Name : acfD
Accession : ACK75664.1
PAI name : VPI
PAI accession : FJ209018
Strain : Vibrio cholerae IEC224
Virulence or Resistance: Virulence
Product : accessory colonization factor AcfD
Function : -
Note : -
Homologs in the searched genomes : 63 hits ( 63 protein-level )
Publication :
-Tay,C.Y., Reeves,P.R. and Lan,R., "Importation of the major pilin TcpA gene and frequent recombination drive the divergence of the Vibrio pathogenicity island in Vibrio cholerae", FEMS Microbiol. Lett. 289 (2), 210-218 (2008) PUBMED 19054108.
-Tay,C.Y., Reeves,P.R. and Lan,R., "Direct Submission", Submitted (13-SEP-2008) School of Biotechnology and Biomolecular Sciences, University of New South Wales, Sydney, NSW 2052, Australia.
| DNA sequence : | |
ATGAAGATTCGTATTGTATCATTGATAGTTTTGGGTTTTCTTATAGGTTGTAAGCATGAAAGTATAATTACCCCTACTGT
GCCTGCTGATGGTTCGGGTGGTAACGCACTAAATCCTGGTTTGGTAGGTGGTTATTTGCCAGATATTGGTGTTCCGGATC
CCATTATCTCGCTATCCATGACTTTAGATGGTAACTTGAAATTTGATAGTTCTTTACTGTGTAATGATCAAGATGCCTCT
CATTTTCAAATATCACAAAAAGATAATGTCTTTTGTACGATCAACGGGCGTTCAATCGCAACATTTACCGCTCCCTTTGA
CGCTAATAAAAATGGCCGTAACACTGATTCTGAAGTTTTATCTTTAATCTCTGCGGATGAGTACCGGGACTCGCCAGTTC
GACAGGAAAATCTCCAAATTTTAATGAAAAATATGGCGACAATACATGGAGATAAAATATCTCTAGTTTTCCGAAGTACT
CTTGATGCCTTGACATTCGAAAATTATTTACGGCACAATTTAGATCTTCCCAAAGACCAATTTTTAGAAGCAATTACAGA
AAAAATCGCCAATGATAATCAGGTCGATAAGCAACCTTCAACTCATGTGCCTAATATCTCTCCATCATTCACGCCTGGGA
CTTCATCTAATTTGAATAGTCCATTCGTTTCTGCTAATGCTGAAGAGTCTTTGAGCTATATACCGACAGATGTTATTCCT
TCGCTTGGTCGCTTACTTGATAGTCAAGGTCGAGTTATTAATGGTGTTTCATACTTCAGTAATAATACTCGTGGTATTAC
TGGTGTAGATAAAACAGGGGCTATTTTAAATGATGGTTCATTTGAATTTTCGTGGGGAGATATTATTAGCTTTTCAATCG
ATACATTTGAATTAGGTAGTACTCGAGCTAATAAAACTGATTTTTATATCAGTGAATTAGGTAAGGACAATGAGGGTAAG
AATGCTGAAGCTTTGATTCATCGTTATGCAAGTATTGATGATTCTAAGCTTATCATTCCAGATAAAGTTACGCAGATTTT
TTCCCTATACCCTAATGTCATTAATGAAGTGATTTCATTATCATTACCTAATGGCGATATCGAACTTGATATTGGAGATG
GTAAAACTCAGATTGTACCTGGTGAATTCTTTAAGCAGTTTGATTCTGGATTAGCAGCACTTATCGATCAATCTATTTCA
CCTATATCGAGGTTCAAATTTGAAGACAGTTTGCCTAAGAAAAAGTCAGCAATTGATTCTGAATCTTCACAAATCCAAGA
