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Homologs of int gene of AJ245585

DNA-level

Hit (GenBank Accn)

Product

Source Genome

Eval.

Ident.(%)

1) ECO26_2859
( - )

NC_013361
(Escherichia coli 11368)

0.0

100

2) SF2046
( - )

NC_004337
(Shigella flexneri 301)

0.0

99.7

3) YPTB1602
( - )

NC_006155
(Yersinia pseudotuberculosis IP 32953)

0.0

99.8

4) YPTS_1719
( - )

NC_010634
(Yersinia pseudotuberculosis PB1/+)

0.0

99.8

5) int
( - )

NC_008800
(Yersinia enterocolitica 8081)

0.0

6) ECOK1_2143
( - )

NC_017628
(Escherichia coli IHE3034)

0.0

99.4

7) int
( - )

NC_011742
(Escherichia coli S88)

0.0

99.4

• Sequence Alignments

1) ECO26_2859 in NC_013361


>AJ245585|1|G1|6179518|CAB59975.1|Escherichia_coli_5720/96|+|1..916|int|-|integrase 
          Length = 916

 Score = 1798 bits (4641), Expect = 0.0
 Identities = 916/916 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 12  atgttccttaccgacgcaaaaatccgcaccctcaagccttctgataaaccctttaaagtc 71
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgttccttaccgacgcaaaaatccgcaccctcaagccttctgataaaccctttaaagtc 60

Query: 72  tccgattctcacggtctgtatctgctggtcaagccgggtggctcccgccactggtatctc 131
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  tccgattctcacggtctgtatctgctggtcaagccgggtggctcccgccactggtatctc 120

Query: 132 aaagctggaggttgcgtcccgcacacggcagcacctgagtaacataatgcgccatgcggt 191
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 aaagctggaggttgcgtcccgcacacggcagcacctgagtaacataatgcgccatgcggt 180

Query: 192 ccatcaggagttaatcgatacgaaccctgcagcaaaccttggcggcgtgaccacacctcc 251
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 ccatcaggagttaatcgatacgaaccctgcagcaaaccttggcggcgtgaccacacctcc 240

Query: 252 tgtcagacggcactatcctgccctgccgctggagcggctgcctgaactgcttgaacgtat 311
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tgtcagacggcactatcctgccctgccgctggagcggctgcctgaactgcttgaacgtat 300

Query: 312 tggggcatatcatcagggccgtgaactgacccggcatgccgttctgctgatgctgcatgt 371
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 tggggcatatcatcagggccgtgaactgacccggcatgccgttctgctgatgctgcatgt 360

Query: 372 gttcattcgctccagtgaactgcgtttcgcccgctggtcagagattgatttcacaaaccg 431
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gttcattcgctccagtgaactgcgtttcgcccgctggtcagagattgatttcacaaaccg 420

Query: 432 agtctggacgatacccgcgacgcgagaacccattattggcgtgcgttattccggccgcgg 491
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 agtctggacgatacccgcgacgcgagaacccattattggcgtgcgttattccggccgcgg 480

Query: 492 ggcaaaaatgcgaatgccgcatatcgtccccctctcagaacagtccatcgccattctgaa 551
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 ggcaaaaatgcgaatgccgcatatcgtccccctctcagaacagtccatcgccattctgaa 540

Query: 552 acagattaaggatatcaccggtaataatgaactgatcttccccggcgaccataacccgta 611
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 acagattaaggatatcaccggtaataatgaactgatcttccccggcgaccataacccgta 600

Query: 612 taagccaatgtgtgaaaacacggtcaataaggcactgcgggtgatgggttacgacacgaa 671
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 taagccaatgtgtgaaaacacggtcaataaggcactgcgggtgatgggttacgacacgaa 660

Query: 672 aaaggatatctgcggtcacggcttccgggcaatggcatgcagtgcgctgatggaatcggg 731
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 aaaggatatctgcggtcacggcttccgggcaatggcatgcagtgcgctgatggaatcggg 720

Query: 732 tttatgggcaaaggacgcagtagaacgccagatgagtcatcaggagcgcaataccgtgcg 791
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 tttatgggcaaaggacgcagtagaacgccagatgagtcatcaggagcgcaataccgtgcg 780

Query: 792 catggcttatattcataaggcagagcacctagaagcccgcaaagcgatgatgcagtggtg 851
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 catggcttatattcataaggcagagcacctagaagcccgcaaagcgatgatgcagtggtg 840

