| Name : VC0395_A0370 (VC0395_A0370) Accession : YP_001216326.1
 PAI name :  VPI-1
 PAI accession : NC_009457_P1
 Strain : Vibrio cholerae IEC224
 Virulence or Resistance: Not determined
 Product : lipoprotein
 Function : -
 Note : -
 Homologs in the searched genomes :    63 hits    ( 63 protein-level )
 Publication :
 
-Feng,L., Reeves,P.R., Lan,R., Ren,Y., Gao,C., Zhou,Z., Ren,Y., Cheng,J., Wang,W., Wang,J., Qian,W., Li,D. and Wang,L., "A recalibrated molecular clock and independent origins for the cholera pandemic clones", PLoS ONE 3 (12), E4053 (2008) PUBMED 19115014.
 -Feng,L., Reeves,P.R., Lan,R., Ren,Y., Gao,C., Zhou,Z., Ren,Y., Cheng,J., Wang,W., Wang,J., Qian,W., Li,D. and Wang,L., "Direct Submission", Submitted (18-MAY-2007) National Center for Biotechnology Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA.
 
 -Heidelberg,J., "Direct Submission", Submitted (16-MAR-2007) The Institute for Genomic Research, 9712 Medical Center Drive, Rockville, MD 20850, USA.
 
 
 
