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Homologs of intB gene of GQ903049

DNA-level

Hit (GenBank Accn)

Product

Source Genome

Eval.

Ident.(%)

1) ECO26_2859
( - )

NC_013361
(Escherichia coli 11368)

0.0

99.6

2) SF2046
( - )

NC_004337
(Shigella flexneri 301)

0.0

99.9

3) ECOK1_2143
( - )

NC_017628
(Escherichia coli IHE3034)

0.0

99.4

4) int
( - )

NC_011742
(Escherichia coli S88)

0.0

99.4

• Sequence Alignments

1) ECO26_2859 in NC_013361


>GQ903049|1|G1|307158319|ADN38958.1|Escherichia_coli_AD110|+|1..792|intB|-|P4-like 
          Length = 792

 Score = 1548 bits (3994), Expect = 0.0
 Identities = 789/792 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 136 ctggaggttgcgtcccgcacacggcagcacctgagtaacataatgcgccatgcggtccat 195
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   ctggaggttgcgtcccgcacacggcagcacctgagtaacataatgcgccatgcggtccat 60

Query: 196 caggagttaatcgatacgaaccctgcagcaaaccttggcggcgtgaccacacctcctgtc 255
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  caggagttaatcgatacgaaccctgcagcaaaccttggcggcgtgaccacacctcctgtc 120

Query: 256 agacggcactatcctgccctgccgctggagcggctgcctgaactgcttgaacgtattggg 315
           ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 agacggcactatcctgccccgccgctggagcggctgcctgaactgcttgaacgtattggg 180

Query: 316 gcatatcatcagggccgtgaactgacccggcatgccgttctgctgatgctgcatgtgttc 375
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gcatatcatcagggccgtgaactgacccggcatgccgttctgctgatgctgcatgtgttc 240

Query: 376 attcgctccagtgaactgcgtttcgcccgctggtcagagattgatttcacaaaccgagtc 435
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 attcgctccagtgaactgcgtttcgcccgctggtcagagattgatttcacaaaccgagtc 300

Query: 436 tggacgatacccgcgacgcgagaacccattattggcgtgcgttattccggccgcggggca 495
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 tggacgatacccgcgacgcgagaacccattattggcgtgcgttattccggccgcggggca 360

Query: 496 aaaatgcgaatgccgcatatcgtccccctctcagaacagtccatcgccattctgaaacag 555
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 aaaatgcgaatgccgcatatcgtccccctctcagaacagtccatcgccattctgaaacag 420

Query: 556 attaaggatatcaccggtaataatgaactgatcttccccggcgaccataacccgtataag 615
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 attaaggatatcaccggtaataatgaactgatcttccccggcgaccataacccgtataag 480

Query: 616 ccaatgtgtgaaaacacggtcaataaggcactgcgggtgatgggttacgacacgaaaaag 675
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 ccaatgtgtgaaaacacggtcaataaggcactgcgggtgatgggttacgacacgaaaaag 540

Query: 676 gatatctgcggtcacggcttccgggcaatggcatgcagtgcgctgatggaatcgggttta 735
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gatatctgcggtcacggcttccgggcaatggcatgcagtgcgctgatggaatcgggttta 600

Query: 736 tgggcaaaggacgcagtagaacgccagatgagtcatcaggagcgcaataccgtgcgcatg 795
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 tgggcaaaggacgcagtagaacgccagatgagtcatcaggagcgcaataccgtgcgcatg 660

Query: 796 gcttatattcataaggcagagcacctagaagcccgcaaagcgatgatgcagtggtggtcg 855
           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 gcttatattcataaggcagagcacctggaagcccgcaaagcgatgatgcagtggtggtcg 720

Query: 856 gattatctggaagcatgccgagaatcttatgcgccgccttatacaattggtaaaaataag 915
           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 gattatctggaagcatgccgagaatcttatgcaccgccttatacaattggtaaaaataag 780

Query: 916 tttatcccatag 927
           ||||||||||||
Sbjct: 781 tttatcccatag 792

2) SF2046 in NC_004337


>GQ903049|1|G1|307158319|ADN38958.1|Escherichia_coli_AD110|+|1..792|intB|-|P4-like 
          Length = 792

 Score = 1542 bits (3980), Expect = 0.0
 Identities = 790/792 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 253  ctggaggttgcgtcccgcacacggcagcacctgagtaacataatgcgccatgcggtccat 312
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1    ctggaggttgcgtcccgcacacggcagcacctgagtaacataatgcgccatgcggtccat 60