Query: 852 gtcggattatctggaagcatgccgagaatcttatgcgccgccttatacaattggtaaaaa 911
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 gtcggattatctggaagcatgccgagaatcttatgcgccgccttatacaattggtaaaaa 900

Query: 912 taagtttatcccatag 927
           ||||||||||||||||
Sbjct: 901 taagtttatcccatag 916

2) SF2046 in NC_004337


>AJ245585|1|G1|6179518|CAB59975.1|Escherichia_coli_5720/96|+|1..916|int|-|integrase 
          Length = 916

 Score = 1542 bits (3978), Expect = 0.0
 Identities = 790/793 (100%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 252  gctggaggttgcgtcccgcacacggcagcacctgagtaacataatgcgccatgcggtcca 311
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 124  gctggaggttgcgtcccgcacacggcagcacctgagtaacataatgcgccatgcggtcca 183

Query: 312  tcaggagttaatcgatacgaaccctgcagcaaaccttggcggcgtgaccacacctcctgt 371
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 184  tcaggagttaatcgatacgaaccctgcagcaaaccttggcggcgtgaccacacctcctgt 243

Query: 372  cagacggcactatcctgccctgccgctggagcggctgcctgaactgcttgaacgtattgg 431
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 244  cagacggcactatcctgccctgccgctggagcggctgcctgaactgcttgaacgtattgg 303

Query: 432  ggcatatcatcagggccgtgaactgacccggcatgccgttctgctgatgctgcatg-gtt 490
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 304  ggcatatcatcagggccgtgaactgacccggcatgccgttctgctgatgctgcatgtgtt 363

Query: 491  cattcgctccagtgaactgcgtttcgcccgctggtcagagattgatttcacaaaccgagt 550
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 364  cattcgctccagtgaactgcgtttcgcccgctggtcagagattgatttcacaaaccgagt 423

Query: 551  ctggacgatacccgcgacgcgagaacccattattggcgtgcgttattccggccgcggggc 610
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 424  ctggacgatacccgcgacgcgagaacccattattggcgtgcgttattccggccgcggggc 483

Query: 611  aaaaatgcgaatgccgcatatcgtccccctctcagaacagtccatcgccattctgaaaca 670
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 484  aaaaatgcgaatgccgcatatcgtccccctctcagaacagtccatcgccattctgaaaca 543

Query: 671  gattaaggatatcaccggtaataatgaactgatcttccccggcgaccataacccgtataa 730
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 544  gattaaggatatcaccggtaataatgaactgatcttccccggcgaccataacccgtataa 603

Query: 731  gccaatgtgtgaaaacacggtcaataaggcactgcgggtgatgggttacgacacgaaaaa 790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 604  gccaatgtgtgaaaacacggtcaataaggcactgcgggtgatgggttacgacacgaaaaa 663

Query: 791  ggatatctgcggtcacggcttccgggcaatggcatgcagtgcgctgatggaatcgggttt 850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 664  ggatatctgcggtcacggcttccgggcaatggcatgcagtgcgctgatggaatcgggttt 723

Query: 851  atgggcaaaggacgcagtagaacgccagatgagtcatcaggagcgcaataccgtgcgcat 910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 724  atgggcaaaggacgcagtagaacgccagatgagtcatcaggagcgcaataccgtgcgcat 783

Query: 911  ggcttatattcataaggcagagcacctggaagcccgcaaagcgatgatgcagtggtggtc 970
            ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 784  ggcttatattcataaggcagagcacctagaagcccgcaaagcgatgatgcagtggtggtc 843

Query: 971  ggattatctggaagcatgccgagaatcttatgcaccgccttatacaattggtaaaaataa 1030
            ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 844  ggattatctggaagcatgccgagaatcttatgcgccgccttatacaattggtaaaaataa 903

Query: 1031 gtttatcccatag 1043
            |||||||||||||
Sbjct: 904  gtttatcccatag 916

3) YPTB1602 in NC_006155


>AJ245585|1|G1|6179518|CAB59975.1|Escherichia_coli_5720/96|+|1..916|int|-|integrase 
          Length = 916

 Score = 1534 bits (3958), Expect = 0.0
 Identities = 787/793 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 471  gctggaggttgcgtcccgcacacggcagcacctgagtaacataatgcgccatgcggtcca 530
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 124  gctggaggttgcgtcccgcacacggcagcacctgagtaacataatgcgccatgcggtcca 183