 
      | DNA sequence : |  |  | ATGCCTCTCATATTTCAAATATCACAAAAAGATAATGTCTTTTGTACGATCAACGGGCGTTCAATCGCAACATTTACCGC
TCCCTTTGACGCTAATAAAAATGGCCGTAACACTGATTCTGAAGTTTTATCTTTAATCTCTGCGGATGAGTACCGGGACT
CGCCAGTTCGACAGGAAAATCTCCAAATTTTAATGAAAAATATGGCGACAATACATGGAGATAAAATATCTCTAGTTTTC
CGAAGTACTCTTGATGCCTTGACATTCGAAAATTATTTACGGCACAATTTAGATCTTCCCAAAGACCAATTTTTAGAAGC
AATTACAGAAAAAATCGCCAATGATAATCAGGTCGATAAGCAACCTTCAACTCATGTGCCTAATATCTCTCCATCATTCA
CGCCTGGGACTTCATCTAATTTGAATAGTCCATTCGTTTCTGCTAATGCTGAAGAGTCTTTGAGCTATATACCGACAGAT
GTTATTCCTTCGCTTGGTCGCTTACTTGATAGTCAAGGTCGAGTTATTAATGGTGTTTCATACTTCAGTAATAATACTCG
TGGTATTACTGGTGTAGATAAAACAGGGGCTATTTTAAATGATGGTTCATTTGAATTTTCGTGGGGAGATATTATTAGCT
TTTCAATCGATACATTTGAATTAGGTAGTACTCGAGCTAATAAAACTGATTTTTATATCAGTGAATTAGGTAAGGACAAT
GAGGGTAAGAATGCTGAAGCTTTGATTCATCGTTATGCAAGTATTGATGATTCTAAGCTTATCATTCCAGATAAAGTTAC
GCAGATTTTTTCCCTATACCCTAATGTCATTAATGAAGTGATTTCATTATCATTACCTAATGGCGATATCGAACTTGATA
TTGGAGATGGTAAAACTCAGATTGTACCTGGTGAATTCTTTAAGCAGTTTGATTCTGGATTAGCAGCACTTATCGATCAA
TCTATTTCACCTATATCGAGGTTCAAATTTGAAGACAGTTTGCCTAAGAAAAAGTCAGCAATTGATTCTGAATCTTCACA
AATCCAAGATATTATTAATAAACTCTGGGGTGCAACCGATACCGTACAAGCTAATGGATGGAAAAAAGTCGATCGTTTTC
ATATTTTTCATGACAGTACAAACTTCTACGGTAGTACAGGAAGTGCCCGAGCACAAGCAGCGGTGAATATTGCTAATAGT
GCATTTCCAGTCTTAATGGCTCGTAATGACAATAATTACTGGATTGATTTTGGTAAACCTAAAGCATGGGATTCGAATAG
TCTGGCATTTATTACTGAAGCACCTTCTACAGTTGTGCCTGATAAAGTATCTGAAGATACATCAACCTTTAATTTACCTT
TTATTAGTTTGGGCGAAATTGGTAAAGGCAAGCTGATGGTACTAGGAAATGCGCGATATAACAGTGTCTTAGTCTGTCCT
AATGGATTTAGTTGGGGCGGAACTGTTAAAAATGGTACTTGTAGCTTAAGTAGTGATCGTGATGATATGGCTAATTTTTT
TAGTAATGTCATCCGCTATCTTACGGGAAGTACTTCCAATGATGTTATTGTTGGAACTAATATTCCAGAAGTTTACTTTA
AATCATCTGGCCAAACTATGGGGTCAAAAGCCAATTTTGAACTCGATTCAAGATTCTCTAAGCAAACTCAACAGTTGACT
AGTTTCCATGATTTAGATGTTAATACTATACCTCTTATTATTATCAATGCATACGACTATAAAGGAAAAAACATAAATAG
TCCGTATGATATTCCATTAAGTGCTGATGTAGGCAGTCCGAAATTGTCTCGTTCTGATGTCACTGATTTAATTGATTATA
TAAACAACGGTGGTAGTGTATTAATGATGGAGACTATCATTAATACAAATAACAGTGAGATTTCTCGTTTATTGGACAGT
GCTGGTATTGCTTTTGGCATTGGAAACAGTGTAGTTGCTGACGGTAATGGCCCGAGTGGAGGCCACCCAGATCGCCCACG
TAGTCAGCGAGAGCACGGTATTTGGGTTATTGAGCGATATGCAGCTGTTGAAGACGAGTCTTCTGGTCAACAGACGCTAC
CTTATGTGATTAATAGTGATGGTTCAATTGAGTGGAAGTATATTGTAGAGAATAGGCCCGATGATAAACCTAAACTTGAA
GTCGCGAGTTGGGTTGAATCTGAAGCTGGAGATAAATTAATTACTCACTATGCATTTATTGATGAGTCTCAGCACTGGAA
AAAAGATATTTCAGGTAAAATAATCTATAACGTGGCAGGGAAGCCGGAAGTAGATAATGCATCATTATCTTTGGCTAAAA
ATAAAGTACTTGATGCTTTTAAAAACAGTAGTGGCCAGAGAGCCTACTCTGAATGTAAAAATTCTGAGTTTCATTATGAG
ATTAATTGCTTAGAATATCGTCCAGGTAATTCAATTCCTATTACTGGTGGTTTGTATGTACCCCGATATACTGATATTAA
GTTAGGAGAGTCTGAAGCCAATGCTATGGTAAAGGCGGCTAATCTTGGTACAAATATTCATGCTTTATATCAGCATGAAC
GTTATTTCCGAACTAAAGGAAAGTCGGGAGCCCGTTTAAATAGTGTTGATTTGAATCGAATTTATCAAAATATGTCAGTA
TGGCTTTGGAACGACCTTGATTATCGTTATGATGATAAGCAATCCGATGAGCTTGGATTTAAAGTTTTTACACAGTATTT
GAATTGTTACACTAGTAACAACGCTGGTGGTAATACAACTTGCCCAGAAGAATTGAAAGATGAACTTACTCAGCTAGGTA
TGATTTATGACGAAAAATCAGGAAGCTATGCAGGTCAAATGGATCCAAGTTACCCACTTAATTATATGGAAAAGCCACTG
ACCCGTTTAATGTTAGGGCGCTCATTCTGGGATCTTGATATCAAAGTTGATGTCAGAAAGTACCCCGGTGAAGTCACAAC
AAGATCAGGTGGAGGGGATATTACTCTTGACATGCGTAATAATACGGCAGCTTGGTTTGCGGGTAATAGGCAGCCGACAG
GGCAGTGGGCCGAAGCTCATCAGCCTTTTAGTGTTTCAGTCTCAGGAGAAACATCGCCTGTCACCATCACCATTGCATTG
GCTGATGATTTAACTGGCCGAGAGAAGCATGAGCTTGGTTTAAAGCGTCCTCCTCGCATGAGCAAATCATTTGTTATTGG
CGGCGATAGTCCGAAAATGCAGACTTTTACCGTACCCTATGGTGGGTTAATATATGCACAAGGGGGAAATTCTCAACAGG
TCAAACTAACATTTTCAGGAACTATAGATGCACCGCTCTATATTGACGGTAAGTGGAGAAACCCTCTTTTATCTGGCGCA
CCAATTGGTGAAGTAGTGTCAGACACCTTCATATTTACTGCACCTAAAGCAAATTTAAATGCCGATGGTTATTTGGGGGG
GATCGAACAGTTTGCAAAAGATCTTGATCAATTCTCAGCGGATTTAAACGATTTTTATGCCCGTGATGAAGGTGCGGACG
GTGACAAAAATCGCAAAGCTACTGATAAGTCAATGCCTAATAATCGTCACCATTTCGTCAATGATGTCGCAATAAGTGTT
GGTGCTGCACACTCTGGCTATCCGGTCATGAATGATAGTTTTATTACCAGTAGCCGTAGTTTGAACACTATGCCGCTGAA
CAGCTGGCTGCTTTGGCATGAGGTCGGGCATAATTCAGCAGAAGCTCCTTTTAATGTTGATGGGGCCACAGAAGTTGTAA
ACAACTTACTTGCCTTATATATGCAAGATCGTCATCAAGGAAAAATGTCTCGTGTAGAACAGGATATCCGTTATGCTTTC
GATTTTGTTAATGCTGAGCATGGGCATGCTTGGGGAGCCGGTGGTGCTGGTGAACGTTTAGTTATGTTTGCGCAACTTAA
AGAGTGGGCAGAAACTGAGTTTGATATAAATGACTGGTATAATGATAAGCTACCTGGTTTTTATATTGAAGAAAGCGGAA
TAAAAGGTTGGAACTTGTTTAAACTGATGCATCGGTTAATGAGAAATGAGAACGATGACCAAATCAATATGAAGGGAGAA
AATCAATGTAAGATATCTGGTATTGGTAAAAGTGATCTATTAATGCTTTGTGCATCATATGCCGCTCAGACGGATTTGTC
AGAATTTTTTAAAGCATGGAATCCGGGAAGTAAGGCATTTCTCTATCCAGATGATCCTCAGCCATATTACGAAGGAGGAA
TAACTCCTTCTGGGATTCAGAGAGTCAAATCTTTAAAATTGAATCTTCCCCAAAAAAATCCCCTTTCTATAAACAGTGTT
ACACAACATTAG
 
