PAI Gene Information


Name : SERP1642 (SERP1642)
Accession : YP_189207.1
PAI name : phi_SP_beta
PAI accession : NC_002976_P2
Strain : Staphylococcus epidermidis ATCC 12228
Virulence or Resistance: Not determined
Product : hypothetical protein
Function : -
Note : -
Homologs in the searched genomes :   1 hits    ( 1 protein-level )  
Publication :
    -Gill,S.R., "Direct Submission", Submitted (20-OCT-2004) The Institute for Genomic Research, 9712 Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA.

    -Gill,S.R., "Direct Submission", Submitted (08-APR-2002) National Center for Biotechnology Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA.

    -Gill,S.R., Fouts,D.E., Archer,G.L., Mongodin,E.F., Deboy,R.T., Ravel,J., Paulsen,I.T., Kolonay,J.F., Brinkac,L., Beanan,M., Dodson,R.J., Daugherty,S.C., Madupu,R., Angiuoli,S.V., Durkin,A.S., Haft,D.H., Vamathevan,J., Khouri,H., Utterback,T., Lee,C., Dimi, "Insights on evolution of virulence and resistance from the complete genome analysis of an early methicillin-resistant Staphylococcus aureus strain and a biofilm-producing methicillin-resistant Staphylococcus epidermidis strain", J. Bacteriol. 187 (7), 2426-2438 (2005) PUBMED 15774886.


DNA sequence :
ATGACTTTAAATAACCATTTTGCATATACATTTGAGGAGAGACCTACCCCAAAATTATGGCTTTGTAAACCAGATGGAAC
TAGAATTGAAAGAATTGCAGATTTTTCAAAACTTGGTGGAACATTCAAATTCACTAATGTGAACACTTTACATTTTGATT
TGCCATTGCAAGTATTTAGTGAAGATACTAAGCAAATTGAAAGAAATAAAGTAGTTGATTTAGTAAAAAATAAATACTTA
ATTGATTATAGATATAACGGATATAGAGATATCTTTGTAATTGATGATATTAAAAAATCTGCTAATGACTCTGATTTTAT
TACATTAAATTTAGACTCAAGAGCGTCTGAATTAAATAAGAAAGCTGCAAATGAAATTGAATTATTAGGTTCTACTATCC
CTCAAATGATGAACAAAATCTTATCAGTTTATGCTCCACTATGGAAACTTGGACATGTTGATGGAAAAATTATTGATGTT
AAACGTGAGTTAACTGGTTCTAATACAACTGTTAACGCTCTTATTGATAATATTTGTTCTCTTTTTGACGCAGTTGCTAT
TTATAACAACATTAATAGAACAATAAGCTTCTATCATAAAGACAATGTTGGTACTAATCGTGGTTTAAGAGTTAGGGAAA
ATAGTTATTTAAAATCATTTGAAGATCAATTTGTATCAAAGGATATCGTTACTAGATTATATCCATTTGGTCAAAGTGGT
TTAACAATTCAAAGTGTTAACCCAGCTGGCTCTTCTTATATTGAAGACTTCTCTTATTTCATGTCACCATTCAAACGTGA
