|
Name : N564_01468 (N564_01468) Accession : YP_008541073.1 Strain : jejuni jejuni 00-2426 Genome accession: NC_022352 Putative virulence/resistance : Virulence Product : pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 1.2.7.- Position : 1388365 - 1391925 bp Length : 3561 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGGTAAAATTATGAAAACTATGGACGGAAATGAGGCTGCTGCATACGCTGCGTATGCTTTTACTGAAGTTGCTGGAAT TTATCCTATTACACCTAGTTCTCCTATGGCTGATTATACCGATATGTGGGCAGCTGCAGGAAAAAAAAATCTTTTTGGAG TTCCTGTAAAAATCGTAGAAATGCAAAGTGAAGCAGGAGCTGCAGGTAGTGTGCATGGATCTTTACAAGCTGGGGCTTTG ACTACAACTTATACGGCTTCTCAAGGATTACTCCTTAAAATTCCAAATATGTATAAAATAGCAGGTCAATTACTCCCCTG TGTAATCCATGTAGCAGCGCGTTCTTTGGCTGCTCAAGCTTTGTCTATCTTTGGTGATCATCAAGATATTTATGCAGCAA GACAAATTGGTTTTGCTATGCTTTGTTCGCATTCTGTGCAAGAAACCATGGACTTAGCTGGTGTAGCACATTTAGCTGCA ATTAAGGGAAGAGTGCCATTTTTACATTTTTTTGATGGTTTTAGAACAAGCCATGAAATTCAAAAAGTTGAAGTAATGGA TTATGCGCATTTTGATAGATTATTAGATAGAGAAGCTTTGCTTGAATTTAGAAATAATGCTTTAAATCCAGAAAATCCAA AAACACGTGGAACAGCACAAAATGATGATATTTATTTTCAAACTAGAGAAGTAAGCAATCGTTTTTACGATGCTTTACCT GATGTTGTTAATGAATATATGCAAGAAATTTCAAAAATTACAGGTAGAGAATACAAACCATTTACTTATTATGGTCACAA AGAGCCAGAGTGTGTGATTGTTGCTATGGGTTCTGTAACTCAAGCACTTGAAGAAGTGGTGGACTATCTTAATGCCAAGG GTGAAAAGGTAGGGATTTTAAAAGTTTATCTTTATCGCCCATTTAGTTTAAAATATTTCTTTGATGTTATGCCAAAATCA GTGAAAAAAATCGCGGTTTTAGATAGAACCAAAGAACCAGGAAGTCTCGGAGAACCACTTTATCTTGATGTAAAATCAGC TTTCTATGGAAGAGAAAATGCTCCTGTTATAGTGGGTGGAAGATACGGACTTTCTTCAAAGGATGTTGATCCTGCTCAAA TGATAGCAGTATTTGAAAATCTTAAACTTGATAATCCAAAAGATGGCTTTACTGTAGGTATAATTGATGATGTAACTCAT ACTTCACTGAGTACTGGAGAGAAAATTTCACTTGGAGATGAAAGTACGATCGAATGTTTATTTTACGGACTTGGTGCTGA TGGAACTGTGGGTGCAAATAAAAACTCGATTAAAATCATCGGAGATAAAACGGATTTTTACGCTCAAGCTTATTTTGCTT ATGATTCTAAAAAATCAGGGGGTTATACAAGAAGCCATTTAAGATTTTCTAAAAAACCTATCCGTTCAACTTATCTTGTT TCAACTCCGCATTTTATCGCTTGTTCGGTAGCGGCTTATTTGGAAATTTATGATGTTTTAGCAGGAATTCGCAAAGGAGG AACTTTCCTTTTAAATAGTATTTGGAATGCTGAAGAAACCATAAGACAACTTCCAGATGCAGTAAAGAAAACTTTAGCTG AAAAAGAAGTAAATTTTTATATCATCAATGCAACCAAACTAGCTCGTGATATAGGTTTGGGAAATCGTACAAATACCATT ATGCAATCAGCCTTTTTCAAACTTGCAAAAATCATTCCTTATGAAGACGCACAAAAATACATGAAAGAGCTTGCGTATAA ATCTTATAGTAAAAAAGGCGATGCTATTGTAGAAATGAATTACAAGGCTATTGATGTGGGTGCTGATGGACTTGTAAAAG TTGAAGTGGATCCAAATTGGAAAAATTTAGAGCTTAAAGAAAAAGAACAAACCAATGCCTATAAAGGTACTGAATTTGTT GAAAAAATCGTAAAACCTATGAATGCGGCTAAGGGTGATGATTTACCTGTTTCAGCCTTTTTAGGTTATGAAGATGGAAG TTTTGAACACGGCACAACCGAATACGAAAAACGCGGTGTTGGGGTTATGGTACCAAGATGGATAGAGGCAAATTGTATTC AATGCAATCAATGTGCTTCAGTTTGTCCGCATGCTGTTATCAGGCCATTTTTGATTAATGATGAAGAAATGGCAAATGCA CCTCGCGGTGTAAAAGATCATGCTTTAGAAGCTAAAGGAACCAAAGGAGAAAAATTAAGCTTTAAAATTCAAGTTTCTCC ACTTGATTGTACAGGCTGTGAGCTTTGTGTTCATGAGTGTCCTACTAAAGAAAAATCTTTGGTTATGGTACCACTTCAAG