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Name : serS (N135_00433) Accession : YP_008561774.1 Strain : jejuni jejuni 00-2425 Genome accession: NC_022362 Putative virulence/resistance : Unknown Product : seryl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 393180 - 394415 bp Length : 1236 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGCTAGATTTAAAAAATTTGCAAAATAATTTTGATGAAGTGGCTAAAAAGTTAAAAAATAAAAAAGTTGATGAAAATAT CTTAAAAAAACTTGCTGAACTTTTTGCAAGTTTAAAAAAAGAAAAAATAGCCTTGGAAGAATTTCAAGCTTTTCAAAATA AATTCAGTAAAGAGCTTGCTACAGCCGAAGATAAAGAAAGTTTAAAAGCAAAATTAAGCGAAAATAAAAGCAAAATTAAT GAGCAAAGCGCTAAAGTAAATGCTTTAGAAAATGAGCTTGAGGAAATCGCTCATGCCATCCCAAATATCCCTGATGAATG TGTGCCTGTGGGTGAAGATGAAAATGAAAATGTGGAGCTTAAAAAAGTTTTAAATCCACCTAGCTTTGATTTTACTCCAA AAGAACATTTTGAATTAGGCGAGAGTTTAAATTGGCTTGATTTTATGCGTGGGGTAAAAATTTCACAAAGTCGTTTTTGT GTGCTTAAAAATGAAGGAGCTTTATTAAGCCGTGCTTTGGTAAATTATATGATAGATTTTAATAGAAGTCGTGGATTTGA ATTTGTTAATGTACCTTTTTTGGTAAATGGTGCTACTATGTTTGGGACGGGTCAGTTGCCAAAATTTAAAGAAGATATGT ATAAGGTAGATGATGAGGATTTGTATTTGATCTCAACTTCTGAAATTCCAGTAACCAATCTTTACAGCGGAGAAATTTTA GCGAGTGAAACTTTACCTATAAAAATGACTTGTTATAGTGCTTGTTTTAGAAAAGAAGCAGGCAGTGCAGGGCGTGATAC AAGGGGTATTATAAGACAACACCAGTTTGAAAAAGTAGAGCTTGTAAGTATCACTAAACCTGAGCAAAGTGATAGTGTGT TTAATGAAATGCTTGAGTGTGCAAGTGATTTGCTGAGTTCTTTAGGTTTAGCGCATAGACATTTGATGCTTTGCACTGGA GATTTGGGTTTTAGTGCAGCAAAAACTGTAGATCTTGAAGTGTGGCTTCCAGGACAGAATAAATATCGTGAGATCAGCTC GGTTTCAAATTGTCGTGATTTTCAAGCAAGACGCGCTAAAATTCGCTATAAAAACGAACAAGGAAAAAATGAACTCGTCC ACACTCTTAATGGCTCATCTTTGGCAGTAGGAAGAACCTTGGTAGCGATTATGGAAAATTATCAAGATAAAGAAGGAAAA ATTCATATTCCTGATGTTTTGAAAAAATATTTTTAA Protein sequence : MLDLKNLQNNFDEVAKKLKNKKVDENILKKLAELFASLKKEKIALEEFQAFQNKFSKELATAEDKESLKAKLSENKSKIN EQSAKVNALENELEEIAHAIPNIPDECVPVGEDENENVELKKVLNPPSFDFTPKEHFELGESLNWLDFMRGVKISQSRFC VLKNEGALLSRALVNYMIDFNRSRGFEFVNVPFLVNGATMFGTGQLPKFKEDMYKVDDEDLYLISTSEIPVTNLYSGEIL ASETLPIKMTCYSACFRKEAGSAGRDTRGIIRQHQFEKVELVSITKPEQSDSVFNEMLECASDLLSSLGLAHRHLMLCTG DLGFSAAKTVDLEVWLPGQNKYREISSVSNCRDFQARRAKIRYKNEQGKNELVHTLNGSSLAVGRTLVAIMENYQDKEGK IHIPDVLKKYF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| serS | YP_003446791.1 | seryl-tRNA synthetase | Not tested | The aminoglycoside resistance gene cluster | Protein | 4e-86 | 48 |