TAATAACAGAAATGTATTACAACATAGTGATTATATGTCTGATGAATTATGTCACGCTTTGTTAGATTATCAAGAGTTTT
ATGCTAGTAAGAAGGATCAAGCTGGTGAATTATCTAAACAATATAGTGCAATTCTTAAAGAGCATTCACAAGAAGACTTC
AGATTAAATCAATTAAGTGCTACACTTCAACGACTAAATGAGCGTGTTGAATTAGTTAAACCTAAATCAGAATATATTGA
CTTAGGAACAAAGGTTAAGAATTTCAAAATCACTGTACCTAAATCATCATATTATTTAATCATGATTAGAAATGATGGTA
GTTTCACTAGAATTAAATTCAATAATAAACAGTATGATATTCCAAGTGGTGAGTGGTTGTATATCAAACTTAAAACTGGT
AAGTTTAATGACGCTACTAAGTTTGAGAAACAATTAGAATACCCTCTTGAAATATTAAGTGCAAACGCTAATTTAAGAGT
GGTATATACTCGTTCTTCTGAAGGAGATTATGAAGAAGAAGATACTAAGACAATCGAAGAAAAATACAACTTAGAAAAAT
ATAAAATTTTAGTAAAAGATCAAGAAAAAGTAGTCGCTTCAATCGAAAGACGATTAAAAGCTTTTGAAGACCAAAAAGCA
AGTGTAATACGTTCAATGAATGCAAAGAATTTCTTATCTGAAAAACTTTATAATGAACGTGAGTTATATGTTTTTGAGTC
TGTTTGGACGGAAGAAAATCATACAGACGCTCAAGAATTATATGATGACGCTGTAAAACAAATGAAGGAACAAAAGAAAA
TCAATAGAACGATTACAGTTGATTTAGTTAACTTCATTCAATCGCTTGACCATAAAGATGATTGGGATAAATTAAATGTT
GGAGATAAAGTTGTTTTCCAAAACAAAATCTTCAATACTAAAATCAAAGCCTATATCACTGAAATGCAATTAGATTTCCA
AACTAATCAAGTAAAAATTACTATTAGTGATATTTTTGATTACAAAGATTTAGACACAATCATCGCTGAAAAATTAGCCC
AAACTACCTCTACTTCTTCTCAAGTTGATTTCCATAAACAACAAATTAGAGAGCAAACCGGAAGAATTACAGATATGACT
CGTCTTATCGAAGGTGAGTGGGACGCAAATAAAAAGCGTGTGATGGCTGGTAATGAAACAGTTGATATTGGTTCACATGG
TGTTAAAGTCATTTCAAAAGAGAACCCTAACGAATTCGTAATCATGGTTGGTGGCGTAATTGCTATGACTCGTGATAACG
GTGAAACATTTAAAACTGGTATTACACCAGAAGGTATCAATGCTGAAATGCTTATCGGTAAGATGATCGTTGGTGAAACT
TTAACTTTTGAAAATGAGTCTGGTACAGTTAAATTCGACAAAGATGGACTTTATGTTAACTCTAAAAACTTCCATTTAGT
TTCAAATGATGGAGAAGAAGACTACTTCGATAAATTAAAACGTGAAATGTCTGAAAACGCTAAACAACAAACAGACAGAA
TGTTAGAAGAGTATAAAAAAGAAGTTTCACAAACTATTTCTGAAGCTACTGACGTTAGAAACATTGTTGATAATGCAGCA
GATATTCTTCAAGCAGCTTTTGCTGATGGAGTTATCACAGATGTTGAAAAACGTTTGATTTCTGAAACTCTTGCTCAACT
TGAAAAAGAAAATAGAGAATTCGAAGATAAAATTAACTTAGCTTTAAACCACCCTTACATCACTGAGGAAGATACTATTG
AGTTAAATAATTCTATCGTTGAATATAGCTCAATGTATGAAACACTTGTTATTTCTATTAATGAAAGTGTTAGTGACAAG
ATGATCACACCTCAAGAGTCTGAAGAAATTAATCAAAATATTATAAACTTCAGAGAAGAGATCAAAGACATCTTATCATT
AGTAGAAGAAATTATTGAACGAACTAAAAATGCTCAACTACAAGCTACTTTAGAAGAAGCAAAAGATTATACAACAAGAG
