Name : SA40_0413 (SA40_0413) Accession : YP_008587059.1 Strain : Staphylococcus aureus SA40 Genome accession: NC_022443 Putative virulence/resistance : Unknown Product : putative glycosyl hydrolase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 469600 - 471240 bp Length : 1641 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGTCGAAAGAAATAGATTGGAGAAAATCCGTTGTATATCAAATTTATCCTAAGTCGTTTAATGATACGACGGGGAATGG TATAGGAGATATTAACGGAATTATAGAAAAATTGGATTATATCAAGTTATTGGGTGTTGATTATATTTGGTTAACACCAG TGTATGAATCACCGATGAATGATAATGGCTATGATATCAGCAATTATTTAGAAATCAATGAAGACTTTGGAACGATGGAT GATTTTGAAAAGTTAATCAAAGTTGCTCATCAAAAAGACTTGAAAGTGATGTTAGATATTGTCATTAATCATACGTCGAC GGAGCATGAATGGTTTAAAGAAGCCCGTAAATCTAAAGACAACTCTTATAGAGATTATTACTTTTTCAGATCATCTGAAG ACGGACCGCCAACAAATTGGCATTCTAAATTTGGTGGTAATGCATGGAAGTATGATTCTGAGACAGATGAATATTATTTA CATTTATTTGATGTCAGTCAAGCTGATTTAAATTGGGATAATCCGGAAGTACGTCAATCGTTATATCGTATTGTCAATCA TTGGATAGACTTCGGCGTTGATGGTTTTCGATTTGATGTCATTAACTTAATTTCTAAAGGTGAATTTAAGGACTCTGACA AAATAGGTAAAGAATTTTATACGGATGGTCCTAGAGTGCATGAGTTTCTGCATGAATTAAATCGTCAAACGTTTGGTAAC ACTGACATGATGACTGTAGGAGAAATGTCTTCGACGACGATTGAAAATTGTATTAAGTATACACAGCCAGAACGCCAAGA ATTGAATAGTGTTTTTAATTTTCATCATCTAAAGGTTGATTATGTTGATGGTGAAAAGTGGACAAATGCGAAGCTTGATT TTCATAAGTTAAAGGAAATTCTGATGCAATGGCAACGAGGTATTTATGACGGTGGCGGATGGAACGCGATTTTCTGGTGT AATCATGATCAGCCACGGGTAGTGTCTAGATTTGGTGATGATACGTCGGAAGAGATGAGGATACAAAGTGCTAAAATGTT AGCTATCGCACTGCATATGTTGCAAGGGACGCCATATATTTACCAAGGTGAAGAAATTGGTATGACGGACCCACATTTTA CATCAATAGCACAATATCGTGATGTTGAATCGATTAATGCCTACCATCAGTTGTTAAGTGAAGGGCATGCTGAAGCGGAT GTGTTAGCGATTTTAGGACAGAAGTCACGAGACAATTCGAGAACGCCTATGCAATGGAGTGATGATGTTAATGCTGGATT TACAGCTGGTAAGCCTTGGATTGATATTTCGGAAAATTATCATCAGGTCAACGTTAGACAAGCACTTCAGAATAAAGATT CTATTTTCTATACGTATCAAAAATTAATACAATTAAGACATACGCATGATATTATTACGTATGGAGACATTGTGCCACGT TTTATGGATCATGATCATTTATTTGTTTATGAACGTCATTATAAGAATCAACAATGGCTAGTAATTGCGAATTTCTCAGC ATCGGCTGTTGATTTGCCAGAAGGATTGGCTAGCGAAGGTCGTGTTGTGATTCAAACAGGCACAGTGGAAAATAATACGA TAAGCGGGTTTGGTGCAATTGTAATCGAAACAAACGCGTAA Protein sequence : MSKEIDWRKSVVYQIYPKSFNDTTGNGIGDINGIIEKLDYIKLLGVDYIWLTPVYESPMNDNGYDISNYLEINEDFGTMD DFEKLIKVAHQKDLKVMLDIVINHTSTEHEWFKEARKSKDNSYRDYYFFRSSEDGPPTNWHSKFGGNAWKYDSETDEYYL HLFDVSQADLNWDNPEVRQSLYRIVNHWIDFGVDGFRFDVINLISKGEFKDSDKIGKEFYTDGPRVHEFLHELNRQTFGN TDMMTVGEMSSTTIENCIKYTQPERQELNSVFNFHHLKVDYVDGEKWTNAKLDFHKLKEILMQWQRGIYDGGGWNAIFWC NHDQPRVVSRFGDDTSEEMRIQSAKMLAIALHMLQGTPYIYQGEEIGMTDPHFTSIAQYRDVESINAYHQLLSEGHAEAD VLAILGQKSRDNSRTPMQWSDDVNAGFTAGKPWIDISENYHQVNVRQALQNKDSIFYTYQKLIQLRHTHDIITYGDIVPR FMDHDHLFVYERHYKNQQWLVIANFSASAVDLPEGLASEGRVVIQTGTVENNTISGFGAIVIETNA |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 4e-120 | 49 |