PAI Gene Information


Name : tcdA
Accession : CAA63564.1
PAI name : PaLoc
PAI accession : X92982
Strain : Clostridium difficile 2007855
Virulence or Resistance: Virulence
Product : -
Function : -
Note : -
Homologs in the searched genomes :   8 hits    ( 8 protein-level )  
Publication :
    -Hundsberger,T., Braun,V., Weidmann,M., Leukel,P., Sauerborn,M. and von Eichel-Streiber,C., "Transcription analysis of the genes tcdA-E of the pathogenicity locus of Clostridium difficile", Eur. J. Biochem. 244 (3), 735-742 (1997) PUBMED 9108241.

    -von Eichel-Streiber,C., "Direct Submission", Submitted (13-NOV-1995) C. Von Eichel-Streiber, Inst. fr Medizinische Mikrobiologie, AG von Eichel, Hochhaus am Augustusplatz, D- 55101 Mainz, FRG.


DNA sequence :
ATGTCTTTAATATCTAAAGAAGAGTTAATAAAACTCGCATATAGCATTAGACCAAGAGAAAATGAGTATAAAACTATACT
AACTAATTTAGACGAATATAATAAGTTAACTACAAACAATAATGAAAATAAATATTTGCAATTAAAAAAACTAAATGAAT
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GCTTAATATTGAATCTTCTATTGGGGATTACATTTATTATGAAAAATTAGAGCCTGTTAAAAATATAATTCACAATTCTA
TAGATGATTTAATAGATGAGTTCAATCTACTTGAAAATGTATCTGATGAATTATATGAATTAAAAAAATTAAATAATCTA
GATGAGAAGTATTTAATATCTTTTGAAGATATCTCAAAAAATAATTCAACTTACTCTGTAAGATTTATTAACAAAAGTAA
TGGTGAGTCAGTTTATGTAGAAACAGAAAAAGAAATTTTTTCAAAATATAGCGAACATATTACAAAAGAAATAAGTACTA
TAAAGAATAGTATAATTACAGATGTTAATGGTAATTTATTGGATAATATACAGTTAGATCATACTTCTCAAGTTAATACA
TTAAACGCAGCATTCTTTATTCAATCATTAATAGATTATAGTAGCAATAAAGATGTACTGAATGATTTAAGTACCTCAGT
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TGTTTTAGCAATAAATATGTCATTATCTATAGCTGCAACTGTAGCTTCAATTGTTGGAATAGGTGCTGAAGTTACTATTT
TCTTATTACCTATAGCTGGTATATCTGCAGGAATACCTTCATTAGTTAATAATGAATTAATATTGCATGATAAGGCAACT
TCAGTGGTAAACTATTTTAATCATTTGTCTGAATCTAAAAAATATGGCCCTCTTAAAACAGAAGATGATAAAATTTTAGT
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TGGAGGGGGGATCAGGACACACAGTGACTGGTAATATAGATCACTTTTTCTCATCTCCATCTATAAGTTCTCATATTCCT
TCATTATCAATTTATTCTGCAATAGGTATAGAAACAGAAAATCTAGATTTTTCAAAAAAAATAATGATGTTACCTAATGC
TCCTTCAAGAGTGTTTTGGTGGGAAACTGGAGCAGTTCCAGGTTTAAGATCATTGGAAAATGACGGAACTAGATTACTTG
ATTCAATAAGAGATTTATACCCAGGTAAATTTTACTGGAGATTCTATGCTTTTTTCGATTATGCAATAACTACATTAAAA
CCAGTTTATGAAGACACTAATATTAAAATTAAACTAGATAAAGATACTAGAAACTTCATAATGCCAACTATAACTACTAA
CGAAATTAGAAACAAATTATCTTATTCATTTGATGGAGCAGGAGGAACTTACTCTTTATTATTATCTTCATATCCAATAT
CAACGAATATAAATTTATCTAAAGATGATTTATGGATATTTAATATTGATAATGAAGTAAGAGAAATATCTATAGAAAAT
GGTACTATTAAAAAAGGAAAGTTAATAAAAGATGTTTTAAGTAAAATTGATATAAATAAAAATAAACTTATTATAGGCAA
TCAAACAATAGATTTTTCAGGCGATATAGATAATAAAGATAGATATATATTCTTGACTTGTGAGTTAGATGATAAAATTA
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ATTAATACTATAACAGGAAAATACTATGTTGATAATAATACTGATAAAAGTATAGATTTCTCTATTTCTTTAGTTAGTAA
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AATTTTGTAATCGATAAATACTTTACCCTTGTTGGTAAAACTAATCTTGGATATGTAGAATTTATTTGTGACAATAATAA
AAATATAGATATATATTTTGGTGAATGGAAAACATCGTCATCTAAAAGCACTATATTTAGCGGAAATGGTAGAAATGTTG
TAGTAGAGCCTATATATAATCCTGATACGGGTGAAGATATATCTACTTCACTAGATTTTTCCTATGAACCTCTCTATGGA
ATAGATAGATATATAAATAAAGTATTGATAGCACCTGATTTATATACAAGTTTAATAAATATTAATACCAATTATTATTC