TTCGTGACGATATTAAAGATGAATTAAAAGACTTAAATAATTCATTTAAATCTTTAAATAGTACAGTTGAAGAGTCATTA
CAAGATAATATTTTTGACGCTGCTGAATTAGAAGCTATTAAAACAGTTGTATTAGTAACTAAATCAGAATATCAAGATAT
TACAAATAGATATTCTTCAATGTCTGCAAATACAGATTTAAAATCGGAAAGTAAATTAGATTTAACAAAATCTTATAAAA
CTTTAGATACTAGCTTTAATGACTTTGTTAAATATATTGACGAAATGACAATGGATAGAATTGCAGATGAGACTGAGAAA
GTTAATTACAAAAAGAAATATGATACTTTACAAAAGAACTTATCAGATTATATGAAAAAATATGATAACTGTATTTTGGA
AATATCTAAAAAGTATTCTAATGACGCAGCAGATAAAGTGTTAGGTGACTTCACAGCTATTGCTACTGAATTACAAAATG
ATTTCCAAGATGTTAAAGACAATTGGGCTGAATTCAAGCAAACTACTCTTGAGTCATTTAAAGATGGTATAGTAACTGAG
GCAGAAAAAGCTCGACTAAGAGTACAATTAGATATGCTTGATCGTGAAAGCATGGATATTGAAGAACGATATAAAAGCTT
ACTTGCTAACCAATATACTAATACTGATATTAAAAATCGCTTAACTGCTTCACGTTCTCCTTACTTATCAGTTCATGCTA
GTTTAAGAAAAGTAATTGAACAAATAATTGCTGACGGAAAAGTTGATGAAAGTGAAAAAACATTAGCTAATAATTCACTT
AATACATACAACACAACATTAACTGCTTATTCTAAAACAATTCAAGAAGCTCTAAATACATTATCACAAATCATCTCTTC
TGATGTAGCAAGTAAAAAAGTTGAAGAATTCAATGGTGTAATAACTACAATTTCTTCAGACGTTGATACAATCAAGAAAC
AAAGAGATGGTGCAGTAATCACTTATTATTATAGCGGTGTACCTACATTATCTAACGATCCAGCTAAAAGTTGGACGACT
AATGATTTAAAAGACTTACATATTAAAGATATGTATTTAGACACTAAATCTGGTTATGCATATACTTTCACTAAATCTGG
TACTAGTTATTCTTGGAAACCACTTACTGACCAAGTTATTGTTAGCTCATTGAAACAAGCAAAAAATGCACAAGACACAG
CGGACAATAAACGTAGAGTTTTTGTAACTCAACCTATTCCTCCTTATGATCAAGGAGATATGTGGACTCAAGGTTCACAA
GGAGATATTTATGTCTGTGGAACTTCGAGAGCTACTGGCTCATTCGTAAGTAGCGACTGGGTTAAAGCGAGCAAATACAC
TGACGATACAGTAGCTAAACAGGCAGCAAAAGATTTAGAAGATTATAAAGTCAAAATGACTAAAGACTTCAAAGATTTAA
ATGACGGTGTATCTACTTTTAAAACTGAAGTGGTTAAAGATTTCAAAGATGGAATTGTAACTGAAGCTGAGAAAACTAGA
TTACGTGTTCAATTAGATATCTTAGATAGAGAAAGTCAAGATATCGAAGAAAGATATAATAGTATCTTTAACAGTCAATA
TGCAGATACTCAAGTTAAAACTTCTATTTCTAACGCACGCTCTACTTATAATAACTCTCTTACTAAGTTAAGAAACACTA
TTCAAACCGTGATTGAAGATGGAAAAGTAACGCCTACTGAGAAAACTACTGCTAATCAAACTTTAACCGCATATAATAAT
GCTTTAACGAGTTATTCAGCTGCTATCCAAGAAGCATTAAATAGCATGTCAAAAGTAATTGCTCAAAAAGAAGCTACTAG
TCAAGTAAATCAATTCAATGAAGTTATCAAAAATATAAATACAAATATTACTGATATTCAAAAACAAGTTGATGGTGCAA
TTGAAACTTTCTATTACAGTGGAGTACCAACACTTACTAATATCCCCGCTTCGTATTGGACAACTGCTAGTAAACGTGAA
