PAI Gene Information


Name : cdd4
Accession : CAA63569.1
PAI name : PaLoc
PAI accession : X92982
Strain : Clostridium difficile 2007855
Virulence or Resistance: Not determined
Product : -
Function : -
Note : -
Homologs in the searched genomes :   584 hits    ( 584 protein-level )  
Publication :
    -Hundsberger,T., Braun,V., Weidmann,M., Leukel,P., Sauerborn,M. and von Eichel-Streiber,C., "Transcription analysis of the genes tcdA-E of the pathogenicity locus of Clostridium difficile", Eur. J. Biochem. 244 (3), 735-742 (1997) PUBMED 9108241.

    -von Eichel-Streiber,C., "Direct Submission", Submitted (13-NOV-1995) C. Von Eichel-Streiber, Inst. fr Medizinische Mikrobiologie, AG von Eichel, Hochhaus am Augustusplatz, D- 55101 Mainz, FRG.


DNA sequence :
ATGGAAATGATAATTAGAACACAAAGACTTTCAAAGGAATACAATAAAATATTTAGAGTAAAGGATATAGACCTAAGAGT
TCCACAAGGAGCTGTATATGGTTTTTTGGGTCCTAATGGAGCTGGAAAATCTACCACTCTTAAAATGCTTCTTGGACTTG
CTAAACCCACACAAGGAAATATTAATATTTTAGGTAAAGAGTTAAATGAAAAAAATAGAATATCAATTTTAAAAGATATA
GGTTCTTTGATAGAATCTCCATCATACTATGGTCATCTTACAGGGCTTGAAAACATGACCATAATGCAAAGACTCTTAGA
TTTACCTAAAAAAAATGTAAATGAAGCATTAAAAATTGTAAGGTTAGAAAATCAAAAAAATAAAAAAGTTAGTCAATATT
CTTTAGGTATGAAGCAACGTCTTGGCATTGCTATGGCAATAATGAAGTTTCCCAAATTATTAATACTTGATGAACCTACA
AATGGACTCGACCCAGCAGGGATTGAGGAAATTAGAGAATTAATAAAATCTCTACCAGAAAAATACGGGATGACTGTTCT
AATCTCTAGCCATCTTTTAAGTGAAATTGACCAAATTGCCACATCAATAGGAATAATAAATCATGGCGAACTGGTTTTTC
AAGATAGCATAAAAGAACTTCATAATAGAGGTCAAAGTCAGATTGCTATCAAAACTAAGAATGTTGTATCTGCACAAAAA
CTATTAAATACTAAAGGATATATGTCACTTATACAAGATGGGTACTTGACTATTGAAAATTTAAAAGACTCAGATGTCGC
TAAAATAAATGGTATGCTTGTCCATTCAAATATAGATGTATTTAGAATAGAAGAACATAAAAAAAGCTTGGAAGATATAT
TCTTAGAATTACTGGTAAGGCGGTGA

Protein sequence :
MEMIIRTQRLSKEYNKIFRVKDIDLRVPQGAVYGFLGPNGAGKSTTLKMLLGLAKPTQGNINILGKELNEKNRISILKDI
GSLIESPSYYGHLTGLENMTIMQRLLDLPKKNVNEALKIVRLENQKNKKVSQYSLGMKQRLGIAMAIMKFPKLLILDEPT
NGLDPAGIEEIRELIKSLPEKYGMTVLISSHLLSEIDQIATSIGIINHGELVFQDSIKELHNRGQSQIAIKTKNVVSAQK
LLNTKGYMSLIQDGYLTIENLKDSDVAKINGMLVHSNIDVFRIEEHKKSLEDIFLELLVRR