AAATGAGTACTACCCTGAGATTATAGTTCTTAACCCAAATACATTCCACAAAAAAGTAAATATAAATTTAGATAGTTCTT
CTTTTGAGTATAAATGGTCTACAGAAGGAAGTGACTTTATTTTAGTTAGATACTTAGAAGAAAGTAATAAAAAAATATTA
CAAAAAATAAGAATCAAAGGTATCTTATCTAATACTCAATCATTTAATAAAATGAGTATAGATTTTAAAGATATTAAAAA
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AAATAATAGATAATAAAACTTATTACTATGATGAAGATAGTAAATTAGTTAAAGGATTAATCAATATAAATAATTCATTA
TTCTATTTTGATCCTATAGAATTTAACTTAGTAACTGGATGGCAAACTATCAATGGTAAAAAATATTATTTTGATATAAA
TACTGGAGCAGCTTTAACTAGTTATAAAATTATTAATGGTAAACACTTTTATTTTAATAATGATGGTGTGATGCAGTTGG
GAGTATTTAAAGGACCTGATGGATTTGAATATTTTGCACCTGCCAATACTCAAAATAATAACATAGAAGGTCAGGCTATA
GTTTATCAAAGTAAATTCTTAACTTTGAATGGCAAAAAATATTATTTTGATAATAACTCAAAAGCAGTCACTGGATGGAG
AATTATTAACAATGAGAAATATTACTTTAATCCTAATAATGCTATTGCTGCAGTCGGATTGCAAGTAATTGACAATAATA
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GATACCGCTATTGCCTTTAATGGTTATAAAACTATTGATGGTAAACACTTTTATTTTGATAGTGATTGTGTAGTGAAAAT
AGGTGTGTTTAGTACCTCTAATGGATTTGAATATTTTGCACCTGCTAATACTTATAATAATAACATAGAAGGTCAGGCTA
TAGTTTATCAAAGTAAATTCTTAACTTTGAATGGTAAAAAATATTACTTTGATAATAACTCAAAAGCAGTTACCGGATTG
CAAACTATTGATAGTAAAAAATATTACTTTAATACTAACACTGCTGAAGCAGCTACTGGATGGCAAACTATTGATGGTAA
AAAATATTACTTTAATACTAACACTGCTGAAGCAGCTACTGGATGGCAAACTATTGATGGTAAAAAATATTACTTTAATA
CTAACACTGCTATAGCTTCAACTGGTTATACAATTATTAATGGTAAACATTTTTATTTTAATACTGATGGTATTATGCAG
ATAGGAGTGTTTAAAGGACCTAATGGATTTGAATATTTTGCACCTGCTAATACGGATGCTAACAACATAGAAGGTCAAGC
TATACTTTACCAAAATGAATTCTTAACTTTGAATGGTAAAAAATATTACTTTGGTAGTGACTCAAAAGCAGTTACTGGAT
GGAGAATTATTAACAATAAGAAATATTACTTTAATCCTAATAATGCTATTGCTGCAATTCATCTATGCACTATAAATAAT
GACAAGTATTACTTTAGTTATGATGGAATTCTTCAAAATGGATATATTACTATTGAAAGAAATAATTTCTATTTTGATGC
TAATAATGAATCTAAAATGGTAACAGGAGTATTTAAAGGACCTAATGGATTTGAGTATTTTGCACCTGCTAATACTCACA
ATAATAACATAGAAGGTCAGGCTATAGTTTACCAGAACAAATTCTTAACTTTGAATGGCAAAAAATATTATTTTGATAAT
GACTCAAAAGCAGTTACTGGATGGCAAACCATTGATGGTAAAAAATATTACTTTAATCTTAACACTGCTGAAGCAGCTAC
TGGATGGCAAACTATTGATGGTAAAAAATATTACTTTAATCTTAACACTGCTGAAGCAGCTACTGGATGGCAAACTATTG
ATGGTAAAAAATATTACTTTAATACTAACACTTTCATAGCCTCAACTGGTTATACAAGTATTAATGGTAAACATTTTTAT
TTTAATACTGATGGTATTATGCAGATAGGAGTGTTTAAAGGACCTAATGGATTTGAATACTTTGCACCTGCTAATACGGA
TGCTAACAACATAGAAGGTCAAGCTATACTTTACCAAAATAAATTCTTAACTTTGAATGGTAAAAAATATTACTTTGGTA
GTGACTCAAAAGCAGTTACCGGACTGCGAACTATTGATGGTAAAAAATATTACTTTAATACTAACACTGCTGTTGCAGTT
ACTGGATGGCAAACTATTAATGGTAAAAAATACTACTTTAATACTAACACTTCTATAGCTTCAACTGGTTATACAATTAT
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TTGCACCTGCTAATACAGATGCTAACAATATAGAAGGTCAAGCTATACGTTATCAAAATAGATTCCTATATTTACATGAC
AATATATATTATTTTGGTAATAATTCAAAAGCGGCTACTGGTTGGGTAACTATTGATGGTAATAGATATTACTTCGAGCC
TAATACAGCTATGGGTGCGAATGGTTATAAAACTATTGATAATAAAAATTTTTACTTTAGAAATGGTTTACCTCAGATAG
GAGTGTTTAAAGGGTCTAATGGATTTGAATACTTTGCACCTGCTAATACGGATGCTAACAATATAGAAGGTCAAGCTATA
CGTTATCAAAATAGATTCCTACATTTACTTGGAAAAATATATTACTTTGGTAATAATTCAAAAGCAGTTACTGGATGGCA
AACTATTAATGGTAAAGTATATTACTTTATGCCTGATACTGCTATGGCTGCAGCTGGTGGACTTTTCGAGATTGATGGTG
TTATATATTTCTTTGGTGTTGATGGAGTAAAAGCCCCTGGGATATATGGCTAA

Protein sequence :
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