PAI Gene Information


Name : ef0047
Accession : AAM75252.1
PAI name : Not named
PAI accession : AF454824
Strain : Enterococcus faecalis D32
Virulence or Resistance: Virulence
Product : EF0047
Function : -
Note : CylB; ABC-type transporter
Homologs in the searched genomes :   No hits  
Publication :
    -Shankar,N., Baghdayan,A.S. and Gilmore,M.S., "Modulation of virulence within a pathogenicity island in vancomycin-resistant Enterococcus faecalis", Nature 417 (6890), 746-750 (2002) PUBMED 12066186.

    -Shankar,N., Baghdayan,A.S. and Gilmore,M.S., "Direct Submission", Submitted (03-DEC-2001) Pharmaceutical Sciences, University of Oklahoma Health Sciences Center, P.O. Box 26901, Oklahoma City, OK 73190, USA.


DNA sequence :
ATGAAAAGATTGAAGTACGTTGCGCAAGGAGAGCATAGTGAATGTGCTTTGGCATGTATCACTATGCTACTTAATTATTA
TGGTAATCAAAGTACACTAGTAGAACTAAGGGAAAAATATGGGGTGCCCAAAGGAGGACTAACTATCAAGAATATTCGTA
CTGTCTTTGACGAATATGGATTTGATGTATCGACATTTAAATCAAGTTTTTCAAATTATTTAGATCTTCCGACTCCTGTA
ATAAGTTATTGGAATAATCAACATTTTGTGGTCATAGAGAAAATAAAAAAGAAGAAAGTATTAATCTTAGATCCTGCAAG
TAATAAACGCTGGATTGATATTTCAGAATTCAAAAAAAATTTTTCAAATATATTAATATACGCACATAAGAAAAAGACTA
AAAAAGAAGGCAAAAGGAAACAGTTTTTTTTAAAGTCATTTATTTTTACAAAATTCAAAAGATATTTCTTTAGTTTAATA
ATATTATCATTTGTTTCACAACTTTTATTACTCTTAATTCCTATTGCAACAAAGTATTCGATAGATAATATTAGATCTTT
TCAAGAAATTCCTACCTATGTTCTGTTATTAATATTAACTAGTTTTTTTTCTGTTTTATATGTAGTTCAATACTTAAAAA
GCTCTGTAGTAGCAGAATTTCAGTATGAATTTGATTTTAAATTAATGTTTTCTTATATTGATAAACTTTTTAGTATGCCA
CTAATGTATTTTAGTAATAGATCAACTGGAGAATTAGTGTTTAGAGCGAACTTAAATATTTATATTAGGCAAATATTGTC
TCAAAAGGTAATAACAACTTTAATAGATAGTCTTTTTTTAGGGATATATTTGTTTTTAATGGTTAACTATTCTATTTTAC
TGACAATAATAGCTCTTGTTCTAATCTCTTTAATAGCTTTTTTAAGTATTATAAATTCGCATACAATAAAAAGATTTGTA
GATAAAGAAATAATGGAACAAGGAAACGTCCAGAGAATTATTACAGAAGCAATTGAAGGGATTGAAACCATTAAATCTGC
TAATGCAGAAAAGAGTTTTTTGTTAAATTGGAAAAACATGTTTACGTCTCAACTATTAATTACAAAAAATAAAAATAGAT
ATATAGCTATTTTTGGAATATTACCAGAAATCATACAAAGTGTAATGCCAGCTCTATTTTTAATAATAGGTATTAAATTA
ATAATCAACAATTCTTTGTCATTAGGATCACTAATTGGTTTTGTTTCTATAGTAACAATGGTTATGAAGCCAATTCTAAG
TTTGGTTTCCTCTTATAATGACTTCCTACTATTAAATGTATATTTTCAAAAATTATCTGAAGTTTTAACTTATGAAGAAA
AAAATGATTTTAATAATAAAAAAGGAAATGTTGGAAAAGAAGAGTTTATTTATAGGGTTAATAATGTTTACTATACTATA
TCTGTTTTTGAAAAAAATATTTTAAATGGTATTTCTTTTGACATAAGAAAAGGGGATAAAGTTGCTATTGTTGGTAGAAG
TGGGTCAGGGAAATCTACTTTACTAAAACTACTGGCTGGATTGTTACAACCTTCTAATGGAGAAATATTGTATGAAGGCT
ATCCTTTATCAAACAACTCCAATAATAGAAGAAACATTTTTTATGTTAATCAAAATGCGCATATTTTTAATGAAACTATC
GAAAAAAATATTTCTTTAGAGTTTAAACCGAATTCTTCTATAAATGAGAAAAAAAGACTAAAAGGAAGTATGAGTAAATC
AAAAATGGATGAGGTACTTTTAGGAATTCCTCAGTATGAGAAAACTATAGTATCAGAAAATGGTAGTAATTTCTCTGGTG
GTCAAAGGCAAAAGATTGCTTTAGCTAGAGCGTTCTATTCTAATGTGAATACATTACTTTTAGATGAACCTACATCTGCA
ATGGATAATATTTCAGAATTTGAAGTTTTTTCTAATTTATTAGATGAGAAAAGAACAGTTATTACTGTTGCTCACAGAAT
TAGTACGGTGAGAAACTTTGATAAAATTATATTAATGGATAATGGTGAAATAGTATGTATTGGAAAGCATGAAGATCTTA
TTGAAAATAGCGAGTTATATCGTTCACTGTATTACAAAAAACAACAATTTGGAGGTACAAAATGA

Protein sequence :
MKRLKYVAQGEHSECALACITMLLNYYGNQSTLVELREKYGVPKGGLTIKNIRTVFDEYGFDVSTFKSSFSNYLDLPTPV
ISYWNNQHFVVIEKIKKKKVLILDPASNKRWIDISEFKKNFSNILIYAHKKKTKKEGKRKQFFLKSFIFTKFKRYFFSLI
ILSFVSQLLLLLIPIATKYSIDNIRSFQEIPTYVLLLILTSFFSVLYVVQYLKSSVVAEFQYEFDFKLMFSYIDKLFSMP
LMYFSNRSTGELVFRANLNIYIRQILSQKVITTLIDSLFLGIYLFLMVNYSILLTIIALVLISLIAFLSIINSHTIKRFV
DKEIMEQGNVQRIITEAIEGIETIKSANAEKSFLLNWKNMFTSQLLITKNKNRYIAIFGILPEIIQSVMPALFLIIGIKL
IINNSLSLGSLIGFVSIVTMVMKPILSLVSSYNDFLLLNVYFQKLSEVLTYEEKNDFNNKKGNVGKEEFIYRVNNVYYTI
SVFEKNILNGISFDIRKGDKVAIVGRSGSGKSTLLKLLAGLLQPSNGEILYEGYPLSNNSNNRRNIFYVNQNAHIFNETI
EKNISLEFKPNSSINEKKRLKGSMSKSKMDEVLLGIPQYEKTIVSENGSNFSGGQRQKIALARAFYSNVNTLLLDEPTSA
MDNISEFEVFSNLLDEKRTVITVAHRISTVRNFDKIILMDNGEIVCIGKHEDLIENSELYRSLYYKKQQFGGTK