Name : fap1 (Spaf_1931)
Accession : YP_006310692.1
PAI name : FWisland_3
PAI accession : NC_017905_P4
Strain : Streptococcus parasanguinis ATCC 15912
Virulence or Resistance: Not determined
Product : fimbriae-associated protein Fap1 (fap1)
Function : -
Note : -
Homologs in the searched genomes : No hits
Publication :
-Geng,J., Chiu,C.-H., Tang,P., Chen,Y., Hu,S. and Chen,Y.-Y.M., "Direct Submission", Submitted (16-NOV-2011) Dept. of Microbiology and Immunology and Research Center for Pathogenic Bacteria, Chang Gung University, 259 Wen-Hwa 1st Road, Kwei-Shan, Tao-Yuan 333, Taiwan.
-Geng,J., Chiu,C.H., Tang,P., Chen,Y., Shieh,H.R., Hu,S. and Chen,Y.Y., "Complete Genome and Transcriptomes of Streptococcus parasanguinis FW213: Phylogenic Relations and Potential Virulence Mechanisms", PLoS ONE 7 (4), E34769 (2012) PUBMED 22529932 REMARK Publication Status: Online-Only.
-Geng,J., Chiu,C.H., Tang,P., Chen,Y., Shieh,H.R., Hu,S. and Chen,Y.Y., "Direct Submission", Submitted (09-MAY-2012) National Center for Biotechnology Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA.
| DNA sequence : | |
TTGGAATACGGTGCTAAAATGGGAAAGTATAAAAGAGCTGGGGAAACTTCACGTAAGACTAGAGTCAAAATGCATAAATC
TGGGAAAAACTGGGTACGTACTCTTATTTCTCAAATAGGATTAATGCATTTTTTAGGCGGGAGTATCTCCGAAAAGAAAA
TTAATGTTGATGTTTATGAACAAAAAAATATTTCTGCAAGTACTATCTTAAAAGGAGCGGTTGCACTGGGGGCCTTGACA
GGTGCAACCGTAGTTTCAGGAAATGTATTTGCAGATGAGACTGTGCTTGCAAAAGAAACAACCCTGACAACTACAGATGC
AAATGAAGTGAAATTGTCAAGTGAGAATTTCGATTCAGAAAAAGCGGAAGAAAAGATTAGCTTATCACAATCAGAATCTG
CTTCTGAGTCAGTCAGTGAATCCATTTCAGAATCTGTTTCTGAGTCCGTTTCGACTAGTGAGTCCGTTTCAGAGTCAGTA
AGCGAGTCGGTTTCAGAATCCATTTCAGAATCTGTTTCGGAGTCAATCAGTGAATCCATTTCAGAGTCGGTTAGCGAATC
AACTTCAACAAGTATTGTTTTATCTGAATCAGGTGCTGCTTCTGGAAATAAGGCTACATCAAAAGGTACTGAAGAAAAAC
AGGACAGTGTTCGTGAAAATCTAGATAAAATGATTTCAGAAGCTGAAGTGTTGAACGATATGGCTGCTCGTAAATTGATC
ACACTAGATGCTGAACAGCAATTGGAACTGATGAAATCATTGGTAGCTACACAATCACAATTGGAAGCTACTAAAAATCT
AATTGGCGATCCTAATGCTACTGTGGCAGATTTACAGATTGCTTATACAACTTTAGGAAATAATACACAAGCACTCGGAA
ATGAACTGATTAAATTAAATCCAAATGGTCAAATTTATGCAGTTTTAAATAATACCGAAGCTAGTCGAGCAGCGACCTTG
CGCTCAACCACTACTGGGACAAAAACAACCTTTACCATTAGTGATTTCTCAAATGGTGGAACTCAGTACTACTGGGCTGG
TGGAAACGCGAACAATCTTAAAAATCCTATTTCTAGTATCTCTGCTGTTTATGATTCTGCAACTGGAAAAATTTCGTGGA
CAGTAGAGTACGATCCGACGACAATATTAAAATCTCCTGCGCTTAAAACGTTAAAAACTTATACAGGGATTTATATTGAT
ACATCCTCAGATTCAAAATTAAGTACCCCAACAAATGTATTAATTGACGGGGCGGCAACAAATCCAGTTACAAATTTTTA
TGGTAATGGTTCTAAAGGGATAGAGTATGTCTCTAAGGGAACAACCAAAGGGGTAACTAAACATACAATTACTTTCGATA
CAGCTTTTAGTGGTAGGGCGAATGATTTAGCTGATTTGAAAATTAAAATGCTAGCTGCCACAACTCTTTCAGACCCCCAT
TTTTATGAAGATGGCTCCAAAGGAAATTATGGACGATATAACGGTCAAACTGCTCCCTATGTTATAGCAAATGATTCCGG
AACGGCAATTGGTGGCTACCAAGTGAGTGGTGTGAATGCAGATTCTATACCTTCAGATACAACCAGTCAGTCGGAATCAA
CGTCTAAATCAGAGTCTACCTCAAAATCAATCTCAGAATCAGTAATTGAATCAATCTCAGAATCAGTGATTGGATCTGTC
TCAGAATCCGTATCAGAGTCCGTATCAGAATCAGTAAGCGAGTCAATTACTGAATCGGTATCAGAGTCAGTGAGCGAGTC
AATTTCTGAGTCCGTATCAGAATCAGTAAGCGAATCTATCTCTGAATCGGTATCAGAGTCAGTAAGCGAATCTATCTCTG
AATCGGTATCAGAGTCAGTAAGCGAATCAATTTCTGAATCAGTATCAGAATCAGTAAGCGAGTCAATTTCTGAATCAATT
TCTGAATCCGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATCTCTGAATCGGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCTATCTCTGAATC
CGTATCAGAGTCAGTAAGTGAATCAATCTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTGAGCGAATCAATTTCTGAATCCGTATCAG
