PAI Gene Information


Name : sepQ
Accession : CAC81865.1
PAI name : LEE II
PAI accession : AJ277443
Strain : Escherichia coli 042
Virulence or Resistance: Not determined
Product : SepQ protein
Function : -
Note : -
Homologs in the searched genomes :   12 hits    ( 12 protein-level )  
Publication :
    -Benkel,P., "Direct Submission", Submitted (19-APR-2000) Benkel P., Justus-Liebig-Universitaet Giessen, Institut fuer Medizinische Mikrobiologie, Frankfurter Strasse 107, Giessen, 35392, GERMANY.

    -Benkel,P. and Chakraborty,T., "Genetic organisation and sequence of the LEE II locus in Shiga toxin-producing Escherichia coli", Unpublished.


DNA sequence :
ATGAACCTATTGAATTCTCAATTGAATATGAAAATTAATGATTTTTACTTGCCATTGTTGTCAGTCATAGGAACCGGTCG
CCTCTATATTACGCCTGAAGGGCATGCTTGCCATGCATATTTTCGCGAAGTCAGCGGTAATGGTATCCGCTTCACGTTAA
CATGCTCAGGCTATGAGGGGCGTTTTTGGATATCAGAAGAACAGTTCATTCAGTGGTGCCAGGAGTTATTCCCGTATAGC
GAAAGCCGGCTGATACCGGAAGATATGATAAAACTCATGATCTTATGGGTAATGCAGACTGCTTTACCAGAAGGTGATGT
GTCTGTTGATGATGTTCAATTTACGATGCTAAATAAAGATGTTTATCCGGTAATAGAAAATAATAATGGAGAAAACAGAC
TTAATGTAATTATACTCGAAATAACGGTACAGAGTTTACAATATCTAATTAATGAAAATTGGCAATTTGTTCCACATTCT
AATACCATTTTCTTTGATGGATATATTGCTCCTGGGTGGACTGATTACCCGGTTACAGAGCTGACTGTTGGTGATAGTTT
AAGGCTCTATCATGTTGATGACAGCAAAGAAAGAGAGTGTTGGCTTGTTATTAATAACCCTTTAGCAACCGTAAAACTTT
GTGATAATAATTTATTTATTGCGGATGTCCAGGCTGCAGATTTGTTATGTACTATCAGCAATGAGGCTGTAATGGATCGC
ATTTATTGTGTTATTGGAACAATTCATGTTGATATACATATGTTGCGCAATGCCAAAAAAGATGATATTATCGATTCAAC
TGGATATCATCTTTTTGGTGGGTGCCGGTTAATACGCAATAATACGACTATAGCATACGGAAGCATTGTAAAAATCAACG
AAGATTTTTATTTTACTGTTAGTTTAGTATGTGATTAA

Protein sequence :
MNLLNSQLNMKINDFYLPLLSVIGTGRLYITPEGHACHAYFREVSGNGIRFTLTCSGYEGRFWISEEQFIQWCQELFPYS
ESRLIPEDMIKLMILWVMQTALPEGDVSVDDVQFTMLNKDVYPVIENNNGENRLNVIILEITVQSLQYLINENWQFVPHS
NTIFFDGYIAPGWTDYPVTELTVGDSLRLYHVDDSKERECWLVINNPLATVKLCDNNLFIADVQAADLLCTISNEAVMDR
IYCVIGTIHVDIHMLRNAKKDDIIDSTGYHLFGGCRLIRNNTTIAYGSIVKINEDFYFTVSLVCD