GCTCATTTAGGTGATTTATATTTAGACACTGCTACTGGTGTTGCTTATCGTTTCTTAAAAAAAGGAACAACTTCCCCTAC
TTACTATTGGTCTCCAATTTCTGATCAAATTATTACAGACGCATTGAATAGAGCAAAAACAGCTCAAGACACCGCCGATG
GAAAAAGAAGAGTTTTTGTAAATACACCTGTTCCACCATACGACACTGGTGACATGTGGACGCAAGGAGCTAGTGGTGAC
ATCTTAGTTTGTAAAACACCTAAAGCTAAAGGTGGTATTTACTCAATAAGCGACTGGGTAAAAGCTAGTAAGTATACAGA
TGATACAGTAGCAAACAGTGCTGTTCAACAATTAAATGAATACAAACGCACTAATAATCTTGATATCGCAGACCTAAAGA
GAAAAACTAGTGACTTCGAAAAAACAGTTGTAAATGCATTTGACGATAGAGTCATTAGTATTTCCGAGTCTTCATCTATT
AAAGGACAACTTGCTCTACTTAATCACGAAAAAGATAGATTAACTAGACAATACGAAAATATAATCAGAAATTCTAATCT
TGTTGGAGCAGAAAAAACTAAATTATCTACTGCATATTCAAATATAAATACTAAGCTTAGTGATTTAAGTACAACTATTA
ATAGTGCAATTGTTGATAATAAAATTGTTGACGCTGAAAGTAAATCTGTAACTTCAAAATTTGAATTGTATAAAGCTTCA
GTTAATGAATATCAAATCGCTTTTGATAATGCTCTAAACTCAATTATTAGAGAAATCGCTTCTTCCCAAGCTAAAGATAG
ATTAGATGAATGGAAACGTACAGAATTTAGTACAGACTCAGACGGTATTATTGAAAGAGTAGCTGGTGCTAAGTTTGACT
CAAAATGGACTGATACTTGGAGAAATACAGTTAACCCAGCTATTCAACAAGTGAGTAATATAACATATGGAAGTGAAAAC
CTATTACTTAATAGCGAAAGTCGAAGTGACGGTGCTAATACCACGACTCACTCTTTTATAAGATACTACCTGACACGCCC
TTTAGAAACAGGGAAAACTTATACTTTAAAAGCTAGTGTTTTAACAACTGATGAAAGACAAAGTGGACAAATTAGTGTTT
ATCCATACTCCCCTAACGGAGCAAGAGAGACAGTAAATATTAAAGACGGTAAAATTACTTATACATTTACTGCACAAACT
GAAAGTACACAATTTCTTATTTATAAAGACGTGGCTGGTCAATCTGATGTAGACTTAAATGTAACAATCGAGAAGGCTAT
TTTAGTCGAAGGAAATAAAGTTACAGGGTGGTCTCCAGCACCAGAGGAGACTTCTTCTGCTTTACGAGATTATAATACTC
GTATCTCCTCAGCAGAAACATTCATTGAGAAAAACAAAGAAAAGATTTCTCAAATTGCTACTAAATCTGATGTTGACGCT
TCACTTAGTAAAGTAGCTACTTATGAAACTCAATATAATGTTTCTAGCGGAACTAACTATCAAATTCCTCTTCAAGAATA
CAATGGTTCATTCTTTACCGACAACTACACTTATGAAGTTGTAGCTAAAAATAACTCTTTAAGTTCTAACAACGTAGCAA
CTGCTATATTCGTAAGTAAAGGTTCAAACAATGGTTATGAATTGGTTGAATTAGACAACATGTCTAAAACTGGTGCTAAC
CCTAGATTTGTTTTAGACAGTAAAGGTAGACCTTCTATCTCTACTTTCTCCCCTCAATCTACTACTCAAGATATTTCAGT
TATTTACACTAAATATTTAGGTAGTGCTTCAGCAATCAATACAACTAAATCATTGATTGAGCAAACTGCTAGTTCTATTG
AATTACAAGTTAAGAAACTTACTGCTGAGACTGAATACAACAACATATTATTAAATTCAGACTTCTCTTCTGGCTGGGAA
GGTTGGATAAATGTTGATCCTCAGTATAGTATTGTTGATAAAAATACTTTTGGTATCACTCTTCCTGACGCAATCACTAA