TATTATTAATAAACTCTGGGGTGCAACCGATACCGTACAAGCTAATGGATGGAAAAAAGTCGATCGTTTTCATATTTTTC
ATGACAGTACAAACTTCTACGGTAGTACAGGAAGTGCCCGAGCACAAGCAGCGGTGAATATTGCTAATAGTGCATTTCCA
GTCTTAATGGCTCGTAATGACAATAATTACTGGATTGATTTTGGTAAACCTAAAGCATGGGATTCGAATAGTCTGGCATT
TATTACTGAAGCACCTTCTACAGTTGTGCCTGATAAAGTATCTGAAGATACATCAACCTTTAATTTACCTTTTATTAGTT
TGGGCGAAATTGGTAAAGGCAAGCTGATGGTACTAGGAAATGCGCGATATAACAGTGTCTTAGTCTGTCCTAATGGATTT
AGTTGGGGCGGAACTGTTAAAAATGGTACTTGTAGCTTAAGTAGTGATCGTGATGATATGGCTAATTTTTTTAGTAATGT
CATCCGCTATCTTACGGGAAGTACTTCCAATGATGTTATTGTTGGAACTAATATTCCAGAAGTTTACTTTAAATCATCTG
GCCAAACTATGGGGTCAAAAGCCAATTTTGAACTCGATTCAAGATTCTCTAAGCAAACTCAACAGTTGACTAGTTTCCAT
GATTTAGATGTTAATACTATACCTCTTATTATTATCAATGCATACGACTATAAAGGAAAAAACATAAATAGTCCGTATGA
TATTCCATTAAGTGCTGATGTAGGCAGTCCGAAATTGTCTCGTTCTGATGTCACTGATTTAATTGATTATATAAACAACG
GTGGTAGTGTATTAATGATGGAGACTATCATTAATACAAATAACAGTGAGATTTCTCGTTTATTGGACAGTGCTGGTATT
GCTTTTGGCATTGGAAACAGTGTAGTTGCTGACGGTAATGGCCCGAGTGGAGGCCACCCAGATCGCCCACGTAGTCAGCG
AGAGCACGGTATTTGGGTTATTGAGCGATATGCAGCTGTTGAAGACGAGTCTTCTGGTCAACAGACGCTACCTTATGTGA
TTAATAGTGATGGTTCAATTGAGTGGAAGTATATTGTAGAGAATAGGCCCGATGATAAACCTAAACTTGAAGTCGCGAGT
TGGGTTGAATCTGAAGCTGGAGATAAATTAATTACTCACTATGCATTTATTGATGAGTCTCAGCACTGGAAAAAAGATAT
TTCAGGTAAAATAATCTATAACGTGGCAGGGAAGCCGGAAGTAGATAATGCATCATTATCTTTGGCTAAAAATAAAGTAC
TTGATGCTTTTAAAAACAGTAGTGGCCAGAGAGCCTACTCTGAATGTAAAAATTCTGAGTTTCATTATGAGATTAATTGC
TTAGAATATCGTCCAGGTAATTCAATTCCTATTACTGGTGGTTTGTATGTACCCCGATATACTGATATTAAGTTAGGAGA
GTCTGAAGCCAATGCTATGGTAAAGGCGGCTAATCTTGGTACAAATATTCATGCTTTATATCAGCATGAACGTTATTTCC
GAACTAAAGGAAAGTCGGGAGCCCGTTTAAATAGTGTTGATTTGAATCGAATTTATCAAAATATGTCAGTATGGCTTTGG
AACGACCTTGATTATCGTTATGATGATAAGCAATCCGATGAGCTTGGATTTAAAGTTTTTACACAGTATTTGAATTGTTA
CACTAGTAACAACGCTGGTGGTAATACAACTTGCCCAGAAGAATTGAAAGATGAACTTACTCAGCTAGGTATGATTTATG
ACGAAAAATCAGGAAGCTATGCAGGTCAAATGGATCCAAGTTACCCACTTAATTATATGGAAAAGCCACTGACCCGTTTA
ATGTTAGGGCGCTCATTCTGGGATCTTGATATCAAAGTTGATGTCAGAAAGTACCCCGGTGAAGTCACAACAAGATCAGG
TGGAGGGGATATTACTCTTGACATGCGTAATAATACGGCAGCTTGGTTTGCGGGTAATAGGCAGCCGACAGGGCAGTGGG
CCGAAGCTCATCAGCCTTTTAGTGTTTCAGTCTCAGGAGAAACATCGCCTGTCACCATCACCATTGCATTGGCTGATGAT
