Gene Information

Name : kw2_1586 (kw2_1586)
Accession : YP_008569228.1
Strain : Lactococcus lactis KW2
Genome accession: NC_022369
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : PTS system component IIC
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 1673158 - 1674558 bp
Length : 1401 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGAACGGGATTTTAAACTTTATTGTATCAGTGGCAACGACTCCAGCGCTTTTAGTTGGATTAATTGCCATGTTGGGTTT
GATTTTGCAAAAAAAAGCTGCCACTGCAGTTATCCAAGGCTCAATCAAAACATTTGCCGGATTTTTAGTGTTGACGGGTG
GAGCCGGAATTTTAGTTACCTCGCTAAATCCCTTTGCAACGATGTTTCAACATGTATTTAATGCTAAAGGAGTTGTACCA
TCAAATGAAGCGGTGGTTGCTTTAGCCTTAGTAAAATATGGCACTCCAGCTGCCTTAATTATGATTGTAGGTTTTATTGT
GAATGTGATACTTGCACGTTTTACAAGATTTAAATATATTTTCTTGACAGGTCAAGCCATGCTTTATGTTTCAACAATGT
CTGCTGTTGTCCTTATTTCAGCTGGACTAGGTAATGGTTGGTTAACAATCTTGTTAGGTGGAATATTTGAAGGAACTTTA
CTGACAATTACACCCGCACTAACTCAACGCTACATGCGTAAAATCACGGGAAATGATGGGGTTGCAATGGGCCATACTGG
AAATATGGGTTACGCACTTTCTGGCTATTTGGGAGAAAAATTAGGGAATAAAGACCCAGAAAAATCAACTGAAAAATTGA
ATATTCCTAAAAACCTGGGATTTTTGAGAGATTCTACTGTTTCTATTTCTCTAGTAATGATGGTTGTCTATGTAGGTTTA
GCTCTAATTGCTGGTCCACGTTTTGTCGAAAGTTCCTCATTGTCAGCTGGAACTAATTATATTGTATATGCGATTACTCA
AGCAGGAACTTTCGCTGCAGGTTTTGTGGTGGTGCTCCAAGGAGTTCGGATGATTTTGTCAGAAATTATTCCGGCCTTCC
AAGGGATTGCTAAAAAACTTGTCCCAAATTCTAAACCAGCGCTTGATGTTCCGATAGTATTTCCTTATGCACCAAATGCG
GTTTTAATAGGATTTTTTGTCTCCTTTATTGTTGGAGTTATTTCTATGCTAATAATGCTTGGCTTAGGAACAACGGTAAT
TATTCCTGGGGTTGTTGGCATTTTCTTTTGTGGAGGAGCAGCTGGTGTTTATGGCAATGCTTTTGGTGGTCTACGTGGGG
CGATTATCGGCTCAATCGCAAATGGATTACTATTAGCTTGGGGTCCACTATTAATTTTGCCTGCTTTAGGTTCATTTGGG
GCAGACGCGTCTTCGACCTTTGCTGATTCTGATTATATTGTATCAGGAGGCTTACTAGGAGTAATGGGAAAAGCTGGTTC
AGGGCTATTGATTGTCTTTATTTTAGCTTTCTTGGCAATTGTTTTAATAACTAGCTTAATTTTGAACAGGAGAGATAGAC
TTCATTCTAAAAAATTAAATAAATCGAATAAATTATTGTAA

Protein sequence :
MNGILNFIVSVATTPALLVGLIAMLGLILQKKAATAVIQGSIKTFAGFLVLTGGAGILVTSLNPFATMFQHVFNAKGVVP
SNEAVVALALVKYGTPAALIMIVGFIVNVILARFTRFKYIFLTGQAMLYVSTMSAVVLISAGLGNGWLTILLGGIFEGTL
LTITPALTQRYMRKITGNDGVAMGHTGNMGYALSGYLGEKLGNKDPEKSTEKLNIPKNLGFLRDSTVSISLVMMVVYVGL
ALIAGPRFVESSSLSAGTNYIVYAITQAGTFAAGFVVVLQGVRMILSEIIPAFQGIAKKLVPNSKPALDVPIVFPYAPNA
VLIGFFVSFIVGVISMLIMLGLGTTVIIPGVVGIFFCGGAAGVYGNAFGGLRGAIIGSIANGLLLAWGPLLILPALGSFG
ADASSTFADSDYIVSGGLLGVMGKAGSGLLIVFILAFLAIVLITSLILNRRDRLHSKKLNKSNKLL

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
ORF8 AAK27335.1 unknown Not tested PAI-I AL862 Protein 2e-84 50
unnamed CAC39291.1 hypothetical protein Not tested LPA Protein 2e-84 50
vpeC ADD91725.1 putative PTS system-specific IIC component VpeC Virulence PAI-I AL862 Protein 2e-84 50