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Homologs of tnpA gene of AF282853

DNA-level

Hit (GenBank Accn)

Product

Source Genome

Eval.

Ident.(%)

1) K750_03920
( - )

NC_021217
(Helicobacter pylori UM037)

e-221

97.1

2) K750_07485
( - )

NC_021217
(Helicobacter pylori UM037)

e-221

97.1

3) K750_06615
( - )

NC_021217
(Helicobacter pylori UM037)

e-221

97.1

4) K750_06300
( - )

NC_021217
(Helicobacter pylori UM037)

e-221

97.1

5) K750_07515
( - )

NC_021217
(Helicobacter pylori UM037)

e-221

97.1

6) unnamed
( - )

NC_011333
(Helicobacter pylori G27)

e-184

7) unnamed
( - )

NC_011333
(Helicobacter pylori G27)

e-184

8) unnamed
( - )

NC_011333
(Helicobacter pylori G27)

e-184

9) unnamed
( - )

NC_011333
(Helicobacter pylori G27)

e-184

10) unnamed
( - )

NC_011333
(Helicobacter pylori G27)

e-184

• Sequence Alignments

1) K750_07515 in NC_021217


>AF282853|1|G1|1752683|AAC44689.1|Helicobacter_pylori_CCUG_17874=NCTC_11638|-|83..511|tnpA|-|TnpA 
          Length = 429

 Score = 763 bits (1970), Expect = e-221
 Identities = 403/415 (97%)
 Strand = Plus / Plus

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           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
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           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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           ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 241 attagctccattattgctaaaatcaaacagatcaccacttatagagtttggcgcgataaa 300
           ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||
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           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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           ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 361 ttttttgtttgctctatcggtcaagctaatcctgaaacgatcaaggcgtatatag 415

2) K750_07485 in NC_021217


>AF282853|1|G1|1752683|AAC44689.1|Helicobacter_pylori_CCUG_17874=NCTC_11638|-|83..511|tnpA|-|TnpA 
          Length = 429

 Score = 763 bits (1970), Expect = e-221
 Identities = 403/415 (97%)
 Strand = Plus / Plus

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           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
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           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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           ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 361 ttttttgtttgctctatcggtcaagctaatcctgaaacgatcaaggcgtatatag 415

3) K750_06615 in NC_021217


>AF282853|1|G1|1752683|AAC44689.1|Helicobacter_pylori_CCUG_17874=NCTC_11638|-|83..511|tnpA|-|TnpA 
          Length = 429

 Score = 763 bits (1970), Expect = e-221
 Identities = 403/415 (97%)
 Strand = Plus / Plus

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           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
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           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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           ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 361 ttttttgtttgctctatcggtcaagctaatcctgaaacgatcaaggcgtatatag 415

4) K750_06300 in NC_021217


>AF282853|1|G1|1752683|AAC44689.1|Helicobacter_pylori_CCUG_17874=NCTC_11638|-|83..511|tnpA|-|TnpA 
          Length = 429

 Score = 763 bits (1970), Expect = e-221
 Identities = 403/415 (97%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaggaaaaaccattatccattaagggggtatatttcaaccaaccgaagtaagcataat 60
           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
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Query: 61  ctaaaagcccatttgattttagtgtgtaagtatagaaaaaagttgttgcaaggggatttg 120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Sbjct: 361 ttttttgtttgctctatcggtcaagctaatcctgaaacgatcaaggcgtatatag 415

5) K750_03920 in NC_021217


>AF282853|1|G1|1752683|AAC44689.1|Helicobacter_pylori_CCUG_17874=NCTC_11638|-|83..511|tnpA|-|TnpA 
          Length = 429

 Score = 763 bits (1970), Expect = e-221
 Identities = 403/415 (97%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaggaaaaaccattatccattaagggggtatatttcaaccaaccgaagtaagcataat 60
           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
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           ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 301 agatttatccccttattgcaaaaacacttttggaaagaaaaaactttttggactgatgga 360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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6) unnamed in NC_011333


>AF282853|1|G1|1752683|AAC44689.1|Helicobacter_pylori_CCUG_17874=NCTC_11638|-|83..511|tnpA|-|TnpA 
          Length = 429

 Score = 642 bits (1657), Expect = e-184
 Identities = 345/367 (94%)
 Strand = Plus / Plus

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           |||||||
Sbjct: 361 ttttttg 367