AAGAGATGGATTTTGGTGAGCAAGAAAATGCGGATTATTTATTTAAAGAAATTACTTATAAAGATGATATTTTAAATAAA GAAACCACAAAAGGAGCGCAATTTGCCCAACCTTTATTTGAATTCCATGGGGCATGTCCTGGATGTGGGGAAACTCCTTA TATTACTTTAATTACAAGATTGTTCGGTGAAAGAATGATTGTGGCTAATGCTACAGGTTGTAGTTCTATTTATGGGGGTT CAGCTCCATCAACTCCTTATAGAAAAAGTGTGAAAAATGGACACGGTCCTGCTTGGGGAAATTCACTTTTTGAAGACAAT GCTGAGTTTGGTTTGGGTATGAAAATTGCAACTGAAAATACAAGACACCGCATTGAACATATCATGAATGAAAGTATGCA AGAAGTTCCAAATGCTTTATCAGCTCTTTTTAAAGATTGGATTGCAAATAAAGACAATGGTGCTATGTCTGTGGAAATTA AAGATAAAATGATCCCTATTTTAGAGCAAAATAAAAATATTAAAGCTGTACAAGATATATTAGAGCTTAAACAGTATTTA AGTAAAAAATCTCACTGGATTTTTGGTGGTGATGGTTGGGCTTATGATATAGGCTATGGCGGACTTGATCATGTTTTAGC AAGTGGAGAAAATGTAAATATTTTAGTGCTTGATACAGAAGTTTATTCTAATACAGGCGGTCAAAGTTCAAAATCTTCTA GAACAGGAGCTGTAGCACAGTTTGCAGCAGCAGGCAAACCTATACAGAAAAAAGATCTAGGTCAAATTGCTATGACTTAT GGTTATATTTTTGTAGCACAAGTAAATTCAACGGCAAATTATACTCATCTTATCAAAGCTATCACTGCAGCTGAGGCCTA TGATGGACCATCTTTGGTGATTTGTTATTCTCCTTGTATAGCTCATGGTATTAAAGGTGGGCTGGGTTACTCAGGAGAGC AAGGTGAGCTTGCTACAAAATGTGGTTATTGGCCACTTTATACCTTTGATCCTCGTTTAGAAGAGCAAGGAAAAAATCCT TTAACTCTAACAGGAAAAGAACCTGATTGGGATTTATATGAGCAATTTTTGATGAATGAAGTGCGTTATAATTCACTTAA AAAAGCAAATCCTGAACACGCTGCTGAGCTTTTTGAACGCAATAAAAAAGACGCTCAACGTCGCTATAGACAGCTTAAGC GTATTGCTATGGCTGATTATAGCAATGAGGTCGAAAGCTGA Protein sequence : MGKIMKTMDGNEAAAYAAYAFTEVAGIYPITPSSPMADYTDMWAAAGKKNLFGVPVKIVEMQSEAGAAGSVHGSLQAGAL TTTYTASQGLLLKIPNMYKIAGQLLPCVIHVAARSLAAQALSIFGDHQDIYAARQIGFAMLCSHSVQETMDLAGVAHLAA IKGRVPFLHFFDGFRTSHEIQKVEVMDYAHFDRLLDREALLEFRNNALNPENPKTRGTAQNDDIYFQTREVSNRFYDALP DVVNEYMQEISKITGREYKPFTYYGHKEPECVIVAMGSVTQALEEVVDYLNAKGEKVGILKVYLYRPFSLKYFFDVMPKS VKKIAVLDRTKEPGSLGEPLYLDVKSAFYGRENAPVIVGGRYGLSSKDVDPAQMIAVFENLKLDNPKDGFTVGIIDDVTH TSLSTGEKISLGDESTIECLFYGLGADGTVGANKNSIKIIGDKTDFYAQAYFAYDSKKSGGYTRSHLRFSKKPIRSTYLV STPHFIACSVAAYLEIYDVLAGIRKGGTFLLNSIWNAEETIRQLPDAVKKTLAEKEVNFYIINATKLARDIGLGNRTNTI MQSAFFKLAKIIPYEDAQKYMKELAYKSYSKKGDAIVEMNYKAIDVGADGLVKVEVDPNWKNLELKEKEQTNAYKGTEFV EKIVKPMNAAKGDDLPVSAFLGYEDGSFEHGTTEYEKRGVGVMVPRWIEANCIQCNQCASVCPHAVIRPFLINDEEMANA PRGVKDHALEAKGTKGEKLSFKIQVSPLDCTGCELCVHECPTKEKSLVMVPLQEEMDFGEQENADYLFKEITYKDDILNK ETTKGAQFAQPLFEFHGACPGCGETPYITLITRLFGERMIVANATGCSSIYGGSAPSTPYRKSVKNGHGPAWGNSLFEDN AEFGLGMKIATENTRHRIEHIMNESMQEVPNALSALFKDWIANKDNGAMSVEIKDKMIPILEQNKNIKAVQDILELKQYL SKKSHWIFGGDGWAYDIGYGGLDHVLASGENVNILVLDTEVYSNTGGQSSKSSRTGAVAQFAAAGKPIQKKDLGQIAMTY GYIFVAQVNSTANYTHLIKAITAAEAYDGPSLVICYSPCIAHGIKGGLGYSGEQGELATKCGYWPLYTFDPRLEEQGKNP LTLTGKEPDWDLYEQFLMNEVRYNSLKKANPEHAAELFERNKKDAQRRYRQLKRIAMADYSNEVES |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | AFJ97267.1 | pyruvate ferredoxin | Virulence | Not named | Protein | 0.0 | 96 |