Query: 531  tcaggagttaatcgatacgaaccctgcagcaaaccttggcggcgtgaccacacctcctgt 590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 184  tcaggagttaatcgatacgaaccctgcagcaaaccttggcggcgtgaccacacctcctgt 243

Query: 591  cagacggca-----ctgccctgccgctggagcggctgcctgaactgcttgaacgtattgg 645
            |||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 244  cagacggcactatcctgccctgccgctggagcggctgcctgaactgcttgaacgtattgg 303

Query: 646  ggcatatcatcagggccgtgaactgacccggcatgccgttctgctgatgctgcatgtgtt 705
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 304  ggcatatcatcagggccgtgaactgacccggcatgccgttctgctgatgctgcatgtgtt 363

Query: 706  cattcgctccagtgaactgcgtttcgcccgctggtcagagattgatttcacaaaccgagt 765
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 364  cattcgctccagtgaactgcgtttcgcccgctggtcagagattgatttcacaaaccgagt 423

Query: 766  ctggacgatacccgcgacgcgagaacccattattggcgtgcgttattccggccgcggggc 825
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 424  ctggacgatacccgcgacgcgagaacccattattggcgtgcgttattccggccgcggggc 483

Query: 826  aaaaatgcgaatgccgcatatcgtccccctctcagaacagtccatcgccattctgaaaca 885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 484  aaaaatgcgaatgccgcatatcgtccccctctcagaacagtccatcgccattctgaaaca 543

Query: 886  gattaaggatatcaccggtaataatgaactgatcttccccggcgaccataacccgtataa 945
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 544  gattaaggatatcaccggtaataatgaactgatcttccccggcgaccataacccgtataa 603

Query: 946  gccaatgtgtgaaaacacggtcaataaggcactgcgggtgatgggttacgacacgaaaaa 1005
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 604  gccaatgtgtgaaaacacggtcaataaggcactgcgggtgatgggttacgacacgaaaaa 663

Query: 1006 ggatatctgcggtcacggcttccgggcaatggcatgcagtgcgctgatggaatcgggttt 1065
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 664  ggatatctgcggtcacggcttccgggcaatggcatgcagtgcgctgatggaatcgggttt 723

Query: 1066 atgggcaaaggacgcagtagaacgccagatgagtcatcaggagcgcaataccgtgcgcat 1125
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 724  atgggcaaaggacgcagtagaacgccagatgagtcatcaggagcgcaataccgtgcgcat 783

Query: 1126 ggcttatattcataaggcagagcacctagaagcccgcaaagcgatgatgcagtggtggtc 1185
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 784  ggcttatattcataaggcagagcacctagaagcccgcaaagcgatgatgcagtggtggtc 843

Query: 1186 ggattatctggaagcatgccgagaatcttatgcaccgccttatacaattggtaaaaataa 1245
            ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 844  ggattatctggaagcatgccgagaatcttatgcgccgccttatacaattggtaaaaataa 903

Query: 1246 gtttatcccatag 1258
            |||||||||||||
Sbjct: 904  gtttatcccatag 916


 Score = 239 bits (616), Expect = 5e-63
 Identities = 122/123 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgtcccttaccgacgcaaaaatccgcaccctcaagccttctgataaaccctttaaagtc 60
           |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgttccttaccgacgcaaaaatccgcaccctcaagccttctgataaaccctttaaagtc 60

Query: 61  tccgattctcacggtctgtatctgctggtcaagccgggtggctcccgccactggtatctc 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  tccgattctcacggtctgtatctgctggtcaagccgggtggctcccgccactggtatctc 120

Query: 121 aaa 123
           |||
Sbjct: 121 aaa 123

4) YPTS_1719 in NC_010634


>AJ245585|1|G1|6179518|CAB59975.1|Escherichia_coli_5720/96|+|1..916|int|-|integrase 
          Length = 916

 Score = 1534 bits (3958), Expect = 0.0
 Identities = 787/793 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 471  gctggaggttgcgtcccgcacacggcagcacctgagtaacataatgcgccatgcggtcca 530
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 124  gctggaggttgcgtcccgcacacggcagcacctgagtaacataatgcgccatgcggtcca 183

Query: 531  tcaggagttaatcgatacgaaccctgcagcaaaccttggcggcgtgaccacacctcctgt 590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 184  tcaggagttaatcgatacgaaccctgcagcaaaccttggcggcgtgaccacacctcctgt 243

Query: 591  cagacggca-----ctgccctgccgctggagcggctgcctgaactgcttgaacgtattgg 645
            |||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 244  cagacggcactatcctgccctgccgctggagcggctgcctgaactgcttgaacgtattgg 303