7) unnamed in NC_011333


>AF282853|1|G1|1752683|AAC44689.1|Helicobacter_pylori_CCUG_17874=NCTC_11638|-|83..511|tnpA|-|TnpA 
          Length = 429

 Score = 642 bits (1657), Expect = e-184
 Identities = 345/367 (94%)
 Strand = Plus / Plus

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           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||
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           |||||||
Sbjct: 361 ttttttg 367

8) unnamed in NC_011333


>AF282853|1|G1|1752683|AAC44689.1|Helicobacter_pylori_CCUG_17874=NCTC_11638|-|83..511|tnpA|-|TnpA 
          Length = 429

 Score = 642 bits (1657), Expect = e-184
 Identities = 345/367 (94%)
 Strand = Plus / Plus

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           ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||
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Query: 121 aataattttattaagtctgttatagatgagatagccacccaaagtaatttcattattatt 180
           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||
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           ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| 
Sbjct: 241 attagttccattatttctaaaatcaaacaaatcaccacttatagagtttggcacgataaa 300

Query: 301 agatttattcccttattgcaaaaacacttttggaaagaaaaaactttttggactgatggt 360
           |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
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Query: 361 ttttttg 367
           |||||||
Sbjct: 361 ttttttg 367

9) unnamed in NC_011333


>AF282853|1|G1|1752683|AAC44689.1|Helicobacter_pylori_CCUG_17874=NCTC_11638|-|83..511|tnpA|-|TnpA 
          Length = 429

 Score = 642 bits (1657), Expect = e-184
 Identities = 345/367 (94%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 1   atgaggaaaacccattatccattaagggggtatattccaaccaacagaagtaagcataat 60
           ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||
Sbjct: 1   atgagaaaaaaccattacccattaagggggtatatttcaaccaaccgaagcaagcataat 60

Query: 61  ctaaaagcccatttgattttagcgtgtaaatacagaaaaaagttgttgcaaggggatttg 120
           |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  ctaaaagcccatttgattttagtgtgtaagtatagaaaaaagttgttgcaaggggatttg 120

Query: 121 aataattttattaagtctgttatagatgagatagccacccaaagtaatttcattattatt 180
           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||
Sbjct: 121 aataactttattaagtctgttatagatgagatagccacccaaagtcatttcattatcatt 180

Query: 181 gcgatggaaagcgatatagatcatttgcacttaatggttcaatatattcctagaatgtcc 240
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| 
Sbjct: 181 gcgatggaaagcgatatagatcatttgcacttaatggttcaatatatccctagaatgtct 240

Query: 241 attagttccattatttctagaatcaaacaaatcactacttataaagtttggcgtgataag 300
           ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| 
Sbjct: 241 attagttccattatttctaaaatcaaacaaatcaccacttatagagtttggcacgataaa 300

Query: 301 agatttattcccttattgcaaaaacacttttggaaagaaaaaactttttggactgatggt 360
           |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct: 301 agatttatccccttattgcaaaaacacttttggaaagaaaaaactttttggactgatgga 360

Query: 361 ttttttg 367
           |||||||
Sbjct: 361 ttttttg 367

10) unnamed in NC_011333


>AF282853|1|G1|1752683|AAC44689.1|Helicobacter_pylori_CCUG_17874=NCTC_11638|-|83..511|tnpA|-|TnpA 
          Length = 429

 Score = 642 bits (1657), Expect = e-184
 Identities = 345/367 (94%)
 Strand = Plus / Plus

Query: 19  atgaggaaaacccattatccattaagggggtatattccaaccaacagaagtaagcataat 78
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Sbjct: 1   atgagaaaaaaccattacccattaagggggtatatttcaaccaaccgaagcaagcataat 60

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Query: 199 gcgatggaaagcgatatagatcatttgcacttaatggttcaatatattcctagaatgtcc 258
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Sbjct: 181 gcgatggaaagcgatatagatcatttgcacttaatggttcaatatatccctagaatgtct 240

Query: 259 attagttccattatttctagaatcaaacaaatcactacttataaagtttggcgtgataag 318
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Query: 319 agatttattcccttattgcaaaaacacttttggaaagaaaaaactttttggactgatggt 378
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Sbjct: 301 agatttatccccttattgcaaaaacacttttggaaagaaaaaactttttggactgatgga 360

Query: 379 ttttttg 385
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Sbjct: 361 ttttttg 367