AATCAGTGAGCGAATCAATTTCTGAATCCGTATCAGAGTCAGTAAGTGAATCAATCTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTG
AGCGAATCAATTTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATTTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTAAGCGAGTC
AATTTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATTTCTGAGTCCGTATCAGAATCAGTAAGCGAGTCAATTTCTG
AATCAGTATCAGAGTCAGTAAGCGAATCAGTTTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATTTCTGAATCAGTA
TCAGAATCAGTAAGCGAGTCAGTTTCTGAATCGGTATCTGAATCAGTGTCAGAATCAGTAAGTGAATCAATCTCTGAATC
GGTATCAGAATCAGTGAGCGAATCAATTTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTGAGTGAATCAATTTCAGAGTCAGTATCAG
AATCAGTGAGCGAGTCAATTTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATCTCTGAATCGGTATCAGAATCAGTA
AGTGAATCAATCTCTGAATCGGTATCAGAATCAGTGAGCGAATCTATCTCTGAATCAGTATCAGAGTCAGTAAGTGAATC
AATTTCTGAATCAGTATCAGAGTCAGTAAGTGAATCAATTTCTGAATCAGTATCAGAGTCAGTAAGTGAATCAATTTCTG
AATCAGTATCAGAATCAGTAAGCGAGTCAGTTTCTGAATCGGTATCTGAATCAGTGTCAGAATCAGTATCTGAATCAGTA
TCAGAATCAATTTCTGAATCGGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATTTCTGAATCAGTATCAGAATCAGTAAGTGAATC
TATCTCTGAATCGGTATCAGAATCAGTGAGCGAATCAATCTCTGAGTCAGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCTATCTCTG
AATCAGTCTCAGAATCAGTAAGCGAGTCAGTAAGTGAATCCGTATCTGAGTCAGTATCAGAATCAGTATCAGAGTCAGTA
AGCGAATCAATCTCTGAGTCAGTATCAGAATCAGTATCTGAATCAGTATCAGAATCAATTTCTGAATCGGTATCAGAATC
AGTAAGTGAATCAATTTCTGAATCAGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATTTCTGAGTCGGTATCTGAGTCCGTATCAG
AATCAGTTTCTGAATCCGTATCAGAGTCAGTAAGCGAATCAATTTCTGAATCAGTATCAGAGTCAGTAAGTGAATCAATC
TCTGAGTCAGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATCTCTGAATCGGTGTCAGAATCTGTGAGTGAATCAATCTCTGAATC
GGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATCTCTGAGTCAGTATCAGAATCAGTGAGCGAGTCAATTTCTGAATCAGTCTCAG
AATCAGTAAGCGAGTCAGTAAGTGAATCCGTATCAGAGTCAGTAAGCGAATCTATCTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTG
AGCGAGTCAATTTCTGAATCCGTATCAGAGTCAGTAAGCGAATCCGTATCTGAATCAATCTCTGAATCCGTATCAGAATC
AGTAAGTGAATCTATCTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCTATCTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTGAGCG
AGTCAATTTCTGAATCAGTATCAGAATCAGTAAGCGAGTCAGTTTCTGAATCGGTATCTGAATCAGTGTCAGAATCAGTA
TCAGAGTCAGTAAGTGAATCCGTATCTGAGTCAGTAAGCGAATCAATCTCTGAGTCAGTATCAGAATCAGTATCAGAGTC
AGTAAGCGAATCTATCTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTGAGCGAGTCAATTTCTGAATCAGTATCAGAGTCAGTAAGTG
AATCAATTTCTGAATCAGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATTTCTGAGTCGGTATCAGAATCAGTGAGCGAATCAATT
TCTGAATCCGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCTATCTCTGAATCAGTCTCAGAATCAGTAAGCGAGTCAGTAAGTGAATC
CGTATCAGAGTCAGTAAGCGAATCTATCTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTGAGCGAGTCAATTTCTGAATCCGTATCAG
AGTCAGTAAGTGAATCAATTTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATTTCTGAGTCAGTATCAGAGTCAGTA
AGCGAATCCGTATCTGAATCAATCTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATCTCTGAATCCGTATCAGAATC
AGTAAGTGAATCAATCTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTAAGCGAGTCAGTAAGTGAATCAGTATCTGAGTCGGTATCAG
AATCAGTTTCTGAATCCGTATCAGAGTCAGTAAGCGAATCAATTTCTGAATCCGTATCAGAGTCAGTAAGTGAATCAATC
TCTGAGTCAGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATCTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATCTCTGAATC
GGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCTATCTCTGAATCGGTATCAGAATCAGTGAGCGAATCAATCTCTGAGTCAGTATCAG
AATCAGTAAGTGAATCTATCTCTGAATCAGTCTCAGAATCAGTAAGCGAGTCAGTAAGTGAATCCGTATCAGAGTCAGTA
AGCGAATCAATCTCTGAGTCCGTATCAGAATCAGTGAGCGAGTCAATTTCTGAATCAGTCTCAGAATCAGTAAGCGAGTC
AGTTTCTGAATCGGTATCTGAATCAGTGTCAGAATCAGTATCTGAATCAGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATTTCTG
AGTCGGTATCTGAGTCCGTATCAGAATCAGTTTCTGAATCCGTATCAGAGTCAGTAAGCGAATCAATTTCTGAATCAGTA
TCAGAGTCAGTAAGTGAATCAATCTCTGAGTCAGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATCTCTGAATCGGTGTCAGAATC
TGTGAGCGAATCAATTTCTGAATCGGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATCTCTGAATCGGTATCAGAATCAGTAAGTG
AATCAATCTCTGAGTCAGTATCAGAATCAGTGAGCGAGTCAATTTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTAAGCGAGTCAGTT
TCTGAATCGGTATCTGAATCAGTGTCAGAATCAGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATCTCTGAATCGGTATCAGAATC
AGTAAGTGAATCAATCTCTGAGTCAGTATCAGAATCAGTGAGCGAGTCAATTTCTGAATCAGTCTCAGAATCAGTAAGCG
AGTCAGTAAGTGAATCCGTATCAGAGTCAGTAAGCGAATCTATTTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTGAGCGAGTCAATT
TCTGAATCCGTATCAGAGTCAGTAAGTGAATCAATTTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATTTCTGAGTC
AGTATCAGAGTCAGTAAGCGAATCCGTATCTGAATCAATCTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATCTCTG
AATCCGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCTATCTCTGAATCAGTATCAGAATCAGTGAGCGAGTCAATTTCTGAATCAGTA
TCAGAATCAGTAAGCGAGTCAATTTCTGAGTCAGTATCAGAGTCAGTAAGTGAATCAATTTCTGAGTCGGTATCTGAGTC
AGTATCAGAGTCAGTAAGTGAATCCGTATCTGAGTCAGTAAGCGAATCAATCTCTGAGTCAGTAAGCGAATCTATCTCTG
AATCCGTATCAGAATCAGTGAGCGAGTCAATTTCTGAGTCAGTATCAGAATCAGTGAGCGAGTCAATTTCTGAATCAGTA
TCAGAATCAGTAAGTGAATCAATCTCTGAATCAGTATCAGAATCAGTGAGCGAGTCAATTTCTGAATCAGTATCAGAGTC
AGTAAGTGAATCAATTTCTGAGTCAGTATCAGAGTCAGTAAGTGAATCAATTTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTAAGTG
AATCAATTTCTGAGTCAGTATCAGAGTCAGTAAGCGAATCCGTATCTGAATCAATCTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTA
AGTGAATCAATCTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATCTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTAAGCGAGTC
AGTAAGTGAATCAGTATCTGAGTCGGTATCAGAATCAGTTTCTGAATCCGTATCAGAGTCAGTAAGCGAATCAATTTCTG
AATCCGTATCAGAGTCAGTAAGTGAATCAATCTCTGAGTCAGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATCTCTGAATCCGTA
TCAGAATCAGTAAGTGAATCAATCTCTGAATCGGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATCTCTGAATCGGTATCAGAATC
AGTGAGCGAATCAATCTCTGAGTCAGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCTATCTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTAAGCG
AGTCAGTAAGTGAATCCGTATCAGAGTCAGTAAGCGAATCAATCTCTGAGTCAGTATCAGAATCAGTATCAGAGTCAGTA
AGCGAATCAATCTCTGAGTCAGTATCAGAATCAGTGAGCGAGTCAATTTCTGAATCAGTCTCAGAATCAGTAAGCGAGTC
AGTTTCTGAATCGGTATCTGAATCAGTGTCAGAATCAGTATCTGAATCAGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATTTCTG
AGTCGGTATCTGAGTCCGTATCAGAATCAGTTTCTGAATCCGTATCAGAGTCAGTAAGCGAATCAATTTCTGAATCAGTA
TCAGAGTCAGTAAGTGAATCAATCTCTGAGTCAGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATCTCTGAATCGGTGTCAGAATC
TGTGAGCGAATCAATTTCTGAATCGGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATCTCTGAATCGGTATCAGAATCAGTGAGCG
AGTCAATTTCTGAATCCGTATCAGAGTCAGTAAGTGAATCAATTTCTGAATCAGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCAATT
