Name : pdpD1 (FTW_0037)
Accession : YP_001121161.1
PAI name : FPI
PAI accession : NC_009257_P1
Strain : Francisella tularensis F92
Virulence or Resistance: Virulence
Product : pathogenicity determinant protein D, pdpD
Function : -
Note : -
Homologs in the searched genomes : 20 hits ( 20 protein-level )
Publication :
-Beckstrom-Sternberg,S.M., Auerbach,R.K., Godbole,S., Pearson,J.V., Beckstrom-Sternberg,J.S., Deng,Z., Munk,C., Kubota,K., Zhou,Y., Bruce,D., Noronha,J., Scheuermann,R.H., Wang,A., Wei,X., Wang,J., Hao,J., Wagner,D.M., Brettin,T.S., Brown,N., Gilna,P. and , "Complete genomic characterization of a pathogenic A.II strain of Francisella tularensis subspecies tularensis", PLoS ONE 2 (9), E947 (2007) PUBMED 17895988 REMARK Publication Status: Online-Only.
-Beckstrom-Sternberg,S.M., Auerbach,R.K., Godbole,S., Pearson,J.V., Beckstrom-Sternberg,J.S., Deng,Z., Munk,C., Kubota,K., Zhou,Y., Bruce,D., Noronha,J., Scheuermann,R.H., Wang,A., Wei,X., Wang,J., Hao,J., Wagner,D.M., Brettin,T.S., Brown,N., Gilna,P. and , "Direct Submission", Submitted (30-MAR-2007) National Center for Biotechnology Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA.
-Godbole,S., Auerbach,R.K., Beckstrom-Sternberg,S.M., Brown,N., Bruce,D., Deng,Z., Gilna,P., Keim,P.S., Kubota,K., Munk,A.C., Noronha,J., Peterson,J., Wagner,D.M., Wei,X., Wang,A., Wang,J., Zhou,Y., Scheuermann,R.H. and Brettin,T.S. CONSRTM BioHealthBase, "Direct Submission", Submitted (08-MAR-2007) Department of Pathology, UT Southwestern Medical Center, 6000, Harry Hines Blvd., Dallas, TX 75390, USA.
| DNA sequence : | |
ATGGATCAAGATATCAATGATTTATTATATGATACTAATGATTTGAAAAAAGAAAAAGTATGTGGCGGCTTTTTTGATTT
TATCAAAGCTTGGTTTTATAATGACGTTGAAAGACATATGTTTTTTGAAGATGAGATTATTGTGGCTCAGAAACTTAAAA
CGATGGATGTCATGGCTAATACATACGCCTTAGAGAGAAAAAAATATTTTGAAAAATTTCTCAAAGATTCTCATAAACAA
AAAGGTTTTTTTACAAGAATAAAAGATAGAGATTTTGCTTTTTATAAAGATCCTACTAGGGTTAAACTATGGAGTAGTAT
TACTGATACTGATGTCTATAGCTTTTTTATAAAGTCAAGCGTTAACCAAGTGCTTGGTGGTGGTAATATAGCTCAACTGA
CATCATTACCAAAATTTAAGTTTAATGCAATAGCATCAGTTAATAATGAAAACATCTCGGCAGCAGCTAATCTTGCAGCT
ACTGGAGCAAAAAGTTTTTTTGGAAGTTCATGTATAAATATTTGGTCTAATTTACCTGTATTTGATAGTGAAAGAGGAGA