Query: 646  ggcatatcatcagggccgtgaactgacccggcatgccgttctgctgatgctgcatgtgtt 705
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 304  ggcatatcatcagggccgtgaactgacccggcatgccgttctgctgatgctgcatgtgtt 363

Query: 706  cattcgctccagtgaactgcgtttcgcccgctggtcagagattgatttcacaaaccgagt 765
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 364  cattcgctccagtgaactgcgtttcgcccgctggtcagagattgatttcacaaaccgagt 423

Query: 766  ctggacgatacccgcgacgcgagaacccattattggcgtgcgttattccggccgcggggc 825
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 424  ctggacgatacccgcgacgcgagaacccattattggcgtgcgttattccggccgcggggc 483

Query: 826  aaaaatgcgaatgccgcatatcgtccccctctcagaacagtccatcgccattctgaaaca 885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 484  aaaaatgcgaatgccgcatatcgtccccctctcagaacagtccatcgccattctgaaaca 543

Query: 886  gattaaggatatcaccggtaataatgaactgatcttccccggcgaccataacccgtataa 945
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 544  gattaaggatatcaccggtaataatgaactgatcttccccggcgaccataacccgtataa 603

Query: 946  gccaatgtgtgaaaacacggtcaataaggcactgcgggtgatgggttacgacacgaaaaa 1005
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 604  gccaatgtgtgaaaacacggtcaataaggcactgcgggtgatgggttacgacacgaaaaa 663

Query: 1006 ggatatctgcggtcacggcttccgggcaatggcatgcagtgcgctgatggaatcgggttt 1065
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 664  ggatatctgcggtcacggcttccgggcaatggcatgcagtgcgctgatggaatcgggttt 723

Query: 1066 atgggcaaaggacgcagtagaacgccagatgagtcatcaggagcgcaataccgtgcgcat 1125
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 724  atgggcaaaggacgcagtagaacgccagatgagtcatcaggagcgcaataccgtgcgcat 783

Query: 1126 ggcttatattcataaggcagagcacctagaagcccgcaaagcgatgatgcagtggtggtc 1185
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 784  ggcttatattcataaggcagagcacctagaagcccgcaaagcgatgatgcagtggtggtc 843

Query: 1186 ggattatctggaagcatgccgagaatcttatgcaccgccttatacaattggtaaaaataa 1245
            ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 844  ggattatctggaagcatgccgagaatcttatgcgccgccttatacaattggtaaaaataa 903

Query: 1246 gtttatcccatag 1258
            |||||||||||||
Sbjct: 904  gtttatcccatag 916


 Score = 239 bits (616), Expect = 5e-63
 Identities = 122/123 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgtcccttaccgacgcaaaaatccgcaccctcaagccttctgataaaccctttaaagtc 60
           |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgttccttaccgacgcaaaaatccgcaccctcaagccttctgataaaccctttaaagtc 60

Query: 61  tccgattctcacggtctgtatctgctggtcaagccgggtggctcccgccactggtatctc 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  tccgattctcacggtctgtatctgctggtcaagccgggtggctcccgccactggtatctc 120

Query: 121 aaa 123
           |||
Sbjct: 121 aaa 123

5) int in NC_008800


>AJ245585|1|G1|6179518|CAB59975.1|Escherichia_coli_5720/96|+|1..916|int|-|integrase 
          Length = 916

 Score = 1513 bits (3903), Expect = 0.0
 Identities = 775/782 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 471  gctggaggttgcgtcccgcacgcggcagcacctgagtaacataatgcgccatgcggtcca 530
            ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 124  gctggaggttgcgtcccgcacacggcagcacctgagtaacataatgcgccatgcggtcca 183

Query: 531  tcaggagttaatcgatactaaccctgcagcaaaccttggcggcgtgaccacacctcctgt 590
            |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 184  tcaggagttaatcgatacgaaccctgcagcaaaccttggcggcgtgaccacacctcctgt 243

Query: 591  cagaccgcactatcctgccctgccgctggagcggctgcctgaactgcttgaacgtattgg 650
            ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 244  cagacggcactatcctgccctgccgctggagcggctgcctgaactgcttgaacgtattgg 303

Query: 651  ggcatatcatcagggccgtgaactgacccggcttgccgttctgctgatgctgcatgtgtt 710
            |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 304  ggcatatcatcagggccgtgaactgacccggcatgccgttctgctgatgctgcatgtgtt 363

