|+|1..881|join|FTW_0033|transposase 
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Sbjct: 361 atgaaaggttggagtatatagaaaaactaaaagaaatagctcaaaacttgttattttata 420

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Sbjct: 421 tagatgagatggggtgtgacaataagctttctatcctaagaggatggtcactaattggtg 480

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Sbjct: 481 agcctagttatggtgaggttttagcatatcaaacacaaagaagaagtattgttgctggat 540

Query: 541 ataattatgcagataaaaagattatagctctattagagtacagcggatataccaatactg 600
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Sbjct: 541 ataattatgcagataaaaagattatagctccattagagtacagtggatataccaatactg 600

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94) unnamed in NC_016937


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95) unnamed in NC_016937


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97) unnamed in NC_016937


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106) unnamed in NC_016937


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107) unnamed in NC_016937


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122) unnamed in NC_016937


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133) unnamed in NC_016933


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150) unnamed in NC_016933


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173) unnamed in NC_016933


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174) unnamed in NC_016933


>NC_009257_P1|1|G1|134301192|YP_001121160.1|Francisella_tularensis_subsp._tularensis_WY96-3418|+|1..881|join|FTW_0033|transposase 
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175) unnamed in NC_016933


>NC_009257_P1|1|G1|134301192|YP_001121160.1|Francisella_tularensis_subsp._tularensis_WY96-3418|+|1..881|join|FTW_0033|transposase 
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176) isftu1 in NC_008245


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177) unnamed in NC_016937


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178) isftu1 in NC_008369


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179) isftu1 in NC_008369


>NC_009257_P1|1|G1|134301192|YP_001121160.1|Francisella_tularensis_subsp._tularensis_WY96-3418|+|1..881|join|FTW_0033|transposase 
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180) isftu1 in NC_008369


>NC_009257_P1|1|G1|134301192|YP_001121160.1|Francisella_tularensis_subsp._tularensis_WY96-3418|+|1..881|join|FTW_0033|transposase 
          Length = 881

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181) isftu1 in NC_008369


>NC_009257_P1|1|G1|134301192|YP_001121160.1|Francisella_tularensis_subsp._tularensis_WY96-3418|+|1..881|join|FTW_0033|transposase 
          Length = 881

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183) isftu1 in NC_008369


>NC_009257_P1|1|G1|134301192|YP_001121160.1|Francisella_tularensis_subsp._tularensis_WY96-3418|+|1..881|join|FTW_0033|transposase 
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184) unnamed in NC_010677


>NC_009257_P1|1|G1|134301192|YP_001121160.1|Francisella_tularensis_subsp._tularensis_WY96-3418|+|1..881|join|FTW_0033|transposase 
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185) unnamed in NC_010677


>NC_009257_P1|1|G1|134301192|YP_001121160.1|Francisella_tularensis_subsp._tularensis_WY96-3418|+|1..881|join|FTW_0033|transposase 
          Length = 881

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186) unnamed in NC_010677


>NC_009257_P1|1|G1|134301192|YP_001121160.1|Francisella_tularensis_subsp._tularensis_WY96-3418|+|1..881|join|FTW_0033|transposase 
          Length = 881

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Sbjct: 361 atgaaag 367

187) unnamed in NC_010677


>NC_009257_P1|1|G1|134301192|YP_001121160.1|Francisella_tularensis_subsp._tularensis_WY96-3418|+|1..881|join|FTW_0033|transposase 
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207) unnamed in NC_010677


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213) unnamed in NC_010677


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234) unnamed in NC_010677


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          Length = 881

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235) unnamed in NC_010677


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