TAAAAATAAGAAATATAATACAGTTAAAATGACATACAATAAAAATACAAATTACCCTTCTGTATTTTCTAATTTTATTT
CTGTTGGAAAAGGTCAAGAGGTAGCTATTGGTGAACATTTAACACTAACTTGTTATGCCTATATCCCTTCTTCATCTAAA
GGTAAATTAACTGGTAACATATATATTGAATTCGCTGGTTACTATGAAAAAGACCAAAAATCAAACCCAATGATTGCTAG
ACATGAAATATTACCTAAAGATTTTGAATATAATAAATGGTTCAGAATGACAGCTAGTACTGCTATTCCTTCTACTAACT
CTGAGGGTAAAAAAATCAATTATATTAGAGCTTGTTTACGTTATGACGGTAAAAATCAAAGCGTAAATAATAGTGCTATA
TTCTATTATGCGTTACCTCAATTAGAGCGTGGATCAAAACCAACCGAGTGGTCGTTATCAAGACTTGACGTATTTAGCAC
TGAACAATTGGCAGCTAAGATTGCCTTAAACCCAGAGAGTGTGGATATTATCGCAAGAAATATTGATTTCAATACTGACT
CAATGAAGATTTATAATTCTAACGGTACATTAAACATTTCTGGAGATACTTTAACAATTAGTAACAACAATAGTTCTAAT
GAAGTAATTATAAATCCAAAAGGTTTTACACTTAAAAAAGATGGTGTAGTTAAGTTTAAAAATGGACTAGACACAAGCGA
TTATAGTGTCCAAGCTTATGAACCACAGTTTAGTTCATGGAATAATATTAAAGCTACTGATCCCGCTGCTAAGAGTAAGT
ATAATTACATTCGACATATTGAGCCGGGGATGAATGGTTATTACACTATAAATACTGGTGTTTACAATTTTGCAGTACAA
CACAAACAACTATTAGAGGTAAATAATACAAAAAATGCGAGAGTTAACAGGTATACATATCTTTACAACAAAAGGTATTT
AAAAATACAAATGTCTGCTTCTTCTCGAGGTAAAAGTAAGCTTTATATAATATTCAAGACAAAAACTGGAGATACTACAC
TCCATCAAGAAATAGTTAGTTCTAGTTCAATGGTATACCCAGATATAACAATTGACTTACAGGCTAAATTAGGTTATCCG
CCTAACAATTTGCCAGACTTTTTTGAATTACAAGCTGGTATTGCCTATGGAGAAAATAATTCTATTGATGGTTTCTTTAG
AATTAGACGTATGGCAATGACAGATACACCAAATGCGGAGGTTTAA

Protein sequence :
MTLNNHFAYTFEERPTPKLWLCKPDGTRIERIADFSKLGGTFKFTNVNTLHFDLPLQVFSEDTKQIERNKVVDLVKNKYL
IDYRYNGYRDIFVIDDIKKSANDSDFITLNLDSRASELNKKAANEIELLGSTIPQMMNKILSVYAPLWKLGHVDGKIIDV
KRELTGSNTTVNALIDNICSLFDAVAIYNNINRTISFYHKDNVGTNRGLRVRENSYLKSFEDQFVSKDIVTRLYPFGQSG
LTIQSVNPAGSSYIEDFSYFMSPFKRDNNRNVLQHSDYMSDELCHALLDYQEFYASKKDQAGELSKQYSAILKEHSQEDF
RLNQLSATLQRLNERVELVKPKSEYIDLGTKVKNFKITVPKSSYYLIMIRNDGSFTRIKFNNKQYDIPSGEWLYIKLKTG
KFNDATKFEKQLEYPLEILSANANLRVVYTRSSEGDYEEEDTKTIEEKYNLEKYKILVKDQEKVVASIERRLKAFEDQKA
SVIRSMNAKNFLSEKLYNERELYVFESVWTEENHTDAQELYDDAVKQMKEQKKINRTITVDLVNFIQSLDHKDDWDKLNV
GDKVVFQNKIFNTKIKAYITEMQLDFQTNQVKITISDIFDYKDLDTIIAEKLAQTTSTSSQVDFHKQQIREQTGRITDMT
RLIEGEWDANKKRVMAGNETVDIGSHGVKVISKENPNEFVIMVGGVIAMTRDNGETFKTGITPEGINAEMLIGKMIVGET
