Gene Information

Name : polA (kw2_2202)
Accession : YP_008569825.1
Strain : Lactococcus lactis KW2
Genome accession: NC_022369
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : DNA polymerase I PolA
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 2266369 - 2269002 bp
Length : 2634 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGGAAGATAAGAATAGACTTTTGCTAATTGATGGGTCATCGGTTGCTTTTCGAGCGTTTTTCGCATTATATAATCAGTT
AGATCGGTTCAAAGCACCTAATGGCTTACATACAAATGCCATTTTTGCTTTTCATACGATGTTATCTTCTTTGATGGAAC
GAATTCAACCAACACATGTTTTAATTGCTTTTGATGCGGGGAAAACGACTTTTCGGACGGAGATGTTTGCGGATTATAAA
GGGGGACGGTCAAAAACACCTGATGAGTTTCGCGAGCAATTGCCTTTTATTAAGGAAATGATTGAGAAGTTAGGAATTCG
ACACTATGAGTTGGCAAACTATGAGGCTGATGATATTATCGGAACTTTGGATAAAATGGCTGAAGCACCTGATGTGAATT
TCGATGTGACCATTGTGACCGGGGATAAGGATATGATCCAGCTTGTCGATGGAAATACACGAGTGGAAATTTCTAAAAAG
GGTGTGGCTGAGTTTGAGGAATTTACGCCTGACTATCTCTTAGAAAAAATGGGACTTACGCCATCACAATTTATTGATTT
GAAGGCTTTGATGGGCGATTCTTCGGATAATTATCCTGGTGTCACTAAAGTTGGTGAAAAAACGGGTCTTAAACTTTTAC
AAGAGTTTGGTTCACTGGAAAATCTTTATGAAAATGTTGAGACGCTAAAAGCCAGCAAGATGAAGGATAATCTAATTGCT
GACAAGGAAATGGCCTTTTTGTCACAGCAATTGGCGACAATCAATACGAAAGCTCCTCTTGAAATTGGTTTAGAAGATAC
GCTTTTAAAAGAAAAAAATGTGGCTGAACTGGGCCAATTTTATGATGAAATGGGATTTTCACAATTCAAAAGTAAGTTAT
TAGCTGACGGCGGTGGAGAAGTTACTGACGAAACTGTCAGTGAAGAAATTAAGTTTGAAATAGTTACTGACAAAAGTTCA
GTTGCTTCAGTAAATGCTGATGACTTCTTTTACTTGGAAACTTTGGGTGAAAATTATCATCGTGAGCAGATTGTGGCATT
TGCTTGGGGAAATTCTGAGAAAATTTATGTTTCAAAAAATCTGGATTTACTGACAGAAATGAAATTTCCTGAAAATACTT
ATGATTTCAAGAAAAATCGCGTACTTTTGAGCCACTTAAGTATTGAATTACCTCTGGTTAAATTTGATGCTATGCTTGCA
AAATATTTAATTTCTACAACGGAAGATAATAAAATTTCAACCATTGCACGACTTTTTGATGTGGGACATTTGGTCACCGA
TGAGGAAATTTTTGGCAAAGGTACAAAACTTGCTCTACCTGATGATGAGATTTTGTTTGACCATTTGGCTCGTAAAATCA
GAGTTTTAGCTCGTGCCAAAGAAAAAATGATGGCTGAACTTATTGAAAATGAACAAGAACATCTTTTGTCTGATATGGAA
TTACCATTAGCCGAAGTTTTGGCAAAAATGGAGATTACAGGAATTTCTGTCAGTCAAAATACGCTGGAAGAAATTGGTGC
AGAAAACGAAGAAAAATTGGCTTCGTTGACTCGTGAAATTTATGATTTGGCTGGTGAAGAATTTAATATTAATTCACCAA
AACAACTGGGAGTGATTTTATTTGAAAAATTGCAATTGCCAGTAGGTAAGAAAACAAAAACGGGTTATTCAACGGCGGTG
