|
Name : N565_00589 (N565_00589) Accession : YP_008538494.1 Strain : jejuni jejuni 00-2538 Genome accession: NC_022351 Putative virulence/resistance : Unknown Product : dicarboxylate carrier protein MatC Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 546536 - 547822 bp Length : 1287 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGTTTTTTTAATCATCTCTAGTATTATAGTGGCTATTATTTTGGGCTATATTACTAGACATAATGTTGGAATTTTTGC TATGATTTTTGCTTATATTATAGGAGCTTTTTTTATGGATTTAGCTCCTAAAAAAATCATAGCTTTTTGGCCTATTTCTA TATTTTTTGTTATTTTTGCTGTCTCATTGTTTTATAATTTTGCAACCGTAAATGGAACTCTTGAAAAATTAGCTGGACAT TTGATGTATCGTTTTGCTAATCATCCTTATTTGCTTCCTTTTGTTATTTTTGTGGTTAGTGCTATTATAGCTGCTTTAGG AGCAGGTTTTTATACAGTTTTAGCTTTTATGGCACCACTTACTTTTTTACTTTGCGATAAAATCGGTTTAAGCAAAATTG CTGGAGCTATGGCTATAAATTATGGTGCTTTGGGAGGAGCAAATTTTATAACTTCTCAAAGCGGGATTATTTTTCGAGGA TTGATGGAAAATTCAGGCATTGAAGCAAATGAAGCTTTTGCAAATTCTAGTATTATTTTTGCTTTTACTATAATCTTGCC TATTGTGGTATTATCTTTTTTTGTGTTTAATGCTTTTAAAAATAATATAAAAATTAGTGTTATTTCAAAACCTGATCCAT TTGATTATAAACAAAAAACTACTTTAATTCTCATGTTTATGATGATTGTTGTTGTTTTAATCTTTCCTGTGCTAAATATT ATTTTTCCACATAATGAGACAATTAGTTATTTTAATAAAAAAATAGATATAGCCATGATAGCCATGATTTTTGTTGCCAT TGCTTTATTTTTAAAATTGGCCGATGAGAAACAAGTTGTTGCTTTAATTCCTTGGGGAACCTTGATAATGATTTGTGGAG TAGGGATGTTAATTAGCATAGCAGTTGAAGCAGGGGCTATAAAATTATTTTCAGATCTTGTAGAAAATGAGATCAATGTG ATTTTTATTCCGTTAATAATGTGTGCTATTGCAGCTTTTATGTCGCTTTTTTCAAGTACTTTGGGTGTGGTTACTCCAGC GCTTTTTCCTATAGTTCCAAGCATTGCTGCAAGCAGTGGATTAAGCGAGGCATTGCTTTTTTCTTGTATTGTTGTAGGGG CTCAAGCTTCTGCTATTTCTCCTTTTTCTTCTGGAGGAAGTCTAATTTTAGGATCTTGCCCTGATAAATATAAGGAAAAA TTATTTAAAGATTTACTTATTAAAGCTGTGCCTATAGGATTTATAGCGGCGATTTTAGCTACTATTATAATGAGTTTTAT TTTATAA Protein sequence : MVFLIISSIIVAIILGYITRHNVGIFAMIFAYIIGAFFMDLAPKKIIAFWPISIFFVIFAVSLFYNFATVNGTLEKLAGH LMYRFANHPYLLPFVIFVVSAIIAALGAGFYTVLAFMAPLTFLLCDKIGLSKIAGAMAINYGALGGANFITSQSGIIFRG LMENSGIEANEAFANSSIIFAFTIILPIVVLSFFVFNAFKNNIKISVISKPDPFDYKQKTTLILMFMMIVVVLIFPVLNI IFPHNETISYFNKKIDIAMIAMIFVAIALFLKLADEKQVVALIPWGTLIMICGVGMLISIAVEAGAIKLFSDLVENEINV IFIPLIMCAIAAFMSLFSSTLGVVTPALFPIVPSIAASSGLSEALLFSCIVVGAQASAISPFSSGGSLILGSCPDKYKEK LFKDLLIKAVPIGFIAAILATIIMSFIL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| M5005_Spy_0169 | YP_281533.1 | malonate permease | Not tested | Not named | Protein | 3e-67 | 42 |
