Gene Information

Name : ECOPMV1_03248 (ECOPMV1_03248)
Accession : YP_008573023.1
Strain : Escherichia coli PMV-1
Genome accession: NC_022370
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : Alpha-2,8-polysialyltransferase (POLYST)
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 3339489 - 3340718 bp
Length : 1230 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGATATTTGATGCTAGTTTAAAGAAGTTGAGGAAATTATTTGTAAATCCAATTGGGTTTTTCCGTGACTCATGGTTTTT
TAATTCTAAAAACAAGGCTGAAGAGCTACTATCACCGTTAAAAATAAAAAGTAAAAATATTTTTATAATTAGTAACCTGG
GGCAATTAAAAAAAGCTGAGTCATTTGTACAAAAATTTAGCAAGAGAAGTAACTATCTTATTGTTTTGGCAACTGAAAAA
AATACTGAGATGCCAAAAATTATTGTTGAACAAATAAATAATAAATTATTTTCTTCATACAAGGTACTATTCATTCCAAC
TTTCCCAAATGTTTTTTCACTTAAAAAGGTTATATGGTTTTATAACGTATATAATTATTTAGTTTTAAATTCAAAAGCTA
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TTAATTGAAGAGGGGACAGGGACTTATAAAACCGAAAAAGAAAACCCAGTAGTAAATATTAATTTTTATTCAGAGATTAT
TAATTCAATTATCTTGTTCCATTATCCAGATTTGAAATTTGAAAATGTATACGGTACATATCCAATTTTGCTTAAGAAAA
AATTTAATGCGCAAAAATTTGTTGAGTTTAAAGGTGCTCCATCAGTTAAATCATCAACCAGAATAGATAATGTTATCCAT
AAATATTCTATAACTAGAGATGATATAATATATGCAAATCAAAAGTATTTGATTGAACATACATTATTTGCGGATTCGTT
AATTTCTATCTTACTTAGAATAGATAAGCCTGATAATGCAAGAATATTTATAAAACCTCACCCTAAAGAGCCTAAAAAAA
ATATTAATGCAATTCAAAAGGCAATAAAAAAGGCAAAATGTCGTGACATAATTCTTATAACAGAGCCAGACTTTTTAATA
GAGCCGGTAATAAAAAAAGCAAAAATAAAACACTTAATTGGATTAACATCATCTTCTTTGGTATATGCACCTTTAGTTTC
TAAAAGATGTCAGTCTTATTCAATAGCGCCTCTTATGATAAAGTTGTGTGATAATGATAAATCCCAAAAAGGGATTAATA
CGCTGCGTCTCCATTTCGATATTTTAAAGAATTTTGATAATGTTAAAATATTATCGGATGATATAACATCTCCCTCTTTG
CACGATAAAAGGATTTTCTTGGGGGAGTAA

Protein sequence :
MIFDASLKKLRKLFVNPIGFFRDSWFFNSKNKAEELLSPLKIKSKNIFIISNLGQLKKAESFVQKFSKRSNYLIVLATEK
NTEMPKIIVEQINNKLFSSYKVLFIPTFPNVFSLKKVIWFYNVYNYLVLNSKAKDAYFMSYAQHYAIFVYLFKKNNIRCS
LIEEGTGTYKTEKENPVVNINFYSEIINSIILFHYPDLKFENVYGTYPILLKKKFNAQKFVEFKGAPSVKSSTRIDNVIH
KYSITRDDIIYANQKYLIEHTLFADSLISILLRIDKPDNARIFIKPHPKEPKKNINAIQKAIKKAKCRDIILITEPDFLI
EPVIKKAKIKHLIGLTSSSLVYAPLVSKRCQSYSIAPLMIKLCDNDKSQKGINTLRLHFDILKNFDNVKILSDDITSPSL
HDKRIFLGE

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
neuS YP_854390.1 poly-alpha-2,8 sialosyl sialyltransferase NeuS Not tested PAI I APEC-O1 Protein 6e-167 100
ORF_63 AAZ04472.1 polysialyltransferase protein Not tested PAI I APEC-O1 Protein 5e-167 100