Gene Information

Name : N135_00604 (N135_00604)
Accession : YP_008561928.1
Strain : jejuni jejuni 00-2425
Genome accession: NC_022362
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : dicarboxylate carrier protein MatC
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 555977 - 557263 bp
Length : 1287 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGGTTTTTTTAATCATCTCTAGTATTATAGTGGCTATTATTTTGGGCTATATTACTAGACATAATGTTGGAATTTTTGC
TATGATTTTTGCTTATATTATAGGAGCTTTTTTTATGGATTTAGCTCCTAAAAAAATCATAGCTTTTTGGCCTATTTCTA
TATTTTTTGTTATTTTTGCTGTCTCATTGTTTTATAATTTTGCAACCGTAAATGGAACTCTTGAAAAATTAGCTGGACAT
TTGATGTATCGTTTTGCTAATCATCCTTATTTGCTTCCTTTTGTTATTTTTGTGGTTAGTGCTATTATAGCTGCTTTAGG
AGCAGGTTTTTATACAGTTTTAGCTTTTATGGCACCACTTACTTTTTTACTTTGCGATAAAATCGGTTTAAGCAAAATTG
CTGGAGCTATGGCTATAAATTATGGTGCTTTGGGAGGAGCAAATTTTATAACTTCTCAAAGCGGGATTATTTTTCGAGGA
TTGATGGAAAATTCAGGCATTGAAGCAAATGAAGCTTTTGCAAATTCTAGTATTATTTTTGCTTTTACTATAATCTTGCC
TATTGTGGTATTATCTTTTTTTGTGTTTAATGCTTTTAAAAATAATATAAAAATTAGTGTTATTTCAAAACCTGATCCAT
TTGATTATAAACAAAAAACTACTTTAATTCTCATGTTTATGATGATTGTTGTTGTTTTAATCTTTCCTGTGCTAAATATT
ATTTTTCCACATAATGAGACAATTAGTTATTTTAATAAAAAAATAGATATAGCCATGATAGCCATGATTTTTGTTGCCAT
TGCTTTATTTTTAAAATTGGCCGATGAGAAACAAGTTGTTGCTTTAATTCCTTGGGGAACCTTGATAATGATTTGTGGAG
TAGGGATGTTAATTAGCATAGCAGTTGAAGCAGGGGCTATAAAATTATTTTCAGATCTTGTAGAAAATGAGATCAATGTG
ATTTTTATTCCGTTAATAATGTGTGCTATTGCAGCTTTTATGTCGCTTTTTTCAAGTACTTTGGGTGTGGTTACTCCAGC
GCTTTTTCCTATAGTTCCAAGCATTGCTGCAAGCAGTGGATTAAGCGAGGCATTGCTTTTTTCTTGTATTGTTGTAGGGG
CTCAAGCTTCTGCTATTTCTCCTTTTTCTTCTGGAGGAAGTCTAATTTTAGGATCTTGCCCTGATAAATATAAGGAAAAA
TTATTTAAAGATTTACTTATTAAAGCTGTGCCTATAGGATTTATAGCGGCGATTTTAGCTACTATTATAATGAGTTTTAT
TTTATAA

Protein sequence :
MVFLIISSIIVAIILGYITRHNVGIFAMIFAYIIGAFFMDLAPKKIIAFWPISIFFVIFAVSLFYNFATVNGTLEKLAGH
LMYRFANHPYLLPFVIFVVSAIIAALGAGFYTVLAFMAPLTFLLCDKIGLSKIAGAMAINYGALGGANFITSQSGIIFRG
LMENSGIEANEAFANSSIIFAFTIILPIVVLSFFVFNAFKNNIKISVISKPDPFDYKQKTTLILMFMMIVVVLIFPVLNI
IFPHNETISYFNKKIDIAMIAMIFVAIALFLKLADEKQVVALIPWGTLIMICGVGMLISIAVEAGAIKLFSDLVENEINV
IFIPLIMCAIAAFMSLFSSTLGVVTPALFPIVPSIAASSGLSEALLFSCIVVGAQASAISPFSSGGSLILGSCPDKYKEK
LFKDLLIKAVPIGFIAAILATIIMSFIL

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
M5005_Spy_0169 YP_281533.1 malonate permease Not tested Not named Protein 3e-67 42