LTFENESGTVKFDKDGLYVNSKNFHLVSNDGEEDYFDKLKREMSENAKQQTDRMLEEYKKEVSQTISEATDVRNIVDNAA
DILQAAFADGVITDVEKRLISETLAQLEKENREFEDKINLALNHPYITEEDTIELNNSIVEYSSMYETLVISINESVSDK
MITPQESEEINQNIINFREEIKDILSLVEEIIERTKNAQLQATLEEAKDYTTRVRDDIKDELKDLNNSFKSLNSTVEESL
QDNIFDAAELEAIKTVVLVTKSEYQDITNRYSSMSANTDLKSESKLDLTKSYKTLDTSFNDFVKYIDEMTMDRIADETEK
VNYKKKYDTLQKNLSDYMKKYDNCILEISKKYSNDAADKVLGDFTAIATELQNDFQDVKDNWAEFKQTTLESFKDGIVTE
AEKARLRVQLDMLDRESMDIEERYKSLLANQYTNTDIKNRLTASRSPYLSVHASLRKVIEQIIADGKVDESEKTLANNSL
NTYNTTLTAYSKTIQEALNTLSQIISSDVASKKVEEFNGVITTISSDVDTIKKQRDGAVITYYYSGVPTLSNDPAKSWTT
NDLKDLHIKDMYLDTKSGYAYTFTKSGTSYSWKPLTDQVIVSSLKQAKNAQDTADNKRRVFVTQPIPPYDQGDMWTQGSQ
GDIYVCGTSRATGSFVSSDWVKASKYTDDTVAKQAAKDLEDYKVKMTKDFKDLNDGVSTFKTEVVKDFKDGIVTEAEKTR
LRVQLDILDRESQDIEERYNSIFNSQYADTQVKTSISNARSTYNNSLTKLRNTIQTVIEDGKVTPTEKTTANQTLTAYNN
ALTSYSAAIQEALNSMSKVIAQKEATSQVNQFNEVIKNINTNITDIQKQVDGAIETFYYSGVPTLTNIPASYWTTASKRE
AHLGDLYLDTATGVAYRFLKKGTTSPTYYWSPISDQIITDALNRAKTAQDTADGKRRVFVNTPVPPYDTGDMWTQGASGD
ILVCKTPKAKGGIYSISDWVKASKYTDDTVANSAVQQLNEYKRTNNLDIADLKRKTSDFEKTVVNAFDDRVISISESSSI
KGQLALLNHEKDRLTRQYENIIRNSNLVGAEKTKLSTAYSNINTKLSDLSTTINSAIVDNKIVDAESKSVTSKFELYKAS
VNEYQIAFDNALNSIIREIASSQAKDRLDEWKRTEFSTDSDGIIERVAGAKFDSKWTDTWRNTVNPAIQQVSNITYGSEN
LLLNSESRSDGANTTTHSFIRYYLTRPLETGKTYTLKASVLTTDERQSGQISVYPYSPNGARETVNIKDGKITYTFTAQT
ESTQFLIYKDVAGQSDVDLNVTIEKAILVEGNKVTGWSPAPEETSSALRDYNTRISSAETFIEKNKEKISQIATKSDVDA
SLSKVATYETQYNVSSGTNYQIPLQEYNGSFFTDNYTYEVVAKNNSLSSNNVATAIFVSKGSNNGYELVELDNMSKTGAN
PRFVLDSKGRPSISTFSPQSTTQDISVIYTKYLGSASAINTTKSLIEQTASSIELQVKKLTAETEYNNILLNSDFSSGWE
GWINVDPQYSIVDKNTFGITLPDAITNKNKKYNTVKMTYNKNTNYPSVFSNFISVGKGQEVAIGEHLTLTCYAYIPSSSK
GKLTGNIYIEFAGYYEKDQKSNPMIARHEILPKDFEYNKWFRMTASTAIPSTNSEGKKINYIRACLRYDGKNQSVNNSAI
FYYALPQLERGSKPTEWSLSRLDVFSTEQLAAKIALNPESVDIIARNIDFNTDSMKIYNSNGTLNISGDTLTISNNNSSN
EVIINPKGFTLKKDGVVKFKNGLDTSDYSVQAYEPQFSSWNNIKATDPAAKSKYNYIRHIEPGMNGYYTINTGVYNFAVQ
HKQLLEVNNTKNARVNRYTYLYNKRYLKIQMSASSRGKSKLYIIFKTKTGDTTLHQEIVSSSSMVYPDITIDLQAKLGYP
PNNLPDFFELQAGIAYGENNSIDGFFRIRRMAMTDTPNAEV