Gene Information

Name : argH (N135_00968)
Accession : YP_008562263.1
Strain : jejuni jejuni 00-2425
Genome accession: NC_022362
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : argininosuccinate lyase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 904725 - 906107 bp
Length : 1383 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGAAAAATGAAATGTGGTCAGGACGTTTTAGTGGTGCAAGTGATGAGCTTTTAAAAGAATTTAATGCAAGTTTAAATGT
AGATAAAACTTTGTTCAATGAAGATATACAAGGTTCTATAGCACACGCTACAATGCTTGAAAGTTGTGGTATTTTAAAAA
AAGAAGAATTAGATGCTATTATAAAAGGTTTAGAGCAGGTTAGAAGTGAAATAGAGCAAGGTAAATTTATTTTTGATATT
AAAGATGAAGATATTCATATGGCTGTAGAAAAGCGTTTAAGCGAGATTATAGGTAGTGAAATTGGCGGAAGACTACATAC
TGCAAGAAGTAGAAATGACCAAGTGGCTACTGATTTTAAACTTTTTGTAAAAAAATCTCATATTGAACTCATAAAGCTTT
TAAAAGAATTGATTCAAACCATGCTCGAACATGCTAAAGTGCATAAAAAAACTATTATGCCAAGTTTTACACATTTACAG
CACGCTCAGCCTGTGAGTTTTTCTTTTTATATTTTAGCTTATGCTTTTATGTTAATGCGAGATATTAAGCGTTTGCAAAA
TAGCCTAGAACTTGCAGACTTTTCACCACTTGGATCTTGTGCATGTGCAGGAACAAGCTATGCTACCAATCGTGAGTTGA
GTGCTAAAATTTTAGGATTTAAAGATATTATGCCAAATGCTATGGATGGAGTGAGTGATAGGGATTTTGCTCTTGATTTG
CTTTATGATATAGCAGTTATTTTTACACACACTTCAAGACTTTGTGAGGAAATGATTTTATTTTCAAGCTCAGAATTTTC
TTTTATAACCATAAGTGATAGTTTTTCAACGGGAAGTTCTATTATGCCTCAGAAAAAAAATCCTGATGTTTGTGAGCTTA
TACGTGGAAAAACAGGGCGTGTTTATGGAAATTTGATTTCTCTTTTAACTATAATGAAAGCTTTACCTTTAGCCTATAAT
AAAGATATGCAAGAAGATAAAGAAGGGATTTTTGATAGTGTAAAAACCGCTAAAGATAGCTTAATCATCTTAAATGCAAT
GCTAAAAGAAATACAAATTAATAAAGAAAATATGCTTAATGCTTGTAAAAAAGGTCATTTATTGGCTACCGATTTGGCAG
ATTATTTGGTGCGTGAAAAAAATATTCCTTTTAGAAAAGCACATTTTATAGTGGGAAATGTTGTTGCACAAGCTGAAGCA
CAAGGTATTGATATAAGTGAAATTAAAGATCTTTCAAAAATAGATCCTGTATTTGATGAAAAAGCTATGGAACTTTTAAA
TTTTGAATTTTCTTTAAATTCTAAGCAAAGTGAAGGCTCAAGTTCTATTGCAAGCGTAGAAAAGCAAATTCAAATTTTGG
AAGGTTTTATTCAAAATTTATAA

Protein sequence :
MKNEMWSGRFSGASDELLKEFNASLNVDKTLFNEDIQGSIAHATMLESCGILKKEELDAIIKGLEQVRSEIEQGKFIFDI
KDEDIHMAVEKRLSEIIGSEIGGRLHTARSRNDQVATDFKLFVKKSHIELIKLLKELIQTMLEHAKVHKKTIMPSFTHLQ
HAQPVSFSFYILAYAFMLMRDIKRLQNSLELADFSPLGSCACAGTSYATNRELSAKILGFKDIMPNAMDGVSDRDFALDL
LYDIAVIFTHTSRLCEEMILFSSSEFSFITISDSFSTGSSIMPQKKNPDVCELIRGKTGRVYGNLISLLTIMKALPLAYN
KDMQEDKEGIFDSVKTAKDSLIILNAMLKEIQINKENMLNACKKGHLLATDLADYLVREKNIPFRKAHFIVGNVVAQAEA
QGIDISEIKDLSKIDPVFDEKAMELLNFEFSLNSKQSEGSSSIASVEKQIQILEGFIQNL

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
BJAB07104_00324 YP_008207789.1 Argininosuccinate lyase Not tested AbaR25 Protein 8e-79 48
BJAB0868_00328 YP_008211654.1 Argininosuccinate lyase Not tested AbaR26 Protein 8e-79 48