Query: 711  cattcgctccagtgaactgcgtttcgcccgctggtcagagattgatttcacaaaccgagt 770
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 364  cattcgctccagtgaactgcgtttcgcccgctggtcagagattgatttcacaaaccgagt 423

Query: 771  ctggacgatacccgcgacgcgagaacccattattggcgtgcgttattccggccgcggggc 830
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 424  ctggacgatacccgcgacgcgagaacccattattggcgtgcgttattccggccgcggggc 483

Query: 831  aaaaatgcgaatgccgcatatcgtccccctctcagaacagtccatcgccattctgaaaca 890
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 484  aaaaatgcgaatgccgcatatcgtccccctctcagaacagtccatcgccattctgaaaca 543

Query: 891  gattaaggatatcaccggtaataatgaactgatcttccccggcgaccataacccgtataa 950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 544  gattaaggatatcaccggtaataatgaactgatcttccccggcgaccataacccgtataa 603

Query: 951  gccaatgtgtgaaaacacggtcaataaggcactgcgggcgatgggctacgacacgaaaaa 1010
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct: 604  gccaatgtgtgaaaacacggtcaataaggcactgcgggtgatgggttacgacacgaaaaa 663

Query: 1011 ggatatctgcggtcacggcttccgggcaatggcatgcagtgcgctgatggaatcgggttt 1070
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 664  ggatatctgcggtcacggcttccgggcaatggcatgcagtgcgctgatggaatcgggttt 723

Query: 1071 atgggcaaaggacgcagtagaacgccagatgagtcatcaggagcgcaataccgtgcgcat 1130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 724  atgggcaaaggacgcagtagaacgccagatgagtcatcaggagcgcaataccgtgcgcat 783

Query: 1131 ggcttatattcataaggcagagcacctagaagcccgcaaagcgatgatgcagtggtggtc 1190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 784  ggcttatattcataaggcagagcacctagaagcccgcaaagcgatgatgcagtggtggtc 843

Query: 1191 ggattatctggaagcatgccgagaatcttatgcaccgccttatacaattggtaaaaataa 1250
            ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 844  ggattatctggaagcatgccgagaatcttatgcgccgccttatacaattggtaaaaataa 903

Query: 1251 gt 1252
            ||
Sbjct: 904  gt 905


 Score = 236 bits (609), Expect = 3e-62
 Identities = 121/123 (98%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgtcccttaccgacgcaaaaatccgcaccctcaagccttctgataaaccctttaaagtc 60
           |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   atgttccttaccgacgcaaaaatccgcaccctcaagccttctgataaaccctttaaagtc 60

Query: 61  tccgattcccacggtctgtatctgctggtcaagccgggtggctcccgccactggtatctc 120
           |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  tccgattctcacggtctgtatctgctggtcaagccgggtggctcccgccactggtatctc 120

Query: 121 aaa 123
           |||
Sbjct: 121 aaa 123

6) ECOK1_2143 in NC_017628


>AJ245585|1|G1|6179518|CAB59975.1|Escherichia_coli_5720/96|+|1..916|int|-|integrase 
          Length = 916

 Score = 1389 bits (3585), Expect = 0.0
 Identities = 708/712 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 252 gctggaggttgcgtcccgcacacggcagcacctgagtaacataatacgccatgcggtcca 311
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 124 gctggaggttgcgtcccgcacacggcagcacctgagtaacataatgcgccatgcggtcca 183

Query: 312 tcaggagttaatcgatacgaaccctgcagcaaaccttggcggcgtgaccacacctcctgt 371
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 184 tcaggagttaatcgatacgaaccctgcagcaaaccttggcggcgtgaccacacctcctgt 243

Query: 372 cagacggcactatcctgccctgccgctggagcggctgcctgaactgcttgaacgtattgg 431
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 244 cagacggcactatcctgccctgccgctggagcggctgcctgaactgcttgaacgtattgg 303

Query: 432 ggcatatcatcagggccgtgaactgacccggcatgccgttctgctgatgctgcatgtgtt 491
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 304 ggcatatcatcagggccgtgaactgacccggcatgccgttctgctgatgctgcatgtgtt 363

Query: 492 cattcgctccagtgaactgcgtttcgcccgctggtcagagattgatttcacaaaccgagt 551
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 364 cattcgctccagtgaactgcgtttcgcccgctggtcagagattgatttcacaaaccgagt 423