Query: 313  caggagttaatcgatacgaaccctgcagcaaaccttggcggcgtgaccacacctcctgtc 372
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61   caggagttaatcgatacgaaccctgcagcaaaccttggcggcgtgaccacacctcctgtc 120

Query: 373  agacggcactatcctgccctgccgctggagcggctgcctgaactgcttgaacgtattggg 432
            ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121  agacggcactatcctgccccgccgctggagcggctgcctgaactgcttgaacgtattggg 180

Query: 433  gcatatcatcagggccgtgaactgacccggcatgccgttctgctgatgctgcatg-gttc 491
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 181  gcatatcatcagggccgtgaactgacccggcatgccgttctgctgatgctgcatgtgttc 240

Query: 492  attcgctccagtgaactgcgtttcgcccgctggtcagagattgatttcacaaaccgagtc 551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241  attcgctccagtgaactgcgtttcgcccgctggtcagagattgatttcacaaaccgagtc 300

Query: 552  tggacgatacccgcgacgcgagaacccattattggcgtgcgttattccggccgcggggca 611
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301  tggacgatacccgcgacgcgagaacccattattggcgtgcgttattccggccgcggggca 360

Query: 612  aaaatgcgaatgccgcatatcgtccccctctcagaacagtccatcgccattctgaaacag 671
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361  aaaatgcgaatgccgcatatcgtccccctctcagaacagtccatcgccattctgaaacag 420

Query: 672  attaaggatatcaccggtaataatgaactgatcttccccggcgaccataacccgtataag 731
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421  attaaggatatcaccggtaataatgaactgatcttccccggcgaccataacccgtataag 480

Query: 732  ccaatgtgtgaaaacacggtcaataaggcactgcgggtgatgggttacgacacgaaaaag 791
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481  ccaatgtgtgaaaacacggtcaataaggcactgcgggtgatgggttacgacacgaaaaag 540

Query: 792  gatatctgcggtcacggcttccgggcaatggcatgcagtgcgctgatggaatcgggttta 851
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541  gatatctgcggtcacggcttccgggcaatggcatgcagtgcgctgatggaatcgggttta 600

Query: 852  tgggcaaaggacgcagtagaacgccagatgagtcatcaggagcgcaataccgtgcgcatg 911
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601  tgggcaaaggacgcagtagaacgccagatgagtcatcaggagcgcaataccgtgcgcatg 660

Query: 912  gcttatattcataaggcagagcacctggaagcccgcaaagcgatgatgcagtggtggtcg 971
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661  gcttatattcataaggcagagcacctggaagcccgcaaagcgatgatgcagtggtggtcg 720

Query: 972  gattatctggaagcatgccgagaatcttatgcaccgccttatacaattggtaaaaataag 1031
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721  gattatctggaagcatgccgagaatcttatgcaccgccttatacaattggtaaaaataag 780

Query: 1032 tttatcccatag 1043
            ||||||||||||
Sbjct: 781  tttatcccatag 792

3) ECOK1_2143 in NC_017628


>GQ903049|1|G1|307158319|ADN38958.1|Escherichia_coli_AD110|+|1..792|intB|-|P4-like 
          Length = 792

 Score = 1388 bits (3581), Expect = 0.0
 Identities = 707/711 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 253 ctggaggttgcgtcccgcacacggcagcacctgagtaacataatacgccatgcggtccat 312
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 1   ctggaggttgcgtcccgcacacggcagcacctgagtaacataatgcgccatgcggtccat 60

Query: 313 caggagttaatcgatacgaaccctgcagcaaaccttggcggcgtgaccacacctcctgtc 372
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  caggagttaatcgatacgaaccctgcagcaaaccttggcggcgtgaccacacctcctgtc 120

Query: 373 agacggcactatcctgccctgccgctggagcggctgcctgaactgcttgaacgtattggg 432
           ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 agacggcactatcctgccccgccgctggagcggctgcctgaactgcttgaacgtattggg 180

Query: 433 gcatatcatcagggccgtgaactgacccggcatgccgttctgctgatgctgcatgtgttc 492
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gcatatcatcagggccgtgaactgacccggcatgccgttctgctgatgctgcatgtgttc 240

Query: 493 attcgctccagtgaactgcgtttcgcccgctggtcagagattgatttcacaaaccgagtc 552
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 attcgctccagtgaactgcgtttcgcccgctggtcagagattgatttcacaaaccgagtc 300

Query: 553 tggacgatacccgcgacgcgagaacccattattggcgtgcattattccggccgcggggca 612
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 301 tggacgatacccgcgacgcgagaacccattattggcgtgcgttattccggccgcggggca 360