TGTTAAATCATTTATTCCATTATACCTAAGAATAAGTGGTAAAGCTTCATCGGCATTATTTAATTATAATATAGATATAA
GTGCTAGCACAAATAGATTAAAATTTACTGAATCAAAATGCATGGAATTATTAAATAACTTTAAGGGCAATGTAAATCTT
AGATTAGTGGCTGCAAAAAGCTCTAGAGAAGCAAAAAGCTTTATTTATACTCCAAAATTTAAAGAAGATAGTAATAAGCA
TTTAAATGATTTAGGTTTTATTCTAAATACTCAGCAAGGTTCATATAGATATTTAGTTCCTGAAATTAGGGATGGACTTG
ATCTAATTAGAGAATATACATACCCCGAAATTGAACAGATTTATTTTGGTAGGAGTGCACTTTCTGGTTATTCAAAAAGT
AATTATGACAAGCAAAGTTTAGGTATTGAGAAAAATGGTGAGGGTCTTATGACTCTTAGGGTTAGTTCCAAAGATTATGA
AAATCCACTAATTCAGGTCAAAACTTCAGTTAATGTAACTAGTTTTGATCTTTTATCAGGACAAATAAAAGGTAAGATTT
TAGCTGATGACTTAATTGGTTTTTCAGATGCTAAAGGTGCTATTAATAAGTTCAGAAACGAAGTTGATACAATTATTAAA
AACAATATTAGTGAAAGCTTTAAGTCTCCTTTTAAGATACCAAACTTATCTGAATTTAGTGATATGGAGATAAGAGTGAG
GTTTGGCTTATATTCTAAACAATCAGCATCCAAGTTGAGGACCATAAGAATCTCTATTCCTATGACTACTAAAATGTTAG
ATTTTAATCAAACATCTGGGTCATATAATACAAAATCAGGTATGGGTTATTCAATGGCTCAGAGACATCAATTAAAAGAA
GCAATACCTTATAATGAAGGTCTTCTAGAAAATTCTGCTCAGCAGGATTTTGATTTGGTTAAACCAACCGGAAATAGTAC
TCTTGGAGCTGTGCAAGATAATTTATCAAACATATATGATAAAAGTAGTACGTTTGACTCAGTAATAGGTTCTTTGAGAG
AGCTTTATAAACTTAAAGGTGAAGACCTAACAAATATTGATTCTCATGATATCCTTAATGTTTTATCACAAAACTCGTCT
TTATCGGGGTTATCTAGTAGTATCGCAGCAGATCTAAATGAGTTAAACTCTAAGTTTAAGGATATTACGTCTATAAATAA
AAAAACATCTGAAGCGATATTATCTACGAATTACCAGCAATATAATCCTAGTTTTAATAAAGCAAAAATATTCGATAATC
CAGATTCTTTCTATGTTCAAGATACTTTAATTAACTACTCACAAACCCTAAAAAAAGAAGAATTTAGAGATCAGATGTCA
ACAATAAATATTATTGAATTTGGTAGTGATGGTGACTTACCTATATTATTTAATCTTTGTAAAATGATGACTAGCGAGTC
AGCAAAAGATGGCGCAAAAAATTTTCTAAGTCAAAAGGAGAATGTTAATAAGACTAAAGAGTTTTTTGATGCTCTAGAAA
ATACCACTTCTGTAATAAGTCCAGAATCAAATATCAGTTATACATCTATTAATGTGCTTTGTAGCAAAAATGCTGGAGGT
GTAATTACTGAGAATAACAAAGCATCTTCTGTATCCCTAGGTTCAACTATTAGTTTAGCGGATTTTAATAGAATGTATTC
GCTTGACTCAAGAGTTTCTGTGCTTGGAGTATCTCCTTTAGAAGAGTTATCAAGTTTTTCAGCGAAAAAAAATGAATATA
AAATCACTTTTGAAGAATATTTTACTAAGTTAGCGATTCAAAGATATATGGAAGTTATTATGATAGATGATGAAGCTGAC
TTTATAAAATCATTTGTATTACCAATGATGGAGTGTCAAAAGAAACTATTAGATAATTTAGTTATTCTAAATAAGGATGC
TAAATGGAAAAGTAGTTCATCATTTAAGAGAGCTTTCTCAAATAGAGGTAGTTTTAGTTTTACTGGTTGGCTTAAAGAGA
GACTTCCTGGCTTTGATTTTGAGCTTTCTCAGGAGTATGCTTATTTTACTGGCTTAGTAATAAACTTTGCCTTTGAAGAA
GATAACTCTTCTTCTGAAACTGTAATTAAACTATGTAAAATTATAAAATCTTTAGATAGGCTTGTTCGAGGTTTTTATTT