TCTGAGTCAGTATCAGAGTCAGTAAGCGAATCCGTATCTGAATCAATCTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTAAGTGAATC
AATCTCTGAATCCGTATCAGAATCAGTAAGTGAATCTATCTCTGAATCAGTATCAGAATCAGTGAGCGAGTCAATTTCTG
AATCAGTATCAGAATCAGTAAGCGAGTCAGTTTCTGAATCGGTATCTGAATCAGTGTCAGAATCAGTATCAGAATCAGTA
AGTGAATCAATTTCTGAGTCAGTATCAGAGTCAGTAAGTGAATCAATTTCTGAGTCGGTATCTGAGTCAGTATCAGAGTC
AGTAAGTGAATCCGTATCTGAGTCAGTAAGCGAATCAATCTCTGAGTCAGTAAGCGAATCTATCTCTGAATCCGTATCAG
AATCAGTGAGCGAGTCAATTTCTGAGTCAGTATCAGAATCAGTGAGCGAGTCAATTTCTGAAAGAACACTTCCGAATACT
GGTGAAAATGTTTCTTCATCACTTGGATTAGTTGGATTAAGTGGTCTTCTATTTGGAGCGCTTCTGGGGCGTAAAAAACG
TAAATCAGAGGATGCTGAATAA
|
| Protein sequence : | |
MEYGAKMGKYKRAGETSRKTRVKMHKSGKNWVRTLISQIGLMHFLGGSISEKKINVDVYEQKNISASTILKGAVALGALT
GATVVSGNVFADETVLAKETTLTTTDANEVKLSSENFDSEKAEEKISLSQSESASESVSESISESVSESVSTSESVSESV
SESVSESISESVSESISESISESVSESTSTSIVLSESGAASGNKATSKGTEEKQDSVRENLDKMISEAEVLNDMAARKLI
TLDAEQQLELMKSLVATQSQLEATKNLIGDPNATVADLQIAYTTLGNNTQALGNELIKLNPNGQIYAVLNNTEASRAATL
RSTTTGTKTTFTISDFSNGGTQYYWAGGNANNLKNPISSISAVYDSATGKISWTVEYDPTTILKSPALKTLKTYTGIYID
TSSDSKLSTPTNVLIDGAATNPVTNFYGNGSKGIEYVSKGTTKGVTKHTITFDTAFSGRANDLADLKIKMLAATTLSDPH
FYEDGSKGNYGRYNGQTAPYVIANDSGTAIGGYQVSGVNADSIPSDTTSQSESTSKSESTSKSISESVIESISESVIGSV
SESVSESVSESVSESITESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESI
SESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESV
SESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESVSESVSESVSESISESV
SESVSESVSESVSESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESV
SESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESVSESVSESVSESVSESV
SESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESVSESVSESVSESVSESV
SESISESVSESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESVSESVSESVSESISESVSESVSESI
SESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESVSESVSESVSESISESVSESV
SESISESVSESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESVSESVSESVSESV
SESVSESVSESVSESISESVSESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESI
SESVSESVSESISESVSESVSESVSESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESV
SESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESVSESVSESVSESVSESVSESVSESISESVSESVSESI
SESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESVSESVSESV
SESISESVSESVSESISESVSESVSESVSESVSESVSESVSESVSESVSESISESVSESVSESVSESVSESVSESISESV
SESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESV
SESVSESVSESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESVSESVSESVSESISESVSESVSESI
SESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESV
SESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESVSESVSESVSESISESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESV
SESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESVSESISESVSESV
SESISESVSESVSESISESVSESVSESVSESVSESVSESVSESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESV
SESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESVSESVSESVSESISESVSESVSESV
SESISESVSESVSESISESVSESVSESVSESVSESVSESVSESVSESVSESISESVSESVSESVSESVSESVSESISESV
SESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESI
SESVSESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESVSESVSESVSESVSESV
SESISESVSESVSESISESVSESVSESVSESVSESVSESISESVSESISESVSESVSESISESVSESVSESISERTLPNT
GENVSSSLGLVGLSGLLFGALLGRKKRKSEDAE
|
|
