Gene Information

Name : hom (N755_00194)
Accession : YP_008541509.1
Strain : jejuni jejuni 00-2544
Genome accession: NC_022353
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : homoserine dehydrogenase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 1.1.1.3
Position : 183393 - 184640 bp
Length : 1248 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGAAAGTAGCGATTCTTGGTTATGGCACTGTTGGAAGTGCGGTGGTTAAATTTCTTTTAGAAAATGATAAACTCATTCG
TGCAAGATGTGGGCAAAGCATAACTCCTGTGATCGCTCTTGCTAGAAGTCCTAAAAAAAATGCTTTAATTCCAATTACTC
ATAGCGTTGCAGAAATTTTAAATGCTGATGTAGATGTTTTTGTAGAATTAATGGGTGGGGTGGATGAAGCTTTTAAAATA
GTGAGTGAAATTTTAAAAAAGAAAAAAGCTGTTGTTACTGCAAATAAAGCTATGCTTGCTTATCATCGTTATGAACTTGA
AAATTTGGCTAAAAATTTAGCTTTTGGTTATGAAGCAAGTGTGGCTGGAGGAATTCCTATTATCAAGGTTTTAAAAGAAG
GTTTAAGTGCAAATAATATTTTGGCTATAAAAGGGATTTTAAATGGTACGAGTAATTATATTTTAAGTTCTATGAGTCAA
AAAAATATGAGTTTTAAACAAGCTTTGCAAATAGCTCAAAATTTAGGTTATGCAGAGGCTGATCCAACTTTTGACATAGA
AGGGCAAGATGCAGCACATAAACTGCTTGTTTTATCAAGTATCGCTTATAATCTTAAAGCTAAACCTGAAGATATTTTGA
TCGAGGGTATTAGTGAAATTGCACCTGAAGATATGTATTTTGCTAATGAGTTTGAATTTACCATAAAACTTTTAGGTATA
GCTAAGGTGCGTGAAAATAAAGTAGAATTAAGGGTGCATCCTACTATGATAGATAAAGAAAAAATGCTTGCAAAAGTTGA
TGGAGTGATGAATGCTATAAGCATTAATGGAGATTTGTTGGGTGAAAGTTTGTATTATGGAGCAGGAGCAGGAGGAGAGG
CCACTGCAAGTGCTGTGATTTCAGATCTTATGGATATAGCAAGAGATCAGGTAAAAGCACCAATGCTTGGTTTTGTGAAT
ACTTTAGAATACAAGCTTTTAAGCAAAGATGAAATTTATACAAAATATTATTTAAGGGTGAAAGTTGAAGATAAAATAGG
GATTTTATCTAAAATCACACAATTGATGAGTGAAAATAATATTTCTATCGATAGTTTTTTACAAAAACCTAAAAAAAATG
ATGAAAATTACAGTACTTTGTTTTTTACTACACATTTAACTTATGAAAAAAGCATACAAAATTTGCTTGAAATTTTACGC
AAACAAGATTTTATAAAAACCAAGCCTTTTATGATGCGTATAGAATAA

Protein sequence :
MKVAILGYGTVGSAVVKFLLENDKLIRARCGQSITPVIALARSPKKNALIPITHSVAEILNADVDVFVELMGGVDEAFKI
VSEILKKKKAVVTANKAMLAYHRYELENLAKNLAFGYEASVAGGIPIIKVLKEGLSANNILAIKGILNGTSNYILSSMSQ
KNMSFKQALQIAQNLGYAEADPTFDIEGQDAAHKLLVLSSIAYNLKAKPEDILIEGISEIAPEDMYFANEFEFTIKLLGI
AKVRENKVELRVHPTMIDKEKMLAKVDGVMNAISINGDLLGESLYYGAGAGGEATASAVISDLMDIARDQVKAPMLGFVN
TLEYKLLSKDEIYTKYYLRVKVEDKIGILSKITQLMSENNISIDSFLQKPKKNDENYSTLFFTTHLTYEKSIQNLLEILR
KQDFIKTKPFMMRIE

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
BJAB07104_00305 YP_008207770.1 Homoserine dehydrogenase Not tested AbaR25 Protein 1e-59 46
BJAB0868_00309 YP_008211635.1 Homoserine dehydrogenase Not tested AbaR26 Protein 1e-59 46