CTTACTAAGAAGGATGGTGAAAAATAGAAATACTAAAGTTGGTTCTCATAATGTCTCTGAAAGTCACATTAATATGGTTA
AGCAGATTTTAACATCCTTATGTGAACCATATCAGATTTTAACTCAGAAGGTAAGCGATAATGCTGAACTGTTGTCTGCT
TTAGTTAATATGTTGAGTTTTATGGATAGCCTTGTTGAAGTACAGCGGTTATGTGCTTCGATTTGTATTCCAACCAGTGC
ATTTTTCACTTTAGTGAATGAAAATAAAAATTTGTTGAAAGATATTTGCTACACTGTCGAAAAAAGTGGTGTTACAGGAA
TAGTGGTTGAATCGACATTTAGCTATTCGCCAGAACTCTTCAAAGAAAATCAACAAGATATTAAGCTTAACATTAAAAAC
ACGTCAGTCAGAGTACGAGATGGTAAAGTCAAGAGGGTTACCAGCATTGATAGGAATGCTAATACTGAAGCTATCTTACA
AAGTATTTATGATAATATAATTGCGTTTGATGAACAAGATTTAGAAAGACTATTTACGGGGTTTAGGATTTTAAAACAAG
AAAATTCGACAAACACTAATAAAGCCGTTTTCAATATTGGTTTAACATATCATCCAATAACTAATAATGCTTTTGTTGAA
TTTAATAAGGATCAACAAAGTTTATTGTACTCATATAATAATTTAAGCAAAGATGCGTATGTTACAAAAATTAAAAGTAT
AGTTGATGCTAAAGTTGCTTTAAACCTTAGTTTTGAACATGAAGAGATTAGAAGTTCACAAGGTTTTAGTGTCTTAGCAA
CTGTACCAGCTAGAGGATATTCTATAGATGATTTAAATAGAAAGTATAGACCAATGATCTGGGTTTAA
|
| Protein sequence : | |
MDQDINDLLYDTNDLKKEKVCGGFFDFIKAWFYNDVERHMFFEDEIIVAQKLKTMDVMANTYALERKKYFEKFLKDSHKQ
KGFFTRIKDRDFAFYKDPTRVKLWSSITDTDVYSFFIKSSVNQVLGGGNIAQLTSLPKFKFNAIASVNNENISAAANLAA
TGAKSFFGSSCINIWSNLPVFDSERGDVKSFIPLYLRISGKASSALFNYNIDISASTNRLKFTESKCMELLNNFKGNVNL
RLVAAKSSREAKSFIYTPKFKEDSNKHLNDLGFILNTQQGSYRYLVPEIRDGLDLIREYTYPEIEQIYFGRSALSGYSKS
NYDKQSLGIEKNGEGLMTLRVSSKDYENPLIQVKTSVNVTSFDLLSGQIKGKILADDLIGFSDAKGAINKFRNEVDTIIK
NNISESFKSPFKIPNLSEFSDMEIRVRFGLYSKQSASKLRTIRISIPMTTKMLDFNQTSGSYNTKSGMGYSMAQRHQLKE
AIPYNEGLLENSAQQDFDLVKPTGNSTLGAVQDNLSNIYDKSSTFDSVIGSLRELYKLKGEDLTNIDSHDILNVLSQNSS
LSGLSSSIAADLNELNSKFKDITSINKKTSEAILSTNYQQYNPSFNKAKIFDNPDSFYVQDTLINYSQTLKKEEFRDQMS
TINIIEFGSDGDLPILFNLCKMMTSESAKDGAKNFLSQKENVNKTKEFFDALENTTSVISPESNISYTSINVLCSKNAGG
VITENNKASSVSLGSTISLADFNRMYSLDSRVSVLGVSPLEELSSFSAKKNEYKITFEEYFTKLAIQRYMEVIMIDDEAD
FIKSFVLPMMECQKKLLDNLVILNKDAKWKSSSSFKRAFSNRGSFSFTGWLKERLPGFDFELSQEYAYFTGLVINFAFEE
DNSSSETVIKLCKIIKSLDRLVRGFYFLLRRMVKNRNTKVGSHNVSESHINMVKQILTSLCEPYQILTQKVSDNAELLSA
LVNMLSFMDSLVEVQRLCASICIPTSAFFTLVNENKNLLKDICYTVEKSGVTGIVVESTFSYSPELFKENQQDIKLNIKN
TSVRVRDGKVKRVTSIDRNANTEAILQSIYDNIIAFDEQDLERLFTGFRILKQENSTNTNKAVFNIGLTYHPITNNAFVE
FNKDQQSLLYSYNNLSKDAYVTKIKSIVDAKVALNLSFEHEEIRSSQGFSVLATVPARGYSIDDLNRKYRPMIWV
|
|
