>AJ245584|1|G1|6179516|CAB59974.1|Escherichia_coli_3172/97|+|1..1263|int|-|integrase
Length = 1263
Score = 1527 bits (3940), Expect = 0.0
Identities = 784/793 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 135 gctggaggttgcgtcccgcacacggcagcacctgagtaacataatgcgccatgcggtcca 194
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 471 gctggaggttgcgtcccgcacgcggcagcacctgagtaacataatgcgccatgcggtcca 530
Query: 195 tcaggagttaatcgatacgaaccctgcagcaaaccttggcggcgtgaccacacctcctgt 254
||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 531 tcaggggttaatcgatacgaacccggcagcaaaccttggcggcgtgaccacacctcctgt 590
Query: 255 cagacggcactatcctgccctgccgctggagcggctgcctgaactgcttgaacgtattgg 314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 591 cagacggcactatcctgccctgccgctggagcggctgcctgaactgcttgaacgtattgg 650
Query: 315 ggcatatcatcagggccgtgaactgacccggcatgccgttctgctgatgctgcatgtgtt 374
||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 651 ggcatatcatcagggccgtgaactgacgcggtttgccgtcctgctgatgctgcatgtgtt 710
Query: 375 cattcgctccagtgaactgcgtttcgcccgctggtcagagattgatttcacaaaccgagt 434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 711 cattcgctccagtgaactgcgtttcgcccgctggtcagagattgatttcacaaaccgagt 770
Query: 435 ctggacgatacccgcgacgcgagaacccattattggcgtgcgttattccggccgcggggc 494
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 771 ctggacgatacccgcgacgcgagaacccattattggagtgcgttattccggccgcggggc 830
Query: 495 aaaaatgcgaatgccgcatatcgtccccctctcagaacagtccatcgccattctgaaaca 554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 831 aaaaatgcgaatgccgcatatcgtccccctctcagaacagtccatcgccattctgaaaca 890
Query: 555 gattaaggatatcaccggtaataatgaactgatcttccccggcgaccataacccgtataa 614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 891 gattaaggatatcaccggtaataatgaactgatcttccccggcgaccataacccgtataa 950
Query: 615 gccaatgtgtgaaaacacggtcaataaggcactgcgggtgatgggttacgacacgaaaaa 674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 951 gccaatgtgtgaaaacacggtcaataaggcactgcgggtgatgggttacgacacgaaaaa 1010
Query: 675 ggatatctgcggtcacggcttccgggcaatggcatgcagtgcgctgatggaatcgggttt 734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1011 ggatatctgcggtcacggcttccgggcaatggcatgcagtgcgctgatggaatcgggttt 1070
Query: 735 atgggcaaaggacgcagtagaacgccagatgagtcatcaggagcgcaataccgtgcgcat 794
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1071 atgggcaaaggacgcagtagaacgccagatgagtcatcaggagcgcaataccgtgcgcat 1130
Query: 795 ggcttatattcataaggcagagcacctagaagcccgcaaagcgatgatgcagtggtggtc 854
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1131 ggcttatattcataaggcagagcacctagaagcccgcaaagcgatgatgcagtggtggtc 1190
Query: 855 ggattatctggaagcatgccgagaatcttatgcgccgccttatacaattggtaaaaataa 914
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1191 ggattatctggaagcatgccgagaatcttatgcaccgccttatacaattggtaaaaataa 1250
Query: 915 gtttatcccatag 927
|||||||||||||
Sbjct: 1251 gtttatcccatag 1263
Score = 222 bits (573), Expect = 5e-58
Identities = 116/122 (95%)
Strand = Plus / Plus
Query: 12 atgttccttaccgacgcaaaaatccgcaccctcaagccttctgataaaccctttaaagtc 71
|||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atgtcccttaccgacgcgaaaatccgcactctcaagccttctgataaaccctttaaagtc 60
Query: 72 tccgattctcacggtctgtatctgctggtcaagccgggtggctcccgccactggtatctc 131
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct: 61 tccgattcccacggtctgtatctgctggtcaagccgggtggctcacgtcactggtatctc 120
Query: 132 aa 133
||
Sbjct: 121 aa 122 |