PAI Gene Information


Name : orf23
Accession : AAN64227.1
PAI name : necrotizing factor locus
PAI accession : AY144118
Strain : Photorhabdus luminescens TTO1
Virulence or Resistance: Not determined
Product : Orf23
Function : -
Note : similar to Nostoc sp. PCC 7120 hypothetical protein all3315
Homologs in the searched genomes :   11 hits    ( 11 protein-level )  
Publication :
    -Waterfield,N.R. and ffrench-Constant,R.H., "Direct Submission", Submitted (22-AUG-2002) Biology and Biochemistry, University of Bath, Claverton Down, Bath BA2 7AY, UK.

    -Waterfield,N.R., Daborn,P.J. and ffrench-Constant,R.H., "Genomic islands in Photorhabdus", Trends Microbiol. 10 (12), 541-545 (2002) PUBMED 12564983.


DNA sequence :
ATGGATAATCAGGATGCCCTGTTTCCCACCGTTAAAGACGATATCGCCTTTGAAACCTTACTCACTCAAGCCAAGACGGT
AGTTGAGCAACAGTCTGGGCAACTCTGGAGCAATACAGCAGAAAATGATCCCGGTATTACCTTATTAGAAGCCGGTTGTT
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AACAAGATATAGCGAGCAAGGTTATTACTGAGCCATTGATTGAGACACAGCCCGAATTATTAAACTGGGGCAAACATCGT
AAAGTTCTGGACTACTATCCAGTCAGCAATAAATTACCCGCCTGCTATGGATTACAGACCTATGCGGAAACTCAACAGCA
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CGTGTTGATAAAGTATCCGCGCTGCAAAAACGGATTGCCGCCCGCATTGGCTTAGGAGGAGAATGTTTTAAAGACAACCC
CAACTTAGCTAATTTGCCTTTCTATCTGATTGAACATCGTCAGCTATTACCGGTAAAACCTGACAAAAAGTTCGATAGCG
AGCAAAAGCCCGATAACCTGGAAATAAAAAGTGATCCCAATGTCAAAAATCATCAATTAATCATTACCCAGAAAGGAACG
GCAGACCAATTATTTCACGGGCAGGTCATTAATCTGATTATTATTGAGGGAGACAGAAAATTCATATTACGAGGCCAAAT
GATCACCGATATTACAGGAGACGCCTTCTCTCTTAACACCCGTAATAGCACCGATCTAGAGCGCAATTTAAACCGCGTGG
AACAAGCGTTTAAGCAAGGTAATTTACGCTGGTGTAATAGCCCGGTATGGATGGAGGATATGGATTACCAACTGGTTTAT
GCCAGTGACACATATCAAACGGGAACAGAAGATGAACGTTGGATCACCTCCAGCACCCAAAGCCCCTTCCCTGCCATGCT
CGAAGTGAATGATGAAATTACGCTGAAATATGTTATTACCCCCTATGGGCCAGCGACAAAAATATTAGCTAATAGTGATT
CTCCTACCGATTATGAGCTTAAAGCACAAGTCGTGGAATTTGATCGCATTAAAGGCCGGATATTAATTAAAAAAATACCG
GGCCAACAATATAATTTTCCAAAACCAGAAGACGCATGGCGCTACCATTGGTATTTTTCCAATGAAAAATACGCGTTGGC
TGACCGCTTTTCATTTATGGTCAGTGTGGTAATTAATCGTCAACTTATTGAGAATGATAAAGTCGATCCTTATAAACTGG
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AACATTAACGTTAGGGCGTTTACCTTCAGCGGCAACCGGTACGGGTAATATGCGAATCGCCACCGAACAGCAGCGCAAAG
AGGTTATCGGCGACTCTGGAACCGAATGGAACGAAAAGGTAATAGAAGATAATCAGTTATTATATGTACCGAAAATTCAA
ACTAATATTCAACCTAAATAA

Protein sequence :
MDNQDALFPTVKDDIAFETLLTQAKTVVEQQSGQLWSNTAENDPGITLLEAGCYGASDLAYRHSLPLRDLLTPEKQEQTS
NDGIFPQEFGPQQMLTCGPITAEDYRRALLDLHSSNNINDKSEGYFFFNDVQLVREPESERYQYWYNKQKREYSFIQTPD
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