TTAACTGGCCGAGAGAAGCATGAGCTTGGTTTAAAGCGTCCTCCTCGCATGAGCAAATCATTTGTTATTGGCGGCGATAG
TCCGAAAATGCAGACTTTTACCGTACCCTATGGTGGGTTAATATATGCACAAGGGGGAAATTCTCAACAGGTCAAACTAA
CATTTTCAGGAACTATAGATGCACCGCTCTATATTGACGGTAAGTGGAGAAACCCTCTTTTATCTGGCGCACCAATTGGT
GAAGTAGTGTCAGACACCTTCATATTTACTGCACCTAAAGCAAATTTAAATGCCGATGGTTATTTGGGGGGGATCGAACA
GTTTGCAAAAGATCTTGATCAATTCTCAGCGGATTTAAACGATTTTTATGCCCGTGATGAAGGTGCGGACGGTGACAAAA
ATCGCAAAGCTACTGATAAGTCAATGCCTAATAATCGTCACCATTTCGTCAATGATGTCGCAATAAGTGTTGGTGCTGCA
CACTCTGGCTATCCGGTCATGAATGATAGTTTTATTACCAGTAGCCGTAGTTTGAACACTATGCCGCTGAACAGCTGGCT
GCTTTGGCATGAGGTCGGGCATAATTCAGCAGAAGCTCCTTTTAATGTTGATGGGGCCACAGAAGTTGTAAACAACTTA
|
| Protein sequence : | |
MKIRIVSLIVLGFLIGCKHESIITPTVPADGSGGNALNPGLVGGYLPDIGVPDPIISLSMTLDGNLKFDSSLLCNDQDAS
HFQISQKDNVFCTINGRSIATFTAPFDANKNGRNTDSEVLSLISADEYRDSPVRQENLQILMKNMATIHGDKISLVFRST
LDALTFENYLRHNLDLPKDQFLEAITEKIANDNQVDKQPSTHVPNISPSFTPGTSSNLNSPFVSANAEESLSYIPTDVIP
SLGRLLDSQGRVINGVSYFSNNTRGITGVDKTGAILNDGSFEFSWGDIISFSIDTFELGSTRANKTDFYISELGKDNEGK
NAEALIHRYASIDDSKLIIPDKVTQIFSLYPNVINEVISLSLPNGDIELDIGDGKTQIVPGEFFKQFDSGLAALIDQSIS
PISRFKFEDSLPKKKSAIDSESSQIQDIINKLWGATDTVQANGWKKVDRFHIFHDSTNFYGSTGSARAQAAVNIANSAFP
VLMARNDNNYWIDFGKPKAWDSNSLAFITEAPSTVVPDKVSEDTSTFNLPFISLGEIGKGKLMVLGNARYNSVLVCPNGF
SWGGTVKNGTCSLSSDRDDMANFFSNVIRYLTGSTSNDVIVGTNIPEVYFKSSGQTMGSKANFELDSRFSKQTQQLTSFH
DLDVNTIPLIIINAYDYKGKNINSPYDIPLSADVGSPKLSRSDVTDLIDYINNGGSVLMMETIINTNNSEISRLLDSAGI
AFGIGNSVVADGNGPSGGHPDRPRSQREHGIWVIERYAAVEDESSGQQTLPYVINSDGSIEWKYIVENRPDDKPKLEVAS
WVESEAGDKLITHYAFIDESQHWKKDISGKIIYNVAGKPEVDNASLSLAKNKVLDAFKNSSGQRAYSECKNSEFHYEINC
LEYRPGNSIPITGGLYVPRYTDIKLGESEANAMVKAANLGTNIHALYQHERYFRTKGKSGARLNSVDLNRIYQNMSVWLW
NDLDYRYDDKQSDELGFKVFTQYLNCYTSNNAGGNTTCPEELKDELTQLGMIYDEKSGSYAGQMDPSYPLNYMEKPLTRL
MLGRSFWDLDIKVDVRKYPGEVTTRSGGGDITLDMRNNTAAWFAGNRQPTGQWAEAHQPFSVSVSGETSPVTITIALADD
LTGREKHELGLKRPPRMSKSFVIGGDSPKMQTFTVPYGGLIYAQGGNSQQVKLTFSGTIDAPLYIDGKWRNPLLSGAPIG
EVVSDTFIFTAPKANLNADGYLGGIEQFAKDLDQFSADLNDFYARDEGADGDKNRKATDKSMPNNRHHFVNDVAISVGAA
HSGYPVMNDSFITSSRSLNTMPLNSWLLWHEVGHNSAEAPFNVDGATEVVNNL
|
|