 |  | Protein sequence : |  |  | MPLIFQISQKDNVFCTINGRSIATFTAPFDANKNGRNTDSEVLSLISADEYRDSPVRQENLQILMKNMATIHGDKISLVF
RSTLDALTFENYLRHNLDLPKDQFLEAITEKIANDNQVDKQPSTHVPNISPSFTPGTSSNLNSPFVSANAEESLSYIPTD
VIPSLGRLLDSQGRVINGVSYFSNNTRGITGVDKTGAILNDGSFEFSWGDIISFSIDTFELGSTRANKTDFYISELGKDN
EGKNAEALIHRYASIDDSKLIIPDKVTQIFSLYPNVINEVISLSLPNGDIELDIGDGKTQIVPGEFFKQFDSGLAALIDQ
SISPISRFKFEDSLPKKKSAIDSESSQIQDIINKLWGATDTVQANGWKKVDRFHIFHDSTNFYGSTGSARAQAAVNIANS
AFPVLMARNDNNYWIDFGKPKAWDSNSLAFITEAPSTVVPDKVSEDTSTFNLPFISLGEIGKGKLMVLGNARYNSVLVCP
NGFSWGGTVKNGTCSLSSDRDDMANFFSNVIRYLTGSTSNDVIVGTNIPEVYFKSSGQTMGSKANFELDSRFSKQTQQLT
SFHDLDVNTIPLIIINAYDYKGKNINSPYDIPLSADVGSPKLSRSDVTDLIDYINNGGSVLMMETIINTNNSEISRLLDS
AGIAFGIGNSVVADGNGPSGGHPDRPRSQREHGIWVIERYAAVEDESSGQQTLPYVINSDGSIEWKYIVENRPDDKPKLE
VASWVESEAGDKLITHYAFIDESQHWKKDISGKIIYNVAGKPEVDNASLSLAKNKVLDAFKNSSGQRAYSECKNSEFHYE
INCLEYRPGNSIPITGGLYVPRYTDIKLGESEANAMVKAANLGTNIHALYQHERYFRTKGKSGARLNSVDLNRIYQNMSV
WLWNDLDYRYDDKQSDELGFKVFTQYLNCYTSNNAGGNTTCPEELKDELTQLGMIYDEKSGSYAGQMDPSYPLNYMEKPL
TRLMLGRSFWDLDIKVDVRKYPGEVTTRSGGGDITLDMRNNTAAWFAGNRQPTGQWAEAHQPFSVSVSGETSPVTITIAL
ADDLTGREKHELGLKRPPRMSKSFVIGGDSPKMQTFTVPYGGLIYAQGGNSQQVKLTFSGTIDAPLYIDGKWRNPLLSGA
PIGEVVSDTFIFTAPKANLNADGYLGGIEQFAKDLDQFSADLNDFYARDEGADGDKNRKATDKSMPNNRHHFVNDVAISV
GAAHSGYPVMNDSFITSSRSLNTMPLNSWLLWHEVGHNSAEAPFNVDGATEVVNNLLALYMQDRHQGKMSRVEQDIRYAF
DFVNAEHGHAWGAGGAGERLVMFAQLKEWAETEFDINDWYNDKLPGFYIEESGIKGWNLFKLMHRLMRNENDDQINMKGE
NQCKISGIGKSDLLMLCASYAAQTDLSEFFKAWNPGSKAFLYPDDPQPYYEGGITPSGIQRVKSLKLNLPQKNPLSINSV
TQH
 
 |  |