GATGTTTTAGAAGACTTGGCTGCTTTATCTCCAGTGGTGGCAAAGATTTTGGAATATCGTCAAATCAATAAAGTACAATC
GACTTATGTTAAAGGCTTGATTCCGCAAATTGCTGATGATGGAAAAATCCATACGCGATATGTTCAGGACTTGACTCAGA
CCGGTCGTTTGAGTTCGGTTGACCCGAATTTGCAAAATATTCCTGTTCGACTGGAAGAAGGACGGAAGATTCGTAAGGCA
TTTGTGCCCAGTCAAGATTCTCTTTTGTTGAGTTCCGACTATTCACAAATTGAATTGCGAGTGCTGGCTCATATTTCTGC
TGATGAGCATTTGATTGACGCCTTTAAACATGGGGCTGATATCCATACGTCAACGGCTATGCGGGTCTTTGGCATTGAAA
AAGCAGAAGATGTCACGGCAAATGACCGCCGAAATGCAAAAGCAGTCAATTTTGGTGTGGTTTATGGAATTTCGGATTTT
GGTTTGGCAAGAAATCTGGGAATTACAAGAAAAGATGCCAAAAATTATATTGAAACTTACTTTGAACGTTATCCTGGTAT
TAAAACTTATATGGAAAATATTGTTCGCGAGGCTAGAGATAAAGGATTTGTTGAGACAATGAGTCATCGTCGTCGTAAGA
TTCCAGATATTAATGCACGTAATTTTAATGTTCGTGGTTTTGCGGAGCGGACGGCAATTAATTCGCCAATCCAAGGATCG
GCAGCGGATATTTTGAAAATTGCGATGATTAATCTGGATAAAGCGCTGACGGAACGTCAATTAAAATCAAAATTATTATT
GCAAGTGCACGATGAAATTATTCTAGATGTTCCACTCGAGGAATTGGAGGATATCAAGGCACTTGTAAAGCAAACAATGG
AAGAAGCAATCGAACTTGCTGTGCCATTGAAAGTGGATGAAAATACTGGTAAAACTTGGTATGAAGCCAAATAA

Protein sequence :
MEDKNRLLLIDGSSVAFRAFFALYNQLDRFKAPNGLHTNAIFAFHTMLSSLMERIQPTHVLIAFDAGKTTFRTEMFADYK
GGRSKTPDEFREQLPFIKEMIEKLGIRHYELANYEADDIIGTLDKMAEAPDVNFDVTIVTGDKDMIQLVDGNTRVEISKK
GVAEFEEFTPDYLLEKMGLTPSQFIDLKALMGDSSDNYPGVTKVGEKTGLKLLQEFGSLENLYENVETLKASKMKDNLIA
DKEMAFLSQQLATINTKAPLEIGLEDTLLKEKNVAELGQFYDEMGFSQFKSKLLADGGGEVTDETVSEEIKFEIVTDKSS
VASVNADDFFYLETLGENYHREQIVAFAWGNSEKIYVSKNLDLLTEMKFPENTYDFKKNRVLLSHLSIELPLVKFDAMLA
KYLISTTEDNKISTIARLFDVGHLVTDEEIFGKGTKLALPDDEILFDHLARKIRVLARAKEKMMAELIENEQEHLLSDME
LPLAEVLAKMEITGISVSQNTLEEIGAENEEKLASLTREIYDLAGEEFNINSPKQLGVILFEKLQLPVGKKTKTGYSTAV
DVLEDLAALSPVVAKILEYRQINKVQSTYVKGLIPQIADDGKIHTRYVQDLTQTGRLSSVDPNLQNIPVRLEEGRKIRKA
FVPSQDSLLLSSDYSQIELRVLAHISADEHLIDAFKHGADIHTSTAMRVFGIEKAEDVTANDRRNAKAVNFGVVYGISDF
GLARNLGITRKDAKNYIETYFERYPGIKTYMENIVREARDKGFVETMSHRRRKIPDINARNFNVRGFAERTAINSPIQGS
AADILKIAMINLDKALTERQLKSKLLLQVHDEIILDVPLEELEDIKALVKQTMEEAIELAVPLKVDENTGKTWYEAK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
polA YP_281523.1 DNA polymerase I Not tested Not named Protein 0.0 68