|
Name : SA40_2180 (SA40_2180) Accession : YP_008588821.1 Strain : Staphylococcus aureus SA40 Genome accession: NC_022443 Putative virulence/resistance : Resistance Product : ABC transporter ATP-binding protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 2392866 - 2394578 bp Length : 1713 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAACAATCAGACAAATTGGATAAAGATACTCAGCGGATTTGCTTCTGATAGTAAATGGAAAATTATGTTATCAATTTT GTTGTCTATCATCAGTGTCTTTTCTGGATTAGTTCCATATTGGGCAGTCTTTAAAATTATTTTAATGATGATTAACAATG CATATACGATTAATTCGATTATGGTTTATATCTTTATTGCTTTAATCGCTTATATTTCACAAGTGTGTTGTTTTGGAGCG TCAACGATGCTATCACATATTACGGCATATGAAATTTTATCTGAAATTCGTAAAAAATTAGCTCAAAAATTAATGCGTCT CCCTTTAGGCGTAGTGGAATCTAAGAAAATAGGTGAATTAAAAAATATATTTGTCGATAAGGTTGAAACAATAGAATTAC CTTTAGCACATATGATTCCTGAAGTTATAGGAAACTTACTTTTGTCAGCTGCTATCTTTTTATACATAATGCTCATTGAT TGGCGTATGGCTAGTGCCTTATTAGTAACGATACCAATTTCAATTTTCGCTTTTAAAAAAGTTATGTCTGGATTTAATGA GACATATGCTGAACAAATGAAATCGAATAATTATATGAATAGCGCCATTGTTGAATATATTGAAGGTATTGAGGTAATTA AAACATTTAATCAATCTCAAAGCTCGTATAAAAAATATCAAGATGCAGTAGATAATTATAAAATACATACTTTAAATTGG TTTAAAAATACATGGGGCTATATGAATTTAGGTGCAAGTGTACTACCTTCGACGTTTTTAGGGATTCTACCTGTTGGCAT GTACTTGATATCTATCAACCAATTAAATTATGCAGAATTTTTTATTTGTATTGTATTATCTCTCGGTGTCGTAGCACCGA TTAAGAATTTTACTAATTATGTGAATCATTTAAAATCAATCCAATATGCGTTAACTGAAGTAAATCAAATATTAATCTTA GAAGAGTTAGCATTGTCATCACGATTTATGGAACCTCAAAGTTATGAAATTGCTTTTAATAATGTGGGTTTTTCATATAC AAATGATAAGGACGAAAGAGTCTTTAAGAATCTATCATTTACGGTACCAGAAAATCATTTTACGGCGATTGTTGGGGAAT CTGGTAGCGGTAAGTCAACTATAGCTAAGCTCATATCAAGGTACTGGGATGTAACGACTGGAGAAATCACGATTGGTAAT GTAAACATAAAAAATATAGAACAAAAGCAACTTAACGAATTAGTTGGTTATGTAGGACAAGATAACTTTTTATTAAATCT TACTTTTAAAGAAAATATTAAACTTGGCAATCCAGAAGCTACGGATGAGGCAGTTGAAAAAGCTGCCAAGTTAGCACAAT GTCATGAATTTATTGAAAAGTTGCCAGATGGATATGATACGAATGTTGGTACAGTGGGAGATAAATTGTCTGGTGGTGAA AAACAACGAGTCACTATTGCAAGAATGATATTAAAAGATGCGCCTATCATTGTATTAGATGAAGCGACTGCTTACGTTGA TCCAGATAGTGAACAAAAAATCCAAGAAGCACTAAATGTGTTGACACGCAATAAAACGCTTATAGTTATTGCACATCGTT TATCTACTATTCAACATGCAGATCAAATTATTGTATTAGGTAATCAACAAATTTTGGAGAAAGGCTCACATCAATTGTTG CTAAAATTAGAAGCTCATTACAAAAATATGTGA Protein sequence : MNNQTNWIKILSGFASDSKWKIMLSILLSIISVFSGLVPYWAVFKIILMMINNAYTINSIMVYIFIALIAYISQVCCFGA STMLSHITAYEILSEIRKKLAQKLMRLPLGVVESKKIGELKNIFVDKVETIELPLAHMIPEVIGNLLLSAAIFLYIMLID WRMASALLVTIPISIFAFKKVMSGFNETYAEQMKSNNYMNSAIVEYIEGIEVIKTFNQSQSSYKKYQDAVDNYKIHTLNW FKNTWGYMNLGASVLPSTFLGILPVGMYLISINQLNYAEFFICIVLSLGVVAPIKNFTNYVNHLKSIQYALTEVNQILIL EELALSSRFMEPQSYEIAFNNVGFSYTNDKDERVFKNLSFTVPENHFTAIVGESGSGKSTIAKLISRYWDVTTGEITIGN VNIKNIEQKQLNELVGYVGQDNFLLNLTFKENIKLGNPEATDEAVEKAAKLAQCHEFIEKLPDGYDTNVGTVGDKLSGGE KQRVTIARMILKDAPIIVLDEATAYVDPDSEQKIQEALNVLTRNKTLIVIAHRLSTIQHADQIIVLGNQQILEKGSHQLL LKLEAHYKNM |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| smi_1698 | YP_003446800.1 | multidrug ABC transporter ATPase/permease | Not tested | The aminoglycoside resistance gene cluster | Protein | 4e-77 | 41 |
