Name : hom (N135_00248) Accession : YP_008561592.1 Strain : jejuni jejuni 00-2425 Genome accession: NC_022362 Putative virulence/resistance : Unknown Product : homoserine dehydrogenase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 234085 - 235332 bp Length : 1248 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAAAGTAGCGATTCTTGGTTATGGCACTGTTGGAAGTGCGGTGGTTAAATTTCTTTTAGAAAATGATAAACTCATTCG TGCAAGATGTGGGCAAAGCATAACTCCTGTGATCGCTCTTGCTAGAAGTCCTAAAAAAAATGCTTTAATTCCAATTACTC ATAGCGTTGCAGAAATTTTAAATGCTGATGTAGATGTTTTTGTAGAATTAATGGGTGGGGTGGATGAAGCTTTTAAAATA GTGAGTGAAATTTTAAAAAAGAAAAAAGCTGTTGTTACTGCAAATAAAGCTATGCTTGCTTATCATCGTTATGAACTTGA AAATTTGGCTAAAAATTTAGCTTTTGGTTATGAAGCAAGTGTGGCTGGAGGAATTCCTATTATCAAGGTTTTAAAAGAAG GTTTAAGTGCAAATAATATTTTGGCTATAAAAGGGATTTTAAATGGTACGAGTAATTATATTTTAAGTTCTATGAGTCAA AAAAATATGAGTTTTAAACAAGCTTTGCAAATAGCTCAAAATTTAGGTTATGCAGAGGCTGATCCAACTTTTGACATAGA AGGGCAAGATGCAGCACATAAACTGCTTGTTTTATCAAGTATCGCTTATAATCTTAAAGCTAAACCTGAAGATATTTTGA TCGAGGGTATTAGTGAAATTGCACCTGAAGATATGTATTTTGCTAATGAGTTTGAATTTACCATAAAACTTTTAGGTATA GCTAAGGTGCGTGAAAATAAAGTAGAATTAAGGGTGCATCCTACTATGATAGATAAAGAAAAAATGCTTGCAAAAGTTGA TGGAGTGATGAATGCTATAAGCATTAATGGAGATTTGTTGGGTGAAAGTTTGTATTATGGAGCAGGAGCAGGAGGAGAGG CCACTGCAAGTGCTGTGATTTCAGATCTTATGGATATAGCAAGAGATCAGGTAAAAGCACCAATGCTTGGTTTTGTGAAT ACTTTAGAATACAAGCTTTTAAGCAAAGATGAAATTTATACAAAATATTATTTAAGGGTGAAAGTTGAAGATAAAATAGG GATTTTATCTAAAATCACACAATTGATGAGTGAAAATAATATTTCTATCGATAGTTTTTTACAAAAACCTAAAAAAAATG ATGAAAATTACAGTACTTTGTTTTTTACTACACATTTAACTTATGAAAAAAGCATACAAAATTTGCTTGAAATTTTACGC AAACAAGATTTTATAAAAACCAAGCCTTTTATGATGCGTATAGAATAA Protein sequence : MKVAILGYGTVGSAVVKFLLENDKLIRARCGQSITPVIALARSPKKNALIPITHSVAEILNADVDVFVELMGGVDEAFKI VSEILKKKKAVVTANKAMLAYHRYELENLAKNLAFGYEASVAGGIPIIKVLKEGLSANNILAIKGILNGTSNYILSSMSQ KNMSFKQALQIAQNLGYAEADPTFDIEGQDAAHKLLVLSSIAYNLKAKPEDILIEGISEIAPEDMYFANEFEFTIKLLGI AKVRENKVELRVHPTMIDKEKMLAKVDGVMNAISINGDLLGESLYYGAGAGGEATASAVISDLMDIARDQVKAPMLGFVN TLEYKLLSKDEIYTKYYLRVKVEDKIGILSKITQLMSENNISIDSFLQKPKKNDENYSTLFFTTHLTYEKSIQNLLEILR KQDFIKTKPFMMRIE |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
BJAB07104_00305 | YP_008207770.1 | Homoserine dehydrogenase | Not tested | AbaR25 | Protein | 1e-59 | 46 |
BJAB0868_00309 | YP_008211635.1 | Homoserine dehydrogenase | Not tested | AbaR26 | Protein | 1e-59 | 46 |