Query: 613 aaaatgcgaatgccgcatatcgtccccctctcagaacagtccatcgccattctgaaacag 672
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 aaaatgcgaatgccgcatatcgtccccctctcagaacagtccatcgccattctgaaacag 420

Query: 673 attaaggatatcaccggtaataatgaactgatcttccccggcgaccataacccgtataag 732
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 attaaggatatcaccggtaataatgaactgatcttccccggcgaccataacccgtataag 480

Query: 733 ccaatgtgtgaaaacacggtcaataaggcactgcgggtgatgggttacgacacgaaaaag 792
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 ccaatgtgtgaaaacacggtcaataaggcactgcgggtgatgggttacgacacgaaaaag 540

Query: 793 gatatctgcggtcacggcttccgggcaatggcatgcagtgcgctgatggaatcgggttta 852
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gatatctgcggtcacggcttccgggcaatggcatgcagtgcgctgatggaatcgggttta 600

Query: 853 tgggcaaaggacgcagtagaacgccagatgagtcatcaggagcgcaataccgtgcgcatg 912
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 tgggcaaaggacgcagtagaacgccagatgagtcatcaggagcgcaataccgtgcgcatg 660

Query: 913 gcttatattcataaggcagagcacctggaagcccgcaaagcgatgatgtag 963
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 661 gcttatattcataaggcagagcacctggaagcccgcaaagcgatgatgcag 711

4) int in NC_011742


>GQ903049|1|G1|307158319|ADN38958.1|Escherichia_coli_AD110|+|1..792|intB|-|P4-like 
          Length = 792

 Score = 1388 bits (3581), Expect = 0.0
 Identities = 707/711 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 253 ctggaggttgcgtcccgcacacggcagcacctgagtaacataatacgccatgcggtccat 312
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 1   ctggaggttgcgtcccgcacacggcagcacctgagtaacataatgcgccatgcggtccat 60

Query: 313 caggagttaatcgatacgaaccctgcagcaaaccttggcggcgtgaccacacctcctgtc 372
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  caggagttaatcgatacgaaccctgcagcaaaccttggcggcgtgaccacacctcctgtc 120

Query: 373 agacggcactatcctgccctgccgctggagcggctgcctgaactgcttgaacgtattggg 432
           ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 agacggcactatcctgccccgccgctggagcggctgcctgaactgcttgaacgtattggg 180

Query: 433 gcatatcatcagggccgtgaactgacccggcatgccgttctgctgatgctgcatgtgttc 492
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gcatatcatcagggccgtgaactgacccggcatgccgttctgctgatgctgcatgtgttc 240

Query: 493 attcgctccagtgaactgcgtttcgcccgctggtcagagattgatttcacaaaccgagtc 552
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 attcgctccagtgaactgcgtttcgcccgctggtcagagattgatttcacaaaccgagtc 300

Query: 553 tggacgatacccgcgacgcgagaacccattattggcgtgcattattccggccgcggggca 612
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 301 tggacgatacccgcgacgcgagaacccattattggcgtgcgttattccggccgcggggca 360

Query: 613 aaaatgcgaatgccgcatatcgtccccctctcagaacagtccatcgccattctgaaacag 672
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 aaaatgcgaatgccgcatatcgtccccctctcagaacagtccatcgccattctgaaacag 420

Query: 673 attaaggatatcaccggtaataatgaactgatcttccccggcgaccataacccgtataag 732
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 attaaggatatcaccggtaataatgaactgatcttccccggcgaccataacccgtataag 480

Query: 733 ccaatgtgtgaaaacacggtcaataaggcactgcgggtgatgggttacgacacgaaaaag 792
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 ccaatgtgtgaaaacacggtcaataaggcactgcgggtgatgggttacgacacgaaaaag 540

Query: 793 gatatctgcggtcacggcttccgggcaatggcatgcagtgcgctgatggaatcgggttta 852
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gatatctgcggtcacggcttccgggcaatggcatgcagtgcgctgatggaatcgggttta 600

Query: 853 tgggcaaaggacgcagtagaacgccagatgagtcatcaggagcgcaataccgtgcgcatg 912
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 tgggcaaaggacgcagtagaacgccagatgagtcatcaggagcgcaataccgtgcgcatg 660

Query: 913 gcttatattcataaggcagagcacctggaagcccgcaaagcgatgatgtag 963
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 661 gcttatattcataaggcagagcacctggaagcccgcaaagcgatgatgcag 711