Query: 552 ctggacgatacccgcgacgcgagaacccattattggcgtgcattattccggccgcggggc 611
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 424 ctggacgatacccgcgacgcgagaacccattattggcgtgcgttattccggccgcggggc 483

Query: 612 aaaaatgcgaatgccgcatatcgtccccctctcagaacagtccatcgccattctgaaaca 671
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 484 aaaaatgcgaatgccgcatatcgtccccctctcagaacagtccatcgccattctgaaaca 543

Query: 672 gattaaggatatcaccggtaataatgaactgatcttccccggcgaccataacccgtataa 731
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 544 gattaaggatatcaccggtaataatgaactgatcttccccggcgaccataacccgtataa 603

Query: 732 gccaatgtgtgaaaacacggtcaataaggcactgcgggtgatgggttacgacacgaaaaa 791
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 604 gccaatgtgtgaaaacacggtcaataaggcactgcgggtgatgggttacgacacgaaaaa 663

Query: 792 ggatatctgcggtcacggcttccgggcaatggcatgcagtgcgctgatggaatcgggttt 851
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 664 ggatatctgcggtcacggcttccgggcaatggcatgcagtgcgctgatggaatcgggttt 723

Query: 852 atgggcaaaggacgcagtagaacgccagatgagtcatcaggagcgcaataccgtgcgcat 911
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 724 atgggcaaaggacgcagtagaacgccagatgagtcatcaggagcgcaataccgtgcgcat 783

Query: 912 ggcttatattcataaggcagagcacctggaagcccgcaaagcgatgatgtag 963
           ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 784 ggcttatattcataaggcagagcacctagaagcccgcaaagcgatgatgcag 835

7) int in NC_011742


>AJ245585|1|G1|6179518|CAB59975.1|Escherichia_coli_5720/96|+|1..916|int|-|integrase 
          Length = 916

 Score = 1389 bits (3585), Expect = 0.0
 Identities = 708/712 (99%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 252 gctggaggttgcgtcccgcacacggcagcacctgagtaacataatacgccatgcggtcca 311
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 124 gctggaggttgcgtcccgcacacggcagcacctgagtaacataatgcgccatgcggtcca 183

Query: 312 tcaggagttaatcgatacgaaccctgcagcaaaccttggcggcgtgaccacacctcctgt 371
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 184 tcaggagttaatcgatacgaaccctgcagcaaaccttggcggcgtgaccacacctcctgt 243

Query: 372 cagacggcactatcctgccctgccgctggagcggctgcctgaactgcttgaacgtattgg 431
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 244 cagacggcactatcctgccctgccgctggagcggctgcctgaactgcttgaacgtattgg 303

Query: 432 ggcatatcatcagggccgtgaactgacccggcatgccgttctgctgatgctgcatgtgtt 491
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 304 ggcatatcatcagggccgtgaactgacccggcatgccgttctgctgatgctgcatgtgtt 363

Query: 492 cattcgctccagtgaactgcgtttcgcccgctggtcagagattgatttcacaaaccgagt 551
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 364 cattcgctccagtgaactgcgtttcgcccgctggtcagagattgatttcacaaaccgagt 423

Query: 552 ctggacgatacccgcgacgcgagaacccattattggcgtgcattattccggccgcggggc 611
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 424 ctggacgatacccgcgacgcgagaacccattattggcgtgcgttattccggccgcggggc 483

Query: 612 aaaaatgcgaatgccgcatatcgtccccctctcagaacagtccatcgccattctgaaaca 671
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 484 aaaaatgcgaatgccgcatatcgtccccctctcagaacagtccatcgccattctgaaaca 543

Query: 672 gattaaggatatcaccggtaataatgaactgatcttccccggcgaccataacccgtataa 731
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 544 gattaaggatatcaccggtaataatgaactgatcttccccggcgaccataacccgtataa 603

Query: 732 gccaatgtgtgaaaacacggtcaataaggcactgcgggtgatgggttacgacacgaaaaa 791
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 604 gccaatgtgtgaaaacacggtcaataaggcactgcgggtgatgggttacgacacgaaaaa 663

Query: 792 ggatatctgcggtcacggcttccgggcaatggcatgcagtgcgctgatggaatcgggttt 851
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Query: 852 atgggcaaaggacgcagtagaacgccagatgagtcatcaggagcgcaataccgtgcgcat 911
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Query: 912 ggcttatattcataaggcagagcacctggaagcccgcaaagcgatgatgtag 963
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Sbjct: 784 ggcttatattcataaggcagagcacctagaagcccgcaaagcgatgatgcag 835